MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Ruminococcus bromii L2-63 draft genome

Total Repeats: 12706

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_021013	GAA	2	6	1759034	1759039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10002	NC_021013	GCC	2	6	1759132	1759137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10003	NC_021013	GTT	2	6	1759183	1759188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10004	NC_021013	AT	3	6	1759211	1759216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10005	NC_021013	GGTT	2	8	1759229	1759236	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10006	NC_021013	TGT	2	6	1759403	1759408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10007	NC_021013	GCG	2	6	1759442	1759447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10008	NC_021013	CAA	2	6	1759449	1759454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10009	NC_021013	TCA	2	6	1759466	1759471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10010	NC_021013	AC	3	6	1759488	1759493	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10011	NC_021013	CCGTG	2	10	1760091	1760100	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10012	NC_021013	ATAA	2	8	1760148	1760155	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10013	NC_021013	TAAT	2	8	1760164	1760171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10014	NC_021013	TA	3	6	1760172	1760177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10015	NC_021013	A	7	7	1760177	1760183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10016	NC_021013	ATT	2	6	1760211	1760216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10017	NC_021013	CAA	2	6	1761810	1761815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10018	NC_021013	CCT	2	6	1763234	1763239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10019	NC_021013	TA	3	6	1763264	1763269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10020	NC_021013	TAA	2	6	1763409	1763414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10021	NC_021013	TCC	2	6	1768325	1768330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10022	NC_021013	AAT	2	6	1768333	1768338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10023	NC_021013	T	6	6	1768350	1768355	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10024	NC_021013	AAT	2	6	1768371	1768376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10025	NC_021013	CCT	2	6	1768389	1768394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10026	NC_021013	TTTA	2	8	1768421	1768428	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10027	NC_021013	ACA	2	6	1768458	1768463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10028	NC_021013	AAATT	2	10	1768481	1768490	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10029	NC_021013	TTA	2	6	1768594	1768599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10030	NC_021013	TATC	2	8	1768607	1768614	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10031	NC_021013	AT	3	6	1768640	1768645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10032	NC_021013	AAT	2	6	1768652	1768657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10033	NC_021013	ATT	2	6	1768666	1768671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10034	NC_021013	AT	3	6	1768689	1768694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10035	NC_021013	TTTA	2	8	1768715	1768722	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10036	NC_021013	TAG	2	6	1768803	1768808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10037	NC_021013	ATG	2	6	1768828	1768833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10038	NC_021013	TGT	2	6	1768942	1768947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10039	NC_021013	GTT	2	6	1769060	1769065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10040	NC_021013	GAC	2	6	1769079	1769084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10041	NC_021013	ATT	2	6	1769159	1769164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10042	NC_021013	TCTT	2	8	1769172	1769179	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10043	NC_021013	AAG	2	6	1769243	1769248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10044	NC_021013	TAT	2	6	1769387	1769392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10045	NC_021013	CAA	2	6	1769455	1769460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10046	NC_021013	CAAA	2	8	1769512	1769519	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10047	NC_021013	ACC	2	6	1769537	1769542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10048	NC_021013	AT	3	6	1769548	1769553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10049	NC_021013	AAG	2	6	1769573	1769578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10050	NC_021013	TTC	2	6	1769615	1769620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10051	NC_021013	ACAA	2	8	1769655	1769662	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10052	NC_021013	CGG	2	6	1769681	1769686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10053	NC_021013	TTCCA	2	10	1769705	1769714	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
10054	NC_021013	T	6	6	1769878	1769883	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10055	NC_021013	A	7	7	1769948	1769954	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10056	NC_021013	T	6	6	1770015	1770020	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10057	NC_021013	ATA	2	6	1770022	1770027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10058	NC_021013	TAA	2	6	1770063	1770068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10059	NC_021013	ACAAA	2	10	1770108	1770117	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
10060	NC_021013	AGGA	2	8	1770150	1770157	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10061	NC_021013	T	6	6	1770163	1770168	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10062	NC_021013	CAC	2	6	1773605	1773610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10063	NC_021013	AAG	2	6	1773672	1773677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10064	NC_021013	TTA	2	6	1773705	1773710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10065	NC_021013	CCG	2	6	1773711	1773716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10066	NC_021013	T	6	6	1773751	1773756	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10067	NC_021013	A	6	6	1773848	1773853	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10068	NC_021013	AG	3	6	1774070	1774075	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10069	NC_021013	ATTTT	2	10	1774076	1774085	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10070	NC_021013	TCC	2	6	1777715	1777720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10071	NC_021013	TAA	2	6	1777722	1777727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10072	NC_021013	TCC	2	6	1780509	1780514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10073	NC_021013	TTTTAA	2	12	1780515	1780526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10074	NC_021013	TTA	2	6	1780562	1780567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10075	NC_021013	TAA	3	9	1780570	1780578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10076	NC_021013	TTTTGT	2	12	1780585	1780596	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10077	NC_021013	TGTTT	2	10	1780612	1780621	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
