MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 21901

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_021014	TG	4	8	1100803	1100810	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6502	NC_021014	GAA	2	6	1100819	1100824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6503	NC_021014	ACACC	2	10	1101070	1101079	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
6504	NC_021014	AAGCTG	2	12	1101087	1101098	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6505	NC_021014	ATT	2	6	1101118	1101123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6506	NC_021014	AGAA	2	8	1101175	1101182	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6507	NC_021014	GAT	2	6	1101198	1101203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6508	NC_021014	AGA	2	6	1101208	1101213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6509	NC_021014	A	6	6	1101237	1101242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6510	NC_021014	AACGA	2	10	1101248	1101257	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
6511	NC_021014	ATC	2	6	1101280	1101285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6512	NC_021014	AG	3	6	1101306	1101311	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6513	NC_021014	GTT	2	6	1101319	1101324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6514	NC_021014	AAT	2	6	1102090	1102095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6515	NC_021014	AT	3	6	1102102	1102107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6516	NC_021014	AT	3	6	1102133	1102138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6517	NC_021014	TTA	2	6	1102140	1102145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6518	NC_021014	CAG	2	6	1107186	1107191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6519	NC_021014	A	6	6	1107233	1107238	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6520	NC_021014	TAT	2	6	1107249	1107254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6521	NC_021014	GCAA	2	8	1107312	1107319	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6522	NC_021014	TGA	2	6	1107368	1107373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6523	NC_021014	T	6	6	1107432	1107437	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6524	NC_021014	GTT	2	6	1107461	1107466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6525	NC_021014	A	6	6	1107605	1107610	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6526	NC_021014	GGCT	2	8	1107680	1107687	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6527	NC_021014	GGA	2	6	1107818	1107823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6528	NC_021014	ACAG	2	8	1107848	1107855	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6529	NC_021014	TGG	2	6	1107924	1107929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6530	NC_021014	GCA	2	6	1107933	1107938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6531	NC_021014	GCA	2	6	1107964	1107969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6532	NC_021014	GAA	2	6	1107982	1107987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6533	NC_021014	GAA	2	6	1108003	1108008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6534	NC_021014	GCAG	2	8	1108020	1108027	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6535	NC_021014	GAAT	2	8	1108032	1108039	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6536	NC_021014	ATGA	2	8	1108199	1108206	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6537	NC_021014	GAA	2	6	1108223	1108228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6538	NC_021014	A	6	6	1108278	1108283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6539	NC_021014	AGGA	2	8	1108285	1108292	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6540	NC_021014	A	7	7	1108312	1108318	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6541	NC_021014	AGA	3	9	1110903	1110911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6542	NC_021014	TGT	2	6	1110914	1110919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6543	NC_021014	CTT	2	6	1110936	1110941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6544	NC_021014	T	8	8	1111117	1111124	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6545	NC_021014	GAC	2	6	1111137	1111142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6546	NC_021014	AGA	2	6	1111165	1111170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6547	NC_021014	GGGA	2	8	1112146	1112153	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6548	NC_021014	AGG	2	6	1112176	1112181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6549	NC_021014	AGG	2	6	1112697	1112702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6550	NC_021014	T	6	6	1113450	1113455	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6551	NC_021014	TCA	2	6	1113533	1113538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6552	NC_021014	AGA	2	6	1113562	1113567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6553	NC_021014	ATA	2	6	1113570	1113575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6554	NC_021014	A	6	6	1113589	1113594	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6555	NC_021014	GTAA	2	8	1113613	1113620	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6556	NC_021014	A	6	6	1113666	1113671	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6557	NC_021014	GAA	2	6	1113681	1113686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6558	NC_021014	A	6	6	1113690	1113695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6559	NC_021014	TGG	2	6	1113728	1113733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6560	NC_021014	ATC	2	6	1113766	1113771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6561	NC_021014	TGGA	2	8	1113796	1113803	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6562	NC_021014	ATC	2	6	1113892	1113897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6563	NC_021014	GAT	2	6	1113979	1113984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6564	NC_021014	CAGG	2	8	1114048	1114055	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6565	NC_021014	TCT	2	6	1114089	1114094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6566	NC_021014	TGC	2	6	1114106	1114111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6567	NC_021014	GGAT	2	8	1114164	1114171	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6568	NC_021014	TGA	2	6	1114181	1114186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6569	NC_021014	AAG	2	6	1114189	1114194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6570	NC_021014	GAAT	2	8	1114208	1114215	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6571	NC_021014	TACAG	2	10	1114261	1114270	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6572	NC_021014	GA	3	6	1114272	1114277	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6573	NC_021014	TGC	2	6	1114286	1114291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6574	NC_021014	AG	3	6	1114321	1114326	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6575	NC_021014	ATCC	2	8	1114366	1114373	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6576	NC_021014	CGG	2	6	1114431	1114436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6577	NC_021014	GGC	2	6	1114447	