MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Ruminococcus obeum A2-162 draft genome

Total Repeats: 18975

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_021022	CCTC	2	8	3056478	3056485	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
15502	NC_021022	CAA	2	6	3056497	3056502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15503	NC_021022	CTG	2	6	3056520	3056525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15504	NC_021022	CGCACT	2	12	3056547	3056558	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
15505	NC_021022	GAT	2	6	3056569	3056574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15506	NC_021022	AT	3	6	3056573	3056578	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15507	NC_021022	TCA	2	6	3056616	3056621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15508	NC_021022	GAT	2	6	3056743	3056748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15509	NC_021022	TAT	2	6	3056896	3056901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15510	NC_021022	CGT	2	6	3057002	3057007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15511	NC_021022	TCT	2	6	3057076	3057081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15512	NC_021022	TGA	2	6	3057144	3057149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15513	NC_021022	AGT	2	6	3057153	3057158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15514	NC_021022	AGA	2	6	3057162	3057167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15515	NC_021022	TCT	2	6	3057273	3057278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15516	NC_021022	ATA	2	6	3057279	3057284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15517	NC_021022	AAATCA	2	12	3057363	3057374	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15518	NC_021022	AGA	2	6	3057405	3057410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15519	NC_021022	TCA	2	6	3057424	3057429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15520	NC_021022	GCG	2	6	3057518	3057523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15521	NC_021022	TGA	2	6	3057552	3057557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15522	NC_021022	TCA	2	6	3057576	3057581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15523	NC_021022	TCT	2	6	3057612	3057617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15524	NC_021022	GCA	2	6	3057658	3057663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15525	NC_021022	ACC	2	6	3057669	3057674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15526	NC_021022	CTT	2	6	3057712	3057717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15527	NC_021022	GAT	2	6	3057775	3057780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15528	NC_021022	CAT	2	6	3057811	3057816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15529	NC_021022	GAC	2	6	3057874	3057879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15530	NC_021022	TGAT	2	8	3057924	3057931	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15531	NC_021022	TTCC	2	8	3058237	3058244	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15532	NC_021022	CTTT	2	8	3058255	3058262	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15533	NC_021022	AGC	2	6	3058275	3058280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15534	NC_021022	CTT	2	6	3058342	3058347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15535	NC_021022	TC	3	6	3058435	3058440	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15536	NC_021022	T	7	7	3058441	3058447	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15537	NC_021022	T	6	6	3058494	3058499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15538	NC_021022	CTT	3	9	3058508	3058516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15539	NC_021022	CTTT	2	8	3058525	3058532	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15540	NC_021022	A	8	8	3058561	3058568	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15541	NC_021022	TCT	2	6	3058597	3058602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15542	NC_021022	CCT	2	6	3058861	3058866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15543	NC_021022	AGA	2	6	3058875	3058880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15544	NC_021022	TAACA	2	10	3058886	3058895	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
15545	NC_021022	CCT	2	6	3060277	3060282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15546	NC_021022	TTTG	2	8	3060288	3060295	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15547	NC_021022	ATT	2	6	3060311	3060316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15548	NC_021022	T	6	6	3060380	3060385	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15549	NC_021022	TA	4	8	3060398	3060405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15550	NC_021022	ATT	2	6	3060406	3060411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15551	NC_021022	TCT	2	6	3060429	3060434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15552	NC_021022	ATAA	2	8	3060491	3060498	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15553	NC_021022	ACC	2	6	3060511	3060516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15554	NC_021022	AG	3	6	3060549	3060554	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15555	NC_021022	ACC	2	6	3060561	3060566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15556	NC_021022	AG	3	6	3060601	3060606	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15557	NC_021022	ACC	2	6	3060613	3060618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15558	NC_021022	AAAAC	2	10	3065755	3065764	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
15559	NC_021022	CTT	2	6	3065812	3065817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15560	NC_021022	TCT	2	6	3068401	3068406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15561	NC_021022	TAT	2	6	3068431	3068436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15562	NC_021022	TAT	2	6	3069688	3069693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15563	NC_021022	A	6	6	3070597	3070602	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15564	NC_021022	ATA	2	6	3070604	3070609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15565	NC_021022	A	6	6	3070609	3070614	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15566	NC_021022	T	7	7	3070652	3070658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15567	NC_021022	A	7	7	3070704	3070710	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15568	NC_021022	AAATTG	2	12	3070796	3070807	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15569	NC_021022	TA	3	6	3070810	3070815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15570	NC_021022	ATA	2	6	3070853	3070858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15571	NC_021022	CAT	2	6	3070880	3070885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15572	NC_021022	TCC	2	6	3070916	3070921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15573	