MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 21901

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_021014	CAT	2	6	2019773	2019778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12002	NC_021014	ATC	2	6	2019821	2019826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12003	NC_021014	ATA	2	6	2019827	2019832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12004	NC_021014	TCT	2	6	2019872	2019877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12005	NC_021014	CAT	2	6	2019890	2019895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12006	NC_021014	GCT	2	6	2020000	2020005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12007	NC_021014	T	6	6	2020007	2020012	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12008	NC_021014	TTC	2	6	2020061	2020066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12009	NC_021014	TTTCCT	2	12	2020090	2020101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12010	NC_021014	TTC	2	6	2020128	2020133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12011	NC_021014	CAT	2	6	2020246	2020251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12012	NC_021014	TAA	2	6	2020299	2020304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12013	NC_021014	TCA	2	6	2020356	2020361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12014	NC_021014	TCT	2	6	2020405	2020410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12015	NC_021014	ATCC	2	8	2020481	2020488	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12016	NC_021014	TGT	2	6	2020501	2020506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12017	NC_021014	CTGT	2	8	2020529	2020536	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12018	NC_021014	GAT	2	6	2020541	2020546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12019	NC_021014	CGA	2	6	2020588	2020593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12020	NC_021014	ACA	2	6	2020605	2020610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12021	NC_021014	GGA	2	6	2020693	2020698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12022	NC_021014	AAC	2	6	2020702	2020707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12023	NC_021014	TTC	2	6	2020714	2020719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12024	NC_021014	TCA	2	6	2020767	2020772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12025	NC_021014	T	7	7	2020811	2020817	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12026	NC_021014	TCC	2	6	2020872	2020877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12027	NC_021014	T	7	7	2020887	2020893	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12028	NC_021014	ACC	2	6	2020964	2020969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12029	NC_021014	TTCCT	2	10	2020976	2020985	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
12030	NC_021014	T	6	6	2021012	2021017	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12031	NC_021014	ACC	2	6	2021028	2021033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12032	NC_021014	GTTCC	2	10	2021098	2021107	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
12033	NC_021014	TAT	2	6	2021140	2021145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12034	NC_021014	TCT	2	6	2021146	2021151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12035	NC_021014	TCA	2	6	2021163	2021168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12036	NC_021014	AAAG	2	8	2021169	2021176	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12037	NC_021014	GTT	2	6	2021205	2021210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12038	NC_021014	CTT	2	6	2021265	2021270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12039	NC_021014	TTC	2	6	2021309	2021314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12040	NC_021014	TCCT	2	8	2021770	2021777	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12041	NC_021014	CTG	2	6	2024313	2024318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12042	NC_021014	TTC	2	6	2024423	2024428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12043	NC_021014	GGC	2	6	2024514	2024519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12044	NC_021014	CGGA	2	8	2024621	2024628	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12045	NC_021014	TCA	2	6	2024721	2024726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12046	NC_021014	A	6	6	2024757	2024762	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12047	NC_021014	TCC	2	6	2024793	2024798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12048	NC_021014	T	6	6	2024867	2024872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12049	NC_021014	CAGT	2	8	2024968	2024975	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12050	NC_021014	T	6	6	2025134	2025139	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12051	NC_021014	TCA	2	6	2025142	2025147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12052	NC_021014	GCT	2	6	2025169	2025174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12053	NC_021014	GTC	2	6	2025194	2025199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12054	NC_021014	TTC	2	6	2025248	2025253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12055	NC_021014	TC	3	6	2025272	2025277	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12056	NC_021014	TCT	2	6	2025289	2025294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12057	NC_021014	AGA	2	6	2025306	2025311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12058	NC_021014	GGT	2	6	2025358	2025363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12059	NC_021014	CCAT	2	8	2025579	2025586	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12060	NC_021014	ATAA	2	8	2025590	2025597	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12061	NC_021014	GCT	2	6	2025599	2025604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12062	NC_021014	GCC	2	6	2025651	2025656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12063	NC_021014	GGA	2	6	2025658	2025663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12064	NC_021014	TGC	3	9	2025664	2025672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12065	NC_021014	GCC	2	6	2025693	2025698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12066	NC_021014	GTT	2	6	2025750	2025755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12067	NC_021014	CCT	2	6	2025778	2025783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12068	NC_021014	CTG	2	6	2025789	2025794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12069	NC_021014	T	6	6	2025804	2025809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12070	NC_021014	ATT	2	6	2025822	2025827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12071	NC_021014	TC	3	6	2025875	2025880	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12072	NC_021014	TCA	2	6	2025957	2025962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12073	NC_021014	TTC	2	6	2026994	2026999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12074	NC_021014	AAT	2	6	2027010	2027015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12075	NC_021014	CAAA	2	8	2027048	2027055	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12076	NC_021014	AAC	2	6	2027056	2027061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12077	NC_021014	GTT	2	6	2027098	2027103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12078	NC_021014	GGA	2	6	2027125	2027130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12079	NC_021014	T	6	6	2027163	2027168	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12080	NC_021014	CTTT	2	8	2029965	2029972	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12081	NC_021014	T	6	6	2029975	2029980	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12082	NC_021014	TTTTTA	2	12	2029983	2029994	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12083	NC_021014	T	6	6	2029995	2030000	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12084	NC_021014	TCTGT	2	10	2030080	2030089	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
