MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Ruminococcus obeum A2-162 draft genome

Total Repeats: 18975

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_021022	ACAGAT	2	12	3599374	3599385	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18002	NC_021022	AGC	2	6	3599544	3599549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18003	NC_021022	TCG	2	6	3599636	3599641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18004	NC_021022	ATG	2	6	3599761	3599766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18005	NC_021022	GATC	2	8	3599844	3599851	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18006	NC_021022	AATG	2	8	3599877	3599884	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18007	NC_021022	A	6	6	3599893	3599898	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18008	NC_021022	TGA	2	6	3599916	3599921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18009	NC_021022	GAT	2	6	3599929	3599934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18010	NC_021022	CAT	2	6	3599962	3599967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18011	NC_021022	CAT	2	6	3599983	3599988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18012	NC_021022	AAG	2	6	3599989	3599994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18013	NC_021022	ATC	2	6	3600001	3600006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18014	NC_021022	CTT	2	6	3600012	3600017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18015	NC_021022	GAG	2	6	3600019	3600024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18016	NC_021022	AGAA	2	8	3600032	3600039	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18017	NC_021022	ATC	2	6	3600065	3600070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18018	NC_021022	TC	3	6	3600080	3600085	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18019	NC_021022	AGA	2	6	3600095	3600100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18020	NC_021022	CGAT	2	8	3600188	3600195	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18021	NC_021022	AG	4	8	3600197	3600204	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18022	NC_021022	TGA	2	6	3600240	3600245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18023	NC_021022	CA	3	6	3600256	3600261	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18024	NC_021022	GCC	2	6	3600297	3600302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18025	NC_021022	GGT	2	6	3600307	3600312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18026	NC_021022	GACA	2	8	3600348	3600355	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18027	NC_021022	TGC	2	6	3600405	3600410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18028	NC_021022	GCA	2	6	3600430	3600435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18029	NC_021022	GATT	2	8	3600459	3600466	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18030	NC_021022	ATT	2	6	3600489	3600494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18031	NC_021022	GAA	2	6	3600496	3600501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18032	NC_021022	AAG	2	6	3600580	3600585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18033	NC_021022	TTA	2	6	3600651	3600656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18034	NC_021022	AGA	2	6	3600663	3600668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18035	NC_021022	GCC	2	6	3600705	3600710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18036	NC_021022	ATG	2	6	3600718	3600723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18037	NC_021022	GAA	2	6	3600775	3600780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18038	NC_021022	TCT	2	6	3600789	3600794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18039	NC_021022	TAC	2	6	3600867	3600872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18040	NC_021022	ACA	2	6	3600882	3600887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18041	NC_021022	TGT	2	6	3600894	3600899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18042	NC_021022	ATA	2	6	3600900	3600905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18043	NC_021022	GTT	2	6	3600927	3600932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18044	NC_021022	T	6	6	3601004	3601009	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18045	NC_021022	A	6	6	3601036	3601041	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18046	NC_021022	GAA	2	6	3601057	3601062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18047	NC_021022	N	1871	1871	3601065	3602935	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18048	NC_021022	TCT	2	6	3602939	3602944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18049	NC_021022	TAT	2	6	3602982	3602987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18050	NC_021022	GGA	2	6	3603015	3603020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18051	NC_021022	T	6	6	3603375	3603380	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18052	NC_021022	AGC	2	6	3603385	3603390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18053	NC_021022	GCT	2	6	3603405	3603410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18054	NC_021022	T	7	7	3603410	3603416	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18055	NC_021022	GCAG	2	8	3603537	3603544	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18056	NC_021022	CAG	2	6	3603604	3603609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18057	NC_021022	GGT	2	6	3603617	3603622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18058	NC_021022	CTG	2	6	3603689	3603694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18059	NC_021022	AGA	2	6	3603756	3603761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18060	NC_021022	TGGAA	2	10	3603762	3603771	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
18061	NC_021022	AT	3	6	3603845	3603850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18062	NC_021022	A	7	7	3603863	3603869	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18063	NC_021022	AT	3	6	3603876	3603881	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18064	NC_021022	ATA	2	6	3603889	3603894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18065	NC_021022	TGT	2	6	3603903	3603908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18066	NC_021022	AG	3	6	3603922	3603927	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18067	NC_021022	AAG	2	6	3603931	3603936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18068	NC_021022	A	8	8	3604151	3604158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18069	NC_021022	T	6	6	3604177	3604182	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18070	NC_021022	CAG	2	6	3604246	3604251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18071	NC_021022	GGT	2	6	3604259	3604264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18072	NC_021022	A	6	6	3605356	3605361	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18073	NC_021022	T	6	6	3605362	3605367	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18074	NC_021022	CA	3	6	3605391	3605396	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18075	NC_021022	CAG	2	6	3605479	3605484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18076	NC_021022	GCG	2	6	3605522	3605527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18077	NC_021022	CAG	2	6	3605658	3605663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18078	NC_021022	GGT	2	6	3605753	3605758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18079	NC_021022	AAT	2	6	3605770	3605775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18080	NC_021022	GCA	2	6	3611771	3611776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18081	NC_021022	ATG	2	6	3611798	3611803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18082	NC_021022	ACAT	2	8	3614397	3614404	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18083	NC_021022	T	7	7	3614410	3614416	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18084	NC_021022	AAT	2	6	3614437	3614442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18085	NC_021022	AGT	2	6	3614484	3614489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18086	NC_021022	TAA	2	6	3614686	3614691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18087	NC_021022	GCC	2	6	3614705	3614710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18088	NC_021022	ATA	2	6	3614730	3614735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18089	NC_021022	ATT	2	6	3614767	3614772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18090	NC_021022	ATT	2	6	3614784	3614789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18091	NC_021022	GGA	2	6	3614837	3614842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18092	NC_021022	A	6	6	3615183	3615188	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18093	NC_021022	CTTT	2	8	3615237	3615244	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
