MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 21901

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_021014	TAT	2	6	1673086	1673091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10002	NC_021014	GGAA	2	8	1673101	1673108	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10003	NC_021014	GATTA	2	10	1673186	1673195	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10004	NC_021014	T	6	6	1673204	1673209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10005	NC_021014	TG	3	6	1673220	1673225	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10006	NC_021014	TCA	2	6	1673253	1673258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10007	NC_021014	TC	3	6	1673366	1673371	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10008	NC_021014	TCA	2	6	1673376	1673381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10009	NC_021014	TCCT	2	8	1673390	1673397	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10010	NC_021014	AGA	2	6	1673428	1673433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10011	NC_021014	AT	3	6	1673829	1673834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10012	NC_021014	TTA	2	6	1673844	1673849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10013	NC_021014	TA	3	6	1673848	1673853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10014	NC_021014	TAAT	2	8	1673914	1673921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10015	NC_021014	ATT	2	6	1673925	1673930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10016	NC_021014	AGC	2	6	1673932	1673937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10017	NC_021014	TGC	2	6	1673939	1673944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10018	NC_021014	TA	3	6	1673970	1673975	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10019	NC_021014	GA	3	6	1675184	1675189	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10020	NC_021014	T	7	7	1675208	1675214	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10021	NC_021014	TA	3	6	1675263	1675268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10022	NC_021014	GAA	2	6	1675270	1675275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10023	NC_021014	A	7	7	1675285	1675291	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10024	NC_021014	GCA	2	6	1675314	1675319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10025	NC_021014	TGC	2	6	1675343	1675348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10026	NC_021014	CCG	2	6	1675404	1675409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10027	NC_021014	GCA	2	6	1675522	1675527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10028	NC_021014	TA	3	6	1675663	1675668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10029	NC_021014	GT	3	6	1675871	1675876	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10030	NC_021014	A	6	6	1675897	1675902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10031	NC_021014	A	6	6	1675917	1675922	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10032	NC_021014	CAG	2	6	1675924	1675929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10033	NC_021014	A	6	6	1676003	1676008	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10034	NC_021014	A	7	7	1676020	1676026	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10035	NC_021014	A	7	7	1676128	1676134	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10036	NC_021014	CAG	2	6	1676136	1676141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10037	NC_021014	GA	3	6	1676303	1676308	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10038	NC_021014	A	6	6	1676308	1676313	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10039	NC_021014	T	6	6	1676315	1676320	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10040	NC_021014	A	6	6	1676342	1676347	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10041	NC_021014	CGG	2	6	1676432	1676437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10042	NC_021014	T	6	6	1676457	1676462	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10043	NC_021014	T	6	6	1676490	1676495	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10044	NC_021014	A	7	7	1676562	1676568	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10045	NC_021014	TAT	2	6	1676645	1676650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10046	NC_021014	AAT	2	6	1676842	1676847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10047	NC_021014	AAG	2	6	1676862	1676867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10048	NC_021014	AG	3	6	1677097	1677102	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10049	NC_021014	GGA	2	6	1677105	1677110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10050	NC_021014	GTTTTT	2	12	1678374	1678385	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10051	NC_021014	T	7	7	1678817	1678823	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10052	NC_021014	TA	3	6	1678856	1678861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10053	NC_021014	GAATA	2	10	1678874	1678883	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10054	NC_021014	TAA	3	9	1679225	1679233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10055	NC_021014	CTGT	2	8	1679250	1679257	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10056	NC_021014	CTT	2	6	1679268	1679273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10057	NC_021014	TA	3	6	1679276	1679281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10058	NC_021014	TAA	2	6	1682742	1682747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10059	NC_021014	GCA	2	6	1682749	1682754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10060	NC_021014	GAT	2	6	1682836	1682841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10061	NC_021014	GAA	2	6	1683009	1683014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10062	NC_021014	AAGT	2	8	1683123	1683130	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10063	NC_021014	GTCT	2	8	1683138	1683145	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10064	NC_021014	GATCA	2	10	1683235	1683244	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10065	NC_021014	TCT	2	6	1683361	1683366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10066	NC_021014	ATCT	2	8	1683483	1683490	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10067	NC_021014	CT	3	6	1683489	1683494	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10068	NC_021014	GAT	2	6	1683496	1683501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10069	NC_021014	ATA	2	6	1683545	1683550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10070	NC_021014	CAA	2	6	1683624	1683629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10071	NC_021014	TCCAG	2	10	1683743	1683752	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10072	NC_021014	CT	3	6	1683761	1683766	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10073	NC_021014	CT	3	6	1683814	1683819	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10074	NC_021014	TC	3	6	1683823	1683828	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10075	NC_021014	GAT	2	6	1683898	1683903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10076	NC_021014	GCA	2	6	1683991	1683996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10077	NC_021014	TCT	2	6	1684048	1684053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10078	NC_021014	GGA	2	6	1684209	1684214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10079	NC_021014	CGG	2	6	1684281	1684286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10080	NC_021014	GGA	2	6	1684428	1684433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10081	NC_021014	ACT	2	6	1684483	1684488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10082	NC_021014	GAT	2	6	1684513	1684518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10083	NC_021014	CTG	2	6	1684571	1684576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10084	NC_021014	CAG	2	6	1684636	1684641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10085	NC_021014	TGGT	2	8	1684724	1684731	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10086	NC_021014	TTC	2	6	1684854	1684859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10087	NC_021014	GCA	2	6	1684876	1684881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10088	NC_021014	GAA	2	6	1684882	1684887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10089	NC_021014	TCT	2	6	1684894	1684899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10090	NC_021014	GCA	2	6	1684945	1684950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10091	NC_021014	TTC	2	6	1684962	1684967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10092	NC_021014	GAAAC	2	10	1684985	1684994	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
