MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 21901

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_021014	TCA	2	6	2809375	2809380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17002	NC_021014	TGC	2	6	2809386	2809391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17003	NC_021014	ATTC	2	8	2809421	2809428	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17004	NC_021014	TCTGCT	2	12	2809444	2809455	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17005	NC_021014	ATG	2	6	2809501	2809506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17006	NC_021014	TCA	2	6	2809789	2809794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17007	NC_021014	TTC	2	6	2809821	2809826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17008	NC_021014	CCG	2	6	2809855	2809860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17009	NC_021014	T	6	6	2809909	2809914	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17010	NC_021014	CTT	2	6	2809933	2809938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17011	NC_021014	TAA	2	6	2809940	2809945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17012	NC_021014	GAA	2	6	2809948	2809953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17013	NC_021014	A	6	6	2810018	2810023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17014	NC_021014	CCG	2	6	2810095	2810100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17015	NC_021014	TCT	2	6	2810112	2810117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17016	NC_021014	CAT	2	6	2810161	2810166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17017	NC_021014	AACCGG	2	12	2810203	2810214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17018	NC_021014	ATT	2	6	2810243	2810248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17019	NC_021014	CTG	2	6	2810260	2810265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17020	NC_021014	TTC	2	6	2810284	2810289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17021	NC_021014	CTT	2	6	2810293	2810298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17022	NC_021014	TCC	2	6	2810420	2810425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17023	NC_021014	GCA	2	6	2810470	2810475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17024	NC_021014	TCC	2	6	2810478	2810483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17025	NC_021014	T	6	6	2810514	2810519	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17026	NC_021014	CT	3	6	2810525	2810530	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17027	NC_021014	TG	3	6	2810610	2810615	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17028	NC_021014	AAT	2	6	2810677	2810682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17029	NC_021014	TTAT	2	8	2810691	2810698	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17030	NC_021014	AAATT	2	10	2810722	2810731	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17031	NC_021014	ATT	2	6	2810807	2810812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17032	NC_021014	TTC	2	6	2810846	2810851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17033	NC_021014	TCC	2	6	2810877	2810882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17034	NC_021014	TAT	3	9	2810887	2810895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17035	NC_021014	GCA	2	6	2810901	2810906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17036	NC_021014	TTC	2	6	2810942	2810947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17037	NC_021014	GGAA	2	8	2811134	2811141	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17038	NC_021014	GCG	2	6	2811162	2811167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17039	NC_021014	GAAA	2	8	2811309	2811316	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17040	NC_021014	TTC	2	6	2811320	2811325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17041	NC_021014	T	6	6	2811389	2811394	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17042	NC_021014	CTTT	3	12	2811398	2811409	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
17043	NC_021014	T	6	6	2811519	2811524	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17044	NC_021014	GA	3	6	2811558	2811563	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17045	NC_021014	TAAA	2	8	2811586	2811593	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17046	NC_021014	TCC	2	6	2813483	2813488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17047	NC_021014	CTTTT	2	10	2813526	2813535	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
17048	NC_021014	AAT	2	6	2813597	2813602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17049	NC_021014	T	6	6	2813718	2813723	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17050	NC_021014	TCC	2	6	2813875	2813880	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17051	NC_021014	GCT	2	6	2813921	2813926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17052	NC_021014	ATGG	2	8	2813929	2813936	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
17053	NC_021014	TTC	2	6	2814021	2814026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17054	NC_021014	GAT	2	6	2814046	2814051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17055	NC_021014	AGA	2	6	2814057	2814062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17056	NC_021014	GAA	2	6	2814122	2814127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17057	NC_021014	GAAA	2	8	2814133	2814140	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17058	NC_021014	AGC	2	6	2814142	2814147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17059	NC_021014	ATTTCC	2	12	2814186	2814197	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17060	NC_021014	ATT	2	6	2814226	2814231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17061	NC_021014	TCC	2	6	2814282	2814287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17062	NC_021014	TGTT	2	8	2814289	2814296	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
