MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 21901

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_021014	TACA	2	8	1179379	1179386	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7002	NC_021014	GGC	2	6	1179428	1179433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7003	NC_021014	GT	3	6	1179456	1179461	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7004	NC_021014	CAGA	2	8	1179481	1179488	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7005	NC_021014	GAA	2	6	1179627	1179632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7006	NC_021014	TTTCTG	2	12	1179688	1179699	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7007	NC_021014	CTG	2	6	1179754	1179759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7008	NC_021014	TCT	2	6	1179792	1179797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7009	NC_021014	AGA	2	6	1179808	1179813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7010	NC_021014	GGC	2	6	1179817	1179822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7011	NC_021014	AT	3	6	1179923	1179928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7012	NC_021014	AG	3	6	1180058	1180063	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7013	NC_021014	TTC	2	6	1180072	1180077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7014	NC_021014	GGA	2	6	1180178	1180183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7015	NC_021014	CTC	2	6	1180192	1180197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7016	NC_021014	GA	3	6	1180283	1180288	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7017	NC_021014	AGGT	2	8	1180319	1180326	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7018	NC_021014	T	6	6	1180380	1180385	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7019	NC_021014	CCT	2	6	1180400	1180405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7020	NC_021014	TTGT	2	8	1181805	1181812	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7021	NC_021014	T	6	6	1181847	1181852	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7022	NC_021014	AAC	2	6	1181861	1181866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7023	NC_021014	T	6	6	1181922	1181927	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7024	NC_021014	T	6	6	1182001	1182006	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7025	NC_021014	TGG	2	6	1182022	1182027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7026	NC_021014	GTT	2	6	1182034	1182039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7027	NC_021014	TGTA	2	8	1182046	1182053	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7028	NC_021014	TGC	2	6	1182054	1182059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7029	NC_021014	TG	3	6	1182069	1182074	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7030	NC_021014	TG	4	8	1182087	1182094	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7031	NC_021014	N	311	311	1182115	1182425	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7032	NC_021014	T	8	8	1182471	1182478	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7033	NC_021014	T	6	6	1182480	1182485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7034	NC_021014	GCG	2	6	1182490	1182495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7035	NC_021014	ATG	2	6	1182571	1182576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7036	NC_021014	T	7	7	1182578	1182584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7037	NC_021014	TG	3	6	1182608	1182613	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7038	NC_021014	TGG	2	6	1182616	1182621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7039	NC_021014	TAT	2	6	1182628	1182633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7040	NC_021014	GCTG	2	8	1182675	1182682	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7041	NC_021014	TAT	2	6	1182707	1182712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7042	NC_021014	GTT	2	6	1183478	1183483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7043	NC_021014	ATA	2	6	1183523	1183528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7044	NC_021014	CAGG	2	8	1183544	1183551	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7045	NC_021014	AT	3	6	1183553	1183558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7046	NC_021014	AAAG	2	8	1183590	1183597	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7047	NC_021014	A	7	7	1183616	1183622	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7048	NC_021014	TCAGA	2	10	1183687	1183696	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7049	NC_021014	A	6	6	1183753	1183758	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7050	NC_021014	A	6	6	1183766	1183771	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7051	NC_021014	A	6	6	1183773	1183778	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7052	NC_021014	A	6	6	1183781	1183786	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7053	NC_021014	TTC	2	6	1183797	1183802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7054	NC_021014	ACA	2	6	1183820	1183825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7055	NC_021014	GAAC	2	8	1183835	1183842	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7056	NC_021014	AAT	2	6	1183862	1183867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7057	NC_021014	T	7	7	1183991	1183997	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7058	NC_021014	G	6	6	1184019	1184024	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7059	NC_021014	ATC	2	6	1184082	1184087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7060	NC_021014	AAAG	2	8	1184147	1184154	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7061	NC_021014	AAG	2	6	1184178	1184183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7062	NC_021014	AGG	2	6	1184190	1184195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7063	NC_021014	GGAA	2	8	1184206	1184213	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7064	NC_021014	GAAAA	2	10	1184227	1184236	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
