MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 21901

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_021014	TGT	2	6	1334671	1334676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8002	NC_021014	CCG	2	6	1334723	1334728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8003	NC_021014	ATT	2	6	1334834	1334839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8004	NC_021014	CAG	2	6	1334877	1334882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8005	NC_021014	CTG	2	6	1334945	1334950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8006	NC_021014	ATCCTG	2	12	1334951	1334962	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8007	NC_021014	ATG	2	6	1334982	1334987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8008	NC_021014	GGT	2	6	1335021	1335026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8009	NC_021014	AAG	2	6	1335046	1335051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8010	NC_021014	GGA	2	6	1335104	1335109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_021014	TGG	2	6	1335305	1335310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8012	NC_021014	GTGATC	2	12	1335311	1335322	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8013	NC_021014	AAT	2	6	1335392	1335397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8014	NC_021014	A	6	6	1335425	1335430	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8015	NC_021014	CAT	2	6	1337042	1337047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8016	NC_021014	AC	3	6	1337151	1337156	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8017	NC_021014	A	7	7	1337200	1337206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8018	NC_021014	GA	3	6	1337208	1337213	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8019	NC_021014	A	6	6	1337710	1337715	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8020	NC_021014	CAGA	2	8	1337770	1337777	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8021	NC_021014	TATG	2	8	1337786	1337793	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8022	NC_021014	TAT	2	6	1337832	1337837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8023	NC_021014	TCT	2	6	1337871	1337876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8024	NC_021014	GCC	2	6	1337927	1337932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8025	NC_021014	CT	3	6	1337933	1337938	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8026	NC_021014	TCC	2	6	1337945	1337950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8027	NC_021014	CTC	2	6	1338010	1338015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8028	NC_021014	ACAGA	2	10	1338174	1338183	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
8029	NC_021014	AGC	2	6	1338220	1338225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8030	NC_021014	GAT	2	6	1338264	1338269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8031	NC_021014	TTCC	2	8	1338272	1338279	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8032	NC_021014	TGG	2	6	1338307	1338312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8033	NC_021014	GA	3	6	1338313	1338318	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8034	NC_021014	GAA	2	6	1338437	1338442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8035	NC_021014	GAT	2	6	1338461	1338466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8036	NC_021014	CGG	2	6	1338647	1338652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8037	NC_021014	ACAGAG	2	12	1338653	1338664	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8038	NC_021014	GAA	2	6	1338676	1338681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8039	NC_021014	A	6	6	1338771	1338776	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8040	NC_021014	CAG	2	6	1338780	1338785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8041	NC_021014	A	6	6	1338787	1338792	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8042	NC_021014	T	6	6	1338836	1338841	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8043	NC_021014	TGA	2	6	1338859	1338864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8044	NC_021014	GCA	2	6	1338917	1338922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8045	NC_021014	AG	3	6	1338974	1338979	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8046	NC_021014	TG	3	6	1339053	1339058	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8047	NC_021014	ATG	2	6	1339072	1339077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8048	NC_021014	C	6	6	1339114	1339119	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8049	NC_021014	GTT	2	6	1339145	1339150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8050	NC_021014	ATA	2	6	1340153	1340158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8051	NC_021014	AGA	2	6	1340174	1340179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8052	NC_021014	AAAGC	2	10	1340197	1340206	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
8053	NC_021014	CCG	2	6	1340313	1340318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8054	NC_021014	GGT	2	6	1340432	1340437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8055	NC_021014	GGC	2	6	1340472	1340477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8056	NC_021014	GGC	2	6	1340675	1340680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8057	NC_021014	ATG	3	9	1340781	1340789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8058	NC_021014	CTTTC	2	10	1340802	1340811	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
