MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 21901

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17501	NC_021014	CTG	2	6	2865704	2865709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17502	NC_021014	CTTC	2	8	2865748	2865755	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17503	NC_021014	GAA	2	6	2865801	2865806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17504	NC_021014	AG	3	6	2866084	2866089	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17505	NC_021014	GGA	2	6	2866137	2866142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17506	NC_021014	CAGATG	2	12	2866200	2866211	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17507	NC_021014	CTG	2	6	2866212	2866217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17508	NC_021014	T	6	6	2866275	2866280	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17509	NC_021014	GGT	2	6	2866293	2866298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17510	NC_021014	TG	3	6	2866341	2866346	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17511	NC_021014	T	6	6	2866356	2866361	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17512	NC_021014	AGG	2	6	2866410	2866415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17513	NC_021014	A	6	6	2871229	2871234	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17514	NC_021014	CCA	2	6	2871272	2871277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17515	NC_021014	TAT	2	6	2871279	2871284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17516	NC_021014	AGG	2	6	2871305	2871310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17517	NC_021014	T	7	7	2871366	2871372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17518	NC_021014	CGT	2	6	2873542	2873547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17519	NC_021014	AAAG	2	8	2873553	2873560	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17520	NC_021014	GCA	2	6	2873613	2873618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17521	NC_021014	TGC	2	6	2873632	2873637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17522	NC_021014	CAGG	2	8	2873660	2873667	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17523	NC_021014	CAG	2	6	2873673	2873678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17524	NC_021014	TACAG	2	10	2873683	2873692	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
17525	NC_021014	CCAG	2	8	2873704	2873711	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17526	NC_021014	CCAGT	2	10	2873747	2873756	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
17527	NC_021014	GCAG	2	8	2873780	2873787	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17528	NC_021014	GCA	2	6	2873846	2873851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17529	NC_021014	GGA	2	6	2873852	2873857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17530	NC_021014	GCG	2	6	2873868	2873873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17531	NC_021014	CAG	2	6	2874002	2874007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17532	NC_021014	CGG	2	6	2874049	2874054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17533	NC_021014	CAG	2	6	2874095	2874100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17534	NC_021014	GGA	2	6	2874111	2874116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17535	NC_021014	A	6	6	2874154	2874159	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17536	NC_021014	T	6	6	2874221	2874226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17537	NC_021014	A	6	6	2874252	2874257	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17538	NC_021014	T	6	6	2876333	2876338	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17539	NC_021014	GTTTT	2	10	2876350	2876359	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
17540	NC_021014	GAT	2	6	2879055	2879060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17541	NC_021014	TACAA	2	10	2879095	2879104	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
17542	NC_021014	T	6	6	2879242	2879247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17543	NC_021014	AT	3	6	2879262	2879267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17544	NC_021014	TA	3	6	2879273	2879278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17545	NC_021014	TTTAT	2	10	2879318	2879327	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17546	NC_021014	AT	3	6	2879326	2879331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17547	NC_021014	CA	3	6	2879332	2879337	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17548	NC_021014	A	7	7	2881524	2881530	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17549	NC_021014	A	7	7	2881552	2881558	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17550	NC_021014	T	7	7	2881602	2881608	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17551	NC_021014	TA	3	6	2882577	2882582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17552	NC_021014	ATA	2	6	2882607	2882612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17553	NC_021014	TAG	2	6	2882642	2882647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17554	NC_021014	AGG	3	9	2882728	2882736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17555	NC_021014	A	6	6	2883671	2883676	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17556	NC_021014	TAT	2	6	2883682	2883687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17557	NC_021014	AAT	2	6	2883719	2883724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17558	NC_021014	A	6	6	2883727	2883732	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17559	NC_021014	TA	3	6	2883744	2883749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17560	NC_021014	TAT	2	6	2883756	2883761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17561	NC_021014	AAT	2	6	2883812	2883817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17562	NC_021014	GCA	2	6	2883888	2883893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17563	NC_021014	GCA	2	6	2883912	2883917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17564	NC_021014	AGCA	2	8	2883936	2883943	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17565	NC_021014	ACAG	2	8	2883954	2883961	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17566	NC_021014	CTT	2	6	2884004	2884009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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17569	NC_021014	GTA	2	6	2884103	2884108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17570	NC_021014	CAA	2	6	2884122	2884127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17571	NC_021014	TATC	2	8	2885816	2885823	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17572	NC_021014	GGA	2	6	2885824	2885829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17573	NC_021014	A	6	6	2885851	2885856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17574	NC_021014	TA	3	6	2885869	2885874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17575	NC_021014	A	7	7	2885874	2885880	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17576	NC_021014	T	7	7	2885909	2885915	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17577	NC_021014	GGC	2	6	2885924	2885929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17578	NC_021014	TGGG	2	8	2888425	2888432	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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17581	NC_021014	CCT	2	6	2888949	2888954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17582	NC_021014	T	6	6	2888992	2888997	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17583	NC_021014	A	6	6	2889011	2889016	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17584	NC_021014	TAA	2	6	2889052	2889057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17585	NC_021014	A	6	6	2889056	2889061	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17586	NC_021014	GCG	2	6	2889073	2889078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17587	NC_021014	TCAA	2	8	2889096	2889103	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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17589	NC_021014	CATGAG	2	12	2889905	2889916	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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17595	NC_021014	TCT	2	6	2890188	2890193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17596	NC_021014	CGG	2	6	2890203	2890208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17597	NC_021014	CAGG	2	8	2890282	2890289	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17598	NC_021014	GCT	2	6	2890293	2890298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17599	NC_021014	GCA	4	12	2890309	2890320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17600	NC_021014	A	6	6	2890320	2890325	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17601	NC_021014	GCGGT	2	10	2890376	2890385	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
17602	NC_021014	TGA	2	6	2890388	2890393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17603	NC_021014	GGC	2	6	2890408	2890413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17604	NC_021014	GATG	2	8	2890446	2890453	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
17605	NC_021014	AGG	2	6	2890454	2890459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17606	NC_021014	GA	3	6	2890460	2890465	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17607	NC_021014	AACTGG	2	12	2890487	2890498	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17608	NC_021014	CAT	2	6	2890512	2890517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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17610	NC_021014	CGT	2	6	2890612	2890617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17611	NC_021014	ACC	2	6	2890618	2890623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17612	NC_021014	AGGT	2	8	2890724	2890731	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
17613	NC_021014	TGA	2	6	2890894	2890899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17614	NC_021014	AAT	2	6	2890924	2890929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17615	NC_021014	ACTT	2	8	2890936	2890943	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17616	NC_021014	GAA	3	9	2891056	2891064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17617	NC_021014	AG	3	6	2891075	2891080	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17618	NC_021014	AAG	2	6	2894072	2894077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17619	NC_021014	CAG	2	6	2894087	2894092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17620	NC_021014	AAGA	2	8	2894132	2894139	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17621	NC_021014	GCA	2	6	2894144	2894149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17622	NC_021014	AGA	2	6	2894158	2894163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17623	NC_021014	TAT	2	6	2894451	2894456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17624	NC_021014	AAG	2	6	2894459	2894464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17625	NC_021014	TCT	2	6	2894490	2894495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17626	NC_021014	A	6	6	2894500	2894505	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17627	NC_021014	A	6	6	2894508	2894513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17628	NC_021014	A	6	6	2894517	2894522	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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