17063	NC_021014	GCA	2	6	2814315	2814320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17064	NC_021014	ATAA	2	8	2815053	2815060	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17065	NC_021014	A	7	7	2815059	2815065	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17066	NC_021014	AT	3	6	2815233	2815238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17067	NC_021014	ATA	2	6	2815257	2815262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17068	NC_021014	GTA	2	6	2815289	2815294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17069	NC_021014	ACT	2	6	2815339	2815344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17070	NC_021014	ATT	2	6	2815384	2815389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17071	NC_021014	AGG	2	6	2815390	2815395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17072	NC_021014	T	6	6	2815687	2815692	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17073	NC_021014	AT	3	6	2815803	2815808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17074	NC_021014	A	6	6	2815904	2815909	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17075	NC_021014	TTG	2	6	2815910	2815915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17076	NC_021014	GTT	2	6	2815928	2815933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17077	NC_021014	A	6	6	2815944	2815949	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17078	NC_021014	T	6	6	2815996	2816001	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17079	NC_021014	T	6	6	2816087	2816092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17080	NC_021014	TAT	2	6	2816121	2816126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17081	NC_021014	TAG	2	6	2816203	2816208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17082	NC_021014	GTA	2	6	2816228	2816233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17083	NC_021014	ATC	2	6	2816272	2816277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17084	NC_021014	CTT	2	6	2816364	2816369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17085	NC_021014	TA	3	6	2816389	2816394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17086	NC_021014	ATC	2	6	2816395	2816400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17087	NC_021014	AAT	2	6	2816761	2816766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17088	NC_021014	CATTAT	3	18	2816861	2816878	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17089	NC_021014	ATTT	2	8	2817899	2817906	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17090	NC_021014	T	7	7	2817904	2817910	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17091	NC_021014	CGTT	2	8	2817915	2817922	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17092	NC_021014	ATAG	2	8	2817968	2817975	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17093	NC_021014	TTGG	2	8	2817978	2817985	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17094	NC_021014	GAC	2	6	2817998	2818003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17095	NC_021014	AAT	2	6	2818007	2818012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17096	NC_021014	AATT	2	8	2818048	2818055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17097	NC_021014	T	7	7	2818054	2818060	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17098	NC_021014	TTGGA	2	10	2818062	2818071	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
17099	NC_021014	TAC	2	6	2818653	2818658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17100	NC_021014	AAAT	3	12	2818663	2818674	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17101	NC_021014	AGG	2	6	2818682	2818687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17102	NC_021014	ATT	2	6	2818860	2818865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17103	NC_021014	ATA	2	6	2818907	2818912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17104	NC_021014	AGA	2	6	2818944	2818949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17105	NC_021014	GTT	2	6	2818955	2818960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17106	NC_021014	ATGAA	2	10	2819024	2819033	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
17107	NC_021014	ATT	2	6	2819072	2819077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17108	NC_021014	GGT	2	6	2819082	2819087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17109	NC_021014	ATG	2	6	2820535	2820540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17110	NC_021014	ATG	2	6	2820544	2820549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17111	NC_021014	T	6	6	2820556	2820561	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17112	NC_021014	T	6	6	2820594	2820599	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17113	NC_021014	TAG	2	6	2820832	2820837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17114	NC_021014	CAT	2	6	2820838	2820843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17115	NC_021014	ACA	2	6	2820872	2820877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17116	NC_021014	TTA	2	6	2821283	2821288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17117	NC_021014	GTAT	2	8	2821301	2821308	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17118	NC_021014	AATAT	2	10	2821327	2821336	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17119	NC_021014	TA	3	6	2821372	2821377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17120	NC_021014	AACAG	2	10	2821398	2821407	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
17121	NC_021014	AT	3	6	2821432	2821437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17122	NC_021014	AAT	2	6	2821438	2821443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17123	NC_021014	AG	3	6	2821481	2821486	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17124	NC_021014	A	6	6	2821580	2821585	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17125	NC_021014	ATT	2	6	2821591	2821596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17126	NC_021014	AGT	2	6	2821602	2821607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17127	NC_021014	TGA	2	6	2821632	2821637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17128	NC_021014	A	7	7	2821665	2821671	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17129	NC_021014	GATC	2	8	2821686	2821693	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17130	NC_021014	ATT	3	9	2821714	2821722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17131	NC_021014	TGA	2	6	2821755	2821760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17132	NC_021014	TAA	2	6	2821806	2821811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17133	