10093	NC_021014	ACA	2	6	1685047	1685052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10094	NC_021014	CCA	2	6	1685053	1685058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10095	NC_021014	AGG	2	6	1685064	1685069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10096	NC_021014	GCA	2	6	1685113	1685118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10097	NC_021014	ACT	2	6	1685191	1685196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10098	NC_021014	ATC	2	6	1685312	1685317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10099	NC_021014	CAG	2	6	1685355	1685360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10100	NC_021014	GCA	2	6	1685536	1685541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10101	NC_021014	ATT	2	6	1685651	1685656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10102	NC_021014	AAAACA	2	12	1685666	1685677	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10103	NC_021014	AGAA	2	8	1685800	1685807	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10104	NC_021014	GAA	3	9	1685925	1685933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10105	NC_021014	GAAG	2	8	1685937	1685944	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10106	NC_021014	CAG	2	6	1685950	1685955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10107	NC_021014	TGA	2	6	1685982	1685987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10108	NC_021014	A	6	6	1685992	1685997	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10109	NC_021014	AGC	2	6	1686010	1686015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10110	NC_021014	TAC	2	6	1686082	1686087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10111	NC_021014	AAG	2	6	1686116	1686121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10112	NC_021014	GCA	2	6	1686127	1686132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10113	NC_021014	A	6	6	1686140	1686145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10114	NC_021014	AGA	2	6	1688206	1688211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10115	NC_021014	TA	3	6	1689432	1689437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10116	NC_021014	GAAG	2	8	1689439	1689446	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10117	NC_021014	AGC	2	6	1689492	1689497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10118	NC_021014	GAA	2	6	1689521	1689526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10119	NC_021014	T	7	7	1689579	1689585	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10120	NC_021014	AAT	2	6	1689603	1689608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10121	NC_021014	T	6	6	1690878	1690883	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10122	NC_021014	ATAA	2	8	1690931	1690938	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10123	NC_021014	AC	3	6	1690955	1690960	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10124	NC_021014	CAG	2	6	1690976	1690981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10125	NC_021014	T	7	7	1690983	1690989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10126	NC_021014	T	6	6	1691008	1691013	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10127	NC_021014	GATAA	2	10	1691057	1691066	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10128	NC_021014	GAT	2	6	1691075	1691080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10129	NC_021014	AGG	2	6	1691085	1691090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10130	NC_021014	CAG	2	6	1692796	1692801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10131	NC_021014	TTGTT	2	10	1692833	1692842	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
10132	NC_021014	TCA	2	6	1692849	1692854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10133	NC_021014	AG	3	6	1692940	1692945	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10134	NC_021014	AAAG	2	8	1695344	1695351	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10135	NC_021014	AAAAT	2	10	1695379	1695388	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10136	NC_021014	AGG	2	6	1695396	1695401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10138	NC_021014	GGC	2	6	1697153	1697158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10140	NC_021014	CCGGAA	3	18	1697283	1697300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10141	NC_021014	GAA	2	6	1697378	1697383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10142	NC_021014	AGTTAC	2	12	1697384	1697395	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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10146	NC_021014	AAG	2	6	1697630	1697635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10147	NC_021014	ACA	2	6	1697744	1697749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10150	NC_021014	TTC	2	6	1697850	1697855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10152	NC_021014	AGTA	2	8	1697899	1697906	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10153	NC_021014	CAG	2	6	1698012	1698017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10162	NC_021014	AGA	2	6	1698432	1698437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10164	NC_021014	T	7	7	1698479	1698485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10165	NC_021014	ATG	2	6	1698529	1698534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10246	NC_021014	T	6	6	1709208	1709213	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10247	NC_021014	GCT	2	6	1709240	1709245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10249	NC_021014	GAT	2	6	1709271	1709276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10250	NC_021014	A	6	6	1709677	1709682	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10251	NC_021014	A	6	6	1709691	1709696	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10252	NC_021014	ATAAA	2	10	1712981	1712990	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10253	NC_021014	AGG	2	6	1713005	1713010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10255	NC_021014	AAC	2	6	1716025	1716030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10256	NC_021014	AGT	2	6	1716045	1716050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10257	NC_021014	AACC	2	8	1716091	1716098	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10258	NC_021014	TGA	2	6	1716107	1716112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10259	NC_021014	TGA	2	6	1716128	1716133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10260	NC_021014	AG	3	6	1716137	1716142	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10261	NC_021014	CAG	2	6	1716937	1716942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10264	NC_021014	TTA	2	6	1719857	1719862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10271	NC_021014	T	7	7	1722191	1722197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10292	NC_021014	A	6	6	1723819	1723824	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10364	NC_021014	AGAGG	2	10	1738831	1738840	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
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10366	NC_021014	AATC	2	8	1740418	1740425	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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10373	NC_021014	TTC	2	6	1740678	1740683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10374	NC_021014	AAG	2	6	1740715	1740720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10375	NC_021014	TCC	2	6	1741300	1741305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10376	NC_021014	CT	3	6	1742136	1742141	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10377	NC_021014	TGC	2	6	1742175	1742180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10379	NC_021014	TGT	2	6	1742274	1742279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10380	NC_021014	CCG	3	9	1742290	1742298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10381	NC_021014	CA	3	6	1742415	1742420	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10382	NC_021014	ATGC	2	8	1742428	1742435	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10383	NC_021014	CATCA	2	10	1742442	1742451	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
10384	NC_021014	ATC	2	6	1742485	1742490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10385	NC_021014	CCG	2	6	1742528	1742533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10387	NC_021014	ATT	2	6	1742602	1742607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10500	NC_021014	AAGA	2	8	1755431	1755438	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding

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