MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 21901

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_021014	GGT	2	6	2957435	2957440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18002	NC_021014	CTG	2	6	2957458	2957463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18003	NC_021014	TTCC	2	8	2957464	2957471	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18004	NC_021014	CCGGT	2	10	2957505	2957514	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
18005	NC_021014	TTTC	2	8	2957526	2957533	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
18006	NC_021014	CTT	2	6	2957534	2957539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18007	NC_021014	TGT	2	6	2957635	2957640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18008	NC_021014	TG	3	6	2957702	2957707	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18009	NC_021014	AT	3	6	2957780	2957785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18010	NC_021014	T	6	6	2957826	2957831	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18011	NC_021014	AG	3	6	2957838	2957843	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18012	NC_021014	CAA	2	6	2957896	2957901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18013	NC_021014	A	7	7	2957900	2957906	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18014	NC_021014	TA	3	6	2959607	2959612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18015	NC_021014	TTG	2	6	2959680	2959685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18016	NC_021014	AGG	2	6	2959710	2959715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18017	NC_021014	GGCA	2	8	2959725	2959732	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18018	NC_021014	CAG	2	6	2959844	2959849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18019	NC_021014	TGA	2	6	2959872	2959877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18020	NC_021014	AGC	2	6	2959887	2959892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18021	NC_021014	GAA	2	6	2959930	2959935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18022	NC_021014	A	6	6	2960038	2960043	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18023	NC_021014	AAGAAA	2	12	2960099	2960110	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18024	NC_021014	AGA	2	6	2960187	2960192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18025	NC_021014	AGA	2	6	2960208	2960213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18026	NC_021014	TGA	2	6	2960373	2960378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18027	NC_021014	GAAGG	2	10	2960382	2960391	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
18028	NC_021014	ATC	2	6	2960392	2960397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18029	NC_021014	TGA	2	6	2960457	2960462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18030	NC_021014	GA	4	8	2960505	2960512	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18031	NC_021014	TGGA	2	8	2960543	2960550	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
18032	NC_021014	ATCC	2	8	2960554	2960561	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
18033	NC_021014	AGAA	2	8	2960594	2960601	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18034	NC_021014	TGC	2	6	2960634	2960639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18035	NC_021014	ATCC	2	8	2960662	2960669	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
18036	NC_021014	CTT	2	6	2960683	2960688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18037	NC_021014	CTT	2	6	2960764	2960769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18038	NC_021014	CTT	2	6	2960815	2960820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18039	NC_021014	TCA	2	6	2960934	2960939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18040	NC_021014	GCT	2	6	2960983	2960988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18041	NC_021014	GCA	2	6	2961001	2961006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18042	NC_021014	CAGG	2	8	2961112	2961119	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18043	NC_021014	GAA	2	6	2961293	2961298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18044	NC_021014	GGCC	2	8	2961337	2961344	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18045	NC_021014	T	7	7	2961345	2961351	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18046	NC_021014	TGG	2	6	2962072	2962077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18047	NC_021014	ATA	2	6	2963096	2963101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18048	NC_021014	A	6	6	2963103	2963108	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18049	NC_021014	A	6	6	2963116	2963121	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18050	NC_021014	GAA	2	6	2963143	2963148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18051	NC_021014	T	7	7	2963158	2963164	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18052	NC_021014	CAGA	2	8	2963215	2963222	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18053	NC_021014	TCC	2	6	2964267	2964272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18054	NC_021014	ATT	2	6	2964291	2964296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18055	NC_021014	TAT	2	6	2964297	2964302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18056	NC_021014	ATT	2	6	2964308	2964313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18057	NC_021014	AGA	2	6	2964354	2964359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18058	NC_021014	AGC	3	9	2964363	2964371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18059	NC_021014	AAC	2	6	2964428	2964433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18060	NC_021014	CAGA	2	8	2964473	2964480	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18061	NC_021014	AGAA	2	8	2964621	2964628	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18062	NC_021014	A	6	6	2964665	2964670	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18063	NC_021014	CGG	2	6	2964687	2964692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18064	