1114452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6578	NC_021014	ATAC	2	8	1114518	1114525	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6579	NC_021014	GGA	2	6	1114572	1114577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6580	NC_021014	ATAA	2	8	1114725	1114732	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6581	NC_021014	TGC	2	6	1114752	1114757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6582	NC_021014	GCA	2	6	1114765	1114770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6583	NC_021014	T	6	6	1114787	1114792	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6584	NC_021014	TTC	2	6	1114795	1114800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6585	NC_021014	GTT	2	6	1115539	1115544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6586	NC_021014	AAT	2	6	1115629	1115634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6587	NC_021014	TTC	2	6	1115686	1115691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6588	NC_021014	AAG	2	6	1115715	1115720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6589	NC_021014	A	7	7	1115743	1115749	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6590	NC_021014	GGA	2	6	1115802	1115807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6591	NC_021014	TGC	2	6	1116785	1116790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6592	NC_021014	AGC	2	6	1118505	1118510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6593	NC_021014	A	6	6	1118674	1118679	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6594	NC_021014	AGA	2	6	1118683	1118688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6595	NC_021014	TGA	2	6	1118756	1118761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6596	NC_021014	CAG	2	6	1118784	1118789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6597	NC_021014	GCA	2	6	1118803	1118808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6598	NC_021014	TTC	2	6	1119069	1119074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6599	NC_021014	CTG	2	6	1119151	1119156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6600	NC_021014	GA	3	6	1119177	1119182	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6601	NC_021014	TGAT	2	8	1119186	1119193	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6602	NC_021014	CAT	2	6	1119277	1119282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6603	NC_021014	GTCC	2	8	1119285	1119292	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6604	NC_021014	GGA	2	6	1119343	1119348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6605	NC_021014	CAG	2	6	1119371	1119376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6606	NC_021014	GAA	2	6	1119563	1119568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6607	NC_021014	TTGCCA	2	12	1119618	1119629	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6608	NC_021014	CGA	2	6	1119664	1119669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6609	NC_021014	AAG	2	6	1119735	1119740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6610	NC_021014	TGG	2	6	1119753	1119758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6611	NC_021014	GAT	2	6	1119812	1119817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6612	NC_021014	TTTC	2	8	1119887	1119894	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6613	NC_021014	GGGGA	2	10	1119954	1119963	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
6614	NC_021014	TCCCC	2	10	1119989	1119998	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
6615	NC_021014	ACCCC	2	10	1120001	1120010	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
6616	NC_021014	CGC	2	6	1120019	1120024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6617	NC_021014	GT	3	6	1120041	1120046	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6618	NC_021014	TGC	2	6	1120070	1120075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6619	NC_021014	TCG	2	6	1120111	1120116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6620	NC_021014	TGT	2	6	1120152	1120157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6621	NC_021014	ACA	2	6	1120188	1120193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6622	NC_021014	ACA	2	6	1120258	1120263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6623	NC_021014	CAGG	2	8	1120364	1120371	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6624	NC_021014	C	6	6	1120692	1120697	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6625	NC_021014	GGAAA	2	10	1120699	1120708	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
6626	NC_021014	CGTC	2	8	1120725	1120732	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6627	NC_021014	ATT	2	6	1120772	1120777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6628	NC_021014	AAT	2	6	1120784	1120789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6629	NC_021014	TAT	2	6	1120803	1120808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6630	NC_021014	GTC	2	6	1120862	1120867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6631	NC_021014	TA	3	6	1120879	1120884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6632	NC_021014	ACA	2	6	1120920	1120925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6633	NC_021014	AGA	2	6	1121000	1121005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6634	NC_021014	TCA	2	6	1121021	1121026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6641	NC_021014	CAGA	2	8	1121245	1121252	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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6645	NC_021014	AC	3	6	1121405	1121410	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6646	NC_021014	AG	3	6	1121420	1121425	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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6673	NC_021014	CATC	2	8	1122737	1122744	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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6739	NC_021014	CAGT	2	8	1137343	1137350	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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6750	NC_021014	AGAC	2	8	1139108	1139115	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6751	NC_021014	AAAG	2	8	1139126	1139133	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6752	NC_021014	TA	3	6	1139141	1139146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6753	NC_021014	GA	3	6	1140580	1140585	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6754	NC_021014	T	6	6	1140619	1140624	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6755	NC_021014	ATA	2	6	1140646	1140651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6756	NC_021014	A	6	6	1140718	1140723	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6757	NC_021014	GAA	2	6	1140970	1140975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6758	NC_021014	A	6	6	1140983	1140988	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6759	NC_021014	TTACA	2	10	1141054	1141063	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6760	NC_021014	GAG	2	6	1141076	1141081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6761	NC_021014	GAT	2	6	1141172	1141177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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