MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Ruminococcus torques L2-14 draft genome

Total Repeats: 16858

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_021015	AT	3	6	3184004	3184009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16002	NC_021015	GAA	3	9	3184033	3184041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16003	NC_021015	A	6	6	3187049	3187054	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16004	NC_021015	GGT	2	6	3188056	3188061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16005	NC_021015	TTA	2	6	3188599	3188604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16006	NC_021015	TCT	2	6	3188700	3188705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16007	NC_021015	TCTT	2	8	3188725	3188732	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16008	NC_021015	AT	3	6	3188772	3188777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16009	NC_021015	AT	3	6	3188782	3188787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16010	NC_021015	GA	3	6	3188817	3188822	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16011	NC_021015	CTT	2	6	3188890	3188895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16012	NC_021015	ATGA	2	8	3188904	3188911	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16013	NC_021015	AAT	2	6	3188912	3188917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16014	NC_021015	TC	3	6	3188969	3188974	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16015	NC_021015	TAA	2	6	3189001	3189006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16016	NC_021015	GT	3	6	3189095	3189100	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16017	NC_021015	CGG	2	6	3189118	3189123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16018	NC_021015	TTGC	2	8	3189229	3189236	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16019	NC_021015	CATT	2	8	3196657	3196664	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16020	NC_021015	GT	3	6	3198039	3198044	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16021	NC_021015	TGA	2	6	3198072	3198077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16022	NC_021015	CTT	2	6	3198082	3198087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16023	NC_021015	CGC	2	6	3198126	3198131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16024	NC_021015	CTCG	2	8	3198156	3198163	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16025	NC_021015	CCT	2	6	3198833	3198838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16026	NC_021015	GTAT	2	8	3198845	3198852	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16027	NC_021015	ATT	2	6	3198898	3198903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16028	NC_021015	CAA	2	6	3198958	3198963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16029	NC_021015	GGC	2	6	3199233	3199238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16030	NC_021015	TGT	2	6	3199339	3199344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16031	NC_021015	AAAG	2	8	3199354	3199361	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16032	NC_021015	CAA	2	6	3199384	3199389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16033	NC_021015	GAA	2	6	3199398	3199403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16034	NC_021015	A	6	6	3199451	3199456	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16035	NC_021015	GGAA	2	8	3199471	3199478	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16036	NC_021015	AGAA	2	8	3199488	3199495	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16037	NC_021015	GAA	2	6	3199500	3199505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16038	NC_021015	A	6	6	3199509	3199514	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16039	NC_021015	GGA	2	6	3199539	3199544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16040	NC_021015	GAG	2	6	3199575	3199580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16041	NC_021015	CTT	2	6	3199604	3199609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16042	NC_021015	AAAC	2	8	3199621	3199628	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16043	NC_021015	AGAA	2	8	3199654	3199661	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16044	NC_021015	GGA	2	6	3199676	3199681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16045	NC_021015	ATG	2	6	3202437	3202442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16046	NC_021015	TGAA	3	12	3202482	3202493	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16047	NC_021015	A	6	6	3202547	3202552	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16048	NC_021015	A	7	7	3202571	3202577	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16049	NC_021015	GAA	2	6	3202600	3202605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16050	NC_021015	A	6	6	3202607	3202612	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16051	NC_021015	ATA	2	6	3202641	3202646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16052	NC_021015	TTGA	2	8	3202647	3202654	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16053	NC_021015	GAT	2	6	3202656	3202661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16054	NC_021015	ATT	2	6	3202687	3202692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16055	NC_021015	ATG	2	6	3202723	3202728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16056	NC_021015	ATG	2	6	3202759	3202764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16057	NC_021015	TGCGCT	2	12	3202769	3202780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16058	NC_021015	ATT	2	6	3202818	3202823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16059	NC_021015	ATT	4	12	3202854	3202865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16060	NC_021015	TGA	2	6	3202916	3202921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16061	NC_021015	AAT	2	6	3203010	3203015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16062	NC_021015	AAAGG	2	10	3203153	3203162	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
16063	NC_021015	AC	3	6	3203217	3203222	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16064	NC_021015	AGA	2	6	3203258	3203263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16065	NC_021015	GGA	2	6	3203309	3203314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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16068	NC_021015	TA	3	6	3205989	3205994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16069	NC_021015	CGG	2	6	3205996	3206001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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16071	NC_021015	ATT	2	6	3206085	3206090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16072	NC_021015	TCAA	2	8	3206352	3206359	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16073	NC_021015	T	6	6	3206363	3206368	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16074	NC_021015	TCATTT	2	12	3206404	3206415	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16075	NC_021015	T	6	6	3206413	3206418	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16076	NC_021015	T	7	7	3206437	