MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Ruminococcus torques L2-14 draft genome

Total Repeats: 16858

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_021015	AAG	2	6	2571738	2571743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13002	NC_021015	A	6	6	2572723	2572728	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13003	NC_021015	GTC	2	6	2573330	2573335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13004	NC_021015	T	6	6	2573388	2573393	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13005	NC_021015	TCC	3	9	2575053	2575061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13006	NC_021015	GTT	2	6	2575069	2575074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13007	NC_021015	A	8	8	2575078	2575085	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13008	NC_021015	A	7	7	2575112	2575118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13009	NC_021015	T	6	6	2575128	2575133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13010	NC_021015	A	6	6	2575147	2575152	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13011	NC_021015	GAAG	2	8	2575188	2575195	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13012	NC_021015	A	7	7	2575229	2575235	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13013	NC_021015	CAG	2	6	2575245	2575250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13014	NC_021015	AG	3	6	2575271	2575276	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13015	NC_021015	TTA	2	6	2576828	2576833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13016	NC_021015	TAT	2	6	2576835	2576840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13017	NC_021015	AGT	2	6	2576964	2576969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13018	NC_021015	T	7	7	2576972	2576978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13019	NC_021015	GGA	2	6	2577027	2577032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13020	NC_021015	TGA	2	6	2579293	2579298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13021	NC_021015	AATGA	2	10	2579310	2579319	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
13022	NC_021015	AGA	2	6	2579398	2579403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13023	NC_021015	TGCAT	2	10	2579413	2579422	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
13024	NC_021015	GCA	2	6	2579435	2579440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13025	NC_021015	ATCA	2	8	2579487	2579494	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13026	NC_021015	A	8	8	2579505	2579512	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13027	NC_021015	A	6	6	2580294	2580299	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13028	NC_021015	ATG	2	6	2585763	2585768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13029	NC_021015	GA	3	6	2585811	2585816	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13030	NC_021015	AGA	2	6	2585818	2585823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13031	NC_021015	TGAAA	2	10	2585922	2585931	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
13032	NC_021015	ATA	2	6	2585936	2585941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13033	NC_021015	CTT	2	6	2585969	2585974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13034	NC_021015	T	8	8	2585996	2586003	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13035	NC_021015	TGA	2	6	2586036	2586041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13036	NC_021015	TTA	2	6	2586065	2586070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13037	NC_021015	CA	3	6	2586991	2586996	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13038	NC_021015	GGC	2	6	2587043	2587048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13039	NC_021015	T	6	6	2587096	2587101	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13040	NC_021015	CTG	2	6	2587147	2587152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13041	NC_021015	CTG	2	6	2587165	2587170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13042	NC_021015	TGA	2	6	2587238	2587243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13043	NC_021015	TAG	2	6	2587273	2587278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13044	NC_021015	TTC	2	6	2587299	2587304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13045	NC_021015	AT	3	6	2587335	2587340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13046	NC_021015	GTAT	2	8	2587389	2587396	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13047	NC_021015	TGT	2	6	2587430	2587435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13048	NC_021015	AGT	2	6	2587448	2587453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13049	NC_021015	GTG	2	6	2587458	2587463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13050	NC_021015	AGAGAC	2	12	2587522	2587533	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13051	NC_021015	ATA	2	6	2587556	2587561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13052	NC_021015	TCCA	2	8	2588000	2588007	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13053	NC_021015	TAT	2	6	2588008	2588013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13054	NC_021015	ATAA	2	8	2588036	2588043	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13055	NC_021015	GA	3	6	2588057	2588062	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13056	NC_021015	TC	3	6	2588116	2588121	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13057	NC_021015	AGG	2	6	2588129	2588134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13058	NC_021015	GAA	2	6	2589771	2589776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13059	NC_021015	GTG	2	6	2597221	2597226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13060	NC_021015	AT	3	6	2597267	2597272	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13061	NC_021015	GGGA	2	8	2597334	2597341	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
