MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 21901

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
20501	NC_021014	CAC	2	6	3322494	3322499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20502	NC_021014	GGC	2	6	3322535	3322540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20503	NC_021014	TTG	2	6	3322631	3322636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20504	NC_021014	TACCA	2	10	3322672	3322681	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
20505	NC_021014	ACC	2	6	3322702	3322707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20506	NC_021014	AAG	2	6	3322741	3322746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20507	NC_021014	GTG	2	6	3322781	3322786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20508	NC_021014	CA	3	6	3322824	3322829	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20509	NC_021014	T	6	6	3322878	3322883	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20510	NC_021014	CTT	2	6	3322884	3322889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20511	NC_021014	TCC	2	6	3322901	3322906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20512	NC_021014	AAC	2	6	3323183	3323188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20513	NC_021014	CTG	2	6	3323192	3323197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20514	NC_021014	ACC	2	6	3323201	3323206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20515	NC_021014	TAC	2	6	3323216	3323221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20516	NC_021014	TGT	2	6	3323231	3323236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20517	NC_021014	TTG	2	6	3323245	3323250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20518	NC_021014	TCC	2	6	3324425	3324430	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20519	NC_021014	TTCT	2	8	3324443	3324450	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
20520	NC_021014	AACGAT	2	12	3324481	3324492	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20521	NC_021014	TGA	2	6	3324501	3324506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20522	NC_021014	CTG	2	6	3324511	3324516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20523	NC_021014	ATG	2	6	3324539	3324544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20524	NC_021014	CTG	2	6	3324547	3324552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20525	NC_021014	AAG	2	6	3324553	3324558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20526	NC_021014	AG	3	6	3324557	3324562	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20527	NC_021014	ATG	2	6	3324563	3324568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20528	NC_021014	CCG	2	6	3324587	3324592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20529	NC_021014	CCA	2	6	3324605	3324610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20530	NC_021014	ACC	2	6	3324622	3324627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20531	NC_021014	GTT	2	6	3324652	3324657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20532	NC_021014	TGTA	2	8	3324690	3324697	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20533	NC_021014	AGA	2	6	3324705	3324710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20534	NC_021014	TACC	2	8	3324720	3324727	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
20535	NC_021014	AAGC	2	8	3324747	3324754	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
20536	NC_021014	TTG	2	6	3324800	3324805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20537	NC_021014	TGT	2	6	3324840	3324845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20538	NC_021014	ATA	2	6	3324884	3324889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20539	NC_021014	AATG	2	8	3325030	3325037	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20540	NC_021014	CAG	2	6	3325169	3325174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20541	NC_021014	TCC	2	6	3325204	3325209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20542	NC_021014	AAG	2	6	3325241	3325246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20543	NC_021014	ACT	2	6	3325313	3325318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20544	NC_021014	AAG	2	6	3325354	3325359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20545	NC_021014	CTT	2	6	3325378	3325383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20546	NC_021014	CTC	2	6	3325422	3325427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20547	NC_021014	TTA	2	6	3325458	3325463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20548	NC_021014	AAT	2	6	3325481	3325486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20549	NC_021014	A	6	6	3325505	3325510	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20550	NC_021014	TGT	2	6	3329980	3329985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20551	NC_021014	TGT	2	6	3330004	3330009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20552	NC_021014	C	6	6	3330040	3330045	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
20553	NC_021014	T	6	6	3331236	3331241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20554	NC_021014	TTA	2	6	3331254	3331259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20555	NC_021014	T	7	7	3335818	3335824	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20556	NC_021014	AGA	2	6	3335827	3335832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20557	NC_021014	TCT	2	6	3336687	3336692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20558	NC_021014	CCT	2	6	3336693	3336698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20559	NC_021014	AATCAT	2	12	3336702	3336713	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20560	NC_021014	TGTT	2	8	3336716	3336723	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