NC_021022	T	7	7	3070944	3070950	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15574	NC_021022	AAC	2	6	3070956	3070961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15575	NC_021022	TGC	2	6	3070976	3070981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15576	NC_021022	A	6	6	3071015	3071020	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15577	NC_021022	TA	3	6	3071029	3071034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15578	NC_021022	C	6	6	3071035	3071040	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15579	NC_021022	N	468	468	3071059	3071526	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15580	NC_021022	TAT	2	6	3071556	3071561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15581	NC_021022	TCT	2	6	3071707	3071712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15582	NC_021022	T	6	6	3073815	3073820	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15583	NC_021022	ATC	2	6	3073880	3073885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15584	NC_021022	T	7	7	3073901	3073907	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15585	NC_021022	TTC	2	6	3073943	3073948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15586	NC_021022	TTC	2	6	3073962	3073967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15587	NC_021022	CAC	2	6	3073972	3073977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15588	NC_021022	TCA	2	6	3073986	3073991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15589	NC_021022	CCAT	2	8	3073998	3074005	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15590	NC_021022	ATC	2	6	3074006	3074011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15591	NC_021022	CTGT	2	8	3074040	3074047	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15592	NC_021022	AAT	2	6	3074064	3074069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15593	NC_021022	CTTTT	2	10	3074198	3074207	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
15594	NC_021022	TCA	2	6	3074250	3074255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15595	NC_021022	CA	3	6	3074254	3074259	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15596	NC_021022	TCC	2	6	3074953	3074958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15597	NC_021022	TTA	2	6	3077255	3077260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15598	NC_021022	ATCAC	2	10	3077340	3077349	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
15599	NC_021022	T	6	6	3077427	3077432	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15600	NC_021022	C	6	6	3077441	3077446	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15601	NC_021022	CAA	2	6	3077527	3077532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15602	NC_021022	ACC	2	6	3077549	3077554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15603	NC_021022	GCT	2	6	3077615	3077620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15604	NC_021022	GTT	2	6	3077663	3077668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15605	NC_021022	ACA	2	6	3077670	3077675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15606	NC_021022	CAG	2	6	3077733	3077738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15607	NC_021022	TTC	3	9	3077744	3077752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15608	NC_021022	AATGA	2	10	3077966	3077975	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
15609	NC_021022	TTC	2	6	3077984	3077989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15610	NC_021022	TTG	2	6	3078006	3078011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15611	NC_021022	TCT	3	9	3078027	3078035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15612	NC_021022	TCG	2	6	3078048	3078053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15613	NC_021022	GAA	2	6	3078059	3078064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15614	NC_021022	TGC	2	6	3078083	3078088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15615	NC_021022	CCG	3	9	3078111	3078119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15616	NC_021022	CAC	2	6	3078172	3078177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15617	NC_021022	TCA	2	6	3078255	3078260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15618	NC_021022	CAC	2	6	3078289	3078294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15619	NC_021022	AAT	2	6	3078322	3078327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15620	NC_021022	GTA	2	6	3078335	3078340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15621	NC_021022	CAG	2	6	3078387	3078392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15622	NC_021022	T	6	6	3078407	3078412	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15623	NC_021022	CA	3	6	3078413	3078418	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15624	NC_021022	GTT	2	6	3078426	3078431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15625	NC_021022	AC	3	6	3078467	3078472	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15626	NC_021022	CCG	2	6	3078525	3078530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15627	NC_021022	GAA	2	6	3078635	3078640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15628	NC_021022	CTTC	2	8	3078654	3078661	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15629	NC_021022	N	433	433	3078797	3079229	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15760	NC_021022	GGA	2	6	3099032	3099037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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15763	NC_021022	CTC	2	6	3102726	3102731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15764	NC_021022	TTTC	2	8	3102738	3102745	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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15768	NC_021022	A	6	6	3102860	3102865	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15769	NC_021022	TAA	2	6	3102871	3102876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15770	NC_021022	GTTTA	2	10	3102877	3102886	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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15772	NC_021022	TA	3	6	3103259	3103264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15773	NC_021022	T	6	6	3103588	3103593	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15781	NC_021022	T	6	6	3103805	3103810	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15782	NC_021022	A	6	6	3103872	3103877	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15783	NC_021022	T	6	6	3103893	3103898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15794	NC_021022	TTCT	2	8	3104365	3104372	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15795	NC_021022	CT	3	6	3104371	3104376	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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15882	NC_021022	A	6	6	3127514	3127519	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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