13062	NC_021015	T	7	7	2597342	2597348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13063	NC_021015	GCT	2	6	2597375	2597380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13064	NC_021015	AAG	2	6	2597495	2597500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13065	NC_021015	AT	4	8	2597503	2597510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13066	NC_021015	T	7	7	2597531	2597537	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13067	NC_021015	T	6	6	2597566	2597571	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13068	NC_021015	AAG	2	6	2597585	2597590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13069	NC_021015	GGA	2	6	2597653	2597658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13070	NC_021015	CAT	2	6	2597823	2597828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13071	NC_021015	AGA	2	6	2597967	2597972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13072	NC_021015	GAA	2	6	2598021	2598026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13073	NC_021015	AC	3	6	2598261	2598266	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13074	NC_021015	AAC	2	6	2598356	2598361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13075	NC_021015	GAA	2	6	2598638	2598643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13076	NC_021015	A	6	6	2598642	2598647	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13077	NC_021015	TA	3	6	2598670	2598675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13078	NC_021015	ATT	2	6	2598695	2598700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13079	NC_021015	GAG	2	6	2598790	2598795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13080	NC_021015	AAG	2	6	2598832	2598837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13081	NC_021015	GTG	2	6	2598864	2598869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13082	NC_021015	AAG	2	6	2599255	2599260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13083	NC_021015	ATG	2	6	2599270	2599275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13084	NC_021015	GAA	2	6	2599282	2599287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13085	NC_021015	TGA	2	6	2600020	2600025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13086	NC_021015	TCA	2	6	2601302	2601307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13087	NC_021015	TAT	2	6	2601308	2601313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13088	NC_021015	AC	3	6	2601314	2601319	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13089	NC_021015	GCA	2	6	2601334	2601339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13092	NC_021015	TG	3	6	2601414	2601419	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13093	NC_021015	GCA	2	6	2601420	2601425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13094	NC_021015	ATA	2	6	2601433	2601438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13095	NC_021015	GAA	3	9	2601504	2601512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13096	NC_021015	AAT	2	6	2601540	2601545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13097	NC_021015	AGA	2	6	2601590	2601595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13098	NC_021015	TTGC	2	8	2601597	2601604	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13099	NC_021015	CCG	2	6	2601675	2601680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13100	NC_021015	ATTT	2	8	2601693	2601700	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13101	NC_021015	GAA	2	6	2601726	2601731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13102	NC_021015	TCAA	2	8	2601768	2601775	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13103	NC_021015	GCAGA	2	10	2601825	2601834	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
13104	NC_021015	ATC	2	6	2601901	2601906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13105	NC_021015	AGA	2	6	2601947	2601952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13106	NC_021015	AGC	2	6	2602013	2602018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13107	NC_021015	ACA	2	6	2602059	2602064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13108	NC_021015	TTAA	2	8	2602065	2602072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13109	NC_021015	AGAA	2	8	2602085	2602092	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13110	NC_021015	TTG	2	6	2602138	2602143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13111	NC_021015	ATTA	2	8	2602230	2602237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13112	NC_021015	TATT	2	8	2602287	2602294	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13113	NC_021015	CTG	2	6	2602529	2602534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13114	NC_021015	GCA	2	6	2602572	2602577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13115	NC_021015	AT	3	6	2602598	2602603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13116	NC_021015	TAAA	2	8	2602627	2602634	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13117	NC_021015	TCT	2	6	2602648	2602653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13118	NC_021015	AT	3	6	2602692	2602697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13119	NC_021015	GT	3	6	2602732	2602737	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13120	NC_021015	GGA	2	6	2602767	2602772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13121	NC_021015	TTA	2	6	2602783	2602788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13122	NC_021015	AGG	2	6	2602828	2602833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13123	NC_021015	CA	3	6	2603599	2603604	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13124	NC_021015	CTG	2	6	2603633	2603638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13125	NC_021015	CAT	2	6	2603639	2603644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13126	NC_021015	CTT	2	6	2603702	2603707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13127	NC_021015	GTA	2	6	2603711	2603716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13128	NC_021015	GAA	2	6	2603722	2603727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13129	NC_021015	GTT	2	6	2603893	2603898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13130	