MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 21901

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
20001	NC_021014	T	6	6	3240231	3240236	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20002	NC_021014	CCA	2	6	3240290	3240295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20003	NC_021014	GATCA	2	10	3240381	3240390	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
20004	NC_021014	AGA	3	9	3240540	3240548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20005	NC_021014	TCC	2	6	3241625	3241630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20006	NC_021014	TGT	2	6	3241637	3241642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20007	NC_021014	T	6	6	3241642	3241647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20008	NC_021014	TTA	2	6	3241666	3241671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20009	NC_021014	A	7	7	3241709	3241715	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20010	NC_021014	TTA	2	6	3241760	3241765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20011	NC_021014	TAA	2	6	3244213	3244218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20012	NC_021014	TCT	2	6	3244323	3244328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20013	NC_021014	CGG	2	6	3244342	3244347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20014	NC_021014	T	6	6	3244360	3244365	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20015	NC_021014	ATT	2	6	3244390	3244395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20016	NC_021014	GAA	2	6	3244443	3244448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20017	NC_021014	AAG	2	6	3244521	3244526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20018	NC_021014	AT	3	6	3244544	3244549	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20019	NC_021014	GAA	2	6	3244553	3244558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20020	NC_021014	CTT	2	6	3244563	3244568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20021	NC_021014	TCT	2	6	3244578	3244583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20022	NC_021014	ATC	2	6	3244594	3244599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20023	NC_021014	TCT	2	6	3244641	3244646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20024	NC_021014	ATC	2	6	3244727	3244732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20025	NC_021014	CTT	2	6	3244743	3244748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20026	NC_021014	T	6	6	3244747	3244752	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20027	NC_021014	CTG	2	6	3244753	3244758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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20029	NC_021014	CTT	2	6	3244809	3244814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20030	NC_021014	CT	3	6	3244845	3244850	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20031	NC_021014	CAA	2	6	3244851	3244856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20032	NC_021014	ATC	2	6	3244919	3244924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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20034	NC_021014	TCCA	2	8	3244956	3244963	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
20035	NC_021014	ATT	2	6	3244975	3244980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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20038	NC_021014	AAT	2	6	3245031	3245036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20039	NC_021014	C	6	6	3245045	3245050	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
20040	NC_021014	AC	3	6	3245052	3245057	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20041	NC_021014	TGT	2	6	3245163	3245168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20042	NC_021014	CT	4	8	3245169	3245176	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20043	NC_021014	CCT	2	6	3245191	3245196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20044	NC_021014	TCT	2	6	3245258	3245263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20045	NC_021014	CCTTT	2	10	3245596	3245605	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
20046	NC_021014	CTG	2	6	3245627	3245632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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20050	NC_021014	ATC	2	6	3246909	3246914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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20053	NC_021014	GTAT	2	8	3247019	3247026	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20054	NC_021014	ATC	3	9	3247109	3247117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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20056	NC_021014	GTCT	2	8	3247253	3247260	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
20057	NC_021014	ATG	2	6	3247374	3247379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20058	NC_021014	TGT	2	6	3247424	3247429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20059	NC_021014	CAT	2	6	3247478	3247483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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20061	NC_021014	AT	3	6	3247608	3247613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20062	NC_021014	CAC	2	6	3247640	3247645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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20064	NC_021014	CATA	3	12	3247805	3247816	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20065	NC_021014	TGC	2	6	3247844	3247849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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20068	NC_021014	TCA	2	6	3248043	3248048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20069	NC_021014	TCA	2	6	3248088	3248093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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20072	NC_021014	ATGTGT	2	12	3248162	3248173	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20073	NC_021014	CCAA	2	8	3248181	3248188	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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20075	NC_021014	ATA	2	6	3248229	3248234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20076	NC_021014	CT	3	6	3248242	3248247	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20077	NC_021014	CA	3	6	3248287	3248292	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20078	NC_021014	AT	3	6	3248297	3248302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20079	NC_021014	TAT	2	6	3248305	3248310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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20084	NC_021014	CTGT	2	8	3250666	3250673	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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20092	NC_021014	TCC	2	6	3251224	3251229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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20096	NC_021014	TGCAT	2	10	3251344	3251353	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
20097	NC_021014	CAT	2	6	3251454	3251459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20098	NC_021014	CAT	2	6	3251466	3251471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20099	NC_021014	CTC	3	9	3251538	3251546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20100	NC_021014	GGA	2	6	3251724	3251729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20101	NC_021014	TC	3	6	3251731	3251736	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20102	NC_021014	CAC	2	6	3251753	3251758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20103	NC_021014	CAT	2	6	3251796	3251801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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20105	NC_021014	CTG	2	6	3251820	3251825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20106	NC_021014	TCGT	2	8	3251830	3251837	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
20107	NC_021014	CT	3	6	3251877	3251882	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20108	NC_021014	GCA	2	6	3251941	3251946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20109	NC_021014	GAAA	2	8	3251956	3251963	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20110	NC_021014	CA	3	6	3251967	3251972	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20111	NC_021014	CAT	2	6	3251982	3251987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20112	NC_021014	CCTG	2	8	3252100	3252107	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20113	NC_021014	TG	3	6	3252106	3252111	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20114	NC_021014	ATG	2	6	3252112	3252117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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20121	NC_021014	CAT	2	6	3252398	3252403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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20125	NC_021014	AAG	2	6	3252552	3252557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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20127	NC_021014	TCA	2	6	3252602	3252607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20128	NC_021014	TTCC	2	8	3252625	3252632	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20129	NC_021014	TCC	2	6	3252671	3252676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20130	NC_021014	CAT	2	6	3252757	3252762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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20132	NC_021014	AAAG	2	8	3252873	3252880	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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20242	NC_021014	AAGG	2	8	3271835	3271842	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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20244	NC_021014	AT	3	6	3272889	3272894	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20245	NC_021014	AGG	2	6	3272907	3272912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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20250	NC_021014	TATCA	2	10	3274523	3274532	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
20251	NC_021014	TTC	2	6	3274564	3274569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20252	NC_021014	AGAA	2	8	3274603	3274610	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20253	NC_021014	AAT	2	6	3274623	3274628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20254	NC_021014	TGC	2	6	3274650	3274655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20255	NC_021014	GTT	2	6	3274767	3274772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20256	NC_021014	GAACA	2	10	3274797	3274806	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
20257	NC_021014	CAG	2	6	3274908	3274913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20258	NC_021014	AGG	2	6	3275021	3275026	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20259	NC_021014	GGA	2	6	3275097	3275102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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20261	NC_021014	CTC	2	6	3276360	3276365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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20271	NC_021014	TTAA	2	8	3277906	3277913	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20272	NC_021014	CAA	2	6	3277971	3277976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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20382	NC_021014	TTTC	2	8	3295642	3295649	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
20383	NC_021014	T	6	6	3295667	3295672	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20384	NC_021014	ATCAA	2	10	3296590	3296599	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
20385	NC_021014	A	6	6	3296625	3296630	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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20500	NC_021014	AG	3	6	3322482	3322487	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

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