MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Roseburia intestinalis M50/1 draft genome

Total Repeats: 20945

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_021040	AT	3	6	1708028	1708033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8502	NC_021040	GTT	2	6	1708039	1708044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8503	NC_021040	TAA	2	6	1708088	1708093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8504	NC_021040	A	6	6	1708111	1708116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8505	NC_021040	ACT	2	6	1708124	1708129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8506	NC_021040	C	7	7	1709010	1709016	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8507	NC_021040	GCG	2	6	1709031	1709036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8508	NC_021040	A	6	6	1709042	1709047	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8509	NC_021040	GAG	2	6	1709072	1709077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8510	NC_021040	AGG	2	6	1710324	1710329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8511	NC_021040	T	6	6	1711194	1711199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8512	NC_021040	A	7	7	1711222	1711228	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8513	NC_021040	ATA	3	9	1711249	1711257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8514	NC_021040	A	6	6	1711278	1711283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8515	NC_021040	GAA	2	6	1713226	1713231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8516	NC_021040	GGA	2	6	1713361	1713366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8517	NC_021040	CA	3	6	1713373	1713378	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8518	NC_021040	GGA	2	6	1713400	1713405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8519	NC_021040	GCG	2	6	1713420	1713425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8520	NC_021040	AG	3	6	1713473	1713478	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8521	NC_021040	CGA	2	6	1713595	1713600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8522	NC_021040	TTTCC	2	10	1713628	1713637	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
8523	NC_021040	ATG	2	6	1713638	1713643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8524	NC_021040	CAG	2	6	1713644	1713649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8525	NC_021040	TGA	2	6	1713705	1713710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8526	NC_021040	AGA	2	6	1713753	1713758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8527	NC_021040	GCA	2	6	1713853	1713858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8528	NC_021040	TAA	2	6	1713904	1713909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8529	NC_021040	AGC	2	6	1713918	1713923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8530	NC_021040	TGA	2	6	1713979	1713984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8531	NC_021040	T	6	6	1713986	1713991	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8532	NC_021040	AGC	2	6	1714008	1714013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8533	NC_021040	ATC	2	6	1714019	1714024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8534	NC_021040	AG	3	6	1714025	1714030	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8535	NC_021040	GA	3	6	1714057	1714062	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8536	NC_021040	ATT	2	6	1714121	1714126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8537	NC_021040	ATG	2	6	1714134	1714139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8538	NC_021040	A	7	7	1714191	1714197	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8539	NC_021040	TTGC	2	8	1714319	1714326	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8540	NC_021040	GGA	2	6	1714368	1714373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8541	NC_021040	GGA	2	6	1714422	1714427	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8542	NC_021040	GGT	2	6	1715256	1715261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8543	NC_021040	TG	3	6	1715537	1715542	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8544	NC_021040	CCT	2	6	1715543	1715548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8545	NC_021040	TA	3	6	1715579	1715584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8546	NC_021040	A	6	6	1715609	1715614	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8547	NC_021040	AG	3	6	1717230	1717235	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8548	NC_021040	GAA	2	6	1719058	1719063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8550	NC_021040	TCT	2	6	1719095	1719100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8551	NC_021040	T	6	6	1719100	1719105	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8552	NC_021040	AGAA	2	8	1719164	1719171	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8553	NC_021040	TCAT	2	8	1719200	1719207	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8554	NC_021040	A	6	6	1720322	1720327	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8555	NC_021040	GAAT	2	8	1720337	1720344	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8556	NC_021040	GGT	2	6	1721287	1721292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8557	NC_021040	T	6	6	1721296	1721301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8558	NC_021040	ATGA	2	8	1722613	1722620	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8559	NC_021040	TCC	2	6	1724057	1724062	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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8561	NC_021040	T	6	6	1724129	1724134	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8562	NC_021040	CAG	2	6	1724967	1724972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8564	NC_021040	G	6	6	1725019	1725024	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8565	NC_021040	GT	4	8	1725079	1725086	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8566	NC_021040	TGG	2	6	1725095	1725100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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8569	NC_021040	A	6	6	1725680	1725685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8570	NC_021040	GCG	2	6	1725688	1725693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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8574	NC_021040	AG	3	6	1728440	1728445	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8575	NC_021040	ATA	2	6	1728452	1728457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8583	NC_021040	ATA	2	6	1731887	1731892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8584	NC_021040	TGTC	2	8	1731939	1731946	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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8589	NC_021040	A	7	7	1735602	1735608	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8590	NC_021040	TTG	2	6	1735619	1735624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8596	NC_021040	GAAA	2	8	1735973	1735980	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8597	NC_021040	AAAAT	2	10	1735992	1736001	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8598	NC_021040	A	6	6	1736002	1736007	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8599	NC_021040	GATAA	2	10	1736028	1736037	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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8601	NC_021040	TAT	2	6	1736089	1736094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8602	NC_021040	ATG	2	6	1736138	1736143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8604	NC_021040	GA	3	6	1736312	1736317	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8605	NC_021040	T	6	6	1736360	1736365	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8606	NC_021040	TGT	2	6	1736611	1736616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8608	NC_021040	TGC	2	6	1739721	1739726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8610	NC_021040	CTA	2	6	1739803	1739808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8611	NC_021040	GAAA	2	8	1739867	1739874	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8612	NC_021040	TG	3	6	1739893	1739898	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8613	NC_021040	AT	3	6	1739901	1739906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8614	NC_021040	CTG	2	6	1739920	1739925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8615	NC_021040	GAT	2	6	1739932	1739937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8617	NC_021040	TGT	2	6	1739982	1739987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8619	NC_021040	CT	3	6	1740068	1740073	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8620	NC_021040	T	6	6	1740073	1740078	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8622	NC_021040	TGT	2	6	1740107	1740112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8623	NC_021040	GCA	2	6	1740202	1740207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8624	NC_021040	T	7	7	1740213	1740219	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8625	NC_021040	CGGG	2	8	1740259	1740266	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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8631	NC_021040	GCA	2	6	1741323	1741328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8633	NC_021040	GGA	2	6	1741438	1741443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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