20561	NC_021014	TAT	2	6	3336727	3336732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20562	NC_021014	TCA	2	6	3336774	3336779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20563	NC_021014	TCA	2	6	3336816	3336821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20564	NC_021014	AGA	2	6	3336847	3336852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20565	NC_021014	ATTA	2	8	3336867	3336874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20566	NC_021014	GTCT	2	8	3336905	3336912	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
20567	NC_021014	TAC	2	6	3336915	3336920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20568	NC_021014	AGG	2	6	3337017	3337022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20569	NC_021014	TCTT	2	8	3337479	3337486	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
20570	NC_021014	AT	3	6	3337507	3337512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20571	NC_021014	N	367	367	3337544	3337910	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20572	NC_021014	TGC	2	6	3337943	3337948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20573	NC_021014	TCC	2	6	3337961	3337966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20574	NC_021014	T	6	6	3337990	3337995	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20575	NC_021014	GCAC	2	8	3338002	3338009	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
20576	NC_021014	GTT	2	6	3338023	3338028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20577	NC_021014	T	6	6	3338032	3338037	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20578	NC_021014	AGG	2	6	3338054	3338059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20579	NC_021014	GCT	2	6	3338061	3338066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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20582	NC_021014	TCT	2	6	3338198	3338203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20583	NC_021014	GCT	2	6	3338229	3338234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20584	NC_021014	TCC	2	6	3338244	3338249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20585	NC_021014	T	6	6	3338256	3338261	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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20588	NC_021014	TCCGA	2	10	3338358	3338367	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
20589	NC_021014	CTT	2	6	3338424	3338429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20590	NC_021014	TCT	2	6	3338534	3338539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20591	NC_021014	AAG	2	6	3338555	3338560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20592	NC_021014	CTG	2	6	3338624	3338629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20593	NC_021014	T	7	7	3338642	3338648	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20594	NC_021014	GATA	2	8	3338671	3338678	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20595	NC_021014	T	6	6	3338811	3338816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20596	NC_021014	T	6	6	3338847	3338852	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20597	NC_021014	AAC	2	6	3338858	3338863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20598	NC_021014	CAG	2	6	3338878	3338883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20599	NC_021014	AGC	2	6	3338921	3338926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20600	NC_021014	ATCT	2	8	3338981	3338988	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20601	NC_021014	GAA	2	6	3338994	3338999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20602	NC_021014	CATC	2	8	3339079	3339086	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
20603	NC_021014	TCC	2	6	3339093	3339098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20604	NC_021014	CA	3	6	3339176	3339181	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20605	NC_021014	TA	3	6	3339188	3339193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20606	NC_021014	CAC	2	6	3339212	3339217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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20609	NC_021014	TTC	2	6	3339690	3339695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20610	NC_021014	AAT	2	6	3339700	3339705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20611	NC_021014	CAC	2	6	3339719	3339724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20612	NC_021014	TAGGA	2	10	3339757	3339766	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
20613	NC_021014	ATT	2	6	3339827	3339832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20614	NC_021014	CTT	2	6	3339845	3339850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20615	NC_021014	AAT	2	6	3339865	3339870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20616	NC_021014	AGC	2	6	3339896	3339901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20617	NC_021014	GCC	2	6	3339921	3339926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20618	NC_021014	TGT	2	6	3339986	3339991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20619	NC_021014	AGA	2	6	3340026	3340031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20620	NC_021014	ATC	2	6	3340067	3340072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20621	NC_021014	TTCT	2	8	3340122	3340129	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
20622	NC_021014	A	7	7	3340136	3340142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20623	NC_021014	AGA	2	6	3340206	3340211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20624	NC_021014	CAT	2	6	3340339	3340344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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20626	NC_021014	CTC	2	6	3340406	3340411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20627	NC_021014	TCC	2	6	3340413	3340418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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20629	NC_021014	CAC	2	6	3340456	3340461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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