MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Ruminococcus bromii L2-63 draft genome

Total Repeats: 12706

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_021013	ATC	2	6	1058807	1058812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6002	NC_021013	AAAAC	2	10	1058822	1058831	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
6003	NC_021013	TTG	2	6	1058843	1058848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_021013	GTT	2	6	1058943	1058948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_021013	GT	3	6	1058976	1058981	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_021013	TTA	2	6	1058992	1058997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_021013	GAC	2	6	1059016	1059021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6008	NC_021013	T	6	6	1059079	1059084	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_021013	TTG	2	6	1059190	1059195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_021013	A	7	7	1059203	1059209	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_021013	CTA	2	6	1059241	1059246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6012	NC_021013	CTTT	2	8	1059290	1059297	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6013	NC_021013	TGC	2	6	1059355	1059360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6014	NC_021013	GAA	2	6	1059432	1059437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_021013	GACA	2	8	1059468	1059475	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6016	NC_021013	TAAAA	2	10	1059488	1059497	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_021013	T	6	6	1060024	1060029	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_021013	T	7	7	1060579	1060585	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_021013	TGTGT	2	10	1060603	1060612	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_021013	ATT	2	6	1060835	1060840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_021013	T	6	6	1060843	1060848	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_021013	T	7	7	1060866	1060872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_021013	TAA	2	6	1060887	1060892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_021013	GAA	2	6	1060953	1060958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_021013	GATT	2	8	1062481	1062488	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_021013	GT	3	6	1062489	1062494	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_021013	TG	3	6	1062495	1062500	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_021013	TTA	2	6	1062513	1062518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_021013	T	6	6	1062531	1062536	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_021013	TG	3	6	1062561	1062566	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_021013	TTAAT	2	10	1063163	1063172	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_021013	T	6	6	1063218	1063223	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_021013	TA	3	6	1063227	1063232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_021013	A	6	6	1063305	1063310	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_021013	A	6	6	1063317	1063322	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_021013	CAC	2	6	1063431	1063436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6037	NC_021013	GGT	2	6	1063566	1063571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_021013	CAG	2	6	1063678	1063683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6039	NC_021013	TGT	3	9	1063692	1063700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_021013	AGA	2	6	1063705	1063710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_021013	GCT	2	6	1063791	1063796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6042	NC_021013	TGA	2	6	1063797	1063802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_021013	TCT	2	6	1063837	1063842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6044	NC_021013	CAA	2	6	1064004	1064009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6045	NC_021013	TGA	2	6	1064025	1064030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_021013	AT	3	6	1064055	1064060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_021013	ACA	2	6	1064078	1064083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6048	NC_021013	AAC	2	6	1064148	1064153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6049	NC_021013	AAG	2	6	1064200	1064205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_021013	ATCAA	2	10	1064209	1064218	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6051	NC_021013	A	6	6	1064223	1064228	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_021013	AT	3	6	1064295	1064300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_021013	TGCGT	2	10	1064323	1064332	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6054	NC_021013	GAA	2	6	1064344	1064349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_021013	A	6	6	1064363	1064368	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_021013	CAT	2	6	1064369	1064374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6057	NC_021013	CATT	2	8	1064412	1064419	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6058	NC_021013	AT	3	6	1064426	1064431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_021013	TTG	2	6	1064453	1064458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_021013	AAG	2	6	1064606	1064611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_021013	CAT	2	6	1064642	1064647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6062	NC_021013	CGG	2	6	1064709	1064714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6063	NC_021013	TGT	2	6	1064718	1064723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_021013	AAG	2	6	1064824	1064829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_021013	ATGA	2	8	1064830	1064837	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_021013	TGC	2	6	1064868	1064873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6067	NC_021013	A	6	6	1064924	1064929	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_021013	TA	3	6	1064968	1064973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6069	NC_021013	TCA	2	6	1064974	1064979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6070	NC_021013	CTA	2	6	1065054	1065059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6071	NC_021013	TCA	2	6	1065073	1065078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6072	NC_021013	TTC	2	6	1065107	1065112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6073	NC_021013	CAT	2	6	1065131	1065136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6074	