MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Roseburia intestinalis M50/1 draft genome

Total Repeats: 20945

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_021040	CTG	2	6	1105892	1105897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5502	NC_021040	CTT	2	6	1109344	1109349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5503	NC_021040	AAT	2	6	1109354	1109359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_021040	TTC	2	6	1109392	1109397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5505	NC_021040	GTAT	2	8	1109410	1109417	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_021040	ATA	2	6	1109452	1109457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_021040	GGA	2	6	1109511	1109516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_021040	A	6	6	1110365	1110370	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_021040	AGA	2	6	1110418	1110423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_021040	ATTG	2	8	1110458	1110465	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_021040	GAT	2	6	1110468	1110473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_021040	AG	3	6	1110484	1110489	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_021040	ATG	2	6	1110520	1110525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_021040	GATG	2	8	1110620	1110627	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_021040	TGC	2	6	1110637	1110642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5516	NC_021040	ATA	2	6	1110872	1110877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_021040	A	6	6	1110903	1110908	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_021040	T	6	6	1112040	1112045	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_021040	TA	3	6	1112092	1112097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_021040	GAA	2	6	1112136	1112141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_021040	GAA	3	9	1112167	1112175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_021040	AAG	2	6	1112196	1112201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_021040	GTTT	2	8	1112251	1112258	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_021040	ATT	2	6	1112415	1112420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_021040	TGA	2	6	1112500	1112505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_021040	GGA	2	6	1112548	1112553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_021040	A	6	6	1112642	1112647	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_021040	ATTAT	2	10	1112649	1112658	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_021040	A	6	6	1112726	1112731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5530	NC_021040	A	7	7	1114189	1114195	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5531	NC_021040	ACAG	2	8	1114197	1114204	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5532	NC_021040	GAA	2	6	1114228	1114233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_021040	GGC	2	6	1114266	1114271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5534	NC_021040	TGC	2	6	1114283	1114288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5535	NC_021040	CTT	2	6	1114289	1114294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5536	NC_021040	TTA	2	6	1114295	1114300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_021040	GA	3	6	1114318	1114323	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_021040	GTG	2	6	1114325	1114330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_021040	A	8	8	1114353	1114360	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_021040	GAA	2	6	1114378	1114383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_021040	ACGA	2	8	1114412	1114419	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5542	NC_021040	TGA	2	6	1114452	1114457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_021040	TGT	2	6	1114485	1114490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_021040	GCA	2	6	1114558	1114563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5545	NC_021040	GGA	2	6	1114569	1114574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_021040	ATG	2	6	1114580	1114585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_021040	GCA	2	6	1114606	1114611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5548	NC_021040	AT	3	6	1114715	1114720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_021040	ATG	2	6	1114727	1114732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_021040	ATC	2	6	1114771	1114776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5551	NC_021040	GAA	2	6	1114929	1114934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_021040	AGG	2	6	1116990	1116995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_021040	TGC	2	6	1117330	1117335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5554	NC_021040	TAAAA	2	10	1117346	1117355	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_021040	CAT	2	6	1117502	1117507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5556	NC_021040	CGG	2	6	1117576	1117581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5557	NC_021040	AGC	2	6	1117600	1117605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5558	NC_021040	TAT	2	6	1117629	1117634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_021040	CTG	2	6	1117635	1117640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5560	NC_021040	GCCGT	2	10	1117664	1117673	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5561	NC_021040	GCG	2	6	1117683	1117688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5562	NC_021040	A	8	8	1117749	1117756	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_021040	A	6	6	1117781	1117786	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_021040	AAT	2	6	1117791	1117796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_021040	AGA	2	6	1117808	1117813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_021040	GCA	2	6	1117837	1117842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5567	NC_021040	TGG	2	6	1117913	1117918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_021040	CG	3	6	1117960	1117965	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5569	NC_021040	GGC	2	6	1117999	1118004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5570	NC_021040	AC	4	8	1118055	1118062	