MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 21901

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_021014	GA	3	6	3083038	3083043	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19002	NC_021014	AAC	2	6	3083079	3083084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19003	NC_021014	CTT	2	6	3083129	3083134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19004	NC_021014	TG	3	6	3083136	3083141	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19005	NC_021014	A	6	6	3083187	3083192	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19006	NC_021014	GC	3	6	3083221	3083226	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19007	NC_021014	AG	3	6	3083231	3083236	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19008	NC_021014	GGAG	2	8	3083254	3083261	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
19009	NC_021014	GAA	2	6	3083278	3083283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19010	NC_021014	TGA	2	6	3083364	3083369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19011	NC_021014	TGC	2	6	3083400	3083405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19012	NC_021014	ATT	2	6	3083417	3083422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19013	NC_021014	GA	3	6	3083473	3083478	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19014	NC_021014	AG	3	6	3084817	3084822	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19015	NC_021014	GA	3	6	3084934	3084939	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19016	NC_021014	TC	3	6	3084950	3084955	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19017	NC_021014	GCA	2	6	3084993	3084998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19018	NC_021014	ATC	2	6	3085077	3085082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19019	NC_021014	AG	3	6	3085163	3085168	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19020	NC_021014	CAT	2	6	3085203	3085208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19021	NC_021014	GCA	2	6	3085234	3085239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19022	NC_021014	GATCA	2	10	3085314	3085323	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
19023	NC_021014	T	7	7	3085350	3085356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19024	NC_021014	T	6	6	3085399	3085404	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19025	NC_021014	AGA	2	6	3085432	3085437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19026	NC_021014	AAAG	2	8	3085456	3085463	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19027	NC_021014	ACA	2	6	3085630	3085635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19028	NC_021014	TGA	2	6	3085648	3085653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19029	NC_021014	TA	3	6	3085658	3085663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19030	NC_021014	CTT	2	6	3085687	3085692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19031	NC_021014	ATTT	2	8	3085701	3085708	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19032	NC_021014	GA	3	6	3085766	3085771	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19033	NC_021014	ATTT	2	8	3085786	3085793	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19034	NC_021014	GA	3	6	3085928	3085933	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19035	NC_021014	GGCT	2	8	3085942	3085949	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19036	NC_021014	TAC	2	6	3085956	3085961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19037	NC_021014	GTACAG	2	12	3085993	3086004	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19038	NC_021014	GCAG	2	8	3086023	3086030	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19039	NC_021014	TCT	2	6	3086038	3086043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19040	NC_021014	GAA	2	6	3086047	3086052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19041	NC_021014	CAG	2	6	3086173	3086178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19042	NC_021014	GGA	2	6	3086199	3086204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19043	NC_021014	AGA	2	6	3086256	3086261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19044	NC_021014	ATG	2	6	3086273	3086278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19045	NC_021014	AGGC	2	8	3086369	3086376	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19046	NC_021014	AGA	2	6	3086391	3086396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19047	NC_021014	TCT	2	6	3086556	3086561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19048	NC_021014	TGA	2	6	3086585	3086590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19049	NC_021014	TCT	2	6	3086718	3086723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19050	NC_021014	TCA	2	6	3086787	3086792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19051	NC_021014	GAACTG	2	12	3086797	3086808	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19052	NC_021014	TATCTG	2	12	3086818	3086829	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19053	NC_021014	GAAG	2	8	3086898	3086905	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19054	NC_021014	A	6	6	3086961	3086966	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19055	NC_021014	GGA	2	6	3086979	3086984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19056	NC_021014	CTG	2	6	3087058	3087063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19057	NC_021014	GAT	2	6	3087229	3087234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19058	NC_021014	AT	3	6	3087255	3087260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19059	NC_021014	CTT	2	6	3087371	3087376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19060	NC_021014	AAC	2	6	3087421	3087426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19061	NC_021014	ATGC	2	8	3087461	3087468	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19062	NC_021014	GGAA	2	8	3087479	3087486	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19063	NC_021014	GGA	2	6	3087525	3087530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19064	NC_021014	ATGA	2	8	3087562	3087569	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19065	NC_021014	GAT	2	6	3087670	3087675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19066	NC_021014	CGTC	2	8	3087696	3087703	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19067	NC_021014	ACAG	2	8	3087704	3087711	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19068	NC_021014	GAA	2	6	3087721	3087726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19069	NC_021014	TGC	2	6	3087816	3087821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19070	NC_021014	TGA	2	6	3087852	3087857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19071	NC_021014	GTCAGG	2	12	3087923	3087934	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