NC_021013	GGC	2	6	1065307	1065312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6075	NC_021013	ACAG	2	8	1065328	1065335	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6076	NC_021013	CAGT	2	8	1065339	1065346	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6077	NC_021013	CAA	2	6	1065443	1065448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6078	NC_021013	TCA	2	6	1065466	1065471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6079	NC_021013	TAA	2	6	1065512	1065517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_021013	TTA	2	6	1065568	1065573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6081	NC_021013	GAAAG	2	10	1065578	1065587	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_021013	AAAT	2	8	1066643	1066650	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_021013	GGA	2	6	1066657	1066662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6087	NC_021013	AGA	2	6	1066743	1066748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6088	NC_021013	GAA	2	6	1066754	1066759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6089	NC_021013	T	6	6	1066763	1066768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6090	NC_021013	GTCC	2	8	1066769	1066776	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6091	NC_021013	A	6	6	1066796	1066801	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6092	NC_021013	TATGAT	2	12	1066876	1066887	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_021013	CTATGC	2	12	1066900	1066911	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6094	NC_021013	TTA	2	6	1066912	1066917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6095	NC_021013	TAT	2	6	1066934	1066939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6096	NC_021013	TGTT	2	8	1066986	1066993	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6097	NC_021013	TTC	2	6	1067000	1067005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6098	NC_021013	ATC	2	6	1067162	1067167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6099	NC_021013	TCT	2	6	1067172	1067177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6100	NC_021013	TAA	2	6	1067200	1067205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_021013	ATC	2	6	1067303	1067308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6102	NC_021013	CGG	2	6	1067338	1067343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6103	NC_021013	AGT	2	6	1067389	1067394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_021013	CTATG	2	10	1067425	1067434	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6105	NC_021013	ACA	2	6	1067471	1067476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6106	NC_021013	GAT	2	6	1067477	1067482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6107	NC_021013	TGG	2	6	1067486	1067491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_021013	GTCA	2	8	1067559	1067566	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6109	NC_021013	GTT	3	9	1067618	1067626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6111	NC_021013	CTT	2	6	1067675	1067680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6112	NC_021013	CGG	2	6	1067842	1067847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6113	NC_021013	TTA	2	6	1067856	1067861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6114	NC_021013	TGC	2	6	1067862	1067867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6115	NC_021013	AAT	2	6	1067922	1067927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_021013	AAAG	2	8	1067970	1067977	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_021013	ATAGA	2	10	1069135	1069144	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_021013	A	6	6	1069235	1069240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_021013	ATT	2	6	1069254	1069259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6120	NC_021013	GCC	2	6	1069260	1069265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6121	NC_021013	TTC	2	6	1069339	1069344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6122	NC_021013	GCC	2	6	1069359	1069364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6123	NC_021013	ATTTC	2	10	1069500	1069509	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6124	NC_021013	CGG	2	6	1069511	1069516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6125	NC_021013	GATT	2	8	1069538	1069545	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6126	NC_021013	GCC	2	6	1069689	1069694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6127	NC_021013	CAA	3	9	1069711	1069719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6128	NC_021013	TCA	2	6	1069720	1069725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6129	NC_021013	GCC	2	6	1069728	1069733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6130	NC_021013	GTC	2	6	1069812	1069817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6132	NC_021013	CA	3	6	1069851	1069856	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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6391	NC_021013	TATAA	2	10	1102953	1102962	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6392	NC_021013	TAAAA	2	10	1102963	1102972	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6394	NC_021013	T	6	6	1103023	1103028	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6400	NC_021013	AGT	3	9	1103279	1103287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6401	NC_021013	A	6	6	1103961	1103966	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6402	NC_021013	TACA	2	8	1106174	1106181	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6403	NC_021013	CTT	2	6	1106192	1106197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6405	NC_021013	T	6	6	1106271	1106276	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6408	NC_021013	T	7	7	1106305	1106311	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6432	NC_021013	GA	3	6	1109688	1109693	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6433	NC_021013	AT	5	10	1114285	1114294	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6435	NC_021013	TCA	2	6	1114330	1114335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6438	NC_021013	A	7	7	1117048	1117054	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6439	NC_021013	TCAG	2	8	1117073	1117080	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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6442	NC_021013	AGG	2	6	1117155	1117160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6443	NC_021013	A	6	6	1117175	1117180	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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