MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Roseburia intestinalis M50/1 draft genome

Total Repeats: 20945

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_021040	GTAA	2	8	1297419	1297426	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6502	NC_021040	T	6	6	1297457	1297462	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6503	NC_021040	ATTAT	2	10	1297501	1297510	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6504	NC_021040	T	7	7	1297548	1297554	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6505	NC_021040	ATTT	2	8	1299098	1299105	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6506	NC_021040	TGTT	2	8	1299120	1299127	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6507	NC_021040	AT	3	6	1301374	1301379	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6508	NC_021040	AGT	2	6	1301388	1301393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6509	NC_021040	ATA	2	6	1301460	1301465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6510	NC_021040	ACA	2	6	1301472	1301477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6511	NC_021040	AAAG	2	8	1301487	1301494	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6512	NC_021040	ATA	2	6	1301502	1301507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6513	NC_021040	A	6	6	1301526	1301531	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6514	NC_021040	ATT	2	6	1301571	1301576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6515	NC_021040	CTGT	2	8	1301593	1301600	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6516	NC_021040	CA	3	6	1301623	1301628	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6517	NC_021040	AGG	2	6	1301664	1301669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6518	NC_021040	A	7	7	1301724	1301730	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6519	NC_021040	AAAG	2	8	1301756	1301763	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6520	NC_021040	GATTT	2	10	1302896	1302905	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6521	NC_021040	A	7	7	1302926	1302932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6522	NC_021040	GCA	2	6	1302938	1302943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6523	NC_021040	GAA	3	9	1302984	1302992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6524	NC_021040	GGT	2	6	1303112	1303117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6525	NC_021040	N	288	288	1303259	1303546	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6526	NC_021040	TGT	2	6	1304910	1304915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6527	NC_021040	TGA	2	6	1304928	1304933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6528	NC_021040	GGA	2	6	1304971	1304976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6529	NC_021040	AGG	2	6	1306676	1306681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6530	NC_021040	AGA	2	6	1309042	1309047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6531	NC_021040	GCA	2	6	1309060	1309065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6532	NC_021040	GAT	2	6	1310426	1310431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6533	NC_021040	T	7	7	1310431	1310437	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6534	NC_021040	AAATTC	2	12	1310439	1310450	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6535	NC_021040	CTT	2	6	1311451	1311456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6536	NC_021040	GCCT	2	8	1311520	1311527	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6537	NC_021040	CAA	2	6	1311559	1311564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6538	NC_021040	TCC	2	6	1311569	1311574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6539	NC_021040	TGT	2	6	1311707	1311712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6540	NC_021040	CAT	2	6	1311734	1311739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6541	NC_021040	T	7	7	1311768	1311774	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6542	NC_021040	A	6	6	1311781	1311786	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6543	NC_021040	A	6	6	1311949	1311954	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6544	NC_021040	AGG	2	6	1312047	1312052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6545	NC_021040	CAG	2	6	1312270	1312275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6546	NC_021040	ATA	2	6	1312345	1312350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6547	NC_021040	AGCGA	2	10	1312360	1312369	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6548	NC_021040	TGC	2	6	1312388	1312393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6549	NC_021040	TGCT	2	8	1312431	1312438	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6550	NC_021040	T	8	8	1312470	1312477	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6551	NC_021040	ATA	2	6	1312482	1312487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6552	NC_021040	GGA	2	6	1312511	1312516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6553	NC_021040	T	7	7	1316388	1316394	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6554	NC_021040	GATG	2	8	1316441	1316448	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6555	NC_021040	GGA	2	6	1316452	1316457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6556	NC_021040	ATT	2	6	1316511	1316516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6557	NC_021040	ATT	2	6	1318213	1318218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6558	NC_021040	ATG	2	6	1324798	1324803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6559	NC_021040	AAT	2	6	1324839	1324844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6560	NC_021040	GGT	2	6	1325989	1325994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6561	NC_021040	GAG	2	6	1326657	1326662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6562	NC_021040	GA	3	6	1328623	1328628	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6563	NC_021040	TTA	2	6	1329821	1329826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6564	