MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Ruminococcus torques L2-14 draft genome

Total Repeats: 16858

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_021015	CTTTT	2	10	796893	796902	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4002	NC_021015	TAAAA	2	10	796917	796926	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_021015	GAAT	2	8	796941	796948	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_021015	A	6	6	796968	796973	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_021015	AAAG	2	8	798266	798273	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_021015	CTTT	2	8	798312	798319	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4007	NC_021015	TAT	2	6	798343	798348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_021015	CTT	2	6	798387	798392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4009	NC_021015	CT	3	6	799663	799668	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4010	NC_021015	TCT	2	6	799723	799728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_021015	TTTC	2	8	800532	800539	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4012	NC_021015	TC	3	6	800541	800546	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4013	NC_021015	GCA	2	6	800644	800649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_021015	AT	3	6	800749	800754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_021015	T	6	6	800754	800759	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_021015	TGT	2	6	800781	800786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_021015	ATG	2	6	801007	801012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_021015	GCAT	2	8	801037	801044	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4019	NC_021015	CTGA	2	8	801045	801052	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4020	NC_021015	CATC	2	8	801142	801149	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4021	NC_021015	TCC	2	6	801171	801176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4022	NC_021015	GAA	2	6	801207	801212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_021015	TAAA	2	8	801269	801276	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_021015	CTG	2	6	801290	801295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_021015	TAA	2	6	801777	801782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_021015	ATC	2	6	801783	801788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4027	NC_021015	ATT	2	6	801791	801796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_021015	ATC	2	6	801808	801813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4029	NC_021015	A	7	7	801826	801832	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_021015	AAT	2	6	801836	801841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_021015	TC	3	6	801870	801875	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4032	NC_021015	T	6	6	801876	801881	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_021015	TTC	2	6	801906	801911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4034	NC_021015	T	6	6	802999	803004	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_021015	ATT	2	6	803058	803063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_021015	T	7	7	803356	803362	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_021015	ACC	2	6	803383	803388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4038	NC_021015	AAG	2	6	803391	803396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_021015	CCAA	2	8	803474	803481	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4040	NC_021015	TGTA	2	8	803578	803585	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_021015	TAA	2	6	803586	803591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_021015	A	6	6	803590	803595	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_021015	AAATA	2	10	803602	803611	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_021015	A	7	7	803617	803623	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_021015	ATA	2	6	803633	803638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_021015	ATT	2	6	803680	803685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_021015	T	6	6	803687	803692	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_021015	A	7	7	803696	803702	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_021015	CTTC	2	8	803706	803713	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4050	NC_021015	CTT	2	6	805943	805948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4051	NC_021015	TTG	2	6	808416	808421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_021015	ACC	2	6	808427	808432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4053	NC_021015	TCA	2	6	808439	808444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4054	NC_021015	CAT	2	6	808543	808548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4055	NC_021015	ACA	2	6	808551	808556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4056	NC_021015	ATC	2	6	808560	808565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4057	NC_021015	TTC	2	6	808577	808582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4058	NC_021015	ATA	2	6	808604	808609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_021015	TCC	2	6	808635	808640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4060	NC_021015	TA	3	6	808661	808666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_021015	GAAA	2	8	808689	808696	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_021015	TA	3	6	808706	808711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_021015	TAC	2	6	808741	808746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4064	NC_021015	T	6	6	808752	808757	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_021015	TCCTT	2	10	808875	808884	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
4066	NC_021015	T	7	7	808950	808956	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_021015	GTTT	2	8	808969	808976	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_021015	CTC	2	6	809003	809008	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4069	NC_021015	T	7	7	809032	809038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_021015	TTTTCT	2	12	809046	809057	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4071	NC_021015	TTA	2	6	809149	809154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_021015	TCT	2	6	809158	809163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4073	NC_021015	TCC	2	6	810638	810643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4074	NC_021015	TCT	2	6	810651	810656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4075	NC_021015	TC	3	6	810729	810734	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4076	NC_021015	CTC	2	6	810745	810750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4077	NC_021015	ATA	2	6	810754	810759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_021015	TTC	2	6	810781	810786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4079	NC_021015	CATT	2	8	810911	810918	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4080	NC_021015	T	7	7	810958	810964	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_021015	TGA	2	6	811072	811077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_021015	CCT	2	6	811098	811103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4083	NC_021015	GCCA	2	8	811128	811135	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4084	NC_021015	TTTA	2	8	811139	811146	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_021015	CAAAA	2	10	811164	811173	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