12085	NC_021014	CTT	2	6	2030267	2030272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12086	NC_021014	CTG	3	9	2030342	2030350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12087	NC_021014	TCTCT	2	10	2030414	2030423	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
12088	NC_021014	GATC	2	8	2030456	2030463	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12089	NC_021014	CACAA	2	10	2030471	2030480	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
12090	NC_021014	GCC	2	6	2030503	2030508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12091	NC_021014	T	6	6	2030534	2030539	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12092	NC_021014	ACT	2	6	2030554	2030559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12093	NC_021014	TA	3	6	2030775	2030780	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12094	NC_021014	TTTA	2	8	2030801	2030808	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12095	NC_021014	TATTC	2	10	2030824	2030833	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
12096	NC_021014	CCT	2	6	2035682	2035687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12097	NC_021014	T	7	7	2035687	2035693	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12098	NC_021014	TTAT	2	8	2035705	2035712	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12099	NC_021014	TTATGT	2	12	2035722	2035733	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12100	NC_021014	T	6	6	2035805	2035810	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12101	NC_021014	N	1554	1554	2035870	2037423	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12102	NC_021014	ACC	2	6	2037485	2037490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12103	NC_021014	A	6	6	2037499	2037504	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12104	NC_021014	AT	4	8	2037527	2037534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12105	NC_021014	AC	3	6	2037540	2037545	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12106	NC_021014	A	6	6	2038625	2038630	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12107	NC_021014	TTC	2	6	2039353	2039358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12108	NC_021014	AAG	2	6	2039401	2039406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12109	NC_021014	CGGT	2	8	2039430	2039437	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12110	NC_021014	T	6	6	2039479	2039484	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12111	NC_021014	CTGCT	2	10	2040425	2040434	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
12112	NC_021014	TAATT	2	10	2040471	2040480	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12113	NC_021014	CTT	2	6	2040484	2040489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12114	NC_021014	T	6	6	2041150	2041155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12115	NC_021014	GAA	2	6	2041189	2041194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12116	NC_021014	TCT	2	6	2041264	2041269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12117	NC_021014	CA	3	6	2041320	2041325	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12118	NC_021014	GCT	2	6	2041346	2041351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12119	NC_021014	GAT	2	6	2041377	2041382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12120	NC_021014	TCA	2	6	2041397	2041402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12121	NC_021014	CAT	2	6	2041434	2041439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12122	NC_021014	TGA	2	6	2041523	2041528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12123	NC_021014	TCT	2	6	2041550	2041555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12124	NC_021014	GCC	2	6	2041668	2041673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12125	NC_021014	TGA	2	6	2041703	2041708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12126	NC_021014	CAA	2	6	2041745	2041750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12127	NC_021014	ATG	2	6	2041828	2041833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12128	NC_021014	CTT	2	6	2041836	2041841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12129	NC_021014	TGT	2	6	2041848	2041853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12130	NC_021014	ATA	2	6	2041879	2041884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12132	NC_021014	CTG	2	6	2041916	2041921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12137	NC_021014	TCT	2	6	2042249	2042254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12161	NC_021014	TAT	2	6	2047785	2047790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12260	NC_021014	GCC	2	6	2063917	2063922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12261	NC_021014	TAT	2	6	2063942	2063947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12262	NC_021014	TCCA	2	8	2063960	2063967	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12263	NC_021014	TA	3	6	2064001	2064006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12264	NC_021014	A	6	6	2064040	2064045	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12265	NC_021014	A	6	6	2064057	2064062	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12266	NC_021014	TCC	2	6	2064138	2064143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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12357	NC_021014	CAGCG	2	10	2079882	2079891	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
12358	NC_021014	ACC	2	6	2079918	2079923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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12373	NC_021014	CTC	2	6	2081320	2081325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12374	NC_021014	CT	3	6	2081348	2081353	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12375	NC_021014	CTT	2	6	2081381	2081386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12377	NC_021014	CGG	2	6	2081395	2081400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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12381	NC_021014	GCC	2	6	2081546	2081551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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12384	NC_021014	T	6	6	2081736	2081741	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12385	NC_021014	ATCA	2	8	2081762	2081769	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12386	NC_021014	TGC	2	6	2081779	2081784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12387	NC_021014	T	6	6	2082029	2082034	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12388	NC_021014	TTC	2	6	2082047	2082052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12389	NC_021014	TGA	2	6	2082135	2082140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12391	NC_021014	T	6	6	2082176	2082181	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12392	NC_021014	CTG	2	6	2082242	2082247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12412	NC_021014	T	6	6	2083568	2083573	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12433	NC_021014	TAT	2	6	2086850	2086855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12451	NC_021014	TCTT	2	8	2088697	2088704	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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12500	NC_021014	ACATA	2	10	2096008	2096017	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding

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