7065	NC_021014	TAA	2	6	1184283	1184288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7066	NC_021014	GAA	2	6	1184377	1184382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7067	NC_021014	AAGT	2	8	1184442	1184449	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7068	NC_021014	G	6	6	1184457	1184462	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7069	NC_021014	ATAA	2	8	1184535	1184542	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7070	NC_021014	T	6	6	1184546	1184551	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7071	NC_021014	TAA	2	6	1184566	1184571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7072	NC_021014	GGAT	2	8	1184607	1184614	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7073	NC_021014	AT	3	6	1184670	1184675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7074	NC_021014	GAG	2	6	1184749	1184754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7075	NC_021014	CGG	2	6	1186330	1186335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7076	NC_021014	AGG	2	6	1186412	1186417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7077	NC_021014	ATC	2	6	1186571	1186576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7078	NC_021014	CGG	2	6	1186582	1186587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7079	NC_021014	GCT	2	6	1186596	1186601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7080	NC_021014	ATT	2	6	1186633	1186638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7081	NC_021014	ATG	2	6	1186685	1186690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7082	NC_021014	AAGA	2	8	1186760	1186767	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7083	NC_021014	CTG	2	6	1186804	1186809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7084	NC_021014	GAAGA	2	10	1186901	1186910	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
7085	NC_021014	CA	3	6	1186946	1186951	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7086	NC_021014	GATG	2	8	1187017	1187024	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7087	NC_021014	TTG	2	6	1187028	1187033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7088	NC_021014	GGT	2	6	1187096	1187101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7089	NC_021014	TCC	2	6	1187108	1187113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7090	NC_021014	GCA	2	6	1187117	1187122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7091	NC_021014	CTT	2	6	1187126	1187131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7092	NC_021014	AGC	2	6	1187148	1187153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7093	NC_021014	CTT	2	6	1187180	1187185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7094	NC_021014	TGA	2	6	1187200	1187205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7095	NC_021014	CAG	2	6	1187267	1187272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7096	NC_021014	GAAGC	2	10	1187309	1187318	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
7097	NC_021014	ATC	2	6	1187324	1187329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7098	NC_021014	GAG	2	6	1187354	1187359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7099	NC_021014	AAG	2	6	1187366	1187371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7100	NC_021014	AG	3	6	1187422	1187427	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7101	NC_021014	CGG	2	6	1187434	1187439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7102	NC_021014	AGG	2	6	1187473	1187478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7103	NC_021014	CCCGGG	2	12	1187602	1187613	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7104	NC_021014	ATC	2	6	1187627	1187632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7105	NC_021014	GAA	2	6	1187690	1187695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7106	NC_021014	GCC	2	6	1187708	1187713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7107	NC_021014	A	6	6	1187720	1187725	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7108	NC_021014	CTG	2	6	1187877	1187882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7109	NC_021014	TAA	2	6	1187902	1187907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7110	NC_021014	TGA	2	6	1187910	1187915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7111	NC_021014	TAT	2	6	1187920	1187925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7112	NC_021014	GCC	2	6	1187974	1187979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7113	NC_021014	N	15	15	1187987	1188001	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7114	NC_021014	TTTTG	2	10	1188046	1188055	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
7115	NC_021014	T	6	6	1188098	1188103	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7116	NC_021014	TGC	2	6	1188117	1188122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7117	NC_021014	CGG	3	9	1188134	1188142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7118	NC_021014	GCT	2	6	1188155	1188160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7119	NC_021014	GGT	2	6	1188210	1188215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7120	NC_021014	T	6	6	1188333	1188338	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7121	NC_021014	CTG	2	6	1188395	1188400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7122	NC_021014	GCTT	2	8	1188473	1188480	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7123	NC_021014	GCA	2	6	1188545	1188550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7124	NC_021014	TTGT	2	8	1188553	1188560	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7125	NC_021014	GTTT	2	8	1188650	1188657	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7126	NC_021014	TTC	2	6	1188681	1188686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7127	NC_021014	TGC	2	6	1188728	1188733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7128	NC_021014	CCG	3	9	1188740	1188748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7129	NC_021014	GTA	2	6	1188765	1188770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7130	NC_021014	