MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Ruminococcus obeum A2-162 draft genome

Total Repeats: 18975

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_021022	AGG	2	6	2160423	2160428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11002	NC_021022	AGG	2	6	2160842	2160847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11003	NC_021022	AT	3	6	2161339	2161344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11004	NC_021022	AT	3	6	2161353	2161358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11005	NC_021022	TGA	2	6	2162023	2162028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11006	NC_021022	AGA	2	6	2162583	2162588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11007	NC_021022	TAA	2	6	2163574	2163579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11008	NC_021022	GCA	2	6	2163618	2163623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11009	NC_021022	GGA	2	6	2163642	2163647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11010	NC_021022	TCT	2	6	2164324	2164329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11011	NC_021022	A	6	6	2164346	2164351	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11012	NC_021022	ATC	2	6	2164418	2164423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11013	NC_021022	TTC	2	6	2164426	2164431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11014	NC_021022	CTT	2	6	2164451	2164456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11015	NC_021022	GAT	2	6	2164484	2164489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11016	NC_021022	GAAA	2	8	2164509	2164516	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11017	NC_021022	GTCT	2	8	2164541	2164548	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11018	NC_021022	CAAAG	2	10	2164555	2164564	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
11019	NC_021022	AGAAA	2	10	2164668	2164677	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
11020	NC_021022	AAG	2	6	2164695	2164700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11021	NC_021022	CTT	2	6	2164709	2164714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11022	NC_021022	CGG	2	6	2164765	2164770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11023	NC_021022	T	6	6	2164826	2164831	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11024	NC_021022	ATGAA	2	10	2164932	2164941	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11025	NC_021022	AGG	2	6	2165013	2165018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11026	NC_021022	TTC	2	6	2165023	2165028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11027	NC_021022	TCA	2	6	2165065	2165070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11028	NC_021022	ATG	2	6	2165098	2165103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11029	NC_021022	TA	3	6	2165110	2165115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11030	NC_021022	GAT	2	6	2165182	2165187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11031	NC_021022	GAG	2	6	2166639	2166644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11032	NC_021022	ATTT	2	8	2167974	2167981	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11033	NC_021022	T	6	6	2168824	2168829	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11034	NC_021022	AGA	2	6	2168841	2168846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11035	NC_021022	ATAA	2	8	2168904	2168911	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11036	NC_021022	TTC	2	6	2168939	2168944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11037	NC_021022	ATT	2	6	2169039	2169044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11038	NC_021022	GAT	2	6	2169073	2169078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11039	NC_021022	A	8	8	2170127	2170134	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11040	NC_021022	A	7	7	2170136	2170142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11041	NC_021022	GTG	2	6	2170340	2170345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11042	NC_021022	T	6	6	2170374	2170379	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11043	NC_021022	GTG	2	6	2170439	2170444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11044	NC_021022	TGT	2	6	2170609	2170614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11045	NC_021022	AAG	2	6	2170638	2170643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11046	NC_021022	A	8	8	2170666	2170673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11047	NC_021022	GGAAAG	2	12	2170700	2170711	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11048	NC_021022	AT	3	6	2170740	2170745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11049	NC_021022	CAG	2	6	2170747	2170752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11050	NC_021022	GGT	2	6	2170853	2170858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11051	NC_021022	AGT	2	6	2170876	2170881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11052	NC_021022	AGT	2	6	2170904	2170909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11053	NC_021022	GAT	2	6	2170996	2171001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11054	NC_021022	GAA	3	9	2171006	2171014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11055	NC_021022	AGA	2	6	2171046	2171051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11056	NC_021022	GCA	2	6	2171066	2171071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11057	NC_021022	TGA	2	6	2171203	2171208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11058	NC_021022	GAT	2	6	2171222	2171227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11059	NC_021022	TCG	2	6	2171232	2171237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11060	NC_021022	ATGA	2	8	2171300	2171307	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11061	NC_021022	GAA	2	6	2171341	2171346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11062	NC_021022	ACA	2	6	2171394	2171399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11063	NC_021022	GAA	2	6	2171425	2171430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11064	NC_021022	GAA	2	6	2171450	2171455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11065	NC_021022	TGG	2	6	2171482	2171487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11066	NC_021022	A	6	6	2171559	2171564	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11067	NC_021022	ATTAT	2	10	2173728	2173737	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11068	NC_021022	GAATT	2	10	2173744	2173753	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11069	NC_021022	GAA	2	6	2173756	2173761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11070	NC_021022	GGA	2	6	2173773	2173778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11071	NC_021022	TCC	2	6	2173789	2173794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11072	NC_021022	TAA	2	6	2173799	2173804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11073	NC_021022	A	6	6	2173803	2173808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11074	NC_021022	GGCA	2	8	2173851	2173858	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11075	NC_021022	GAAA	2	8	2173890	2173897	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11076	NC_021022	A	6	6	2173968	2173973	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11077	NC_021022	AT	3	6	2173995	2174000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11078	NC_021022	GTG	2	6	2174048	2174053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11081	NC_021022	ATG	2	6	2174171	2174176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11082	NC_021022	TGCA	2	8	2174189	2174196	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11083	NC_021022	CGT	2	6	2174209	2174214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11084	NC_021022	GATC	2	8	2174241	2174248	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11085	NC_021022	AGA	2	6	2174361	2174366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11086	NC_021022	TCA	2	6	2174385	