MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 21901

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9501	NC_021014	CAG	2	6	1598352	1598357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9502	NC_021014	CGT	2	6	1598441	1598446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9503	NC_021014	AAG	2	6	1598544	1598549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9504	NC_021014	TGCT	2	8	1598562	1598569	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9505	NC_021014	TCG	2	6	1598571	1598576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9506	NC_021014	T	7	7	1598621	1598627	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9507	NC_021014	CGT	2	6	1598703	1598708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9508	NC_021014	AGT	2	6	1598740	1598745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9509	NC_021014	CGT	2	6	1598768	1598773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9510	NC_021014	CA	3	6	1598778	1598783	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9511	NC_021014	AGA	2	6	1598807	1598812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9512	NC_021014	TGA	2	6	1598828	1598833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9513	NC_021014	TTG	2	6	1599055	1599060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9514	NC_021014	A	6	6	1599570	1599575	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9515	NC_021014	GAATC	2	10	1599616	1599625	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
9516	NC_021014	AGG	2	6	1599636	1599641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9517	NC_021014	A	6	6	1599642	1599647	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9518	NC_021014	TGG	2	6	1601226	1601231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9519	NC_021014	GAT	2	6	1601234	1601239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9520	NC_021014	A	6	6	1601254	1601259	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9521	NC_021014	TAT	2	6	1601282	1601287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9522	NC_021014	AG	3	6	1601317	1601322	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9523	NC_021014	AGG	2	6	1601452	1601457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9524	NC_021014	A	6	6	1604550	1604555	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9525	NC_021014	TCCG	2	8	1604613	1604620	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9526	NC_021014	CAGAAG	2	12	1604757	1604768	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9527	NC_021014	GCA	2	6	1604848	1604853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9528	NC_021014	A	6	6	1604853	1604858	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9529	NC_021014	ATC	2	6	1604873	1604878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9530	NC_021014	GATC	2	8	1604973	1604980	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9531	NC_021014	TTC	2	6	1605039	1605044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9532	NC_021014	TGA	2	6	1605080	1605085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9533	NC_021014	GATTT	2	10	1605092	1605101	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
9534	NC_021014	CAG	2	6	1605102	1605107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9535	NC_021014	ATC	2	6	1605109	1605114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9536	NC_021014	AG	3	6	1605174	1605179	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9537	NC_021014	GT	3	6	1605201	1605206	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9538	NC_021014	A	6	6	1605220	1605225	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9539	NC_021014	GGAA	2	8	1605249	1605256	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9540	NC_021014	CTG	2	6	1605293	1605298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9541	NC_021014	TC	3	6	1605352	1605357	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9542	NC_021014	GGC	2	6	1605406	1605411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9543	NC_021014	CAA	2	6	1605465	1605470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9544	NC_021014	AAGAT	2	10	1605510	1605519	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
9545	NC_021014	AGC	2	6	1606429	1606434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9546	NC_021014	AGA	2	6	1606435	1606440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9547	NC_021014	A	6	6	1607365	1607370	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9548	NC_021014	A	6	6	1607413	1607418	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9549	NC_021014	CTT	2	6	1607450	1607455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9550	NC_021014	TTAA	2	8	1607468	1607475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9551	NC_021014	AGG	2	6	1607483	1607488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9552	NC_021014	GAT	2	6	1607781	1607786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9553	NC_021014	TG	3	6	1607808	1607813	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9554	NC_021014	ACT	2	6	1607853	1607858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9555	NC_021014	GTT	2	6	1607909	1607914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9556	NC_021014	TAATA	2	10	1607934	1607943	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9557	NC_021014	T	6	6	1610557	1610562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9558	NC_021014	A	7	7	1611574	1611580	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9559	NC_021014	TCC	2	6	1611581	1611586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9560	NC_021014	CTG	3	9	1611590	1611598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9561	NC_021014	CAA	2	6	1611664	1611669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9562	NC_021014	T	6	6	1611703	1611708	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9563	NC_021014	ATA	2	6	1611731	1611736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9564	NC_021014	A	6	6	1611748	1611753	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9565	