MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Ruminococcus obeum A2-162 draft genome

Total Repeats: 18975

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_021022	AAG	2	6	3685053	3685058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18502	NC_021022	AT	3	6	3685070	3685075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18503	NC_021022	ATT	2	6	3685082	3685087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18504	NC_021022	GCA	2	6	3685093	3685098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18505	NC_021022	ATT	2	6	3685102	3685107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18506	NC_021022	GAT	2	6	3685109	3685114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18507	NC_021022	TA	3	6	3685141	3685146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18508	NC_021022	AG	3	6	3685151	3685156	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18509	NC_021022	T	6	6	3685205	3685210	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18510	NC_021022	TTG	2	6	3685224	3685229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18511	NC_021022	AGG	2	6	3685275	3685280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18512	NC_021022	GAA	2	6	3685334	3685339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18513	NC_021022	AAAAAG	2	12	3685394	3685405	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18514	NC_021022	ATT	2	6	3685450	3685455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18515	NC_021022	GAA	2	6	3685463	3685468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18516	NC_021022	TA	3	6	3685479	3685484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18517	NC_021022	TTA	2	6	3685487	3685492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18518	NC_021022	TAA	2	6	3685513	3685518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18519	NC_021022	CAA	2	6	3685534	3685539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18520	NC_021022	GTT	2	6	3685555	3685560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18521	NC_021022	ATAGT	2	10	3685566	3685575	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
18522	NC_021022	AAT	2	6	3685606	3685611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18523	NC_021022	GA	3	6	3685631	3685636	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18524	NC_021022	GATAG	2	10	3688837	3688846	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
18525	NC_021022	AGTA	2	8	3688862	3688869	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18526	NC_021022	T	6	6	3688920	3688925	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18527	NC_021022	ATG	2	6	3689383	3689388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18528	NC_021022	TTC	2	6	3689627	3689632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18529	NC_021022	TCCG	2	8	3689638	3689645	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18530	NC_021022	A	6	6	3690185	3690190	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18531	NC_021022	AT	3	6	3690249	3690254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18532	NC_021022	ATT	2	6	3690260	3690265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18533	NC_021022	TAA	2	6	3690309	3690314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18534	NC_021022	AAT	2	6	3690332	3690337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18535	NC_021022	AAT	2	6	3690367	3690372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18536	NC_021022	GAA	2	6	3690386	3690391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18537	NC_021022	AT	3	6	3690403	3690408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18538	NC_021022	A	6	6	3690477	3690482	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18539	NC_021022	TTAT	2	8	3690564	3690571	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18540	NC_021022	AATT	2	8	3690607	3690614	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18541	NC_021022	CTA	2	6	3690651	3690656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18542	NC_021022	A	7	7	3690759	3690765	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18543	NC_021022	AAT	2	6	3690800	3690805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18544	NC_021022	CTA	2	6	3690807	3690812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18545	NC_021022	ATT	2	6	3690851	3690856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18546	NC_021022	CGC	2	6	3690864	3690869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18547	NC_021022	ATT	2	6	3693339	3693344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18548	NC_021022	ACA	2	6	3693345	3693350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18549	NC_021022	TGG	2	6	3693370	3693375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18550	NC_021022	TAAAA	2	10	3693376	3693385	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18551	NC_021022	ATTA	2	8	3693392	3693399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18552	NC_021022	TGC	2	6	3693400	3693405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18553	NC_021022	ATT	3	9	3693431	3693439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18554	NC_021022	GAT	2	6	3693444	3693449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18555	NC_021022	TGT	2	6	3693551	3693556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18556	NC_021022	TGA	2	6	3693569	3693574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18557	NC_021022	A	6	6	3693585	3693590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18558	NC_021022	AT	3	6	3693592	3693597	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18559	NC_021022	AAT	2	6	3693605	3693610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18560	NC_021022	T	6	6	3693682	3693687	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18561	NC_021022	GT	3	6	3693703	3693708	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18562	NC_021022	ACA	2	6	3693723	3693728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18565	NC_021022	A	6	6	3693789	3693794	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18566	NC_021022	A	6	6	3693809	3693814	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18567	NC_021022	T	6	6	3693909	3693914	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18568	NC_021022	TAG	2	6	3693916	3693921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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18572	NC_021022	ATGCT	2	10	3694212	3694221	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
18573	NC_021022	GTA	2	6	3694275	3694280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18574	NC_021022	AGG	2	6	3694316	3694321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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18577	NC_021022	AGTA	2	8	3694412	3694419	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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18585	NC_021022	AAG	2	6	3696203	3696208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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18589	NC_021022	TTAAG	2	10	3696513	3696522	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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18593	NC_021022	AGA	2	6	3696702	3696707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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18595	NC_021022	GAAA	2	8	3696764	3696771	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18596	NC_021022	GA	3	6	3696835	3696840	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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18601	NC_021022	ATT	2	6	3697040	3697045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18607	NC_021022	AGAA	2	8	3697239	3697246	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18608	NC_021022	GCAG	2	8	3697324	3697331	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18609	NC_021022	AGA	2	6	3697372	3697377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18610	NC_021022	A	6	6	3697390	3697395	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18611	NC_021022	AG	3	6	3697403	3697408	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18612	NC_021022	ATT	2	6	3697415	3697420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18613	NC_021022	CAT	2	6	3697436	3697441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18614	NC_021022	AT	4	8	3697539	3697546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18615	NC_021022	A	7	7	3697565	3697571	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18616	NC_021022	ACA	2	6	3697680	3697685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18618	NC_021022	AAT	2	6	3697697	3697702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18622	NC_021022	ACA	2	6	3698307	3698312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18623	NC_021022	ATA	2	6	3698322	3698327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18624	NC_021022	ATG	2	6	3698409	3698414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18625	NC_021022	ACA	2	6	3698425	3698430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18626	NC_021022	CTT	2	6	3698437	3698442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18627	NC_021022	T	6	6	3698462	3698467	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18628	NC_021022	A	6	6	3698474	3698479	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.