MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 21901

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_021014	ATC	2	6	1851798	1851803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11002	NC_021014	T	7	7	1851818	1851824	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11003	NC_021014	CCG	2	6	1851853	1851858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11004	NC_021014	ACA	2	6	1851861	1851866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11005	NC_021014	CTGTC	2	10	1851917	1851926	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
11006	NC_021014	TCA	2	6	1851940	1851945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11007	NC_021014	CCG	2	6	1852017	1852022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11008	NC_021014	CCT	2	6	1852092	1852097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11009	NC_021014	T	7	7	1852128	1852134	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11010	NC_021014	TAT	2	6	1852144	1852149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11011	NC_021014	TAT	2	6	1852177	1852182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11012	NC_021014	CATTTA	2	12	1853128	1853139	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11013	NC_021014	TCC	2	6	1853234	1853239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11014	NC_021014	TCT	2	6	1853267	1853272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11015	NC_021014	AT	3	6	1853273	1853278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11016	NC_021014	TCAT	2	8	1853279	1853286	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11017	NC_021014	AT	3	6	1853327	1853332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11018	NC_021014	TCA	2	6	1853343	1853348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11019	NC_021014	TCTT	2	8	1853379	1853386	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11020	NC_021014	TCG	2	6	1853510	1853515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11021	NC_021014	ATCC	2	8	1853524	1853531	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11022	NC_021014	TCT	2	6	1853544	1853549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11023	NC_021014	A	6	6	1853580	1853585	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11024	NC_021014	ATC	2	6	1853596	1853601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11025	NC_021014	TCT	2	6	1853709	1853714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11026	NC_021014	TC	3	6	1853720	1853725	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11027	NC_021014	AGCC	2	8	1853806	1853813	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11028	NC_021014	GCTG	2	8	1853847	1853854	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11029	NC_021014	CTT	2	6	1853857	1853862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11030	NC_021014	TTC	2	6	1853905	1853910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11031	NC_021014	ATG	2	6	1853924	1853929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11032	NC_021014	CCA	2	6	1853973	1853978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11033	NC_021014	TA	3	6	1853983	1853988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11034	NC_021014	CTG	2	6	1853991	1853996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11035	NC_021014	CCA	2	6	1854009	1854014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11036	NC_021014	TCTT	2	8	1854082	1854089	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11037	NC_021014	GACA	2	8	1854107	1854114	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11038	NC_021014	GC	3	6	1854139	1854144	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11039	NC_021014	GC	3	6	1854156	1854161	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11040	NC_021014	TCT	2	6	1854177	1854182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11041	NC_021014	ATT	2	6	1854185	1854190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11042	NC_021014	AAT	2	6	1856696	1856701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11043	NC_021014	CAG	2	6	1856726	1856731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11044	NC_021014	GAAAC	2	10	1856763	1856772	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
11045	NC_021014	GCA	2	6	1856837	1856842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11046	NC_021014	T	6	6	1856846	1856851	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11047	NC_021014	ACA	2	6	1856858	1856863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11048	NC_021014	GAGG	2	8	1858628	1858635	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
11049	NC_021014	GCT	2	6	1858679	1858684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11050	NC_021014	GATATA	2	12	1858703	1858714	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11051	NC_021014	A	6	6	1858750	1858755	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11052	NC_021014	TCAA	2	8	1858757	1858764	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11053	NC_021014	CAG	2	6	1858771	1858776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11054	NC_021014	CTGG	2	8	1858806	1858813	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11055	NC_021014	TTG	2	6	1858814	1858819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11056	NC_021014	TCTT	2	8	1858829	1858836	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11057	NC_021014	TCG	2	6	1858862	1858867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11058	NC_021014	TCC	2	6	1858873	1858878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11059	NC_021014	TGT	2	6	1858906	1858911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11060	NC_021014	CTG	2	6	1858914	1858919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11061	NC_021014	TGC	2	6	1858933	1858938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11062	NC_021014	TGT	2	6	1858951	1858956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11063	NC_021014	TGT	2	6	1858981	1858986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11064	NC_021014	GCT	2	6	1858997	1859002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11065	NC_021014	TCT	2	6	1859016	1859021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11066	NC_021014	GCT	2	6	1859036	1859041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11067	NC_021014	T	6	6	1859058	1859063	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11068	NC_021014	TGCT	2	8	1859190	1859197	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11069	NC_021014	ACA	2	6	1860002	1860007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11070	NC_021014	TTA	2	6	1860035	1860040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11071	NC_021014	N	197	197	1860108	1860304	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11072	NC_021014	ACC	2	6	1860365	1860370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11073	NC_021014	CAC	2	6	1860382	1860387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11074	NC_021014	TCTT	2	8	1861606	1861613	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11075	NC_021014	CCT	2	6	1863603	1863608	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11076	NC_021014	TTA	2	6	1863656	1863661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11077	NC_021014	CAA	2	6	1863681	1863686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11078	NC_021014	T	6	6	1863700	1863705	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11079	NC_021014	A	6	6	1863744	1863749	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11080	NC_021014	T	7	7	1863777	1863783	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11081	NC_021014	ATTTTT	2	12	1863789	1863800	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11082	NC_021014	TA	3	6	1863803	1863808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11083	NC_021014	ATT	2	6	1863849	1863854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11084	