MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 21901

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_021014	GT	3	6	2745452	2745457	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16502	NC_021014	TGTTC	2	10	2745469	2745478	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
16503	NC_021014	TTTC	2	8	2745521	2745528	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16504	NC_021014	CTT	2	6	2745549	2745554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16505	NC_021014	TTCT	2	8	2745560	2745567	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16506	NC_021014	CTT	2	6	2745572	2745577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16507	NC_021014	TTTC	2	8	2745578	2745585	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16508	NC_021014	AT	3	6	2745592	2745597	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16509	NC_021014	T	6	6	2745597	2745602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16510	NC_021014	TTC	2	6	2745609	2745614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16511	NC_021014	TCT	2	6	2745640	2745645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16512	NC_021014	AT	3	6	2745646	2745651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16513	NC_021014	CTC	2	6	2745702	2745707	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16514	NC_021014	ATA	2	6	2745754	2745759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16515	NC_021014	ATA	2	6	2745774	2745779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16516	NC_021014	TCA	2	6	2745811	2745816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16517	NC_021014	TTC	2	6	2745837	2745842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16518	NC_021014	CTGTT	2	10	2745862	2745871	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
16519	NC_021014	AAC	2	6	2745942	2745947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16520	NC_021014	CCA	2	6	2745959	2745964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16521	NC_021014	TA	3	6	2745990	2745995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16522	NC_021014	TAT	2	6	2746018	2746023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16523	NC_021014	ATA	2	6	2746024	2746029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16524	NC_021014	A	7	7	2746041	2746047	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16525	NC_021014	ATC	2	6	2746055	2746060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16526	NC_021014	CTT	2	6	2746128	2746133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16527	NC_021014	CCA	2	6	2746269	2746274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16528	NC_021014	TCC	2	6	2746288	2746293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16529	NC_021014	AGGAAG	2	12	2746303	2746314	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16530	NC_021014	TCA	2	6	2746320	2746325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16531	NC_021014	AGAA	2	8	2746339	2746346	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16532	NC_021014	CAA	2	6	2746360	2746365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16533	NC_021014	ATC	2	6	2746376	2746381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16534	NC_021014	GTA	2	6	2746502	2746507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16535	NC_021014	CTC	2	6	2746693	2746698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16536	NC_021014	TCCG	2	8	2746720	2746727	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16537	NC_021014	AAG	2	6	2746849	2746854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16538	NC_021014	ATCAC	2	10	2747012	2747021	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
16539	NC_021014	GCA	2	6	2747045	2747050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16540	NC_021014	ACAAA	2	10	2747115	2747124	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
16541	NC_021014	CAG	2	6	2747128	2747133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16542	NC_021014	GCA	2	6	2747153	2747158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16543	NC_021014	CA	3	6	2747177	2747182	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16544	NC_021014	GCC	2	6	2747281	2747286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16545	NC_021014	T	6	6	2747351	2747356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16546	NC_021014	AGA	2	6	2747360	2747365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16547	NC_021014	AAT	2	6	2747404	2747409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16548	NC_021014	TCC	2	6	2750098	2750103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16549	NC_021014	AG	3	6	2750112	2750117	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16550	NC_021014	CTT	2	6	2750118	2750123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16551	NC_021014	CT	3	6	2750134	2750139	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16552	NC_021014	T	6	6	2750732	2750737	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16553	NC_021014	ATT	2	6	2750738	2750743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16554	NC_021014	TCC	2	6	2752495	2752500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16555	NC_021014	TAT	2	6	2752540	2752545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16556	NC_021014	TCTT	2	8	2752557	2752564	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16557	NC_021014	ATA	2	6	2752617	2752622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16558	NC_021014	T	6	6	2752635	2752640	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16559	NC_021014	T	6	6	2753148	2753153	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16560	NC_021014	TACTTT	2	12	2753201	2753212	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16561	NC_021014	T	6	6	2753242	2753247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16562	NC_021014	CTTCT	2	10	2753267	2753276	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