NC_021014	TCTGCT	2	12	2964694	2964705	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18065	NC_021014	GCATCA	2	12	2964736	2964747	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18066	NC_021014	GCG	2	6	2964750	2964755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18067	NC_021014	GGAA	2	8	2964770	2964777	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18068	NC_021014	TGC	2	6	2964886	2964891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18069	NC_021014	CAG	2	6	2965022	2965027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18070	NC_021014	TC	3	6	2965048	2965053	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18071	NC_021014	GAAA	2	8	2965104	2965111	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18072	NC_021014	T	6	6	2965187	2965192	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18073	NC_021014	ATA	3	9	2965199	2965207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18074	NC_021014	GAAT	2	8	2965221	2965228	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18075	NC_021014	AG	3	6	2965234	2965239	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18076	NC_021014	GAA	2	6	2965261	2965266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18077	NC_021014	A	7	7	2965304	2965310	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18078	NC_021014	GCA	2	6	2965341	2965346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18079	NC_021014	A	7	7	2965348	2965354	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18080	NC_021014	CCT	2	6	2965393	2965398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18081	NC_021014	GAA	2	6	2965492	2965497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18082	NC_021014	AGG	2	6	2966195	2966200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18083	NC_021014	AGG	2	6	2967411	2967416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18084	NC_021014	A	6	6	2967417	2967422	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18085	NC_021014	TTTA	2	8	2967877	2967884	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18086	NC_021014	GTAA	2	8	2967948	2967955	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18087	NC_021014	CGG	2	6	2968456	2968461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18088	NC_021014	ATC	2	6	2968479	2968484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18089	NC_021014	T	6	6	2968624	2968629	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18090	NC_021014	TAT	2	6	2968638	2968643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18091	NC_021014	TGT	2	6	2968670	2968675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18092	NC_021014	CTT	2	6	2968722	2968727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18093	NC_021014	AGA	3	9	2968768	2968776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18094	NC_021014	CTGTA	2	10	2968791	2968800	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
18095	NC_021014	TG	4	8	2968867	2968874	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18096	NC_021014	CCG	2	6	2968893	2968898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18097	NC_021014	ATG	2	6	2968903	2968908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18098	NC_021014	AGG	2	6	2969017	2969022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18099	NC_021014	TCT	2	6	2969229	2969234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18100	NC_021014	TGAG	2	8	2969395	2969402	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
18101	NC_021014	GGAGC	2	10	2969403	2969412	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
18102	NC_021014	TTA	2	6	2969446	2969451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18103	NC_021014	TGA	2	6	2969531	2969536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18104	NC_021014	CAA	2	6	2969602	2969607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18105	NC_021014	GT	3	6	2969653	2969658	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18106	NC_021014	CAG	2	6	2969676	2969681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18107	NC_021014	CAG	2	6	2969712	2969717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18108	NC_021014	ATG	2	6	2969749	2969754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18109	NC_021014	TGC	2	6	2969807	2969812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18110	NC_021014	GCA	2	6	2969853	2969858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18111	NC_021014	ATA	2	6	2969896	2969901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18112	NC_021014	T	6	6	2969938	2969943	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18113	NC_021014	TGC	2	6	2969947	2969952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18114	NC_021014	TCT	2	6	2969968	2969973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18115	NC_021014	AAT	2	6	2970063	2970068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18116	NC_021014	GCT	2	6	2970123	2970128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18117	NC_021014	TG	3	6	2970144	2970149	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18118	NC_021014	ATGCT	2	10	2970190	2970199	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
18119	NC_021014	TG	3	6	2970210	2970215	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18120	NC_021014	GGC	2	6	2970239	2970244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18121	NC_021014	GCG	2	6	2970321	2970326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18122	NC_021014	TCT	2	6	2970341	2970346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18123	NC_021014	TGA	2	6	2970394	2970399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18124	NC_021014	TGC	2	6	2970488	2970493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18125	NC_021014	ATA	3	9	2970515	2970523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18126	NC_021014	A	6	6	2970532	2970537	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18127	NC_021014	T	6	6	2970568	2970573	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18128	NC_021014	TAT	2	6	2970659	2970664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18129	NC_021014	TC	3	6	2970719	2970724	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18130	NC_021014	AGA	2	6	2970737	2970742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18131	NC_021014	TTC	2	6	2970820	2970825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18132	NC_021014	TGGC	2	8	2970908	2970915	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18133	NC_021014	GGAT	2	8	2970918	2970925	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