NC_021040	T	7	7	1329869	1329875	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6565	NC_021040	ACAT	2	8	1330022	1330029	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6566	NC_021040	ATT	2	6	1331363	1331368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6567	NC_021040	AATG	2	8	1331387	1331394	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6568	NC_021040	AGG	2	6	1331412	1331417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6569	NC_021040	GAA	2	6	1332565	1332570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6570	NC_021040	TGC	2	6	1332602	1332607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6571	NC_021040	ATA	2	6	1334303	1334308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6572	NC_021040	A	6	6	1334327	1334332	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6573	NC_021040	TGC	2	6	1334333	1334338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6574	NC_021040	GAT	2	6	1334351	1334356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6575	NC_021040	ATC	2	6	1334377	1334382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6576	NC_021040	T	6	6	1334383	1334388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6577	NC_021040	CAGG	2	8	1336438	1336445	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6578	NC_021040	GAAAA	2	10	1336468	1336477	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
6579	NC_021040	A	6	6	1336474	1336479	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6580	NC_021040	A	7	7	1336485	1336491	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6581	NC_021040	AAGG	2	8	1336509	1336516	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6582	NC_021040	AGT	2	6	1337232	1337237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6583	NC_021040	GGA	2	6	1337265	1337270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6584	NC_021040	TGC	2	6	1337301	1337306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6585	NC_021040	TCA	2	6	1337436	1337441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6586	NC_021040	T	7	7	1337449	1337455	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6587	NC_021040	AATA	2	8	1337482	1337489	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6588	NC_021040	ATA	2	6	1337528	1337533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6589	NC_021040	AGG	2	6	1337542	1337547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6592	NC_021040	GTTG	2	8	1339340	1339347	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6593	NC_021040	GATAA	2	10	1339366	1339375	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6594	NC_021040	A	6	6	1339374	1339379	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6595	NC_021040	GCA	2	6	1339380	1339385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6597	NC_021040	TAT	2	6	1341408	1341413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6598	NC_021040	AAAATA	2	12	1342313	1342324	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6599	NC_021040	A	6	6	1342339	1342344	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6600	NC_021040	TG	3	6	1342387	1342392	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6601	NC_021040	CCA	2	6	1342479	1342484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6602	NC_021040	ATTG	2	8	1342547	1342554	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6603	NC_021040	GAT	2	6	1342590	1342595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6604	NC_021040	AGT	2	6	1342634	1342639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6605	NC_021040	TAGA	2	8	1342705	1342712	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6606	NC_021040	ATG	2	6	1342730	1342735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6609	NC_021040	GATG	2	8	1342759	1342766	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6610	NC_021040	T	7	7	1342774	1342780	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6611	NC_021040	TGA	2	6	1342820	1342825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6612	NC_021040	T	7	7	1342865	1342871	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6613	NC_021040	AGA	2	6	1344367	1344372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6614	NC_021040	T	6	6	1344373	1344378	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6615	NC_021040	AAG	2	6	1344382	1344387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6616	NC_021040	ATTAA	2	10	1345267	1345276	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6617	NC_021040	ATTT	2	8	1345278	1345285	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6618	NC_021040	T	7	7	1345283	1345289	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6619	NC_021040	TG	3	6	1346630	1346635	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6620	NC_021040	AATT	2	8	1349067	1349074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6621	NC_021040	A	6	6	1350095	1350100	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6622	NC_021040	A	7	7	1350111	1350117	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6623	NC_021040	CAG	2	6	1350133	1350138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6624	NC_021040	T	6	6	1350173	1350178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6625	NC_021040	TGA	2	6	1350194	1350199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6626	NC_021040	CT	3	6	1351254	1351259	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6627	NC_021040	AT	3	6	1351305	1351310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6628	NC_021040	TAT	2	6	1351339	1351344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6629	NC_021040	CAG	2	6	1351349	1351354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6630	NC_021040	ACG	2	6	1351452	1351457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6631	NC_021040	TGT	2	6	1351474	1351479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6633	NC_021040	TAT	2	6	1355104	1355109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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