16563	NC_021014	CTT	2	6	2753283	2753288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16564	NC_021014	TGCCA	2	10	2753328	2753337	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
16565	NC_021014	GCA	2	6	2753441	2753446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16568	NC_021014	AAT	2	6	2753642	2753647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16569	NC_021014	TAT	2	6	2753663	2753668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16570	NC_021014	T	7	7	2753690	2753696	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16571	NC_021014	GGA	2	6	2756025	2756030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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16573	NC_021014	AAG	2	6	2756083	2756088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16574	NC_021014	TCT	2	6	2756103	2756108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16575	NC_021014	GCA	2	6	2756119	2756124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16577	NC_021014	CAGAT	2	10	2756156	2756165	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
16578	NC_021014	ACC	2	6	2756229	2756234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16579	NC_021014	AGTA	2	8	2756264	2756271	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16580	NC_021014	CTG	2	6	2756301	2756306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16581	NC_021014	CCT	2	6	2756312	2756317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16582	NC_021014	ACA	2	6	2756329	2756334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16583	NC_021014	AAT	2	6	2756373	2756378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16584	NC_021014	CCT	2	6	2756403	2756408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16585	NC_021014	CCT	2	6	2757823	2757828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16586	NC_021014	ATA	3	9	2757834	2757842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16587	NC_021014	TCT	2	6	2757873	2757878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16588	NC_021014	GAA	2	6	2758097	2758102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16589	NC_021014	CAG	2	6	2758155	2758160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16590	NC_021014	GAT	2	6	2758221	2758226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16591	NC_021014	TTG	2	6	2758235	2758240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16592	NC_021014	ATCA	2	8	2758254	2758261	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16593	NC_021014	TTC	2	6	2758270	2758275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16594	NC_021014	TTA	2	6	2758315	2758320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16595	NC_021014	TCA	2	6	2759149	2759154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16596	NC_021014	GCTT	2	8	2759156	2759163	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16597	NC_021014	AC	3	6	2759168	2759173	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16598	NC_021014	ATG	2	6	2759178	2759183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16599	NC_021014	TTC	2	6	2759184	2759189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16600	NC_021014	T	6	6	2759723	2759728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16601	NC_021014	TAT	2	6	2759730	2759735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16602	NC_021014	CAG	2	6	2759739	2759744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16603	NC_021014	CCTG	2	8	2759770	2759777	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16604	NC_021014	T	6	6	2759843	2759848	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16605	NC_021014	TCC	2	6	2760629	2760634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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16607	NC_021014	T	6	6	2760670	2760675	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16608	NC_021014	TTG	2	6	2760687	2760692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16609	NC_021014	AG	3	6	2760788	2760793	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16610	NC_021014	T	7	7	2760830	2760836	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16611	NC_021014	ATT	2	6	2760843	2760848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16612	NC_021014	GTTT	2	8	2760851	2760858	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16613	NC_021014	TTG	2	6	2760907	2760912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16614	NC_021014	TA	4	8	2760936	2760943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16615	NC_021014	T	6	6	2760950	2760955	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16616	NC_021014	ATG	2	6	2760969	2760974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16618	NC_021014	T	6	6	2761527	2761532	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16619	NC_021014	ACT	2	6	2761558	2761563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16620	NC_021014	A	6	6	2761577	2761582	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16621	NC_021014	T	6	6	2761679	2761684	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16622	NC_021014	A	6	6	2761685	2761690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16623	NC_021014	AAG	2	6	2761722	2761727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16624	NC_021014	TAA	2	6	2761756	2761761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16625	NC_021014	T	6	6	2762850	2762855	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16626	NC_021014	TTG	2	6	2762873	2762878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16627	NC_021014	TTTC	2	8	2762882	2762889	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16628	NC_021014	ATT	2	6	2762925	2762930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16629	NC_021014	AGA	2	6	2762937	2762942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16630	NC_021014	CTTTT	2	10	2762964	2762973	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
16631	NC_021014	CATT	2	8	2762992	2762999	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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