MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 21901

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_021014	N	15	15	1249172	1249186	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7502	NC_021014	ATT	2	6	1249207	1249212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7503	NC_021014	CAAA	2	8	1249224	1249231	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7504	NC_021014	A	6	6	1249229	1249234	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7505	NC_021014	CAA	2	6	1249247	1249252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7506	NC_021014	GCA	2	6	1249257	1249262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7507	NC_021014	A	6	6	1249287	1249292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7508	NC_021014	AGA	2	6	1249314	1249319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7509	NC_021014	TTTTC	2	10	1249329	1249338	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
7510	NC_021014	TCT	2	6	1249365	1249370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7511	NC_021014	TATC	2	8	1249374	1249381	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7512	NC_021014	T	7	7	1249432	1249438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7513	NC_021014	TCT	2	6	1249443	1249448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7514	NC_021014	TGA	2	6	1249638	1249643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7515	NC_021014	AAG	2	6	1249744	1249749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7516	NC_021014	TTG	2	6	1249751	1249756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7517	NC_021014	ATT	2	6	1249772	1249777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7518	NC_021014	ACA	2	6	1249778	1249783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7519	NC_021014	AAG	2	6	1249811	1249816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7520	NC_021014	ATT	2	6	1249818	1249823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7521	NC_021014	TAA	2	6	1249851	1249856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7522	NC_021014	AT	3	6	1249878	1249883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7523	NC_021014	A	6	6	1249895	1249900	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7524	NC_021014	TGA	2	6	1249929	1249934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7525	NC_021014	ATA	2	6	1249980	1249985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7526	NC_021014	A	6	6	1252210	1252215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7527	NC_021014	ATC	2	6	1252240	1252245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7528	NC_021014	CAA	2	6	1252277	1252282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7529	NC_021014	AAAT	2	8	1252298	1252305	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7530	NC_021014	AT	3	6	1252316	1252321	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7531	NC_021014	TAAA	2	8	1252349	1252356	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7532	NC_021014	TAAGT	2	10	1252358	1252367	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7533	NC_021014	AAT	2	6	1252392	1252397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7534	NC_021014	ATT	2	6	1252402	1252407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7535	NC_021014	T	6	6	1252406	1252411	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7536	NC_021014	GAA	2	6	1252455	1252460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7537	NC_021014	GCTTT	2	10	1252519	1252528	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
7538	NC_021014	GAC	2	6	1252575	1252580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7539	NC_021014	ATA	2	6	1252614	1252619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7540	NC_021014	T	6	6	1252723	1252728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7541	NC_021014	AAT	2	6	1252742	1252747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7542	NC_021014	AT	3	6	1252770	1252775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7543	NC_021014	GAG	2	6	1252783	1252788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7544	NC_021014	TA	3	6	1252801	1252806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7545	NC_021014	ATT	2	6	1252845	1252850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7546	NC_021014	TAT	2	6	1252872	1252877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7547	NC_021014	GAT	2	6	1252971	1252976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7548	NC_021014	A	6	6	1252983	1252988	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7549	NC_021014	GCA	2	6	1253066	1253071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7550	NC_021014	AAC	2	6	1253089	1253094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7551	NC_021014	GAA	2	6	1253122	1253127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7552	NC_021014	A	6	6	1253688	1253693	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7553	NC_021014	TAA	2	6	1253694	1253699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7554	NC_021014	ATT	2	6	1253802	1253807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7555	NC_021014	CAG	2	6	1253830	1253835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7556	NC_021014	ATA	2	6	1253860	1253865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7557	NC_021014	GAA	2	6	1253874	1253879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7558	NC_021014	GCA	2	6	1255846	1255851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7559	NC_021014	AAT	2	6	1255853	1255858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7560	NC_021014	TGC	2	6	1255867	1255872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7561	NC_021014	AAT	2	6	1255881	1255886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7562	NC_021014	AT	3	6	1255926	1255931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7563	NC_021014	AATG	2	8	1255964	1255971	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7564	NC_021014	ACA	2	6	1255996	1256001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7565	NC_021014	AAT	2	6	1256002	1256007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7566	