MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 21901

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_021014	TC	3	6	2438028	2438033	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14502	NC_021014	A	6	6	2438062	2438067	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14503	NC_021014	TCCA	2	8	2438078	2438085	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14504	NC_021014	AAT	2	6	2438089	2438094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14505	NC_021014	TA	4	8	2438128	2438135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14506	NC_021014	CTT	2	6	2438147	2438152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14507	NC_021014	TC	3	6	2438188	2438193	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14508	NC_021014	A	7	7	2438197	2438203	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14509	NC_021014	TTTAT	2	10	2438238	2438247	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14510	NC_021014	TATT	2	8	2438269	2438276	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14511	NC_021014	TTC	2	6	2438283	2438288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14512	NC_021014	TA	3	6	2438298	2438303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14513	NC_021014	ATAAA	2	10	2438405	2438414	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14514	NC_021014	TCT	2	6	2438434	2438439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14515	NC_021014	TCT	2	6	2438466	2438471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14516	NC_021014	CCCA	2	8	2438569	2438576	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
14517	NC_021014	T	6	6	2438587	2438592	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14518	NC_021014	AGC	2	6	2438601	2438606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14519	NC_021014	CTTT	2	8	2438609	2438616	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14520	NC_021014	ATCA	2	8	2438623	2438630	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14521	NC_021014	TG	3	6	2438684	2438689	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14522	NC_021014	T	6	6	2438716	2438721	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14523	NC_021014	TTTA	2	8	2438759	2438766	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14524	NC_021014	T	6	6	2438793	2438798	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14525	NC_021014	TAT	2	6	2438814	2438819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14526	NC_021014	TATT	2	8	2438823	2438830	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14527	NC_021014	AAT	2	6	2438914	2438919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14528	NC_021014	TTC	2	6	2438958	2438963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14529	NC_021014	TTA	2	6	2439021	2439026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14530	NC_021014	TGA	2	6	2439094	2439099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14531	NC_021014	TTC	2	6	2439326	2439331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14532	NC_021014	CCAC	2	8	2439342	2439349	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
14533	NC_021014	TTA	2	6	2439353	2439358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14534	NC_021014	TTA	2	6	2439360	2439365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14535	NC_021014	TCC	2	6	2439413	2439418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14536	NC_021014	T	7	7	2439422	2439428	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14537	NC_021014	AAAG	2	8	2439760	2439767	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14538	NC_021014	CAA	2	6	2439918	2439923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14539	NC_021014	GAT	2	6	2439996	2440001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14540	NC_021014	GAC	2	6	2440053	2440058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14541	NC_021014	GCA	2	6	2440062	2440067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14542	NC_021014	ATC	2	6	2440127	2440132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14543	NC_021014	TTTC	2	8	2440754	2440761	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14544	NC_021014	AAGT	2	8	2440771	2440778	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14545	NC_021014	ACTT	2	8	2440820	2440827	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14546	NC_021014	ATA	2	6	2440891	2440896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14547	NC_021014	T	6	6	2440906	2440911	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14548	NC_021014	AGCG	2	8	2441022	2441029	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14549	NC_021014	T	8	8	2441057	2441064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14550	NC_021014	GAAC	2	8	2441159	2441166	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14551	NC_021014	ATC	2	6	2441179	2441184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14552	NC_021014	TAA	2	6	2441274	2441279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14553	NC_021014	A	6	6	2441297	2441302	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14554	NC_021014	TCAGA	2	10	2441303	2441312	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
14555	NC_021014	ATT	2	6	2441340	2441345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14556	NC_021014	AGG	2	6	2441358	2441363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14557	NC_021014	AAC	2	6	2442326	2442331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14558	NC_021014	CAA	2	6	2442450	2442455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14559	NC_021014	A	6	6	2442465	2442470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14560	NC_021014	CAAA	2	8	2442505	2442512	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
14561	NC_021014	T	6	6	2442532	2442537	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14562	NC_021014	GCAT	2	8	2442550	2442557	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14563	NC_021014	A	6	6	2443182	2443187	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14564	NC_021014	TCC	2	6	2443199	2443204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14565	NC_021014	CTG	2	6	2443320	2443325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14566	NC_021014	ACG	2	6	2443357	2443362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14567	NC_021014	CTG	2	6	2443386	2443391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14568	NC_021014	TAT	2	6	2443479	2443484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14569	NC_021014	T	6	6	2443489	2443494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14570	NC_021014	ATT	2	6	2443514	2443519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14571	NC_021014	TTTG	2	8	2443610	2443617	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
14572	NC_021014	TCG	2	6	2443666	2443671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14573	NC_021014	ATA	2	6	2443711	2443716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14574	NC_021014	TAA	2	6	2443722	2443727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14575	NC_021014	TCG	2	6	2443793	2443798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14576	NC_021014	ATC	2	6	2443822	2443827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14577	NC_021014	CAG	2	6	2444012	2444017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14578	NC_021014	CAG	2	6	2444321	2444326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14579	NC_021014	AACAA	2	10	2444335	2444344	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
