MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Ruminococcus torques L2-14 draft genome

Total Repeats: 16858

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_021015	T	6	6	2796452	2796457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14002	NC_021015	A	6	6	2796488	2796493	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14003	NC_021015	CGCTC	2	10	2796494	2796503	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
14004	NC_021015	GCG	2	6	2796516	2796521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14005	NC_021015	AGGT	2	8	2796526	2796533	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14006	NC_021015	CCG	2	6	2796545	2796550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14007	NC_021015	ATA	2	6	2796609	2796614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14008	NC_021015	TATAG	2	10	2796633	2796642	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14009	NC_021015	TCAGAT	2	12	2796739	2796750	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14010	NC_021015	AGG	2	6	2796754	2796759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14011	NC_021015	ATT	2	6	2797064	2797069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14012	NC_021015	AGA	2	6	2797098	2797103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14013	NC_021015	TGC	2	6	2797137	2797142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14014	NC_021015	TTTTCT	2	12	2797897	2797908	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14015	NC_021015	GA	3	6	2798139	2798144	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14016	NC_021015	AGG	2	6	2799862	2799867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14017	NC_021015	ATAA	2	8	2801603	2801610	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14018	NC_021015	ATA	2	6	2801623	2801628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14019	NC_021015	TA	3	6	2801627	2801632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14020	NC_021015	AT	3	6	2803178	2803183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14021	NC_021015	T	7	7	2803204	2803210	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14022	NC_021015	ATA	2	6	2803254	2803259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14023	NC_021015	GGA	2	6	2803273	2803278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14024	NC_021015	TGT	2	6	2804213	2804218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14025	NC_021015	TGG	2	6	2804296	2804301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14026	NC_021015	ACA	2	6	2804319	2804324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14027	NC_021015	AAGC	2	8	2804335	2804342	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14028	NC_021015	GAG	2	6	2804362	2804367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14029	NC_021015	AGG	2	6	2804393	2804398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14030	NC_021015	GTT	2	6	2805458	2805463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14031	NC_021015	GAT	2	6	2805481	2805486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14032	NC_021015	CAA	2	6	2805507	2805512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14033	NC_021015	T	6	6	2805514	2805519	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14034	NC_021015	CAAC	2	8	2805571	2805578	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14035	NC_021015	TAT	2	6	2805589	2805594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14036	NC_021015	A	6	6	2805620	2805625	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14037	NC_021015	GATA	2	8	2805630	2805637	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14038	NC_021015	AAC	2	6	2806319	2806324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14039	NC_021015	GCA	2	6	2806334	2806339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14040	NC_021015	A	6	6	2808310	2808315	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14041	NC_021015	AGAA	2	8	2808324	2808331	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14042	NC_021015	A	6	6	2808369	2808374	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14043	NC_021015	CGG	2	6	2808476	2808481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14044	NC_021015	CGG	2	6	2808572	2808577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14045	NC_021015	TTG	2	6	2808679	2808684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14046	NC_021015	TTG	2	6	2808710	2808715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14047	NC_021015	ATT	2	6	2808769	2808774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14048	NC_021015	ATG	2	6	2808775	2808780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14049	NC_021015	CGG	2	6	2808806	2808811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14050	NC_021015	A	6	6	2808922	2808927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14051	NC_021015	TTA	2	6	2808956	2808961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14052	NC_021015	TC	3	6	2808975	2808980	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14053	NC_021015	TTC	2	6	2809016	2809021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14054	NC_021015	GCAG	2	8	2809023	2809030	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14055	NC_021015	TGT	2	6	2809116	2809121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14056	NC_021015	TGC	2	6	2809224	2809229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14057	NC_021015	ATGA	2	8	2809279	2809286	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14058	NC_021015	GGA	2	6	2809294	2809299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14059	NC_021015	TTCCGG	2	12	2809379	2809390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14060	NC_021015	TGA	2	6	2809418	2809423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14061	NC_021015	TGT	2	6	2809425	2809430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14062	NC_021015	GCA	2	6	2809492	2809497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14063	NC_021015	TAT	2	6	2809630	2809635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14064	NC_021015	GA	3	6	2809642	2809647	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14065	