MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 21901

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_021014	AATA	2	8	2614068	2614075	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15502	NC_021014	CTTTT	2	10	2614089	2614098	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
15503	NC_021014	TA	3	6	2614099	2614104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15504	NC_021014	T	6	6	2614110	2614115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15505	NC_021014	TAT	3	9	2614171	2614179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15506	NC_021014	CTTTT	2	10	2615569	2615578	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
15507	NC_021014	T	6	6	2615627	2615632	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15508	NC_021014	ATT	2	6	2615680	2615685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15509	NC_021014	AT	3	6	2616123	2616128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15510	NC_021014	AT	3	6	2616140	2616145	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15511	NC_021014	T	6	6	2616145	2616150	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15512	NC_021014	AAAT	2	8	2616166	2616173	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15513	NC_021014	TCA	2	6	2616194	2616199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15514	NC_021014	AT	3	6	2616220	2616225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15515	NC_021014	AGC	2	6	2616259	2616264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15516	NC_021014	A	6	6	2616286	2616291	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15517	NC_021014	CCT	2	6	2617615	2617620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15518	NC_021014	TA	3	6	2617632	2617637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15519	NC_021014	TGT	2	6	2617650	2617655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15520	NC_021014	TA	3	6	2617663	2617668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15521	NC_021014	AGT	2	6	2617678	2617683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15522	NC_021014	AT	3	6	2617695	2617700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15523	NC_021014	T	6	6	2617700	2617705	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15524	NC_021014	A	6	6	2617712	2617717	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15525	NC_021014	ATT	2	6	2617736	2617741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15526	NC_021014	TTATT	2	10	2617923	2617932	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15527	NC_021014	TA	3	6	2620083	2620088	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15528	NC_021014	TCA	2	6	2621104	2621109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15529	NC_021014	CT	3	6	2621114	2621119	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15530	NC_021014	TTAC	2	8	2621131	2621138	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15531	NC_021014	TCA	2	6	2625632	2625637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15532	NC_021014	CCT	2	6	2628055	2628060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15533	NC_021014	AAT	2	6	2628337	2628342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15534	NC_021014	T	6	6	2628346	2628351	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15535	NC_021014	AAT	2	6	2628431	2628436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15536	NC_021014	A	6	6	2628437	2628442	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15537	NC_021014	CCT	2	6	2628574	2628579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15538	NC_021014	CT	3	6	2628670	2628675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15539	NC_021014	TA	3	6	2628703	2628708	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15540	NC_021014	ATT	2	6	2628709	2628714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15541	NC_021014	AAG	2	6	2628853	2628858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15542	NC_021014	CATT	2	8	2628903	2628910	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15543	NC_021014	GCT	2	6	2628959	2628964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15544	NC_021014	TGG	2	6	2629004	2629009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15545	NC_021014	AGT	2	6	2629069	2629074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15546	NC_021014	GAAA	2	8	2629111	2629118	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15547	NC_021014	AAT	2	6	2629161	2629166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15548	NC_021014	GTA	2	6	2629171	2629176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15549	NC_021014	GTA	2	6	2629204	2629209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15550	NC_021014	T	6	6	2629244	2629249	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15551	NC_021014	CAA	2	6	2629302	2629307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15552	NC_021014	T	6	6	2629315	2629320	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15553	NC_021014	TTGG	2	8	2629325	2629332	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15554	NC_021014	GAT	2	6	2629336	2629341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15555	NC_021014	AT	3	6	2629340	2629345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15556	NC_021014	CAT	2	6	2629359	2629364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15557	NC_021014	TGC	2	6	2629371	2629376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15558	NC_021014	TTC	2	6	2629396	2629401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15559	NC_021014	TGCCA	2	10	2629415	2629424	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
15560	NC_021014	ATA	2	6	2629456	2629461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15561	NC_021014	TGA	2	6	2630161	2630166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15562	NC_021014	CGTG	2	8	2630174	2630181	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15563	NC_021014	CTG	2	6	2630801	2630806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15564	NC_021014	CCT	2	6	2630847	2630852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15565	NC_021014	GTAT	2	8	2630859	2630866	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15566	NC_021014	ATT	2	6	2630912	2630917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15567	NC_021014	AGG	2	6	2630997	2631002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15568	NC_021014	GGC	2	6	2631244	2631249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15569	NC_021014	AAG	2	6	2631306	2631311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15570	NC_021014	CTT	2	6	2631325	2631330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15571	NC_021014	AAAG	2	8	2631361	2631368	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15572	NC_021014	AGAA	2	8	2631660	2631667	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15573	NC_021014	GGA	2	6	2631682	2631687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15574	NC_021014	GTC	2	6	2631766	2631771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15575	NC_021014	CGG	2	6	2631832	2631837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15576	NC_021014	AGG	2	6	2631866	2631871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15577	NC_021014	A	6	6	2632349	2632354	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15578	NC_021014	A	6	6	2632448	2632453	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15579	NC_021014	GAAA	2	8	2632568	2632575	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15580	NC_021014	TGAT	2	8	2632622	2632629	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15581	NC_021014	TGG	2	6	2632645	2632650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15582	NC_021014	AGA	2	6	2632715	2632720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15583	NC_021014	TGGA	2	8	2632770	2632777	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15584	NC_021014	A	6	6	2632785	2632790	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15585	NC_021014	CCAT	2	8	2632901	2632908	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15586	NC_021014	AAGA	2	8	2632923	2632930	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15587	NC_021014	AAATC	2	10	2632986	2632995	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
