MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Roseburia intestinalis M50/1 draft genome

Total Repeats: 20945

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_021040	AGGA	2	8	1514556	1514563	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7502	NC_021040	GGA	2	6	1517456	1517461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7503	NC_021040	TAA	2	6	1518630	1518635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7504	NC_021040	AGG	2	6	1518656	1518661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7505	NC_021040	AGG	2	6	1519357	1519362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7506	NC_021040	AGG	2	6	1520002	1520007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7507	NC_021040	GCCA	2	8	1523504	1523511	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7508	NC_021040	TCC	2	6	1524225	1524230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7509	NC_021040	A	6	6	1524974	1524979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7510	NC_021040	ATA	2	6	1524999	1525004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7511	NC_021040	TAA	2	6	1525042	1525047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7512	NC_021040	T	7	7	1525280	1525286	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7513	NC_021040	ATTT	2	8	1525293	1525300	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7514	NC_021040	AGA	2	6	1525310	1525315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7515	NC_021040	ACA	2	6	1525329	1525334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7516	NC_021040	AACA	2	8	1525344	1525351	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7517	NC_021040	AAT	2	6	1525383	1525388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7518	NC_021040	ATGT	2	8	1525392	1525399	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7519	NC_021040	TAT	2	6	1525414	1525419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7520	NC_021040	TGT	2	6	1528476	1528481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7521	NC_021040	CA	3	6	1528637	1528642	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7522	NC_021040	TG	3	6	1528646	1528651	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7523	NC_021040	AGA	2	6	1528672	1528677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7524	NC_021040	ACC	2	6	1528704	1528709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7525	NC_021040	AAG	2	6	1528755	1528760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7526	NC_021040	AAG	2	6	1528768	1528773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7527	NC_021040	ATC	2	6	1529624	1529629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7529	NC_021040	TCT	2	6	1529671	1529676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7531	NC_021040	CCGGAA	2	12	1529751	1529762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7533	NC_021040	CAA	2	6	1531529	1531534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7534	NC_021040	AAC	2	6	1531547	1531552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7535	NC_021040	CAA	2	6	1531592	1531597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7536	NC_021040	AG	3	6	1531623	1531628	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7537	NC_021040	ACC	2	6	1531632	1531637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7538	NC_021040	TTTA	2	8	1535502	1535509	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7540	NC_021040	TAAAA	2	10	1537041	1537050	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7541	NC_021040	GA	3	6	1537076	1537081	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7542	NC_021040	AT	3	6	1537142	1537147	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7543	NC_021040	AGAATA	2	12	1537149	1537160	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7544	NC_021040	AAG	2	6	1537166	1537171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7545	NC_021040	TGT	2	6	1538987	1538992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7546	NC_021040	ATATT	2	10	1539018	1539027	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7550	NC_021040	GCA	2	6	1539150	1539155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7551	NC_021040	A	7	7	1539172	1539178	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7552	NC_021040	GCA	2	6	1539231	1539236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7553	NC_021040	T	6	6	1539244	1539249	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7554	NC_021040	GGA	2	6	1539252	1539257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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7557	NC_021040	GTGGA	2	10	1539341	1539350	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
7558	NC_021040	TG	3	6	1539412	1539417	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7559	NC_021040	TG	3	6	1539437	1539442	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7560	NC_021040	GAA	2	6	1539478	1539483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7561	NC_021040	A	6	6	1539504	1539509	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7562	NC_021040	GGC	2	6	1539529	1539534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7563	NC_021040	TG	4	8	1539545	1539552	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7564	NC_021040	TGG	2	6	1539602	1539607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7565	NC_021040	GT	3	6	1539770	1539775	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7566	NC_021040	CAATG	2	10	1539822	1539831	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7567	NC_021040	CTG	2	6	1539845	1539850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7569	NC_021040	ACCG	2	8	1539903	1539910	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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7573	NC_021040	AG	3	6	1540099	1540104	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7574	NC_021040	TAG	2	6	1540109	1540114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7581	NC_021040	TG	3	6	1542882	1542887	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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7598	NC_021040	T	7	7	1543515	1543521	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7599	NC_021040	AGA	2	6	1543530	1543535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7601	NC_021040	T	8	8	1543644	1543651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7602	NC_021040	ATG	2	6	1543673	1543678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7604	NC_021040	TCA	2	6	1543734	1543739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7606	NC_021040	TGC	2	6	1543798	1543803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7608	NC_021040	ATG	2	6	1543953	1543958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7609	NC_021040	A	6	6	1543961	1543966	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7610	NC_021040	CAG	2	6	1543977	1543982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7612	NC_021040	CTT	2	6	1544027	1544032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7613	NC_021040	AG	3	6	1544041	1544046	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7614	NC_021040	ATG	2	6	1544052	1544057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7615	NC_021040	TAT	3	9	1544063	1544071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7616	NC_021040	ATA	2	6	1544136	1544141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7617	NC_021040	A	6	6	1544187	1544192	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7618	NC_021040	ACA	2	6	1544207	1544212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7619	NC_021040	GTTT	2	8	1544218	1544225	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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7622	NC_021040	CCAT	2	8	1544294	1544301	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7623	NC_021040	TGT	2	6	1544344	1544349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7626	NC_021040	T	6	6	1544489	1544494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7627	NC_021040	AGG	2	6	1544577	1544582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7628	NC_021040	GAG	2	6	1544816	1544821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7629	NC_021040	GAT	2	6	1544878	1544883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7630	NC_021040	GT	3	6	1544928	1544933	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7631	NC_021040	AT	3	6	1544993	1544998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7632	NC_021040	TCA	2	6	1545072	1545077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7633	NC_021040	A	7	7	1545089	1545095	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7634	NC_021040	CCGT	2	8	1545263	1545270	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7635	NC_021040	A	7	7	1545285	1545291	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7762	NC_021040	CGC	2	6	1583805	1583810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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