NC_021014	GAG	2	6	1611755	1611760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9566	NC_021014	AAT	2	6	1612562	1612567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9567	NC_021014	AGG	2	6	1612579	1612584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9568	NC_021014	CAA	2	6	1612648	1612653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9569	NC_021014	GGA	2	6	1612690	1612695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9570	NC_021014	TA	3	6	1612716	1612721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9571	NC_021014	A	7	7	1612721	1612727	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9572	NC_021014	GAG	2	6	1612728	1612733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9573	NC_021014	GT	3	6	1612782	1612787	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9574	NC_021014	GA	3	6	1612888	1612893	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9575	NC_021014	AGG	2	6	1612923	1612928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9576	NC_021014	GAT	2	6	1613092	1613097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9577	NC_021014	TGCC	2	8	1613139	1613146	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9578	NC_021014	GAAG	2	8	1613179	1613186	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9579	NC_021014	GCA	2	6	1613280	1613285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9580	NC_021014	ACAG	2	8	1613378	1613385	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9581	NC_021014	GA	3	6	1613416	1613421	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9582	NC_021014	CTT	2	6	1613477	1613482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9583	NC_021014	GGGAT	2	10	1613484	1613493	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
9584	NC_021014	TTTGAT	2	12	1613525	1613536	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9585	NC_021014	GCGGA	2	10	1613571	1613580	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
9586	NC_021014	TGG	2	6	1613637	1613642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9587	NC_021014	GCA	2	6	1613648	1613653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9591	NC_021014	TGTGG	2	10	1613813	1613822	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
9592	NC_021014	TCCG	2	8	1613843	1613850	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9593	NC_021014	TGA	2	6	1613886	1613891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9594	NC_021014	TGC	2	6	1613892	1613897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9595	NC_021014	TGA	2	6	1613929	1613934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9596	NC_021014	AAT	2	6	1613960	1613965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9597	NC_021014	TTC	2	6	1614078	1614083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9598	NC_021014	CAG	2	6	1614184	1614189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9599	NC_021014	CTT	2	6	1614191	1614196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9600	NC_021014	ATG	2	6	1614200	1614205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9601	NC_021014	TAC	2	6	1614206	1614211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9602	NC_021014	GAT	2	6	1614254	1614259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9603	NC_021014	TTTA	2	8	1614260	1614267	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9604	NC_021014	A	7	7	1614338	1614344	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9605	NC_021014	CT	3	6	1614355	1614360	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9606	NC_021014	TCTG	2	8	1614375	1614382	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9607	NC_021014	GAG	2	6	1614383	1614388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9608	NC_021014	GAA	3	9	1614389	1614397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9609	NC_021014	A	6	6	1614401	1614406	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9610	NC_021014	AGG	2	6	1614453	1614458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9611	NC_021014	TGA	2	6	1614526	1614531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9612	NC_021014	TA	3	6	1614553	1614558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9613	NC_021014	AAG	2	6	1614635	1614640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9614	NC_021014	CAA	2	6	1614644	1614649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9615	NC_021014	GAA	2	6	1614700	1614705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9616	NC_021014	CCAC	2	8	1614905	1614912	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
9617	NC_021014	AAAG	2	8	1614917	1614924	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9618	NC_021014	A	6	6	1615016	1615021	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9619	NC_021014	ATA	2	6	1615088	1615093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9620	NC_021014	AGG	2	6	1615104	1615109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9621	NC_021014	ACT	2	6	1615729	1615734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9622	NC_021014	TTG	2	6	1615746	1615751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9623	NC_021014	T	6	6	1615779	1615784	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9624	NC_021014	AGG	2	6	1615822	1615827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9625	NC_021014	CTG	2	6	1618773	1618778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9626	NC_021014	ATTT	2	8	1620528	1620535	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9627	NC_021014	CAGGA	2	10	1620544	1620553	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
9628	NC_021014	TAA	2	6	1620601	1620606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9629	NC_021014	A	6	6	1620619	1620624	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9630	NC_021014	GA	3	6	1620681	1620686	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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9632	NC_021014	A	6	6	1622104	1622109	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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