19072	NC_021014	TGA	2	6	3087993	3087998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19073	NC_021014	ATT	2	6	3088031	3088036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19074	NC_021014	GAT	2	6	3088080	3088085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19075	NC_021014	GTG	2	6	3088171	3088176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19076	NC_021014	ATC	2	6	3088237	3088242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19077	NC_021014	ATG	2	6	3088310	3088315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19078	NC_021014	TGA	2	6	3088334	3088339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19079	NC_021014	GGA	2	6	3088419	3088424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19080	NC_021014	TCT	2	6	3088437	3088442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19081	NC_021014	AT	3	6	3088491	3088496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19082	NC_021014	AG	3	6	3088512	3088517	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19083	NC_021014	TGACC	2	10	3088644	3088653	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
19084	NC_021014	GAA	2	6	3088672	3088677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19085	NC_021014	A	6	6	3088676	3088681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19086	NC_021014	CTG	2	6	3088682	3088687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19087	NC_021014	GAA	2	6	3088690	3088695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19088	NC_021014	GGA	2	6	3088707	3088712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19089	NC_021014	A	6	6	3088712	3088717	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19090	NC_021014	TCCTC	2	10	3088718	3088727	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
19091	NC_021014	AGGA	2	8	3088736	3088743	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19092	NC_021014	GAT	2	6	3088801	3088806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19093	NC_021014	TAT	2	6	3088855	3088860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19094	NC_021014	GA	3	6	3088961	3088966	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19095	NC_021014	ATT	2	6	3088976	3088981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19096	NC_021014	CAGA	2	8	3088984	3088991	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19097	NC_021014	GAA	2	6	3089017	3089022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19098	NC_021014	A	6	6	3089021	3089026	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19099	NC_021014	ATCA	2	8	3089077	3089084	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19100	NC_021014	ATT	2	6	3092717	3092722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19101	NC_021014	AAT	2	6	3092747	3092752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19102	NC_021014	A	6	6	3092757	3092762	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19103	NC_021014	TCTT	2	8	3092795	3092802	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
19104	NC_021014	AAAAT	2	10	3092805	3092814	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19105	NC_021014	GAGG	2	8	3092835	3092842	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
19106	NC_021014	A	6	6	3093652	3093657	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19107	NC_021014	T	7	7	3094598	3094604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19108	NC_021014	CAG	2	6	3094616	3094621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19109	NC_021014	TGT	2	6	3094720	3094725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19110	NC_021014	AGG	2	6	3094777	3094782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19111	NC_021014	A	7	7	3094783	3094789	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19112	NC_021014	ATT	2	6	3095466	3095471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19113	NC_021014	TGAAA	2	10	3095472	3095481	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
19114	NC_021014	A	6	6	3095488	3095493	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19115	NC_021014	TC	3	6	3095524	3095529	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19116	NC_021014	ATC	2	6	3095559	3095564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19117	NC_021014	TTCCGG	2	12	3095570	3095581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19118	NC_021014	GCG	2	6	3095629	3095634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19119	NC_021014	ATC	2	6	3095637	3095642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19120	NC_021014	CAG	2	6	3095670	3095675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19121	NC_021014	AGA	2	6	3095737	3095742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19122	NC_021014	GAAA	2	8	3095743	3095750	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19123	NC_021014	AAG	2	6	3095771	3095776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19124	NC_021014	CTT	2	6	3095778	3095783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19125	NC_021014	GGA	2	6	3095835	3095840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19126	NC_021014	CAG	3	9	3095841	3095849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19127	NC_021014	T	6	6	3095895	3095900	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19128	NC_021014	ATGAA	2	10	3096001	3096010	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
