MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 21901

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_021014	AGA	2	6	3029234	3029239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18502	NC_021014	A	7	7	3029239	3029245	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18503	NC_021014	A	6	6	3029288	3029293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18504	NC_021014	GGA	2	6	3029300	3029305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18505	NC_021014	CAA	2	6	3029306	3029311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18506	NC_021014	AG	3	6	3029329	3029334	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18507	NC_021014	GGA	2	6	3029402	3029407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18508	NC_021014	A	6	6	3029442	3029447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18509	NC_021014	AAG	3	9	3029530	3029538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18510	NC_021014	AT	3	6	3029545	3029550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18511	NC_021014	GAT	2	6	3029621	3029626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18512	NC_021014	ATT	3	9	3029636	3029644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18513	NC_021014	GAAATT	2	12	3029654	3029665	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18514	NC_021014	ATG	2	6	3029667	3029672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18515	NC_021014	T	7	7	3029706	3029712	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18516	NC_021014	AT	3	6	3029720	3029725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18517	NC_021014	AT	3	6	3029768	3029773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18518	NC_021014	AGA	2	6	3029794	3029799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18519	NC_021014	TTG	2	6	3029853	3029858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18520	NC_021014	TAG	2	6	3029878	3029883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18521	NC_021014	GAA	2	6	3029929	3029934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18522	NC_021014	AAC	2	6	3029963	3029968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18523	NC_021014	ATA	2	6	3030024	3030029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18524	NC_021014	TTA	2	6	3030041	3030046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18525	NC_021014	T	7	7	3030066	3030072	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18526	NC_021014	ATTT	2	8	3030096	3030103	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18527	NC_021014	ATT	2	6	3030107	3030112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18528	NC_021014	TGA	2	6	3030118	3030123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18529	NC_021014	AGA	2	6	3030178	3030183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18530	NC_021014	A	6	6	3030183	3030188	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18531	NC_021014	GAA	2	6	3030206	3030211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18532	NC_021014	AGA	2	6	3030220	3030225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18533	NC_021014	GAAAA	2	10	3030282	3030291	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
18534	NC_021014	TAT	2	6	3030323	3030328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18535	NC_021014	A	6	6	3030330	3030335	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18536	NC_021014	GCA	2	6	3030386	3030391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18537	NC_021014	AATTT	2	10	3030411	3030420	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18538	NC_021014	AAG	2	6	3030452	3030457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18539	NC_021014	GATT	2	8	3030485	3030492	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18540	NC_021014	AGTC	2	8	3030502	3030509	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18541	NC_021014	AAGG	2	8	3030574	3030581	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18542	NC_021014	TCCCC	2	10	3032377	3032386	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
18543	NC_021014	CAG	2	6	3032409	3032414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18544	NC_021014	TCT	2	6	3032451	3032456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18545	NC_021014	AAAG	2	8	3032555	3032562	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18546	NC_021014	GAA	2	6	3032577	3032582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18547	NC_021014	GT	3	6	3032596	3032601	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18548	NC_021014	AG	4	8	3032691	3032698	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18549	NC_021014	AT	3	6	3032703	3032708	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18550	NC_021014	TGA	2	6	3032717	3032722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18551	NC_021014	ATG	2	6	3032723	3032728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18552	NC_021014	CATT	2	8	3032733	3032740	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18553	NC_021014	TGC	2	6	3032856	3032861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18554	NC_021014	GT	3	6	3032958	3032963	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18555	NC_021014	TGAG	2	8	3032978	3032985	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