GCA	2	6	1188793	1188798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7131	NC_021014	GTT	2	6	1188804	1188809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7132	NC_021014	GCG	2	6	1188896	1188901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7133	NC_021014	TGC	2	6	1188920	1188925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7260	NC_021014	GCC	3	9	1214921	1214929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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7262	NC_021014	TGT	2	6	1214968	1214973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7263	NC_021014	GAA	2	6	1214990	1214995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7264	NC_021014	AG	4	8	1215083	1215090	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7265	NC_021014	GAT	2	6	1215147	1215152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7269	NC_021014	ATTTT	2	10	1215343	1215352	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7272	NC_021014	TAA	2	6	1215455	1215460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7273	NC_021014	GAGGAC	2	12	1215546	1215557	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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7276	NC_021014	GAT	2	6	1215672	1215677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7298	NC_021014	TGA	2	6	1220771	1220776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7374	NC_021014	CAG	2	6	1231235	1231240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7376	NC_021014	GCAG	2	8	1231338	1231345	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7377	NC_021014	AGC	2	6	1231350	1231355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7380	NC_021014	GCAA	2	8	1231455	1231462	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7381	NC_021014	AGC	2	6	1231483	1231488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7382	NC_021014	AGC	2	6	1231514	1231519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7384	NC_021014	GAG	2	6	1231627	1231632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7385	NC_021014	ACC	2	6	1231676	1231681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7386	NC_021014	GGA	2	6	1231722	1231727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7387	NC_021014	ATT	2	6	1231744	1231749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7389	NC_021014	GCGCAG	2	12	1231828	1231839	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
7390	NC_021014	GCA	2	6	1231942	1231947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7391	NC_021014	GCCA	2	8	1232050	1232057	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7392	NC_021014	ACA	2	6	1232111	1232116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7393	NC_021014	GGC	2	6	1232122	1232127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7394	NC_021014	CAA	2	6	1232147	1232152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7395	NC_021014	ATT	2	6	1232192	1232197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7396	NC_021014	AAC	2	6	1232212	1232217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7397	NC_021014	CAG	2	6	1232272	1232277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7399	NC_021014	TGG	2	6	1232372	1232377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7400	NC_021014	TGC	2	6	1232451	1232456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7401	NC_021014	TGAT	2	8	1232525	1232532	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7402	NC_021014	GATG	2	8	1232544	1232551	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7403	NC_021014	TAT	2	6	1232850	1232855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7405	NC_021014	ACTG	2	8	1232952	1232959	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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7413	NC_021014	GCAG	2	8	1233349	1233356	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7414	NC_021014	ATA	2	6	1233401	1233406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7420	NC_021014	CGCGGC	2	12	1233736	1233747	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7421	NC_021014	CGG	2	6	1233822	1233827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7422	NC_021014	GGC	2	6	1233841	1233846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7423	NC_021014	GAA	2	6	1233847	1233852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7424	NC_021014	TAG	2	6	1233945	1233950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7425	NC_021014	GCA	2	6	1233991	1233996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7433	NC_021014	TGGGA	2	10	1234959	1234968	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
7434	NC_021014	GGA	3	9	1234966	1234974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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7473	NC_021014	GGA	2	6	1237547	1237552	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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7486	NC_021014	AGG	2	6	1241239	1241244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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7491	NC_021014	TAT	2	6	1241995	1242000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7492	NC_021014	CA	3	6	1242016	1242021	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7493	NC_021014	T	6	6	1244368	1244373	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7494	NC_021014	GGGA	2	8	1244697	1244704	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
7495	NC_021014	ACC	2	6	1246316	1246321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7496	NC_021014	T	7	7	1246325	1246331	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7497	NC_021014	CACTA	2	10	1246376	1246385	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
7498	NC_021014	ACC	2	6	1246416	1246421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7499	NC_021014	GAG	2	6	1247689	1247694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7500	NC_021014	GTT	2	6	1249166	1249171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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