18134	NC_021014	GCT	2	6	2970930	2970935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18135	NC_021014	GCT	2	6	2971034	2971039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18136	NC_021014	GGGA	2	8	2971115	2971122	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
18137	NC_021014	AAG	2	6	2971123	2971128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18138	NC_021014	GTT	2	6	2971223	2971228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18139	NC_021014	ATTC	2	8	2971311	2971318	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18140	NC_021014	CGG	2	6	2971460	2971465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18141	NC_021014	CCG	2	6	2971559	2971564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18142	NC_021014	GCA	2	6	2971568	2971573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18143	NC_021014	GAA	2	6	2971608	2971613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18144	NC_021014	CA	3	6	2971632	2971637	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18145	NC_021014	GCA	2	6	2971653	2971658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18146	NC_021014	TTC	2	6	2971681	2971686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18150	NC_021014	CA	3	6	2971789	2971794	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18151	NC_021014	GT	3	6	2971884	2971889	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18152	NC_021014	AG	3	6	2971928	2971933	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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18155	NC_021014	CTTC	2	8	2972115	2972122	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18156	NC_021014	TTTC	2	8	2972148	2972155	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
18157	NC_021014	T	6	6	2972159	2972164	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18158	NC_021014	GTA	3	9	2972239	2972247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18159	NC_021014	TCC	2	6	2972285	2972290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18160	NC_021014	AGT	2	6	2972326	2972331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18161	NC_021014	N	439	439	2972345	2972783	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18162	NC_021014	CTT	2	6	2972806	2972811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18163	NC_021014	T	6	6	2972824	2972829	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18164	NC_021014	GCA	2	6	2972882	2972887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18165	NC_021014	T	8	8	2972894	2972901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18166	NC_021014	GCT	2	6	2972904	2972909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18167	NC_021014	T	7	7	2972914	2972920	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18168	NC_021014	CTTT	2	8	2972934	2972941	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
18169	NC_021014	TTG	2	6	2972955	2972960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18170	NC_021014	TCC	2	6	2972972	2972977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18171	NC_021014	CT	3	6	2973014	2973019	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18172	NC_021014	GA	4	8	2973025	2973032	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18173	NC_021014	CTGC	2	8	2973907	2973914	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18174	NC_021014	CGG	2	6	2973940	2973945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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18178	NC_021014	TTTG	2	8	2974070	2974077	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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18184	NC_021014	CAAA	2	8	2975267	2975274	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
18185	NC_021014	A	7	7	2975272	2975278	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18190	NC_021014	A	7	7	2977420	2977426	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18193	NC_021014	TTA	2	6	2977793	2977798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18223	NC_021014	T	6	6	2982529	2982534	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18240	NC_021014	A	6	6	2988501	2988506	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18244	NC_021014	T	7	7	2991404	2991410	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18245	NC_021014	TCT	2	6	2991429	2991434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18248	NC_021014	ACAT	2	8	2991529	2991536	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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18252	NC_021014	CAGAA	2	10	2991580	2991589	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
18253	NC_021014	CTC	2	6	2991600	2991605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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18255	NC_021014	TGG	2	6	2991699	2991704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18256	NC_021014	CCA	2	6	2991729	2991734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18257	NC_021014	ACA	2	6	2991806	2991811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18261	NC_021014	ATCAT	2	10	2991959	2991968	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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18433	NC_021014	AT	3	6	3023124	3023129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18481	NC_021014	GATA	2	8	3028244	3028251	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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