MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Ruminococcus obeum A2-162 draft genome

Total Repeats: 18975

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12003	NC_021022	GCAA	2	8	2357785	2357792	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12004	NC_021022	GAA	2	6	2357809	2357814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12005	NC_021022	GCT	2	6	2358527	2358532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12006	NC_021022	AAG	2	6	2358551	2358556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12007	NC_021022	GATG	2	8	2358559	2358566	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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12016	NC_021022	TGAC	2	8	2359557	2359564	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12017	NC_021022	CGTC	2	8	2359594	2359601	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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12114	NC_021022	TAA	2	6	2384072	2384077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12115	NC_021022	GA	3	6	2384150	2384155	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12116	NC_021022	TA	4	8	2384156	2384163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12117	NC_021022	TTAA	2	8	2384186	2384193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12127	NC_021022	TTA	2	6	2384735	2384740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12129	NC_021022	A	6	6	2384807	2384812	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12131	NC_021022	AAAC	2	8	2384855	2384862	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12132	NC_021022	AAAC	2	8	2384895	2384902	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12133	NC_021022	AGG	2	6	2384913	2384918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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12135	NC_021022	GAA	2	6	2385511	2385516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12137	NC_021022	TAA	2	6	2385568	2385573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12258	NC_021022	TCA	2	6	2398888	2398893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12259	NC_021022	GCG	2	6	2398906	2398911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12260	NC_021022	CCG	2	6	2398943	2398948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12261	NC_021022	AAAG	2	8	2398955	2398962	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12262	NC_021022	TGA	2	6	2399086	2399091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12263	NC_021022	AG	3	6	2399164	2399169	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12264	NC_021022	AAG	2	6	2399214	2399219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12265	NC_021022	GA	3	6	2399266	2399271	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12266	NC_021022	TCG	2	6	2399290	2399295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12267	NC_021022	TTCC	2	8	2399313	2399320	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12268	NC_021022	GCA	2	6	2399322	2399327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12269	NC_021022	ATC	2	6	2399332	2399337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12270	NC_021022	GCC	2	6	2399533	2399538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12271	NC_021022	ATG	2	6	2399640	2399645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12272	NC_021022	CGG	2	6	2399657	2399662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12273	NC_021022	GAATC	2	10	2399813	2399822	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12274	NC_021022	CACAG	2	10	2399837	2399846	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
12275	NC_021022	AGT	2	6	2399910	2399915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12277	NC_021022	CTGC	2	8	2399942	2399949	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12278	NC_021022	GCA	2	6	2399968	2399973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12279	NC_021022	TACA	2	8	2400105	2400112	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12280	NC_021022	ATA	2	6	2400134	2400139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12281	NC_021022	A	7	7	2400139	2400145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12282	NC_021022	A	7	7	2400151	2400157	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12283	NC_021022	AAG	2	6	2400193	2400198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12284	NC_021022	GAAA	2	8	2400215	2400222	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12285	NC_021022	CAA	2	6	2400270	2400275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12286	NC_021022	A	7	7	2400274	2400280	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12287	NC_021022	GTT	2	6	2400304	2400309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12288	NC_021022	AAG	2	6	2400358	2400363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12289	NC_021022	AAACCG	2	12	2400394	2400405	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12290	NC_021022	GAG	2	6	2400482	2400487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12291	NC_021022	GC	3	6	2400530	2400535	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12292	NC_021022	TTC	2	6	2400536	2400541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12293	NC_021022	TGA	2	6	2400663	2400668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12294	NC_021022	TCCA	2	8	2400766	2400773	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12295	NC_021022	GCT	2	6	2400828	2400833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12296	NC_021022	GCA	2	6	2400850	2400855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12297	NC_021022	AAG	2	6	2400914	2400919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12298	NC_021022	AAGA	2	8	2401041	2401048	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12299	NC_021022	GTT	2	6	2401057	2401062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12300	NC_021022	A	6	6	2402365	2402370	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12301	NC_021022	T	6	6	2402396	2402401	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12302	NC_021022	ATG	2	6	2402406	2402411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12303	NC_021022	AT	3	6	2402412	2402417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12304	NC_021022	CAG	2	6	2402430	2402435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12305	NC_021022	CAG	2	6	2402446	2402451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12306	NC_021022	AGG	2	6	2402454	2402459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12307	NC_021022	ATG	2	6	2402495	2402500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12308	NC_021022	ATGG	2	8	2402506	2402513	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12309	NC_021022	TGA	2	6	2402541	2402546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12310	NC_021022	AGA	2	6	2402556	2402561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12311	NC_021022	AGA	2	6	2402568	2402573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12312	NC_021022	CAA	2	6	2402622	2402627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12313	NC_021022	ATC	2	6	2402645	2402650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12314	NC_021022	AGA	3	9	2402659	2402667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12315	NC_021022	N	464	464	2402723	2403186	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12316	