NC_021014	TAT	2	6	2821824	2821829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17134	NC_021014	AGA	2	6	2821868	2821873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17135	NC_021014	CAA	2	6	2821957	2821962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17136	NC_021014	AGA	2	6	2821972	2821977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17137	NC_021014	A	7	7	2821999	2822005	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17138	NC_021014	TTA	2	6	2822070	2822075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17139	NC_021014	ATTAG	2	10	2822093	2822102	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17140	NC_021014	A	6	6	2822103	2822108	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17141	NC_021014	TGAA	2	8	2822111	2822118	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17142	NC_021014	TA	3	6	2822131	2822136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17143	NC_021014	A	6	6	2822147	2822152	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17144	NC_021014	ATT	2	6	2822158	2822163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17145	NC_021014	A	6	6	2822165	2822170	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17146	NC_021014	TAG	2	6	2822172	2822177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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17148	NC_021014	AG	3	6	2822212	2822217	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17149	NC_021014	CTT	2	6	2822259	2822264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17150	NC_021014	AT	3	6	2822275	2822280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17151	NC_021014	ATTA	2	8	2822362	2822369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17152	NC_021014	TGA	2	6	2822491	2822496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17153	NC_021014	ATTTG	2	10	2822512	2822521	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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17156	NC_021014	A	6	6	2822668	2822673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17157	NC_021014	TGAAAG	2	12	2822723	2822734	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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17159	NC_021014	TCT	2	6	2822756	2822761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17160	NC_021014	ATT	3	9	2822774	2822782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17161	NC_021014	ATA	2	6	2822886	2822891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17163	NC_021014	TCCT	2	8	2823394	2823401	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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17165	NC_021014	TGGA	2	8	2823559	2823566	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
17166	NC_021014	T	7	7	2823613	2823619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17167	NC_021014	T	6	6	2823662	2823667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17168	NC_021014	TG	3	6	2823688	2823693	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17169	NC_021014	T	6	6	2823697	2823702	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17170	NC_021014	AGAT	2	8	2823713	2823720	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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17175	NC_021014	TTGG	2	8	2824207	2824214	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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17178	NC_021014	GGC	2	6	2824507	2824512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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17187	NC_021014	A	6	6	2825852	2825857	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17190	NC_021014	TAA	2	6	2825929	2825934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17200	NC_021014	TTC	2	6	2830435	2830440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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17230	NC_021014	TGTT	2	8	2832218	2832225	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
17231	NC_021014	T	6	6	2832235	2832240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17232	NC_021014	ATC	2	6	2832245	2832250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17233	NC_021014	TAGG	2	8	2832280	2832287	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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17239	NC_021014	T	6	6	2832514	2832519	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17240	NC_021014	TCC	2	6	2832523	2832528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17241	NC_021014	TGC	2	6	2832535	2832540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17242	NC_021014	TGT	2	6	2832547	2832552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17243	NC_021014	TGCC	2	8	2832564	2832571	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17244	NC_021014	T	6	6	2832603	2832608	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17245	NC_021014	T	8	8	2832701	2832708	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17246	NC_021014	AGA	3	9	2832767	2832775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17247	NC_021014	CGTTTT	2	12	2832798	2832809	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17248	NC_021014	TTG	2	6	2832825	2832830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17249	NC_021014	TCC	2	6	2836561	2836566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17250	NC_021014	CCT	2	6	2837291	2837296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17251	NC_021014	CCG	2	6	2837321	2837326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17252	NC_021014	ATG	2	6	2837387	2837392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17253	NC_021014	TCA	2	6	2837448	2837453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17254	NC_021014	AAAGC	2	10	2837454	2837463	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
17255	NC_021014	ACA	2	6	2837477	2837482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17256	NC_021014	TGG	2	6	2837490	2837495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17257	NC_021014	TA	3	6	2837514	2837519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17259	NC_021014	AAGG	2	8	2837602	2837609	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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