MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 21901

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_021014	GAA	2	6	1755463	1755468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10502	NC_021014	CCA	2	6	1755512	1755517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10503	NC_021014	CAG	2	6	1755524	1755529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10504	NC_021014	ATGTC	2	10	1755541	1755550	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10505	NC_021014	A	6	6	1755619	1755624	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10506	NC_021014	TATC	2	8	1755698	1755705	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10507	NC_021014	AT	3	6	1755761	1755766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10508	NC_021014	AGA	2	6	1755769	1755774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10509	NC_021014	CCA	2	6	1755779	1755784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10510	NC_021014	AGC	2	6	1755817	1755822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10511	NC_021014	AG	3	6	1755832	1755837	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10512	NC_021014	CT	3	6	1755845	1755850	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10513	NC_021014	TTCT	2	8	1755857	1755864	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10514	NC_021014	TAC	2	6	1755942	1755947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10515	NC_021014	CTG	2	6	1756163	1756168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10516	NC_021014	ACC	2	6	1756179	1756184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10517	NC_021014	GAT	2	6	1756185	1756190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10518	NC_021014	A	7	7	1756519	1756525	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10519	NC_021014	GGCAG	2	10	1756529	1756538	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
10520	NC_021014	ATC	2	6	1756638	1756643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10521	NC_021014	TGCT	2	8	1756652	1756659	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10522	NC_021014	CA	3	6	1756678	1756683	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10523	NC_021014	CTG	2	6	1756712	1756717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10524	NC_021014	GCA	2	6	1756763	1756768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10525	NC_021014	GCC	2	6	1756808	1756813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10526	NC_021014	GCT	2	6	1758813	1758818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10527	NC_021014	ATTTT	2	10	1758830	1758839	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10528	NC_021014	A	7	7	1758872	1758878	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10529	NC_021014	TCC	2	6	1758891	1758896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10530	NC_021014	GCA	2	6	1758948	1758953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10531	NC_021014	ATC	2	6	1760378	1760383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10532	NC_021014	TATT	2	8	1760402	1760409	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10533	NC_021014	CT	3	6	1760410	1760415	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10534	NC_021014	GTTTT	2	10	1760429	1760438	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
10535	NC_021014	ATAA	2	8	1761697	1761704	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10536	NC_021014	CA	3	6	1761753	1761758	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10537	NC_021014	AC	4	8	1761766	1761773	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10538	NC_021014	ATC	2	6	1761778	1761783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10539	NC_021014	AC	4	8	1761839	1761846	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10540	NC_021014	AC	3	6	1761912	1761917	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10541	NC_021014	GCG	2	6	1761942	1761947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10542	NC_021014	CAA	2	6	1761971	1761976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10543	NC_021014	CA	3	6	1761980	1761985	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10544	NC_021014	AAC	2	6	1762030	1762035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10545	NC_021014	GCA	2	6	1762037	1762042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10546	NC_021014	CCGC	2	8	1762066	1762073	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10547	NC_021014	A	7	7	1762090	1762096	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10548	NC_021014	TGTC	2	8	1763351	1763358	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10549	NC_021014	TAAAG	2	10	1763369	1763378	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10550	NC_021014	AT	3	6	1763432	1763437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10551	NC_021014	CCT	2	6	1764215	1764220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10552	NC_021014	CTG	2	6	1766473	1766478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10553	NC_021014	AGG	2	6	1766504	1766509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10554	NC_021014	ATT	2	6	1766513	1766518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10555	NC_021014	TGC	2	6	1766553	1766558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10556	NC_021014	TCA	2	6	1766602	1766607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10557	NC_021014	ACA	2	6	1766665	1766670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10558	NC_021014	CAT	2	6	1766675	1766680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10559	NC_021014	ACA	2	6	1767073	1767078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10560	NC_021014	TTG	2	6	1767103	1767108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10561	NC_021014	ATT	2	6	1767144	1767149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10562	NC_021014	CTTT	2	8	1767170	1767177	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10563	NC_021014	TCC	2	6	1767550	1767555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10564	NC_021014	GCA	2	6	1767607	1767612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10565	NC_021014	TCC	2	6	1768283	1768288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10566	NC_021014	ATCTT	2	10	1768292	1768301	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10567	NC_021014	AT	3	6	1768316	1768321	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10568	NC_021014	TCC	2	6	1769941	1769946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10569	NC_021014	TCC	2	6	1771345	1771350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10570	NC_021014	TCC	2	6	1772259	1772264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10571	NC_021014	GTT	2	6	1772339	1772344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10572	NC_021014	TTG	2	6	1772358	1772363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10573	NC_021014	TGT	2	6	1772371	1772376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10574	NC_021014	T	6	6	1772413	1772418	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10575	NC_021014	GTT	2	6	1775786	1775791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10577	NC_021014	TAT	2	6	1775858	1775863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10578	NC_021014	T	6	6	1775956	1775961	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10579	NC_021014	TCTGC	2	10	1775996	1776005	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
10580	NC_021014	TA	3	6	1776018	1776023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10584	NC_021014	CA	3	6	1777258	1777263	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10585	NC_021014	T	6	6	1777267	1777272	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10586	NC_021014	A	6	6	1777278	1777283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10589	NC_021014	A	6	6	1777432	1777437	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10590	NC_021014	GTT	2	6	1777475	1777480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10593	NC_021014	CATA	2	8	1777558	1777565	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10594	NC_021014	CTC	2	6	1777589	1777594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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10596	NC_021014	TAA	2	6	1777723	1777728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10597	NC_021014	TA	3	6	1777767	1777772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10598	NC_021014	T	6	6	1777823	1777828	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10599	NC_021014	CTG	2	6	1777854	1777859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10602	NC_021014	TGT	2	6	1777884	1777889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10603	NC_021014	TA	3	6	1779466	1779471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10604	NC_021014	ATTA	2	8	1779507	1779514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10605	NC_021014	TTA	2	6	1779534	1779539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10607	NC_021014	TACA	2	8	1779613	1779620	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10608	NC_021014	TTTC	2	8	1779623	1779630	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10609	NC_021014	CCTT	2	8	1781137	1781144	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10610	NC_021014	GATA	2	8	1781146	1781153	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10611	NC_021014	TA	3	6	1781230	1781235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10612	NC_021014	CTGT	2	8	1781388	1781395	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10613	NC_021014	TCC	2	6	1782410	1782415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10614	NC_021014	A	7	7	1784553	1784559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10615	NC_021014	A	6	6	1785943	1785948	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10621	NC_021014	T	6	6	1787696	1787701	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10622	NC_021014	TTAC	2	8	1787756	1787763	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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10626	NC_021014	ATCTG	2	10	1787925	1787934	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10627	NC_021014	T	6	6	1787959	1787964	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10629	NC_021014	T	6	6	1787978	1787983	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10631	NC_021014	CAT	2	6	1788137	1788142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10886	NC_021014	GCA	2	6	1835371	1835376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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