MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 21901

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19501	NC_021014	CAGG	2	8	3147303	3147310	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19502	NC_021014	TAC	2	6	3147326	3147331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19503	NC_021014	TTC	2	6	3147402	3147407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19504	NC_021014	CAGGA	2	10	3147445	3147454	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
19505	NC_021014	T	6	6	3147483	3147488	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19506	NC_021014	CGGGC	2	10	3147527	3147536	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
19507	NC_021014	TGC	2	6	3147537	3147542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19508	NC_021014	AGG	2	6	3147545	3147550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19509	NC_021014	TAC	2	6	3147557	3147562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19510	NC_021014	CTG	2	6	3147598	3147603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19511	NC_021014	TAG	2	6	3147663	3147668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19512	NC_021014	AC	3	6	3147897	3147902	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19513	NC_021014	A	7	7	3147904	3147910	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19514	NC_021014	AT	3	6	3147955	3147960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19515	NC_021014	A	6	6	3148072	3148077	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19516	NC_021014	TCC	2	6	3150441	3150446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19517	NC_021014	TGT	2	6	3150455	3150460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19518	NC_021014	ACC	2	6	3150477	3150482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19519	NC_021014	CAC	2	6	3150528	3150533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19520	NC_021014	AACAG	2	10	3150545	3150554	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
19521	NC_021014	AAT	2	6	3150557	3150562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19522	NC_021014	TTC	2	6	3150572	3150577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19523	NC_021014	AGG	2	6	3150635	3150640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19524	NC_021014	ATC	2	6	3150642	3150647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19525	NC_021014	ATT	2	6	3151641	3151646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19526	NC_021014	T	6	6	3151645	3151650	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19527	NC_021014	TTG	2	6	3151788	3151793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19528	NC_021014	TG	3	6	3151792	3151797	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19529	NC_021014	AT	3	6	3151823	3151828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19530	NC_021014	TTA	2	6	3151831	3151836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19531	NC_021014	ATATT	2	10	3151878	3151887	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19532	NC_021014	TATTTG	2	12	3151897	3151908	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19533	NC_021014	AT	3	6	3151909	3151914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19534	NC_021014	AT	3	6	3151924	3151929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19535	NC_021014	AT	3	6	3151939	3151944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19536	NC_021014	N	45	45	3151949	3151993	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19537	NC_021014	AT	3	6	3152007	3152012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19538	NC_021014	AT	3	6	3152030	3152035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19539	NC_021014	AT	3	6	3152053	3152058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19540	NC_021014	AT	3	6	3152076	3152081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19541	NC_021014	AT	3	6	3152091	3152096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19542	NC_021014	TAT	2	6	3152119	3152124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19543	NC_021014	A	6	6	3152128	3152133	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19544	NC_021014	CAA	2	6	3152253	3152258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19545	NC_021014	TCC	2	6	3152275	3152280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19546	NC_021014	CAA	2	6	3152328	3152333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19547	NC_021014	TCC	2	6	3152342	3152347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19548	NC_021014	A	7	7	3152364	3152370	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19549	NC_021014	T	6	6	3152424	3152429	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19550	NC_021014	A	7	7	3152434	3152440	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19551	NC_021014	A	7	7	3152459	3152465	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19552	NC_021014	CA	3	6	3152474	3152479	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19553	NC_021014	A	7	7	3152486	3152492	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19554	NC_021014	TCC	2	6	3156444	3156449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19555	NC_021014	TC	3	6	3158132	3158137	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19556	NC_021014	T	6	6	3158199	3158204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19557	NC_021014	CTGTT	2	10	3158205	3158214	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
19558	NC_021014	TCT	2	6	3158221	3158226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19559	NC_021014	CT	3	6	3158225	3158230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19560	NC_021014	CTC	2	6	3159337	3159342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19561	NC_021014	TTA	2	6	3159391	3159396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19562	NC_021014	TGA	2	6	3159583	3159588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19563	NC_021014	TCT	2	6	3159589	3159594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19564	NC_021014	ACC	2	6	3159612	3159617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19565	NC_021014	ACC	2	6	3159654	3159659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19566	NC_021014	CTGCC	2	10	3159742	3159751	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
19567	NC_021014	AAG	2	6	3159758	3159763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19568	NC_021014	TCT	2	6	3159798	3159803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19569	NC_021014	CAG	2	6	3159855	3159860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19570	NC_021014	CTGC	2	8	3159923	3159930	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19571	NC_021014	ATC	2	6	3159939	3159944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19572	NC_021014	ATG	2	6	3160015	3160020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19573	NC_021014	GT	3	6	3160062	3160067	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19574	NC_021014	AATAA	2	10	3160149	3160158	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19575	NC_021014	TCC	2	6	3160159	3160164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19576	NC_021014	CTG	2	6	3160269	3160274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19577	NC_021014	TGCC	2	8	3160319	3160326	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19578	NC_021014	T	6	6	3160385	3160390	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19579	NC_021014	TCA	2	6	3161507	3161512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19580	NC_021014	CAA	2	6	3161522	3161527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19581	NC_021014	TC	3	6	3161563	3161568	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19582	NC_021014	ATTC	2	8	3162954	3162961	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19583	NC_021014	CAT	2	6	3163018	3163023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19584	NC_021014	CA	3	6	3163113	3163118	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19585	NC_021014	CAGCG	2	10	3163194	3163203	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
19586	NC_021014	C	6	6	3163214	3163219	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
19587	NC_021014	GTC	2	6	3163246	3163251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19588	NC_021014	CAGCG	2	10	3163252	3163261	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