4086	NC_021015	TAT	2	6	811227	811232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_021015	TCAT	2	8	811246	811253	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4088	NC_021015	AAG	2	6	811258	811263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_021015	TCC	2	6	811287	811292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4090	NC_021015	A	7	7	811322	811328	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_021015	T	6	6	811387	811392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_021015	AAG	2	6	811419	811424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_021015	CTA	2	6	811439	811444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4095	NC_021015	AAT	2	6	814103	814108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_021015	AAATA	2	10	814115	814124	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_021015	ATA	2	6	814139	814144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_021015	TA	3	6	814189	814194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_021015	A	8	8	814326	814333	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_021015	T	7	7	814371	814377	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_021015	CCA	2	6	814423	814428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4102	NC_021015	CAT	2	6	814430	814435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4103	NC_021015	CAA	2	6	814453	814458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4104	NC_021015	TCC	2	6	815878	815883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4105	NC_021015	TTAT	2	8	815974	815981	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_021015	TCT	2	6	815997	816002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4107	NC_021015	GTCACG	2	12	816052	816063	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4108	NC_021015	GAC	2	6	816135	816140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4109	NC_021015	ATC	2	6	816166	816171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4110	NC_021015	GTA	2	6	816184	816189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_021015	TCT	2	6	816314	816319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4112	NC_021015	TCA	2	6	816335	816340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4113	NC_021015	ACA	2	6	816365	816370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4114	NC_021015	TCA	3	9	816425	816433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4115	NC_021015	GTA	2	6	816548	816553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_021015	AGA	2	6	816693	816698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_021015	CT	3	6	816721	816726	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4118	NC_021015	TTTC	2	8	816802	816809	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4119	NC_021015	TTC	2	6	816881	816886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4120	NC_021015	TTA	2	6	816980	816985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_021015	CTG	2	6	817056	817061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4122	NC_021015	AAT	2	6	817072	817077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_021015	TCC	2	6	817135	817140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4124	NC_021015	TGAA	2	8	817217	817224	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_021015	CTT	2	6	817225	817230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4126	NC_021015	CCA	2	6	817231	817236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4127	NC_021015	CT	3	6	817239	817244	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4128	NC_021015	ATT	2	6	817249	817254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_021015	CCG	2	6	817301	817306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4130	NC_021015	T	6	6	817402	817407	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_021015	TAT	2	6	817512	817517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_021015	CATA	2	8	817581	817588	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4133	NC_021015	TACA	2	8	817695	817702	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4134	NC_021015	TCA	2	6	817706	817711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4135	NC_021015	TA	3	6	817766	817771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4136	NC_021015	TC	3	6	817840	817845	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4137	NC_021015	CATT	2	8	817858	817865	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4138	NC_021015	AC	3	6	817866	817871	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4139	NC_021015	CGC	2	6	817884	817889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4140	NC_021015	CCG	2	6	817898	817903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4141	NC_021015	AC	3	6	817927	817932	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4142	NC_021015	TCA	2	6	818065	818070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4259	NC_021015	CATTT	2	10	837470	837479	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4260	NC_021015	T	7	7	837923	837929	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4261	NC_021015	T	6	6	837947	837952	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4262	NC_021015	CTT	2	6	837954	837959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4264	NC_021015	ATT	2	6	839117	839122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4265	NC_021015	ATT	2	6	839136	839141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4266	NC_021015	AAG	2	6	839182	839187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4267	NC_021015	TTC	2	6	842186	842191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4268	NC_021015	CT	3	6	842214	842219	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4269	NC_021015	CT	3	6	845427	845432	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4270	NC_021015	A	6	6	845470	845475	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4271	NC_021015	GTAT	2	8	845512	845519	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4272	NC_021015	TCT	2	6	845559	845564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4273	NC_021015	TAAA	2	8	845575	845582	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4274	NC_021015	TA	3	6	845609	845614	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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