MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 21901

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_021014	ATC	3	9	325205	325213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2002	NC_021014	A	6	6	325217	325222	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2003	NC_021014	AAG	2	6	325236	325241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2004	NC_021014	GGC	2	6	325265	325270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2005	NC_021014	GCA	2	6	325277	325282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2006	NC_021014	GGA	2	6	325336	325341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2007	NC_021014	ATT	2	6	325371	325376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2008	NC_021014	CAA	2	6	325398	325403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2009	NC_021014	AGA	2	6	325435	325440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2010	NC_021014	CGG	2	6	325479	325484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2011	NC_021014	TGGA	2	8	325497	325504	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2012	NC_021014	AG	3	6	325511	325516	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2013	NC_021014	ATG	2	6	325560	325565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2014	NC_021014	AAGA	2	8	325610	325617	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2015	NC_021014	A	7	7	325617	325623	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2016	NC_021014	CAAT	2	8	325776	325783	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2017	NC_021014	ACT	2	6	325788	325793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2018	NC_021014	AAG	2	6	325800	325805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2019	NC_021014	CTG	2	6	325815	325820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2020	NC_021014	ACA	2	6	325829	325834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2021	NC_021014	GAA	2	6	325835	325840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2022	NC_021014	ACT	2	6	325919	325924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2023	NC_021014	GAA	2	6	325958	325963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2024	NC_021014	CACAC	2	10	326032	326041	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
2025	NC_021014	GAAA	2	8	326064	326071	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2026	NC_021014	CTG	2	6	326094	326099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2027	NC_021014	GTA	2	6	326132	326137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2028	NC_021014	GAT	2	6	326174	326179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2029	NC_021014	ACA	2	6	326180	326185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2030	NC_021014	AGC	2	6	326222	326227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2031	NC_021014	GTT	2	6	326341	326346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2032	NC_021014	GGA	2	6	326347	326352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2033	NC_021014	TAAA	2	8	326466	326473	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2034	NC_021014	AAG	2	6	326489	326494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2035	NC_021014	ACAG	2	8	326558	326565	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2036	NC_021014	A	6	6	326624	326629	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2037	NC_021014	AT	3	6	326638	326643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2038	NC_021014	GAAA	2	8	326647	326654	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2039	NC_021014	TGA	2	6	326680	326685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2040	NC_021014	ATA	2	6	326874	326879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2041	NC_021014	CAG	2	6	326916	326921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2042	NC_021014	ATA	2	6	326965	326970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2043	NC_021014	GAA	2	6	327022	327027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2044	NC_021014	AGT	2	6	327116	327121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2045	NC_021014	T	6	6	327220	327225	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2046	NC_021014	TGGA	2	8	327272	327279	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2047	NC_021014	GAA	2	6	327281	327286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2048	NC_021014	A	7	7	327359	327365	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2049	NC_021014	ATGG	2	8	327385	327392	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2050	NC_021014	GAA	2	6	327417	327422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2051	NC_021014	AGA	2	6	327427	327432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2052	NC_021014	TGGAA	2	10	327441	327450	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
2053	NC_021014	CCT	2	6	327576	327581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2054	NC_021014	AGA	2	6	327609	327614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2055	NC_021014	CT	3	6	327761	327766	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2056	NC_021014	AAAT	2	8	327776	327783	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2057	NC_021014	TC	3	6	327849	327854	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2058	NC_021014	AAAGT	2	10	327858	327867	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2059	NC_021014	GCT	2	6	327900	327905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2061	NC_021014	AGG	2	6	327917	327922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2062	NC_021014	GA	3	6	329820	329825	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2063	NC_021014	GAA	2	6	335796	335801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2064	NC_021014	TCA	2	6	335840	335845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2065	NC_021014	CGA	2	6	335847	335852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2067	NC_021014	ATC	2	6	335893	335898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2068	NC_021014	TCC	2	6	335926	335931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2069	NC_021014	CTGGTC	2	12	337380	337391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2071	NC_021014	TTC	2	6	337498	337503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2072	NC_021014	TG	3	6	337514	337519	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2073	NC_021014	TTGC	2	8	337534	337541	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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2077	NC_021014	ATG	2	6	337599	337604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2082	NC_021014	GTT	2	6	337697	337702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2089	NC_021014	AG	3	6	338927	338932	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2090	NC_021014	AATG	2	8	338954	338961	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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2093	NC_021014	A	7	7	345708	345714	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2094	NC_021014	GCAGG	2	10	345720	345729	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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2098	NC_021014	TTC	2	6	345817	