18556	NC_021014	GGA	2	6	3033109	3033114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18557	NC_021014	A	6	6	3033186	3033191	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18558	NC_021014	TTG	2	6	3033239	3033244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18559	NC_021014	GTA	2	6	3033278	3033283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18560	NC_021014	ACA	2	6	3033301	3033306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18561	NC_021014	TGAAGT	2	12	3033327	3033338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18562	NC_021014	GCA	2	6	3033535	3033540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18563	NC_021014	ATT	2	6	3033566	3033571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18564	NC_021014	ATC	2	6	3034982	3034987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18565	NC_021014	A	6	6	3035176	3035181	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18566	NC_021014	TATT	2	8	3035196	3035203	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18567	NC_021014	AAAAT	2	10	3035285	3035294	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18568	NC_021014	AT	3	6	3035318	3035323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18569	NC_021014	A	6	6	3035328	3035333	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18570	NC_021014	GA	3	6	3035362	3035367	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18571	NC_021014	ATA	2	6	3035380	3035385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18572	NC_021014	A	7	7	3035955	3035961	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18573	NC_021014	ATT	2	6	3035979	3035984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18574	NC_021014	ATTG	2	8	3036048	3036055	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18575	NC_021014	ATT	2	6	3036065	3036070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18576	NC_021014	ATG	2	6	3036071	3036076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18577	NC_021014	AGA	2	6	3036144	3036149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18578	NC_021014	GAT	2	6	3036201	3036206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18579	NC_021014	GCA	2	6	3036207	3036212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18580	NC_021014	A	6	6	3036216	3036221	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18581	NC_021014	GAA	2	6	3036238	3036243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18582	NC_021014	CAT	2	6	3036245	3036250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18583	NC_021014	CTTT	2	8	3036278	3036285	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
18584	NC_021014	CAA	2	6	3036323	3036328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18585	NC_021014	CAT	2	6	3036337	3036342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18588	NC_021014	ATT	2	6	3036396	3036401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18589	NC_021014	GA	3	6	3036463	3036468	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18590	NC_021014	ATG	2	6	3036521	3036526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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18592	NC_021014	ATC	2	6	3036561	3036566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18593	NC_021014	TATT	2	8	3036639	3036646	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18594	NC_021014	GGAA	2	8	3036699	3036706	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18595	NC_021014	AG	3	6	3036745	3036750	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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18597	NC_021014	AAG	2	6	3036773	3036778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18598	NC_021014	GAA	3	9	3036810	3036818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18599	NC_021014	TTC	2	6	3036843	3036848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18601	NC_021014	CATTT	2	10	3036971	3036980	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
18602	NC_021014	TTGA	2	8	3036990	3036997	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18603	NC_021014	AGAA	2	8	3037012	3037019	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18604	NC_021014	GAT	2	6	3037055	3037060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18605	NC_021014	TGT	2	6	3037061	3037066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18606	NC_021014	ATG	2	6	3037105	3037110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18607	NC_021014	AGA	2	6	3037132	3037137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18608	NC_021014	AT	3	6	3037138	3037143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18609	NC_021014	ATT	2	6	3037169	3037174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18610	NC_021014	CTG	2	6	3037176	3037181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18611	NC_021014	GAT	2	6	3037206	3037211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18612	NC_021014	GTT	2	6	3037277	3037282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18613	NC_021014	AATC	2	8	3037298	3037305	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18614	NC_021014	GAA	2	6	3037307	3037312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18615	NC_021014	TGC	2	6	3037316	3037321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18616	NC_021014	GAAAA	2	10	3037365	3037374	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
18617	NC_021014	TCA	2	6	3037388	3037393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18619	NC_021014	GAT	2	6	3037449	3037454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18620	NC_021014	GTT	2	6	3037464	3037469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18621	NC_021014	TAA	2	6	3038951	3038956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18622	NC_021014	GATA	2	8	3038988	3038995	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18623	NC_021014	TATG	2	8	3039014	3039021	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18624	NC_021014	A	6	6	3039064	3039069	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18625	NC_021014	AGA	2	6	3039074	3039079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18626	NC_021014	ATA	2	6	3039085	3039090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18627	NC_021014	ATAGA	2	10	3039100	3039109	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
18628	NC_021014	GAA	2	6	3039120	3039125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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18630	NC_021014	ATT	2	6	3039206	3039211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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