19589	NC_021014	GAC	2	6	3163264	3163269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19590	NC_021014	CAAC	2	8	3163273	3163280	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19591	NC_021014	N	171	171	3163336	3163506	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19592	NC_021014	CA	3	6	3163538	3163543	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19593	NC_021014	A	7	7	3163543	3163549	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19594	NC_021014	A	6	6	3163563	3163568	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19595	NC_021014	CT	3	6	3163577	3163582	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19596	NC_021014	A	6	6	3163601	3163606	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19597	NC_021014	TCC	2	6	3163932	3163937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19598	NC_021014	AAT	2	6	3163949	3163954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19599	NC_021014	CCG	2	6	3163966	3163971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19600	NC_021014	A	6	6	3164019	3164024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19601	NC_021014	TAAA	2	8	3164072	3164079	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19602	NC_021014	T	6	6	3165354	3165359	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19603	NC_021014	T	6	6	3165397	3165402	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19604	NC_021014	TAA	2	6	3165447	3165452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19605	NC_021014	GAA	2	6	3165453	3165458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19606	NC_021014	GAG	2	6	3165514	3165519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19607	NC_021014	T	6	6	3165528	3165533	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19608	NC_021014	CAGA	2	8	3169887	3169894	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19609	NC_021014	T	6	6	3169895	3169900	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19610	NC_021014	TCAT	2	8	3171075	3171082	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19611	NC_021014	T	6	6	3171106	3171111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19612	NC_021014	AT	4	8	3171146	3171153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19613	NC_021014	T	7	7	3171168	3171174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19614	NC_021014	TA	4	8	3171176	3171183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19615	NC_021014	AGG	2	6	3171295	3171300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19616	NC_021014	ATTT	2	8	3174167	3174174	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19617	NC_021014	AC	3	6	3174185	3174190	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19618	NC_021014	TTC	2	6	3174192	3174197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19619	NC_021014	TAT	2	6	3174212	3174217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19620	NC_021014	TGA	2	6	3174231	3174236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19621	NC_021014	TTTTTC	2	12	3174250	3174261	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19622	NC_021014	CCT	2	6	3174287	3174292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19623	NC_021014	T	7	7	3174308	3174314	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19624	NC_021014	TCCT	2	8	3174364	3174371	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19625	NC_021014	CAG	2	6	3174402	3174407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19626	NC_021014	CT	3	6	3174427	3174432	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19627	NC_021014	ATA	2	6	3174497	3174502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19628	NC_021014	ATCC	2	8	3174615	3174622	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
19629	NC_021014	TC	3	6	3174657	3174662	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19630	NC_021014	T	6	6	3174792	3174797	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19631	NC_021014	ACC	2	6	3174818	3174823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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19633	NC_021014	CAG	2	6	3175013	3175018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19634	NC_021014	TCC	2	6	3175079	3175084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19635	NC_021014	TC	3	6	3175117	3175122	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19636	NC_021014	T	6	6	3175141	3175146	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19637	NC_021014	TTC	2	6	3175204	3175209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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19642	NC_021014	TCTT	2	8	3175278	3175285	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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19649	NC_021014	GAC	2	6	3175494	3175499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19651	NC_021014	AAC	2	6	3175593	3175598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19652	NC_021014	CTG	2	6	3175611	3175616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19667	NC_021014	T	6	6	3181639	3181644	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19668	NC_021014	CAG	2	6	3181657	3181662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19701	NC_021014	A	6	6	3185722	3185727	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19731	NC_021014	CCA	2	6	3188312	3188317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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19739	NC_021014	AGCTCC	2	12	3189586	3189597	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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19741	NC_021014	AT	3	6	3189634	3189639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19742	NC_021014	CCT	2	6	3189654	3189659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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19746	NC_021014	ATTT	2	8	3190018	3190025	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19747	NC_021014	ACAA	2	8	3190832	3190839	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
19748	NC_021014	A	6	6	3190902	3190907	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19749	NC_021014	TAT	2	6	3191170	3191175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19750	NC_021014	GGAAT	2	10	3191187	3191196	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
19751	NC_021014	AT	3	6	3191255	3191260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19752	NC_021014	ATA	2	6	3191296	3191301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19753	NC_021014	AGG	2	6	3191313	3191318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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19756	NC_021014	AATG	2	8	3191526	3191533	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19757	NC_021014	TA	3	6	3192125	3192130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19758	NC_021014	CTG	3	9	3192139	3192147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19759	NC_021014	AAT	2	6	3192184	3192189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19760	NC_021014	CA	3	6	3192255	3192260	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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19762	NC_021014	A	7	7	3196268	3196274	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19894	NC_021014	ATC	2	6	3229182	3229187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19895	NC_021014	CTC	2	6	3229188	3229193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19896	NC_021014	GAC	2	6	3229224	3229229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19897	NC_021014	ATCAT	2	10	3229354	3229363	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
19898	NC_021014	TCA	2	6	3229388	3229393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19899	NC_021014	ATA	2	6	3229629	3229634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19928	NC_021014	AAG	2	6	3234414	3234419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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19989	NC_021014	CT	3	6	3239562	3239567	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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19995	NC_021014	T	6	6	3239978	3239983	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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