3206443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16077	NC_021015	TGG	2	6	3206480	3206485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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16079	NC_021015	ATA	2	6	3206567	3206572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16080	NC_021015	ATT	2	6	3206583	3206588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16084	NC_021015	TAA	2	6	3208263	3208268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16085	NC_021015	TAA	2	6	3208314	3208319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16086	NC_021015	GCAA	2	8	3209154	3209161	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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16092	NC_021015	T	7	7	3210177	3210183	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16093	NC_021015	AGA	2	6	3210186	3210191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16094	NC_021015	GCAG	2	8	3210196	3210203	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16095	NC_021015	CTG	2	6	3210235	3210240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16096	NC_021015	ATT	2	6	3210259	3210264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16097	NC_021015	TCT	2	6	3210306	3210311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16098	NC_021015	CGC	2	6	3210331	3210336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16099	NC_021015	CAT	2	6	3210364	3210369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16100	NC_021015	GGCA	2	8	3210482	3210489	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16101	NC_021015	GCTTC	2	10	3210502	3210511	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
16102	NC_021015	GAA	2	6	3210521	3210526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16103	NC_021015	ATA	2	6	3210584	3210589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16104	NC_021015	GA	3	6	3210672	3210677	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16105	NC_021015	AGG	2	6	3210735	3210740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16106	NC_021015	ATTT	2	8	3211052	3211059	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16108	NC_021015	T	6	6	3211137	3211142	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16109	NC_021015	T	6	6	3212813	3212818	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16110	NC_021015	A	7	7	3212836	3212842	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16111	NC_021015	AGG	2	6	3212845	3212850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16112	NC_021015	TG	3	6	3214614	3214619	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16113	NC_021015	T	6	6	3214623	3214628	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16114	NC_021015	TAC	2	6	3214733	3214738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16115	NC_021015	CAT	2	6	3214749	3214754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16116	NC_021015	CAT	2	6	3214758	3214763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16117	NC_021015	CAT	2	6	3214770	3214775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16118	NC_021015	A	6	6	3215383	3215388	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16119	NC_021015	TAC	2	6	3215419	3215424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16120	NC_021015	ACA	2	6	3215435	3215440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16121	NC_021015	GAA	2	6	3215458	3215463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16122	NC_021015	A	6	6	3215503	3215508	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16123	NC_021015	GAG	2	6	3215545	3215550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16124	NC_021015	T	6	6	3215558	3215563	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16125	NC_021015	A	7	7	3215581	3215587	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16126	NC_021015	AT	3	6	3216753	3216758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16127	NC_021015	T	6	6	3216812	3216817	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16128	NC_021015	ATT	2	6	3216866	3216871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16129	NC_021015	AT	3	6	3216933	3216938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16131	NC_021015	A	6	6	3217006	3217011	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16132	NC_021015	AGG	2	6	3217035	3217040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16133	NC_021015	CAT	2	6	3220010	3220015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16134	NC_021015	A	6	6	3220044	3220049	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16135	NC_021015	GAA	2	6	3221456	3221461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16136	NC_021015	GAA	2	6	3221482	3221487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16137	NC_021015	GACA	2	8	3221490	3221497	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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16142	NC_021015	AGA	2	6	3223124	3223129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16143	NC_021015	TTG	2	6	3223288	3223293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16145	NC_021015	ATT	2	6	3223444	3223449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16146	NC_021015	T	6	6	3223579	3223584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16157	NC_021015	A	6	6	3226363	3226368	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16164	NC_021015	TTAT	2	8	3226675	3226682	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16165	NC_021015	AAG	2	6	3226693	3226698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16252	NC_021015	AGA	2	6	3251015	3251020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16253	NC_021015	TAC	2	6	3251069	3251074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16255	NC_021015	CGA	2	6	3251790	3251795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16256	NC_021015	GCA	2	6	3251801	3251806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16257	NC_021015	AATAA	2	10	3251836	3251845	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16258	NC_021015	T	7	7	3251889	3251895	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16259	NC_021015	T	6	6	3251899	3251904	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16260	NC_021015	ATT	2	6	3251906	3251911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16261	NC_021015	CGAT	2	8	3251920	3251927	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16262	NC_021015	TAA	2	6	3251934	3251939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16263	NC_021015	A	6	6	3251938	3251943	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16264	NC_021015	TA	3	6	3251988	3251993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16382	NC_021015	A	7	7	3273173	3273179	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16383	NC_021015	AT	3	6	3273188	3273193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16386	NC_021015	AG	3	6	3273233	3273238	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16387	NC_021015	AAG	2	6	3273266	3273271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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