15588	NC_021014	ACA	2	6	2633001	2633006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15589	NC_021014	CATTAT	2	12	2633057	2633068	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15590	NC_021014	AGA	2	6	2633092	2633097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15591	NC_021014	GAA	2	6	2633144	2633149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15592	NC_021014	CAG	2	6	2633150	2633155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15593	NC_021014	CT	4	8	2633204	2633211	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15594	NC_021014	GCT	2	6	2633263	2633268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15595	NC_021014	GAA	2	6	2633309	2633314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15596	NC_021014	TTA	2	6	2633396	2633401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15597	NC_021014	CAG	2	6	2633434	2633439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15598	NC_021014	GAG	2	6	2633522	2633527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15599	NC_021014	AAG	2	6	2633532	2633537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15600	NC_021014	CAGA	2	8	2633670	2633677	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15601	NC_021014	A	6	6	2634440	2634445	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15602	NC_021014	CTA	2	6	2634477	2634482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15603	NC_021014	TA	3	6	2634484	2634489	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15604	NC_021014	TC	4	8	2634509	2634516	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15605	NC_021014	ATT	2	6	2635407	2635412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15606	NC_021014	T	6	6	2635423	2635428	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15607	NC_021014	ACTTA	2	10	2635429	2635438	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
15608	NC_021014	TTC	2	6	2635462	2635467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15609	NC_021014	CCCAT	2	10	2635524	2635533	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
15610	NC_021014	T	7	7	2635557	2635563	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15611	NC_021014	TTTA	2	8	2635593	2635600	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15612	NC_021014	CTT	2	6	2635614	2635619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15613	NC_021014	T	6	6	2635649	2635654	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15614	NC_021014	A	7	7	2635692	2635698	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15615	NC_021014	AT	3	6	2635739	2635744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15616	NC_021014	TA	3	6	2635978	2635983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15617	NC_021014	TTCC	2	8	2635984	2635991	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15618	NC_021014	TAAA	2	8	2635999	2636006	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15619	NC_021014	T	6	6	2636489	2636494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15620	NC_021014	GTG	2	6	2636495	2636500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15621	NC_021014	AT	4	8	2636511	2636518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15622	NC_021014	ATA	2	6	2636521	2636526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15623	NC_021014	TA	3	6	2636530	2636535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15624	NC_021014	ATC	2	6	2636549	2636554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15625	NC_021014	TAAC	2	8	2636571	2636578	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15626	NC_021014	CCA	2	6	2636588	2636593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15627	NC_021014	A	6	6	2636596	2636601	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15628	NC_021014	ATT	2	6	2636618	2636623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15629	NC_021014	T	6	6	2637244	2637249	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15630	NC_021014	TCT	2	6	2637261	2637266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15631	NC_021014	T	6	6	2637272	2637277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15632	NC_021014	T	7	7	2637339	2637345	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15765	NC_021014	TCT	2	6	2645998	2646003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15766	NC_021014	TTC	2	6	2646010	2646015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15769	NC_021014	CCT	2	6	2646073	2646078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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15773	NC_021014	TGTC	2	8	2650123	2650130	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15774	NC_021014	TC	3	6	2650129	2650134	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15775	NC_021014	CAAA	2	8	2650145	2650152	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15776	NC_021014	TC	3	6	2650165	2650170	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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15778	NC_021014	ATT	2	6	2651072	2651077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15791	NC_021014	TC	3	6	2651967	2651972	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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15803	NC_021014	ATCA	2	8	2652746	2652753	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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15811	NC_021014	TTTA	2	8	2652941	2652948	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15843	NC_021014	CTGT	2	8	2658799	2658806	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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15881	NC_021014	TTG	2	6	2660340	2660345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15884	NC_021014	T	6	6	2660920	2660925	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15885	NC_021014	A	7	7	2660929	2660935	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15886	NC_021014	T	6	6	2660978	2660983	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15887	NC_021014	A	6	6	2660986	2660991	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15888	NC_021014	TAT	2	6	2661026	2661031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15889	NC_021014	A	7	7	2661091	2661097	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15890	NC_021014	CG	3	6	2661100	2661105	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15891	NC_021014	TAT	2	6	2661135	2661140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15927	NC_021014	T	6	6	2672415	2672420	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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