NC_021015	ATG	2	6	2603937	2603942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13131	NC_021015	CAG	2	6	2603947	2603952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13132	NC_021015	AAG	2	6	2603955	2603960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13133	NC_021015	TCAA	2	8	2603979	2603986	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13134	NC_021015	CAA	2	6	2604025	2604030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13135	NC_021015	TGT	2	6	2604052	2604057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13136	NC_021015	TCA	2	6	2604066	2604071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13137	NC_021015	ATG	2	6	2604123	2604128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13138	NC_021015	GCC	2	6	2604153	2604158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13139	NC_021015	TTGAT	2	10	2604211	2604220	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
13140	NC_021015	AAT	2	6	2604227	2604232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13141	NC_021015	CTTG	2	8	2604235	2604242	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13142	NC_021015	AAT	2	6	2604282	2604287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13143	NC_021015	TGA	2	6	2604304	2604309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13144	NC_021015	TAA	2	6	2604316	2604321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13146	NC_021015	CTT	2	6	2604427	2604432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13147	NC_021015	TTG	2	6	2604503	2604508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13148	NC_021015	ATG	2	6	2604529	2604534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13149	NC_021015	AGA	2	6	2604551	2604556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13150	NC_021015	GAA	3	9	2604564	2604572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13151	NC_021015	GATT	2	8	2604597	2604604	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13152	NC_021015	GAAA	2	8	2604653	2604660	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13153	NC_021015	GAA	2	6	2604663	2604668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13154	NC_021015	N	1204	1204	2604719	2605922	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13155	NC_021015	AGA	2	6	2605934	2605939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13156	NC_021015	GA	3	6	2606058	2606063	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13157	NC_021015	GGAACG	2	12	2606095	2606106	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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13159	NC_021015	ATTC	2	8	2606189	2606196	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13160	NC_021015	T	7	7	2606225	2606231	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13161	NC_021015	TCA	2	6	2606272	2606277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13162	NC_021015	ATCG	2	8	2606292	2606299	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13163	NC_021015	ATG	2	6	2606344	2606349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13164	NC_021015	TTC	2	6	2606430	2606435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13165	NC_021015	TCT	2	6	2606444	2606449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13166	NC_021015	CT	3	6	2606448	2606453	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13167	NC_021015	TG	3	6	2606458	2606463	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13168	NC_021015	AG	3	6	2606508	2606513	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13169	NC_021015	TTGC	2	8	2606584	2606591	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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13174	NC_021015	CTTC	2	8	2606858	2606865	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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13182	NC_021015	T	6	6	2607120	2607125	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13205	NC_021015	ATTTT	2	10	2614136	2614145	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13213	NC_021015	CTG	2	6	2614740	2614745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13214	NC_021015	TCAGT	2	10	2614747	2614756	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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13225	NC_021015	TTCA	2	8	2615282	2615289	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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13242	NC_021015	CAAAG	2	10	2615931	2615940	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
13243	NC_021015	TCA	2	6	2616024	2616029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13244	NC_021015	T	6	6	2616036	2616041	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13245	NC_021015	CCA	2	6	2616055	2616060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13246	NC_021015	GTTTT	2	10	2616081	2616090	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
13247	NC_021015	CAT	2	6	2616139	2616144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13250	NC_021015	AT	3	6	2617186	2617191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13251	NC_021015	A	6	6	2617197	2617202	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13252	NC_021015	A	7	7	2617223	2617229	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13253	NC_021015	AGGA	2	8	2617343	2617350	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13254	NC_021015	AGCGA	2	10	2620408	2620417	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
13255	NC_021015	ACAG	2	8	2620420	2620427	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13256	NC_021015	ACAGG	2	10	2624572	2624581	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
13257	NC_021015	TGT	2	6	2624606	2624611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13258	NC_021015	AAG	2	6	2624637	2624642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13500	NC_021015	CTTTT	2	10	2683503	2683512	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding

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