18094	NC_021022	ATA	2	6	3615246	3615251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18095	NC_021022	ACC	2	6	3615778	3615783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18096	NC_021022	A	7	7	3616092	3616098	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18097	NC_021022	TTG	2	6	3616223	3616228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18098	NC_021022	AGG	2	6	3616367	3616372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18099	NC_021022	ACC	2	6	3616376	3616381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18100	NC_021022	TGA	2	6	3616851	3616856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18101	NC_021022	GGC	2	6	3616862	3616867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18102	NC_021022	GAGG	2	8	3616875	3616882	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
18103	NC_021022	TTC	2	6	3616893	3616898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18104	NC_021022	CCA	2	6	3616989	3616994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18105	NC_021022	ATC	2	6	3616999	3617004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18106	NC_021022	ACGGG	2	10	3617016	3617025	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
18107	NC_021022	CACC	2	8	3617115	3617122	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
18108	NC_021022	TCA	2	6	3617165	3617170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18109	NC_021022	CGC	2	6	3617259	3617264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18110	NC_021022	GCA	2	6	3617339	3617344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18111	NC_021022	AAAG	2	8	3617379	3617386	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18112	NC_021022	CGC	2	6	3617412	3617417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18113	NC_021022	GCC	2	6	3617425	3617430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18114	NC_021022	CCA	2	6	3617447	3617452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18115	NC_021022	GGCA	2	8	3617492	3617499	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18116	NC_021022	TTC	2	6	3617529	3617534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18117	NC_021022	TGC	2	6	3617540	3617545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18118	NC_021022	GGC	2	6	3617576	3617581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18119	NC_021022	GGACA	2	10	3617598	3617607	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
18120	NC_021022	GCT	2	6	3617650	3617655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18121	NC_021022	ACC	2	6	3617767	3617772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18122	NC_021022	ACA	2	6	3617780	3617785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18123	NC_021022	GGC	2	6	3617853	3617858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18124	NC_021022	CAG	2	6	3617902	3617907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18125	NC_021022	TCC	2	6	3617917	3617922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18126	NC_021022	GGA	2	6	3617925	3617930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18127	NC_021022	GCC	2	6	3617950	3617955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18128	NC_021022	GCC	2	6	3617959	3617964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18129	NC_021022	CAG	2	6	3618082	3618087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18130	NC_021022	AAAGCA	2	12	3618097	3618108	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18131	NC_021022	GCC	2	6	3618154	3618159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18132	NC_021022	GAG	2	6	3618277	3618282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18133	NC_021022	CCG	2	6	3618285	3618290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18134	NC_021022	GAGC	2	8	3618333	3618340	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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18142	NC_021022	ACAG	2	8	3620720	3620727	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18143	NC_021022	GCTG	2	8	3620766	3620773	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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18150	NC_021022	CAAG	2	8	3621276	3621283	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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18167	NC_021022	GCC	2	6	3622169	3622174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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18169	NC_021022	GAA	2	6	3622262	3622267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18170	NC_021022	CTG	2	6	3622280	3622285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18189	NC_021022	AATAT	2	10	3627057	3627066	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18194	NC_021022	TTC	2	6	3627130	3627135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18196	NC_021022	A	7	7	3627239	3627245	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18199	NC_021022	A	7	7	3627403	3627409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18200	NC_021022	CTTT	2	8	3627541	3627548	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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18211	NC_021022	GA	3	6	3629168	3629173	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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18224	NC_021022	GA	3	6	3632469	3632474	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18225	NC_021022	A	6	6	3632474	3632479	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18229	NC_021022	TTA	2	6	3632676	3632681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18233	NC_021022	N	794	794	3633100	3633893	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18238	NC_021022	GGT	2	6	3638376	3638381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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18240	NC_021022	CA	3	6	3638451	3638456	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18241	NC_021022	TAT	2	6	3638523	3638528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18242	NC_021022	AT	3	6	3638565	3638570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18243	NC_021022	GCT	2	6	3638612	3638617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18244	NC_021022	T	7	7	3638619	3638625	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18245	NC_021022	A	6	6	3638628	3638633	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18246	NC_021022	ATTT	2	8	3640696	3640703	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18249	NC_021022	GAA	2	6	3642054	3642059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18250	NC_021022	CTG	2	6	3642064	3642069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18251	NC_021022	GAT	2	6	3642128	3642133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18252	NC_021022	A	6	6	3642216	3642221	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18253	NC_021022	GAA	2	6	3642264	3642269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18254	NC_021022	GGC	2	6	3642287	3642292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18255	NC_021022	GCT	2	6	3642300	3642305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18256	NC_021022	GAA	2	6	3642309	3642314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18257	NC_021022	A	7	7	3642313	3642319	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18258	NC_021022	CA	3	6	3642351	3642356	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18259	NC_021022	A	6	6	3642356	3642361	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18260	NC_021022	GCC	2	6	3642368	3642373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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18373	NC_021022	TTTCG	2	10	3670132	3670141	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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18382	NC_021022	A	6	6	3672631	3672636	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18383	NC_021022	AAG	2	6	3672644	3672649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18384	NC_021022	TA	3	6	3672652	3672657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18385	NC_021022	A	6	6	3672662	3672667	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18386	NC_021022	TTGC	2	8	3672706	3672713	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18387	NC_021022	CAAA	2	8	3672743	3672750	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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