MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 21901

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_021014	ATT	2	6	2096087	2096092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12502	NC_021014	TAT	2	6	2096123	2096128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12503	NC_021014	T	6	6	2096148	2096153	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12504	NC_021014	A	6	6	2096187	2096192	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12505	NC_021014	A	8	8	2096205	2096212	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12506	NC_021014	AAG	2	6	2096215	2096220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12507	NC_021014	TTTC	2	8	2096229	2096236	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12508	NC_021014	TTA	2	6	2096242	2096247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12509	NC_021014	GCT	2	6	2096272	2096277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12510	NC_021014	GAA	2	6	2096345	2096350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12511	NC_021014	CCG	2	6	2096382	2096387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12512	NC_021014	A	6	6	2096434	2096439	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12513	NC_021014	CCT	2	6	2096483	2096488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12514	NC_021014	TCC	2	6	2096515	2096520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12515	NC_021014	GTC	2	6	2096668	2096673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12516	NC_021014	TGC	2	6	2096692	2096697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12517	NC_021014	TTTC	2	8	2096803	2096810	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12518	NC_021014	CTT	2	6	2096829	2096834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12519	NC_021014	T	7	7	2096842	2096848	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12520	NC_021014	GGA	2	6	2096869	2096874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12521	NC_021014	ATC	2	6	2096902	2096907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12522	NC_021014	GAT	2	6	2096923	2096928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12523	NC_021014	TTC	2	6	2096932	2096937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12524	NC_021014	A	6	6	2096959	2096964	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12525	NC_021014	T	6	6	2097129	2097134	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12526	NC_021014	T	7	7	2097141	2097147	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12527	NC_021014	TGC	2	6	2097186	2097191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12528	NC_021014	CTG	2	6	2097207	2097212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12529	NC_021014	GAT	2	6	2097261	2097266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12530	NC_021014	GGA	2	6	2097273	2097278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12531	NC_021014	ATC	2	6	2097325	2097330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12532	NC_021014	CTG	2	6	2097331	2097336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12533	NC_021014	ACG	2	6	2097362	2097367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12534	NC_021014	CTTC	2	8	2097463	2097470	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12535	NC_021014	CT	3	6	2097908	2097913	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12536	NC_021014	CAG	2	6	2097957	2097962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12537	NC_021014	TCC	2	6	2100296	2100301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12538	NC_021014	AT	3	6	2100312	2100317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12539	NC_021014	TGC	2	6	2102893	2102898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12540	NC_021014	AT	3	6	2102921	2102926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12541	NC_021014	TA	3	6	2102989	2102994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12542	NC_021014	T	6	6	2103032	2103037	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12543	NC_021014	TAT	2	6	2103070	2103075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12544	NC_021014	T	7	7	2103084	2103090	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12545	NC_021014	ATC	2	6	2103169	2103174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12546	NC_021014	CTC	2	6	2103179	2103184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12547	NC_021014	TATGA	2	10	2103257	2103266	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12548	NC_021014	T	6	6	2103267	2103272	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12549	NC_021014	GAA	2	6	2103305	2103310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12550	NC_021014	A	6	6	2103309	2103314	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12551	NC_021014	ATA	2	6	2103394	2103399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12552	NC_021014	ATC	2	6	2103459	2103464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12553	NC_021014	CGG	2	6	2103572	2103577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12554	NC_021014	CAT	2	6	2103581	2103586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12555	NC_021014	TAA	2	6	2103596	2103601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12556	NC_021014	TCTG	2	8	2103738	2103745	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12557	NC_021014	CAA	2	6	2103771	2103776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12558	NC_021014	ATTT	2	8	2103785	2103792	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12559	NC_021014	TG	3	6	2104336	2104341	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12560	NC_021014	N	24	24	2104343	2104366	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12561	NC_021014	T	7	7	2104401	2104407	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12562	NC_021014	GCCAC	2	10	2104508	2104517	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
12563	NC_021014	CTG	2	6	2104565	2104570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12564	NC_021014	ATT	2	6	2104595	2104600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12565	NC_021014	CTG	2	6	2104617	2104622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12566	NC_021014	ATT	2	6	2104647	2104652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12567	NC_021014	CTG	2	6	2104669	2104674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12568	NC_021014	ATT	2	6	2104699	2104704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12569	NC_021014	CTG	2	6	2104721	2104726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12570	NC_021014	ATT	2	6	2104751	2104756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12571	NC_021014	CTG	2	6	2104773	2104778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12572	NC_021014	TTG	2	6	2104804	2104809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12573	NC_021014	ATT	2	6	2104821	2104826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12574	NC_021014	CTT	2	6	2104828	2104833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12575	NC_021014	AT	3	6	2104934	2104939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12576	NC_021014	GTA	2	6	2104979	2104984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12577	NC_021014	C	6	6	2105162	2105167	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12578	NC_021014	C	6	6	2105197	2105202	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12579	NC_021014	TCC	2	6	2105231	2105236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12580	NC_021014	TCC	2	6	2105252	2105257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12581	NC_021014	T	6	6	2106113	2106118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12582	NC_021014	AT	3	6	2106126	2106131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12583	NC_021014	TTCTT	2	10	2107366	2107375	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