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5571	NC_021040	CGG	2	6	1118083	1118088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5572	NC_021040	AG	3	6	1118114	1118119	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_021040	GTCC	2	8	1118344	1118351	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5574	NC_021040	AAAAG	2	10	1118513	1118522	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5575	NC_021040	CTG	2	6	1118546	1118551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5576	NC_021040	TCT	2	6	1118561	1118566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5577	NC_021040	TTTA	2	8	1118613	1118620	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_021040	ATAAA	2	10	1118666	1118675	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_021040	A	6	6	1118673	1118678	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_021040	GAAAA	2	10	1118682	1118691	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5581	NC_021040	A	6	6	1118688	1118693	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5582	NC_021040	GAAAA	2	10	1118696	1118705	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_021040	N	399	399	1118706	1119104	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5584	NC_021040	A	6	6	1119132	1119137	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5585	NC_021040	GTCC	2	8	1119155	1119162	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5586	NC_021040	GCG	2	6	1119242	1119247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5587	NC_021040	GGC	2	6	1119262	1119267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5588	NC_021040	GGT	2	6	1119370	1119375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5589	NC_021040	AAT	2	6	1119385	1119390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5590	NC_021040	TGA	2	6	1119531	1119536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5591	NC_021040	GAA	2	6	1119553	1119558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5592	NC_021040	CAC	2	6	1119609	1119614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5593	NC_021040	GAT	2	6	1119652	1119657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5594	NC_021040	AGA	2	6	1119702	1119707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5595	NC_021040	CGG	2	6	1119768	1119773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5596	NC_021040	GGAG	2	8	1119789	1119796	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5597	NC_021040	CAG	2	6	1119882	1119887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5598	NC_021040	ATG	2	6	1119902	1119907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_021040	TAC	2	6	1119973	1119978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5600	NC_021040	ATG	2	6	1120013	1120018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5601	NC_021040	GA	3	6	1120066	1120071	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_021040	GC	3	6	1120110	1120115	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5603	NC_021040	ATA	2	6	1120182	1120187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_021040	CAG	2	6	1120211	1120216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5605	NC_021040	ACAG	2	8	1120264	1120271	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5606	NC_021040	TGAT	2	8	1120280	1120287	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5607	NC_021040	GCG	2	6	1120406	1120411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5608	NC_021040	TTG	2	6	1120503	1120508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5609	NC_021040	AAG	2	6	1120518	1120523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5610	NC_021040	ATG	2	6	1120527	1120532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5611	NC_021040	TGA	2	6	1120561	1120566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5612	NC_021040	GAA	2	6	1120574	1120579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5613	NC_021040	AAAGGA	2	12	1120597	1120608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5614	NC_021040	GAAGG	2	10	1120637	1120646	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
5615	NC_021040	A	6	6	1122822	1122827	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5616	NC_021040	TTA	3	9	1122828	1122836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5617	NC_021040	ACTG	2	8	1122942	1122949	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5618	NC_021040	ATG	2	6	1122973	1122978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5619	NC_021040	ATT	3	9	1123013	1123021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5620	NC_021040	TA	3	6	1123064	1123069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5621	NC_021040	TG	3	6	1123097	1123102	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5622	NC_021040	ATT	2	6	1123139	1123144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5623	NC_021040	CGG	2	6	1123154	1123159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5624	NC_021040	TTA	2	6	1123209	1123214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5625	NC_021040	TAT	2	6	1123249	1123254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5626	NC_021040	ATT	2	6	1123256	1123261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5627	NC_021040	ATG	2	6	1123409	1123414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5628	NC_021040	TGA	2	6	1123419	1123424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5629	NC_021040	AAT	2	6	1123536	1123541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5630	NC_021040	GTA	2	6	1123551	1123556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5631	NC_021040	T	7	7	1128060	1128066	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5632	NC_021040	GAA	3	9	1128081	1128089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5640	NC_021040	TG	4	8	1128451	1128458	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5641	NC_021040	GAA	2	6	1128531	1128536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5757	NC_021040	T	6	6	1178784	1178789	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5760	NC_021040	A	8	8	1178914	1178921	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5763	NC_021040	GAAG	2	8	1180140	1180147	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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