2174390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11087	NC_021022	TGCT	2	8	2174507	2174514	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11088	NC_021022	CAA	2	6	2174574	2174579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11089	NC_021022	AGA	2	6	2174610	2174615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11090	NC_021022	AG	3	6	2174650	2174655	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11091	NC_021022	AAAG	2	8	2176462	2176469	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11092	NC_021022	A	6	6	2176482	2176487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11093	NC_021022	TAAA	2	8	2176491	2176498	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11094	NC_021022	TAA	3	9	2176559	2176567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11095	NC_021022	A	9	9	2176580	2176588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11096	NC_021022	TTACT	2	10	2178939	2178948	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11097	NC_021022	A	7	7	2178992	2178998	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11098	NC_021022	AT	3	6	2179013	2179018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11099	NC_021022	ATT	2	6	2179023	2179028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11100	NC_021022	GCA	2	6	2179074	2179079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11101	NC_021022	N	282	282	2179136	2179417	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11102	NC_021022	TCT	2	6	2179463	2179468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11103	NC_021022	CGC	2	6	2179469	2179474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11104	NC_021022	TAAAA	2	10	2179475	2179484	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11105	NC_021022	A	7	7	2179499	2179505	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11106	NC_021022	CTGG	2	8	2179535	2179542	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11107	NC_021022	GGA	2	6	2179596	2179601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11108	NC_021022	TCT	2	6	2179664	2179669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11109	NC_021022	GCA	2	6	2179671	2179676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11110	NC_021022	ATC	2	6	2179677	2179682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11111	NC_021022	ATT	2	6	2179699	2179704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11112	NC_021022	AGT	2	6	2179739	2179744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11113	NC_021022	ATGT	2	8	2179755	2179762	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11114	NC_021022	ATT	2	6	2179791	2179796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11115	NC_021022	ATT	2	6	2179830	2179835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11116	NC_021022	GTT	2	6	2179857	2179862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11117	NC_021022	ATT	2	6	2179866	2179871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11118	NC_021022	GAAA	2	8	2179993	2180000	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11119	NC_021022	A	6	6	2180020	2180025	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11120	NC_021022	TGA	2	6	2180036	2180041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11121	NC_021022	AG	3	6	2180070	2180075	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11122	NC_021022	ATT	2	6	2180108	2180113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11123	NC_021022	A	7	7	2180117	2180123	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11124	NC_021022	A	6	6	2180127	2180132	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11125	NC_021022	ACA	2	6	2181398	2181403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11126	NC_021022	TAA	2	6	2181418	2181423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11127	NC_021022	TGC	2	6	2181448	2181453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11128	NC_021022	GGC	2	6	2181463	2181468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11129	NC_021022	T	6	6	2181470	2181475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11130	NC_021022	TA	4	8	2181479	2181486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11131	NC_021022	AGG	2	6	2181488	2181493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11132	NC_021022	AATATC	2	12	2183090	2183101	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11133	NC_021022	ACAG	2	8	2183150	2183157	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11134	NC_021022	AAGG	2	8	2183162	2183169	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11135	NC_021022	TGCT	2	8	2184378	2184385	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11136	NC_021022	T	9	9	2184396	2184404	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11140	NC_021022	A	6	6	2190227	2190232	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11153	NC_021022	GACA	2	8	2192393	2192400	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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11248	NC_021022	GAAGA	2	10	2212373	2212382	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
11249	NC_021022	A	6	6	2212423	2212428	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11250	NC_021022	TGT	2	6	2212497	2212502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11251	NC_021022	CTT	2	6	2212507	2212512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11252	NC_021022	CGGG	2	8	2212517	2212524	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11253	NC_021022	TGC	2	6	2212544	2212549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11255	NC_021022	GA	3	6	2212617	2212622	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11256	NC_021022	CAT	2	6	2212642	2212647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11259	NC_021022	TAA	2	6	2213959	2213964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11260	NC_021022	GCT	2	6	2214003	2214008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11261	NC_021022	GATT	2	8	2216217	2216224	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11262	NC_021022	TTC	2	6	2216258	2216263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11263	NC_021022	TGATT	2	10	2216266	2216275	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
11264	NC_021022	AGA	2	6	2216278	2216283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11265	NC_021022	T	6	6	2216319	2216324	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11266	NC_021022	T	7	7	2216332	2216338	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11267	NC_021022	GGCG	2	8	2216372	2216379	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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11274	NC_021022	GTCC	2	8	2216577	2216584	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11275	NC_021022	AG	3	6	2216599	2216604	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11276	NC_021022	T	7	7	2216619	2216625	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11281	NC_021022	A	7	7	2216990	2216996	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11282	NC_021022	AAT	2	6	2217006	2217011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11292	NC_021022	AGC	2	6	2217616	2217621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11294	NC_021022	AAC	2	6	2217695	2217700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11381	NC_021022	GAG	2	6	2227260	2227265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11383	NC_021022	TATAA	2	10	2228405	2228414	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11384	NC_021022	ATT	2	6	2228447	2228452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11385	NC_021022	ATGG	2	8	2228469	2228476	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11386	NC_021022	T	7	7	2228480	2228486	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11387	NC_021022	A	7	7	2228508	2228514	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11500	NC_021022	T	6	6	2255794	2255799	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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