14580	NC_021014	AAG	2	6	2444359	2444364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14581	NC_021014	CCA	2	6	2444369	2444374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14582	NC_021014	GCG	2	6	2444498	2444503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14583	NC_021014	N	373	373	2444515	2444887	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14584	NC_021014	CAG	2	6	2444910	2444915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14585	NC_021014	TAA	2	6	2444939	2444944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14586	NC_021014	AGC	2	6	2444973	2444978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14587	NC_021014	ACC	2	6	2445078	2445083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14588	NC_021014	TC	3	6	2445169	2445174	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14589	NC_021014	CAG	2	6	2445234	2445239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14590	NC_021014	AAC	2	6	2445293	2445298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14591	NC_021014	CAA	2	6	2445311	2445316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14592	NC_021014	TGC	2	6	2445380	2445385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14593	NC_021014	CAA	2	6	2445416	2445421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14594	NC_021014	AT	3	6	2445431	2445436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14595	NC_021014	CAG	3	9	2445467	2445475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14596	NC_021014	CA	3	6	2445515	2445520	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14597	NC_021014	AGGT	2	8	2445529	2445536	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14598	NC_021014	CAG	2	6	2445570	2445575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14599	NC_021014	GACA	2	8	2445622	2445629	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14600	NC_021014	AGC	2	6	2445641	2445646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14601	NC_021014	GCA	2	6	2445696	2445701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14602	NC_021014	ATG	2	6	2445709	2445714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14603	NC_021014	AGC	2	6	2445774	2445779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14604	NC_021014	CT	3	6	2445825	2445830	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14605	NC_021014	AGC	2	6	2445875	2445880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14606	NC_021014	GACT	2	8	2445886	2445893	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14607	NC_021014	GGA	2	6	2445903	2445908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14608	NC_021014	CAA	2	6	2445943	2445948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14609	NC_021014	CAA	2	6	2445985	2445990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14610	NC_021014	GCA	3	9	2446176	2446184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14611	NC_021014	AGC	2	6	2446234	2446239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14612	NC_021014	TGC	2	6	2446400	2446405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14613	NC_021014	CTA	2	6	2446462	2446467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14614	NC_021014	CTA	2	6	2446630	2446635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14615	NC_021014	CAA	2	6	2446709	2446714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14616	NC_021014	ATG	2	6	2446789	2446794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14617	NC_021014	AAG	2	6	2446800	2446805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14618	NC_021014	TGA	2	6	2446901	2446906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14619	NC_021014	TGT	2	6	2446931	2446936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14620	NC_021014	ATG	2	6	2446995	2447000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14621	NC_021014	TGG	2	6	2447088	2447093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14622	NC_021014	GCAA	2	8	2447094	2447101	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14623	NC_021014	CTG	2	6	2447151	2447156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14624	NC_021014	GCCT	2	8	2447211	2447218	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14625	NC_021014	CTT	2	6	2447249	2447254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14626	NC_021014	ATT	2	6	2447451	2447456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14627	NC_021014	AGAA	2	8	2447523	2447530	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14628	NC_021014	GTT	2	6	2447541	2447546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14629	NC_021014	CTGG	2	8	2447555	2447562	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14630	NC_021014	AAGA	2	8	2447563	2447570	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14631	NC_021014	ATA	2	6	2447579	2447584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14632	NC_021014	T	6	6	2447673	2447678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14633	NC_021014	ATT	2	6	2447679	2447684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14634	NC_021014	GCA	2	6	2447762	2447767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14635	NC_021014	TTCAG	2	10	2447771	2447780	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
14636	NC_021014	AGA	2	6	2447800	2447805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14637	NC_021014	A	6	6	2448072	2448077	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14638	NC_021014	ATA	2	6	2448112	2448117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14639	NC_021014	TG	3	6	2448150	2448155	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14640	NC_021014	ATC	2	6	2448173	2448178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14641	NC_021014	TTA	2	6	2448201	2448206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14642	NC_021014	TATT	2	8	2448230	2448237	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14643	NC_021014	TCA	2	6	2452230	2452235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14645	NC_021014	T	6	6	2452272	2452277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14646	NC_021014	CTT	2	6	2452278	2452283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14651	NC_021014	CT	3	6	2452386	2452391	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14652	NC_021014	AGA	2	6	2452437	2452442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14653	NC_021014	GTTTT	2	10	2452479	2452488	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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14660	NC_021014	CTT	2	6	2452932	2452937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14661	NC_021014	T	7	7	2452968	2452974	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14662	NC_021014	GCG	2	6	2453025	2453030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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14664	NC_021014	ATC	2	6	2453099	2453104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14666	NC_021014	GAAAG	2	10	2453211	2453220	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
14667	NC_021014	TTAC	2	8	2453261	2453268	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14668	NC_021014	CTC	2	6	2453284	2453289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14669	NC_021014	T	7	7	2453311	2453317	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14674	NC_021014	TG	3	6	2456307	2456312	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14675	NC_021014	CTTG	2	8	2456340	2456347	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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14683	NC_021014	TA	3	6	2456886	2456891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14688	NC_021014	A	6	6	2457049	2457054	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14690	NC_021014	TCT	2	6	2458843	2458848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14701	NC_021014	CTGAT	2	10	2462239	2462248	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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14706	NC_021014	CCT	2	6	2462551	2462556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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14749	NC_021014	TCT	2	6	2467739	2467744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14751	NC_021014	TA	3	6	2467881	2467886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14752	NC_021014	GAA	2	6	2467910	2467915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14753	NC_021014	TGAA	2	8	2467924	2467931	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14754	NC_021014	GAT	2	6	2468051	2468056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14757	NC_021014	CCG	2	6	2468175	2468180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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14759	NC_021014	GAT	2	6	2468265	2468270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14999	NC_021014	AG	4	8	2504214	2504221	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15000	NC_021014	N	470	470	2504230	2504699	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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