NC_021015	ATT	2	6	2809678	2809683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14066	NC_021015	GCA	2	6	2809837	2809842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14067	NC_021015	A	6	6	2809849	2809854	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14068	NC_021015	AAG	2	6	2809937	2809942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14069	NC_021015	GAA	2	6	2809952	2809957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14070	NC_021015	ATG	2	6	2809976	2809981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14071	NC_021015	AGC	2	6	2809991	2809996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14072	NC_021015	AGA	3	9	2810016	2810024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14073	NC_021015	AGA	3	9	2810067	2810075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14074	NC_021015	TGA	2	6	2810109	2810114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14075	NC_021015	GAA	2	6	2810194	2810199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14076	NC_021015	GAA	2	6	2810206	2810211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14077	NC_021015	TGA	2	6	2810244	2810249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14078	NC_021015	GAT	2	6	2810284	2810289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14079	NC_021015	A	6	6	2810314	2810319	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14080	NC_021015	ATTGA	2	10	2810326	2810335	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14081	NC_021015	AGA	3	9	2810344	2810352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14082	NC_021015	TCT	2	6	2810367	2810372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14083	NC_021015	TTG	2	6	2810390	2810395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14084	NC_021015	AG	3	6	2810413	2810418	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14085	NC_021015	GAA	2	6	2810485	2810490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14086	NC_021015	TAA	2	6	2810517	2810522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14087	NC_021015	A	6	6	2810557	2810562	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14088	NC_021015	GAA	2	6	2810583	2810588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14089	NC_021015	AGAAA	2	10	2810631	2810640	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
14090	NC_021015	A	7	7	2810638	2810644	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14091	NC_021015	AC	3	6	2812223	2812228	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14092	NC_021015	TAAA	2	8	2813907	2813914	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14093	NC_021015	GTT	2	6	2813931	2813936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14094	NC_021015	AT	3	6	2813983	2813988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14095	NC_021015	AGA	2	6	2813995	2814000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14096	NC_021015	TG	3	6	2814056	2814061	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14097	NC_021015	AAAT	2	8	2815028	2815035	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14098	NC_021015	AGA	2	6	2815048	2815053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14099	NC_021015	GA	3	6	2815052	2815057	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14100	NC_021015	GAGTT	2	10	2815063	2815072	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
14101	NC_021015	ATAA	2	8	2818292	2818299	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14102	NC_021015	TG	3	6	2821214	2821219	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14103	NC_021015	AGG	2	6	2821243	2821248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14104	NC_021015	CAA	2	6	2822184	2822189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14105	NC_021015	GAAAA	2	10	2822209	2822218	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
14106	NC_021015	GAA	2	6	2822247	2822252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14107	NC_021015	A	7	7	2822256	2822262	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14108	NC_021015	CAA	2	6	2822264	2822269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14109	NC_021015	AGG	2	6	2822283	2822288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14110	NC_021015	ATG	2	6	2822360	2822365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14111	NC_021015	A	6	6	2822367	2822372	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14112	NC_021015	AAG	2	6	2822405	2822410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14113	NC_021015	GGAACA	2	12	2822434	2822445	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14114	NC_021015	TGG	2	6	2822508	2822513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14115	NC_021015	CAG	2	6	2822518	2822523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14116	NC_021015	GATT	2	8	2822550	2822557	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14117	NC_021015	CTT	2	6	2822617	2822622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14118	NC_021015	AGT	2	6	2822631	2822636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14119	NC_021015	CAG	2	6	2822669	2822674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14120	NC_021015	ATGA	2	8	2822698	2822705	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14121	NC_021015	CAGA	2	8	2822715	2822722	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14122	NC_021015	AAATA	2	10	2822767	2822776	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14123	NC_021015	A	8	8	2822788	2822795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14124	NC_021015	TCT	2	6	2824025	2824030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14125	NC_021015	AATT	2	8	2824041	2824048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14126	NC_021015	ATTA	2	8	2824087	2824094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14127	NC_021015	AGG	2	6	2824154	2824159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14128	NC_021015	T	6	6	2824189	2824194	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14129	NC_021015	AAGAA	2	10	2824494	2824503	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