8059	NC_021014	GAA	2	6	1340866	1340871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8060	NC_021014	TGC	2	6	1340875	1340880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8061	NC_021014	TTA	2	6	1340923	1340928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8062	NC_021014	TCT	2	6	1340945	1340950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8063	NC_021014	TAAA	2	8	1341019	1341026	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8064	NC_021014	AGC	2	6	1344154	1344159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8065	NC_021014	CGGT	2	8	1344165	1344172	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8066	NC_021014	AGT	2	6	1344214	1344219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8067	NC_021014	T	6	6	1344235	1344240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8068	NC_021014	A	6	6	1344283	1344288	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8069	NC_021014	AATA	2	8	1344312	1344319	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8070	NC_021014	TA	3	6	1346285	1346290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8071	NC_021014	AGA	2	6	1346315	1346320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8072	NC_021014	GAT	2	6	1346383	1346388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8073	NC_021014	AGG	2	6	1346391	1346396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8074	NC_021014	A	6	6	1346497	1346502	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8075	NC_021014	ACT	2	6	1346511	1346516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8076	NC_021014	GGC	2	6	1346546	1346551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8077	NC_021014	GCA	2	6	1346626	1346631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8078	NC_021014	A	6	6	1346689	1346694	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8079	NC_021014	GACG	2	8	1346797	1346804	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8080	NC_021014	CTGCC	2	10	1346818	1346827	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
8081	NC_021014	TCT	2	6	1346832	1346837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8082	NC_021014	GAG	2	6	1346860	1346865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8083	NC_021014	AGA	2	6	1346940	1346945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8084	NC_021014	GAA	2	6	1346953	1346958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8085	NC_021014	TTC	2	6	1346994	1346999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8086	NC_021014	GGGAA	2	10	1347084	1347093	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
8087	NC_021014	TCT	2	6	1347099	1347104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8088	NC_021014	TGCAG	2	10	1347138	1347147	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
8089	NC_021014	T	6	6	1347178	1347183	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8090	NC_021014	GAA	2	6	1347187	1347192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8091	NC_021014	GT	3	6	1347227	1347232	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8092	NC_021014	AAG	2	6	1347245	1347250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8093	NC_021014	AAG	2	6	1347286	1347291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8094	NC_021014	TGA	2	6	1347336	1347341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8095	NC_021014	TG	3	6	1347415	1347420	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8096	NC_021014	GCAA	2	8	1347433	1347440	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8097	NC_021014	A	6	6	1347439	1347444	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8098	NC_021014	GCT	2	6	1347465	1347470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8099	NC_021014	AG	3	6	1347502	1347507	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8100	NC_021014	CCG	2	6	1347511	1347516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8101	NC_021014	CGG	2	6	1347534	1347539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8102	NC_021014	CGG	2	6	1347562	1347567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8103	NC_021014	GTG	2	6	1347583	1347588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8104	NC_021014	AGC	2	6	1347717	1347722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8105	NC_021014	T	6	6	1348367	1348372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8106	NC_021014	TAA	2	6	1348418	1348423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8107	NC_021014	A	6	6	1348422	1348427	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8108	NC_021014	AGG	2	6	1348548	1348553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8109	NC_021014	ATC	3	9	1349382	1349390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8110	NC_021014	GAG	2	6	1349445	1349450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8111	NC_021014	CTTGGA	2	12	1349466	1349477	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8112	NC_021014	AGC	2	6	1349541	1349546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8113	NC_021014	ATG	2	6	1349604	1349609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8114	NC_021014	T	7	7	1349685	1349691	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8115	NC_021014	GTT	2	6	1349692	1349697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8116	NC_021014	T	7	7	1349751	1349757	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8117	NC_021014	AGT	2	6	1349791	1349796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8118	NC_021014	AT	4	8	1349847	1349854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8119	NC_021014	AATAA	2	10	1349868	1349877	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8120	NC_021014	GGA	2	6	1349879	1349884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8121	NC_021014	A	7	7	1354511	1354517	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8122	NC_021014	GGAT	2	8	1354726	1354733	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8123	NC_021014	GGA	2	6	1354998	1355003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8124	NC_021014	AT	3	6	1356000	1356005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8125	NC_021014	TA	3	6	1356021	1356026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8126	NC_021014	ATA	2	6	1356076	1356081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8127	NC_021014	TA	3	6	1356080	1356085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8128	NC_021014	A	7	7	1356085	1356091	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8129	NC_021014	ATA	2	6	1356125	1356130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8131	NC_021014	AT	3	6	1356165	1356170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8399	NC_021014	CAG	2	6	1394719	1394724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8401	NC_021014	GGTG	2	8	1396906	1396913	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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