10078	NC_021013	T	6	6	1780688	1780693	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10079	NC_021013	TAA	2	6	1780796	1780801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10080	NC_021013	A	6	6	1780837	1780842	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10081	NC_021013	GCA	2	6	1780848	1780853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10082	NC_021013	A	7	7	1780878	1780884	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10083	NC_021013	TTC	2	6	1780918	1780923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10084	NC_021013	ATT	2	6	1780957	1780962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10085	NC_021013	TGA	2	6	1780969	1780974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10088	NC_021013	AAT	2	6	1781130	1781135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10089	NC_021013	ATG	2	6	1781356	1781361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10090	NC_021013	TAT	2	6	1781366	1781371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10091	NC_021013	CAT	2	6	1781389	1781394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10092	NC_021013	ATG	2	6	1781406	1781411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10093	NC_021013	TAC	2	6	1781582	1781587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10094	NC_021013	ATTT	2	8	1781630	1781637	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10095	NC_021013	ATG	2	6	1781643	1781648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10096	NC_021013	ATT	2	6	1781665	1781670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10097	NC_021013	ATT	2	6	1781744	1781749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10098	NC_021013	TAA	2	6	1781775	1781780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10099	NC_021013	ATTATA	2	12	1781781	1781792	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10100	NC_021013	TAA	2	6	1781845	1781850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10101	NC_021013	GAC	3	9	1782005	1782013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10102	NC_021013	TTC	2	6	1782017	1782022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10103	NC_021013	A	6	6	1782071	1782076	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10104	NC_021013	TGA	2	6	1782080	1782085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10105	NC_021013	GAA	2	6	1782105	1782110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10106	NC_021013	TTC	2	6	1782129	1782134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10107	NC_021013	T	6	6	1782147	1782152	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10108	NC_021013	ATA	2	6	1782158	1782163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10109	NC_021013	A	6	6	1782175	1782180	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10110	NC_021013	C	7	7	1782189	1782195	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10111	NC_021013	AAT	2	6	1783130	1783135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10112	NC_021013	ATT	2	6	1783150	1783155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10113	NC_021013	AGC	2	6	1783190	1783195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10114	NC_021013	ATT	2	6	1783196	1783201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10115	NC_021013	AAT	2	6	1783255	1783260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10116	NC_021013	TTG	2	6	1783451	1783456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10117	NC_021013	CGG	2	6	1783504	1783509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10118	NC_021013	GAA	2	6	1783543	1783548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10119	NC_021013	TGCA	2	8	1783603	1783610	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10120	NC_021013	AAT	2	6	1783670	1783675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10121	NC_021013	TA	3	6	1783712	1783717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10122	NC_021013	CAT	2	6	1783732	1783737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10124	NC_021013	TGT	2	6	1783774	1783779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10125	NC_021013	CAAT	2	8	1783818	1783825	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10126	NC_021013	CAA	2	6	1784010	1784015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10127	NC_021013	ATAC	2	8	1784046	1784053	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10128	NC_021013	T	6	6	1784097	1784102	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10129	NC_021013	TTCAA	2	10	1784119	1784128	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10130	NC_021013	A	6	6	1784240	1784245	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10131	NC_021013	ATA	2	6	1784272	1784277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10132	NC_021013	T	6	6	1784302	1784307	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10133	NC_021013	AAATAT	2	12	1784332	1784343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10141	NC_021013	AT	3	6	1788517	1788522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10142	NC_021013	AAC	2	6	1790108	1790113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10151	NC_021013	TTC	2	6	1790535	1790540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10165	NC_021013	ATAAA	2	10	1793053	1793062	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10167	NC_021013	TTTA	2	8	1793515	1793522	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10168	NC_021013	AAAT	2	8	1793577	1793584	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10169	NC_021013	A	6	6	1793611	1793616	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10175	NC_021013	CGGTA	2	10	1794331	1794340	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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10247	NC_021013	CGG	2	6	1811150	1811155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10251	NC_021013	CGG	2	6	1811315	1811320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10252	NC_021013	GCG	2	6	1811335	1811340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10253	NC_021013	CGAGG	2	10	1811415	1811424	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
10254	NC_021013	ACA	2	6	1811470	1811475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10255	NC_021013	T	6	6	1811512	1811517	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10256	NC_021013	TGCCG	2	10	1811523	1811532	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10257	NC_021013	GCC	2	6	1811569	1811574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10258	NC_021013	GCG	2	6	1811713	1811718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10259	NC_021013	AGT	2	6	1811745	1811750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10262	NC_021013	GGC	2	6	1811863	1811868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10367	NC_021013	TTTG	2	8	1834132	1834139	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10368	NC_021013	AT	3	6	1834234	1834239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10369	NC_021013	CAATT	2	10	1834277	1834286	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10370	NC_021013	A	8	8	1834348	1834355	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10371	NC_021013	T	6	6	1834405	1834410	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10372	NC_021013	T	7	7	1834423	1834429	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10373	NC_021013	A	7	7	1834518	1834524	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10374	NC_021013	ACTGA	2	10	1834560	1834569	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10375	NC_021013	AAAC	2	8	1834588	1834595	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10376	NC_021013	A	6	6	1834705	1834710	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10377	NC_021013	ATC	2	6	1835219	1835224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10378	NC_021013	CT	3	6	1835259	1835264	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10379	NC_021013	TCA	2	6	1835323	1835328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10380	NC_021013	CTATTG	2	12	1835338	1835349	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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10382	NC_021013	GAAA	2	8	1835393	1835400	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10383	NC_021013	GGC	2	6	1835484	1835489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10384	NC_021013	CGA	2	6	1835501	1835506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10385	NC_021013	CGTG	2	8	1835566	1835573	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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10387	NC_021013	TGA	2	6	1835656	1835661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10388	NC_021013	GCA	2	6	1835668	1835673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10393	NC_021013	AGG	2	6	1836684	1836689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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