14130	NC_021015	ATA	2	6	2824763	2824768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14131	NC_021015	TCAAG	2	10	2824772	2824781	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
14132	NC_021015	AAT	2	6	2824813	2824818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14133	NC_021015	T	6	6	2824827	2824832	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14134	NC_021015	T	7	7	2824835	2824841	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14135	NC_021015	CAG	2	6	2824848	2824853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14138	NC_021015	GGA	2	6	2824907	2824912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14139	NC_021015	T	7	7	2826113	2826119	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14140	NC_021015	A	6	6	2826141	2826146	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14141	NC_021015	AAAGA	2	10	2827682	2827691	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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14145	NC_021015	GGA	2	6	2828783	2828788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14146	NC_021015	AT	4	8	2831610	2831617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14147	NC_021015	T	6	6	2831642	2831647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14148	NC_021015	TG	3	6	2831718	2831723	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14149	NC_021015	G	7	7	2831723	2831729	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14150	NC_021015	TAG	2	6	2831844	2831849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14152	NC_021015	TATT	2	8	2831899	2831906	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14153	NC_021015	TGA	2	6	2831926	2831931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14155	NC_021015	GA	3	6	2831960	2831965	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14156	NC_021015	AGA	2	6	2832016	2832021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14157	NC_021015	TGA	2	6	2832037	2832042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14158	NC_021015	AAC	2	6	2832123	2832128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14159	NC_021015	TGA	2	6	2832190	2832195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14161	NC_021015	GAG	2	6	2832233	2832238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14162	NC_021015	A	6	6	2832239	2832244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14163	NC_021015	A	7	7	2832262	2832268	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14164	NC_021015	T	6	6	2832315	2832320	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14165	NC_021015	ATT	2	6	2832331	2832336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14177	NC_021015	A	6	6	2832912	2832917	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14187	NC_021015	GCTG	2	8	2833284	2833291	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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14200	NC_021015	TAA	2	6	2836022	2836027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14203	NC_021015	ACA	2	6	2839342	2839347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14242	NC_021015	GTAG	2	8	2841923	2841930	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14243	NC_021015	AAAG	2	8	2844323	2844330	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14244	NC_021015	GA	3	6	2844333	2844338	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14245	NC_021015	AAC	2	6	2844367	2844372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14248	NC_021015	TCA	2	6	2844852	2844857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14250	NC_021015	TTG	2	6	2844877	2844882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14251	NC_021015	AGCA	2	8	2844896	2844903	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14252	NC_021015	ATT	2	6	2844920	2844925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14253	NC_021015	T	7	7	2844924	2844930	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14254	NC_021015	TTTTC	2	10	2845080	2845089	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
14255	NC_021015	TCAA	2	8	2845106	2845113	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14256	NC_021015	T	6	6	2845118	2845123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14257	NC_021015	GTG	2	6	2845835	2845840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14258	NC_021015	GGTA	2	8	2845853	2845860	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14259	NC_021015	TAAGA	2	10	2845869	2845878	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14260	NC_021015	AGA	2	6	2845892	2845897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14261	NC_021015	ATAA	2	8	2845947	2845954	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14262	NC_021015	ACAG	2	8	2845969	2845976	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14263	NC_021015	A	6	6	2845997	2846002	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14264	NC_021015	CCTA	2	8	2846102	2846109	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14265	NC_021015	T	7	7	2846217	2846223	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14270	NC_021015	A	6	6	2846421	2846426	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14271	NC_021015	N	1452	1452	2846450	2847901	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14274	NC_021015	T	6	6	2848052	2848057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14280	NC_021015	A	6	6	2848134	2848139	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14288	NC_021015	A	7	7	2849812	2849818	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14294	NC_021015	CTT	2	6	2850081	2850086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14322	NC_021015	AAAG	2	8	2860619	2860626	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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14357	NC_021015	TGG	2	6	2862274	2862279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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14388	NC_021015	GGA	2	6	2865132	2865137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14389	NC_021015	GATA	2	8	2866193	2866200	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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