19129	NC_021014	ATC	2	6	3096036	3096041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19130	NC_021014	CGC	2	6	3096076	3096081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19131	NC_021014	AGG	2	6	3096082	3096087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19132	NC_021014	TTC	2	6	3096092	3096097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19133	NC_021014	TA	3	6	3096181	3096186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19134	NC_021014	ATGT	2	8	3096251	3096258	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19135	NC_021014	AGG	2	6	3096263	3096268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19136	NC_021014	ATA	2	6	3096269	3096274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19137	NC_021014	ACAG	2	8	3097741	3097748	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19138	NC_021014	AAT	2	6	3097795	3097800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19139	NC_021014	AGG	2	6	3097814	3097819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19140	NC_021014	ACA	2	6	3099129	3099134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19141	NC_021014	GAA	2	6	3099147	3099152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19142	NC_021014	GGA	2	6	3100125	3100130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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19144	NC_021014	TTC	3	9	3100204	3100212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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19146	NC_021014	GT	3	6	3100660	3100665	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19147	NC_021014	ACAG	2	8	3100703	3100710	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19148	NC_021014	A	6	6	3100719	3100724	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19149	NC_021014	TTCATG	2	12	3100725	3100736	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19150	NC_021014	AAGT	2	8	3101143	3101150	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19151	NC_021014	TTC	2	6	3101232	3101237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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19155	NC_021014	GAGAA	2	10	3102328	3102337	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
19156	NC_021014	A	6	6	3102411	3102416	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19157	NC_021014	GACGA	2	10	3102423	3102432	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
19158	NC_021014	AG	4	8	3102452	3102459	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19159	NC_021014	TCCGG	2	10	3102522	3102531	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
19160	NC_021014	ATC	2	6	3102542	3102547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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19162	NC_021014	AGCA	2	8	3102589	3102596	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19163	NC_021014	GAAT	2	8	3102611	3102618	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19164	NC_021014	ACA	2	6	3102734	3102739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19165	NC_021014	CATTA	2	10	3102745	3102754	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
19166	NC_021014	A	6	6	3102766	3102771	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19167	NC_021014	TGC	2	6	3102834	3102839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19168	NC_021014	CCAT	2	8	3103021	3103028	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
19169	NC_021014	CTA	2	6	3103041	3103046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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19172	NC_021014	GGAG	2	8	3103224	3103231	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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19181	NC_021014	GA	3	6	3103844	3103849	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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19191	NC_021014	GA	3	6	3104442	3104447	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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19199	NC_021014	GAAGA	2	10	3104686	3104695	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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19244	NC_021014	G	6	6	3112649	3112654	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
19245	NC_021014	A	7	7	3112712	3112718	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19249	NC_021014	GAA	2	6	3112964	3112969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19250	NC_021014	GAA	2	6	3112978	3112983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19251	NC_021014	A	6	6	3113008	3113013	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19252	NC_021014	A	6	6	3113030	3113035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19253	NC_021014	GAA	2	6	3113099	3113104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19254	NC_021014	GCA	2	6	3113146	3113151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19255	NC_021014	AGA	2	6	3113331	3113336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19256	NC_021014	ATT	2	6	3113439	3113444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19257	NC_021014	A	6	6	3113473	3113478	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19259	NC_021014	GGA	2	6	3113521	3113526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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19262	NC_021014	TA	3	6	3113622	3113627	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19263	NC_021014	TA	5	10	3115465	3115474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19374	NC_021014	AT	3	6	3128269	3128274	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19375	NC_021014	AT	3	6	3128355	3128360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19384	NC_021014	TAGT	2	8	3129084	3129091	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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