345822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2099	NC_021014	GA	3	6	345953	345958	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2102	NC_021014	ATG	2	6	346378	346383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2103	NC_021014	TTA	2	6	346392	346397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2104	NC_021014	TA	3	6	346427	346432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2105	NC_021014	AGG	2	6	348419	348424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2108	NC_021014	TGA	2	6	349455	349460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2109	NC_021014	ATG	2	6	349472	349477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2110	NC_021014	GCC	2	6	349577	349582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2111	NC_021014	T	6	6	349589	349594	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2112	NC_021014	T	6	6	349698	349703	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2113	NC_021014	CTA	2	6	349713	349718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2116	NC_021014	TTG	2	6	349836	349841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2117	NC_021014	T	6	6	349863	349868	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2118	NC_021014	TG	3	6	349878	349883	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2119	NC_021014	GGAA	2	8	349919	349926	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2120	NC_021014	TGA	2	6	349943	349948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2122	NC_021014	ATTG	2	8	350049	350056	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2123	NC_021014	TGA	2	6	350108	350113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2124	NC_021014	AGT	2	6	350114	350119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2126	NC_021014	ATTGA	2	10	350217	350226	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2127	NC_021014	AAT	2	6	350233	350238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2128	NC_021014	TG	3	6	350246	350251	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2129	NC_021014	A	6	6	350310	350315	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2130	NC_021014	TAT	3	9	350770	350778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2131	NC_021014	GAAG	2	8	350790	350797	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2132	NC_021014	N	956	956	350991	351946	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2133	NC_021014	CTG	2	6	352006	352011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2134	NC_021014	CAG	2	6	352020	352025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2136	NC_021014	TGAT	2	8	352077	352084	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2137	NC_021014	AAAG	2	8	352100	352107	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2138	NC_021014	AAACA	2	10	352176	352185	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
2139	NC_021014	AAGA	2	8	352226	352233	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2140	NC_021014	GAACC	2	10	352247	352256	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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2145	NC_021014	AAG	2	6	352393	352398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2146	NC_021014	TA	3	6	352738	352743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2242	NC_021014	TCC	2	6	362174	362179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2244	NC_021014	A	6	6	362208	362213	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2245	NC_021014	ATG	2	6	362257	362262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2263	NC_021014	TAT	3	9	363863	363871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2268	NC_021014	ATTT	2	8	364031	364038	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2269	NC_021014	TACAG	2	10	364074	364083	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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2272	NC_021014	AGA	2	6	364106	364111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2410	NC_021014	GGAT	2	8	383194	383201	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2411	NC_021014	T	6	6	383627	383632	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2412	NC_021014	TGT	2	6	383655	383660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2413	NC_021014	CAGG	2	8	383688	383695	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2414	NC_021014	GGA	2	6	386040	386045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2415	NC_021014	ATG	2	6	386717	386722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2420	NC_021014	ATG	2	6	386936	386941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2425	NC_021014	TTCA	2	8	387267	387274	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2426	NC_021014	GA	3	6	387289	387294	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2427	NC_021014	GAT	2	6	387357	387362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2428	NC_021014	CTT	2	6	387439	387444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2429	NC_021014	GAG	2	6	387472	387477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2435	NC_021014	GGA	2	6	388011	388016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2442	NC_021014	GA	3	6	388191	388196	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2443	NC_021014	AGA	2	6	388217	388222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2450	NC_021014	TGA	2	6	388694	388699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2452	NC_021014	A	6	6	390075	390080	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2453	NC_021014	AGG	2	6	390088	390093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2454	NC_021014	GAA	2	6	392667	392672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2455	NC_021014	A	6	6	392676	392681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2456	NC_021014	CTTTC	2	10	393887	393896	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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2458	NC_021014	TTATA	2	10	393904	393913	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2459	NC_021014	A	6	6	393953	393958	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2467	NC_021014	A	6	6	394302	394307	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2468	NC_021014	A	6	6	394314	394319	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2469	NC_021014	GGT	2	6	394348	394353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2483	NC_021014	A	6	6	394900	394905	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2484	NC_021014	TGA	2	6	395231	395236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2485	NC_021014	GCA	2	6	395246	395251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2488	NC_021014	ATT	2	6	397519	397524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2490	NC_021014	T	8	8	397555	397562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2491	NC_021014	TTC	2	6	397591	397596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2493	NC_021014	ATG	2	6	397627	397632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2499	NC_021014	CGG	2	6	403205	403210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2500	NC_021014	TA	3	6	403289	403294	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

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