NC_021014	GTTT	2	8	1256010	1256017	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7567	NC_021014	AGG	2	6	1256061	1256066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7568	NC_021014	AGG	2	6	1257419	1257424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7569	NC_021014	TGA	3	9	1258436	1258444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7570	NC_021014	CAG	2	6	1258469	1258474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7571	NC_021014	TTGA	2	8	1258563	1258570	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7572	NC_021014	A	6	6	1258577	1258582	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7573	NC_021014	ATA	2	6	1258588	1258593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7574	NC_021014	AG	4	8	1258595	1258602	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7575	NC_021014	ATGG	2	8	1258648	1258655	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7576	NC_021014	TGA	2	6	1259011	1259016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7577	NC_021014	AGG	2	6	1259020	1259025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7578	NC_021014	AT	4	8	1259026	1259033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7579	NC_021014	GAAA	2	8	1259038	1259045	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7580	NC_021014	A	6	6	1259061	1259066	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7581	NC_021014	TAA	2	6	1260571	1260576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7582	NC_021014	A	6	6	1260627	1260632	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7583	NC_021014	GTC	2	6	1260770	1260775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7584	NC_021014	T	6	6	1260828	1260833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7585	NC_021014	T	7	7	1260853	1260859	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7586	NC_021014	A	7	7	1260873	1260879	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7587	NC_021014	A	7	7	1260893	1260899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7588	NC_021014	A	6	6	1260921	1260926	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7589	NC_021014	GCA	2	6	1261176	1261181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7590	NC_021014	TTA	2	6	1261195	1261200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7591	NC_021014	AAG	2	6	1261263	1261268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7592	NC_021014	CCGGA	2	10	1261273	1261282	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
7593	NC_021014	TGGTG	2	10	1261301	1261310	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
7594	NC_021014	CTT	2	6	1261353	1261358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7595	NC_021014	GATT	2	8	1261390	1261397	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7596	NC_021014	GGA	2	6	1261478	1261483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7597	NC_021014	CAGA	2	8	1261575	1261582	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7598	NC_021014	GAT	2	6	1261650	1261655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7599	NC_021014	AAG	2	6	1261662	1261667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7600	NC_021014	CAG	2	6	1261736	1261741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7601	NC_021014	CTTT	2	8	1261815	1261822	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7602	NC_021014	AGA	2	6	1261831	1261836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7603	NC_021014	CA	3	6	1261928	1261933	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7604	NC_021014	AGA	2	6	1261949	1261954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7605	NC_021014	TTA	2	6	1261955	1261960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7606	NC_021014	CAG	2	6	1261981	1261986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7607	NC_021014	CAA	2	6	1262053	1262058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7608	NC_021014	TGGAG	2	10	1262066	1262075	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
7609	NC_021014	GCT	2	6	1262133	1262138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7610	NC_021014	GAT	2	6	1262195	1262200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7611	NC_021014	TGA	3	9	1262219	1262227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7612	NC_021014	GAT	2	6	1262234	1262239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7613	NC_021014	GACA	2	8	1262273	1262280	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7614	NC_021014	AAAGA	2	10	1262325	1262334	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
7615	NC_021014	GAC	2	6	1262420	1262425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7616	NC_021014	AGA	2	6	1262426	1262431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7617	NC_021014	ATG	2	6	1262466	1262471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7618	NC_021014	CCG	2	6	1262475	1262480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7619	NC_021014	GAA	2	6	1262484	1262489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7620	NC_021014	CAG	2	6	1262563	1262568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7621	NC_021014	TGA	2	6	1262645	1262650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7622	NC_021014	GAT	2	6	1262744	1262749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7623	NC_021014	ATG	2	6	1262776	1262781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7624	NC_021014	GCAG	2	8	1262795	1262802	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7625	NC_021014	GCA	2	6	1262853	1262858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7626	NC_021014	GAT	2	6	1262871	1262876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7627	NC_021014	CAA	2	6	1262884	1262889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7628	NC_021014	TCT	2	6	1262951	1262956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7629	NC_021014	CTG	2	6	1263036	1263041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7631	NC_021014	CAG	2	6	1263098	1263103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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