NC_021014	AAC	2	6	1863863	1863868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11085	NC_021014	ATCAAA	2	12	1863869	1863880	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11086	NC_021014	A	6	6	1863878	1863883	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11087	NC_021014	TTA	2	6	1863925	1863930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11088	NC_021014	TAC	2	6	1863954	1863959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11089	NC_021014	A	6	6	1864126	1864131	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11090	NC_021014	TCT	2	6	1864222	1864227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11091	NC_021014	TAT	2	6	1864249	1864254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11092	NC_021014	CTT	2	6	1865738	1865743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11093	NC_021014	ACT	2	6	1865764	1865769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11094	NC_021014	AGT	2	6	1865784	1865789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11095	NC_021014	A	6	6	1865843	1865848	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11096	NC_021014	N	197	197	1865930	1866126	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11097	NC_021014	ACC	2	6	1866187	1866192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11098	NC_021014	CAC	2	6	1866204	1866209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11099	NC_021014	CATC	2	8	1866231	1866238	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11100	NC_021014	GAA	2	6	1866266	1866271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11101	NC_021014	AGC	2	6	1866304	1866309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11102	NC_021014	AGA	2	6	1866311	1866316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11103	NC_021014	TTG	2	6	1866372	1866377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11104	NC_021014	ACC	2	6	1866388	1866393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11105	NC_021014	TGT	2	6	1866415	1866420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11106	NC_021014	ATGT	2	8	1866434	1866441	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11107	NC_021014	GAT	2	6	1866451	1866456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11108	NC_021014	AGAGA	2	10	1866468	1866477	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
11109	NC_021014	AAC	2	6	1866523	1866528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11110	NC_021014	ACC	2	6	1866559	1866564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11111	NC_021014	T	7	7	1866586	1866592	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11112	NC_021014	AAT	2	6	1866643	1866648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11113	NC_021014	CCA	2	6	1866686	1866691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11114	NC_021014	AGCA	2	8	1866790	1866797	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11115	NC_021014	GGA	2	6	1866821	1866826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11116	NC_021014	AAG	2	6	1866880	1866885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11117	NC_021014	CAT	2	6	1866928	1866933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11118	NC_021014	ACC	2	6	1866937	1866942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11119	NC_021014	CAG	2	6	1866945	1866950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11120	NC_021014	CAA	2	6	1866951	1866956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11121	NC_021014	ACA	2	6	1866962	1866967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11122	NC_021014	ACC	2	6	1866991	1866996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11123	NC_021014	AATA	2	8	1867030	1867037	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11124	NC_021014	GAA	2	6	1867077	1867082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11125	NC_021014	CAA	2	6	1867119	1867124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11126	NC_021014	T	6	6	1867150	1867155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11127	NC_021014	TCT	2	6	1867187	1867192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11128	NC_021014	CAC	2	6	1867251	1867256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11129	NC_021014	TCTG	2	8	1867297	1867304	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11130	NC_021014	AGA	2	6	1867330	1867335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11131	NC_021014	CTG	2	6	1867356	1867361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11132	NC_021014	TGA	2	6	1867374	1867379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11133	NC_021014	AAG	2	6	1867471	1867476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11134	NC_021014	CTG	2	6	1867483	1867488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11135	NC_021014	ACC	2	6	1867492	1867497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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11138	NC_021014	TTG	2	6	1867703	1867708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11139	NC_021014	CTT	2	6	1867740	1867745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11143	NC_021014	ATTTA	2	10	1868119	1868128	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11149	NC_021014	AGC	2	6	1868237	1868242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11151	NC_021014	TGC	2	6	1868282	1868287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11153	NC_021014	TCC	2	6	1868327	1868332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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11160	NC_021014	TTTC	2	8	1868795	1868802	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11161	NC_021014	TAT	2	6	1870070	1870075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11165	NC_021014	TTCC	2	8	1870407	1870414	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11166	NC_021014	CTGG	2	8	1870504	1870511	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11167	NC_021014	ATC	2	6	1870516	1870521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11172	NC_021014	CAT	2	6	1870812	1870817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11181	NC_021014	ATT	2	6	1872955	1872960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11184	NC_021014	TC	3	6	1873090	1873095	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11185	NC_021014	CACAT	2	10	1873201	1873210	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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11223	NC_021014	CAGC	2	8	1879550	1879557	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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11235	NC_021014	T	6	6	1880332	1880337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11239	NC_021014	T	7	7	1880925	1880931	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11247	NC_021014	ATTT	2	8	1883285	1883292	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11249	NC_021014	TCC	2	6	1884660	1884665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11250	NC_021014	CTTT	2	8	1884668	1884675	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11251	NC_021014	TAC	2	6	1884778	1884783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11254	NC_021014	TTG	2	6	1884830	1884835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11255	NC_021014	A	6	6	1884881	1884886	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11256	NC_021014	CT	3	6	1884887	1884892	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11257	NC_021014	TA	3	6	1884910	1884915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11259	NC_021014	T	6	6	1884935	1884940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11263	NC_021014	CTGC	2	8	1885306	1885313	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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11388	NC_021014	T	6	6	1906513	1906518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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