12584	NC_021014	TGG	2	6	2108126	2108131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12585	NC_021014	CTG	2	6	2108168	2108173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12586	NC_021014	GAA	2	6	2108179	2108184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12587	NC_021014	TC	3	6	2108638	2108643	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12588	NC_021014	TCC	2	6	2108653	2108658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12589	NC_021014	GCA	2	6	2108783	2108788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12590	NC_021014	GGAAA	2	10	2108861	2108870	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
12591	NC_021014	CAG	2	6	2108921	2108926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12592	NC_021014	ACC	2	6	2108977	2108982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12593	NC_021014	TAC	2	6	2109015	2109020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12594	NC_021014	TTTTC	2	10	2109028	2109037	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
12595	NC_021014	CT	3	6	2109059	2109064	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12596	NC_021014	CTG	2	6	2109067	2109072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12597	NC_021014	CAG	2	6	2109086	2109091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12598	NC_021014	AT	3	6	2109134	2109139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12599	NC_021014	ATA	2	6	2109144	2109149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12600	NC_021014	T	6	6	2109169	2109174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12601	NC_021014	TTC	2	6	2110235	2110240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12602	NC_021014	CTT	2	6	2110352	2110357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12603	NC_021014	TA	3	6	2110360	2110365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12604	NC_021014	CCTG	2	8	2110380	2110387	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12605	NC_021014	ACA	2	6	2111362	2111367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12606	NC_021014	GCA	2	6	2111370	2111375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12607	NC_021014	A	6	6	2111453	2111458	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12608	NC_021014	CAT	2	6	2111470	2111475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12609	NC_021014	CTTC	2	8	2111496	2111503	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12610	NC_021014	CTG	2	6	2114116	2114121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12611	NC_021014	TA	3	6	2114191	2114196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12612	NC_021014	ATT	2	6	2114231	2114236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12613	NC_021014	AAC	2	6	2114254	2114259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12614	NC_021014	T	6	6	2114379	2114384	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12615	NC_021014	ATA	2	6	2114403	2114408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12616	NC_021014	TGG	2	6	2114453	2114458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12617	NC_021014	GCT	2	6	2114524	2114529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12618	NC_021014	T	6	6	2114529	2114534	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12619	NC_021014	GACG	2	8	2114597	2114604	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12620	NC_021014	TGC	2	6	2114750	2114755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12621	NC_021014	T	6	6	2114802	2114807	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12622	NC_021014	TCA	2	6	2114920	2114925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12623	NC_021014	GATCC	2	10	2115013	2115022	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
12624	NC_021014	GTA	2	6	2115028	2115033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12625	NC_021014	TTC	2	6	2115034	2115039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12626	NC_021014	TA	3	6	2115216	2115221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12627	NC_021014	GGCGTC	2	12	2115235	2115246	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
12628	NC_021014	CAT	2	6	2115248	2115253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12629	NC_021014	CGGG	2	8	2115258	2115265	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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12756	NC_021014	TCTT	2	8	2142213	2142220	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12757	NC_021014	TGA	2	6	2142252	2142257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12759	NC_021014	TTC	2	6	2142297	2142302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12762	NC_021014	TAA	2	6	2142378	2142383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12763	NC_021014	TAT	2	6	2142427	2142432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12764	NC_021014	TATT	2	8	2142436	2142443	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12765	NC_021014	TAT	2	6	2142449	2142454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12766	NC_021014	TTTG	2	8	2142472	2142479	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12767	NC_021014	T	6	6	2142482	2142487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12768	NC_021014	ATT	2	6	2142488	2142493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12770	NC_021014	GAA	2	6	2142524	2142529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12777	NC_021014	TCTG	2	8	2143102	2143109	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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12831	NC_021014	T	6	6	2154978	2154983	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12886	NC_021014	TTA	2	6	2167256	2167261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12888	NC_021014	A	6	6	2167325	2167330	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12889	NC_021014	GCT	2	6	2167331	2167336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12891	NC_021014	N	295	295	2167373	2167667	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12893	NC_021014	TGTT	2	8	2168314	2168321	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12894	NC_021014	TAT	2	6	2168327	2168332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12895	NC_021014	CAAG	2	8	2168354	2168361	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12896	NC_021014	CA	4	8	2168364	2168371	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12897	NC_021014	CTTA	2	8	2168431	2168438	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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12928	NC_021014	A	7	7	2172983	2172989	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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