NC_021022	TGC	2	6	2403228	2403233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12317	NC_021022	CTT	2	6	2403247	2403252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12318	NC_021022	T	7	7	2403251	2403257	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12319	NC_021022	GTA	2	6	2403320	2403325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12320	NC_021022	A	6	6	2403342	2403347	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12321	NC_021022	TTA	2	6	2403353	2403358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12322	NC_021022	TAA	2	6	2403359	2403364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12323	NC_021022	TG	3	6	2403397	2403402	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12324	NC_021022	AG	4	8	2403407	2403414	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12325	NC_021022	GAA	2	6	2403420	2403425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12326	NC_021022	A	7	7	2403488	2403494	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12327	NC_021022	ATC	2	6	2403520	2403525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12328	NC_021022	GGT	2	6	2403648	2403653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12329	NC_021022	CTT	2	6	2403711	2403716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12330	NC_021022	AAGA	2	8	2403798	2403805	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12331	NC_021022	CGG	2	6	2403854	2403859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12332	NC_021022	GAAA	2	8	2403873	2403880	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12333	NC_021022	GAA	2	6	2403888	2403893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12334	NC_021022	AAAG	2	8	2403902	2403909	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12335	NC_021022	CGT	2	6	2403945	2403950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12336	NC_021022	GAAGA	2	10	2403980	2403989	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
12337	NC_021022	TTC	2	6	2404028	2404033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12339	NC_021022	TTC	2	6	2404229	2404234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12340	NC_021022	TGAA	2	8	2404243	2404250	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12341	NC_021022	GAGCC	2	10	2404269	2404278	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
12342	NC_021022	TGA	2	6	2404373	2404378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12343	NC_021022	AGC	2	6	2404397	2404402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12344	NC_021022	TAA	2	6	2404509	2404514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12345	NC_021022	CA	3	6	2406234	2406239	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12346	NC_021022	GGA	2	6	2406240	2406245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12347	NC_021022	ATTC	2	8	2410211	2410218	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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12351	NC_021022	ATC	2	6	2411280	2411285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12352	NC_021022	AG	3	6	2411296	2411301	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12353	NC_021022	TTCTT	2	10	2411325	2411334	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
12354	NC_021022	A	7	7	2411346	2411352	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12355	NC_021022	ATG	2	6	2411394	2411399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12356	NC_021022	AGG	2	6	2411410	2411415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12357	NC_021022	GGC	2	6	2413736	2413741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12358	NC_021022	A	7	7	2413751	2413757	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12359	NC_021022	AT	3	6	2413851	2413856	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12360	NC_021022	ATC	2	6	2414012	2414017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12361	NC_021022	AGA	2	6	2415359	2415364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12362	NC_021022	CAG	2	6	2415366	2415371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12363	NC_021022	AGA	2	6	2415382	2415387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12364	NC_021022	AAGT	2	8	2418153	2418160	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12365	NC_021022	TA	3	6	2418194	2418199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12366	NC_021022	AAGA	2	8	2418205	2418212	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12367	NC_021022	AGA	2	6	2418215	2418220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12368	NC_021022	GA	3	6	2418222	2418227	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12369	NC_021022	TAA	2	6	2422078	2422083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12370	NC_021022	GTT	2	6	2422091	2422096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12371	NC_021022	TGC	2	6	2422139	2422144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12372	NC_021022	CCT	2	6	2423025	2423030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12373	NC_021022	TGA	2	6	2423031	2423036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12374	NC_021022	AAAAT	2	10	2423037	2423046	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12375	NC_021022	AT	3	6	2423045	2423050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12376	NC_021022	TAT	2	6	2423107	2423112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12377	NC_021022	TGA	2	6	2423170	2423175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12378	NC_021022	TA	4	8	2423189	2423196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12379	NC_021022	CGG	2	6	2423205	2423210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12380	NC_021022	GAT	2	6	2423219	2423224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12381	NC_021022	AGG	2	6	2423268	2423273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12382	NC_021022	TTTG	2	8	2423287	2423294	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12383	NC_021022	TC	3	6	2423335	2423340	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12384	NC_021022	AG	3	6	2423421	2423426	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12385	NC_021022	GAA	2	6	2423432	2423437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12386	NC_021022	AAT	2	6	2423443	2423448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12387	NC_021022	GA	3	6	2423455	2423460	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12388	NC_021022	GTTT	2	8	2423481	2423488	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12389	NC_021022	T	6	6	2423567	2423572	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12390	NC_021022	TAT	2	6	2423579	2423584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12391	NC_021022	GCGG	2	8	2423617	2423624	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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12402	NC_021022	TAT	2	6	2425288	2425293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12430	NC_021022	CTT	2	6	2426835	2426840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12481	NC_021022	A	6	6	2434439	2434444	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12482	NC_021022	AAT	2	6	2435611	2435616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12497	NC_021022	TATCA	2	10	2446373	2446382	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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