MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Roseburia intestinalis XB6B4 draft genome

Total Repeats: 20928

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_021012	CCG	2	6	3630150	3630155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18002	NC_021012	GCC	2	6	3630167	3630172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18003	NC_021012	GCC	2	6	3630197	3630202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18004	NC_021012	GGA	2	6	3630216	3630221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18005	NC_021012	TGA	2	6	3630224	3630229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18006	NC_021012	TAT	2	6	3630250	3630255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18007	NC_021012	AAT	2	6	3630258	3630263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18008	NC_021012	AGA	2	6	3630291	3630296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18009	NC_021012	TGG	2	6	3630306	3630311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18010	NC_021012	T	6	6	3630359	3630364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18011	NC_021012	TCTT	2	8	3630370	3630377	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
18012	NC_021012	A	8	8	3630418	3630425	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18013	NC_021012	AT	3	6	3630434	3630439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18014	NC_021012	T	7	7	3630447	3630453	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18015	NC_021012	AGA	2	6	3630462	3630467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18016	NC_021012	TTCA	2	8	3630506	3630513	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18017	NC_021012	T	8	8	3630576	3630583	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18018	NC_021012	ATG	2	6	3630605	3630610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18019	NC_021012	ACA	2	6	3630635	3630640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18020	NC_021012	TCA	2	6	3630666	3630671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18021	NC_021012	AG	3	6	3630676	3630681	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18022	NC_021012	TGC	2	6	3630730	3630735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18023	NC_021012	GA	3	6	3630851	3630856	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18024	NC_021012	ATG	2	6	3630885	3630890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18025	NC_021012	A	6	6	3630893	3630898	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18026	NC_021012	AGG	2	6	3630939	3630944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18027	NC_021012	CTT	2	6	3630959	3630964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18028	NC_021012	AG	3	6	3630973	3630978	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18029	NC_021012	ATG	2	6	3630984	3630989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18030	NC_021012	TAT	3	9	3630995	3631003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18031	NC_021012	ATA	2	6	3631068	3631073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18032	NC_021012	A	6	6	3631119	3631124	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18033	NC_021012	ACA	2	6	3631139	3631144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18034	NC_021012	GTTT	2	8	3631150	3631157	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
18035	NC_021012	TTC	2	6	3631165	3631170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18036	NC_021012	ACG	2	6	3631214	3631219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18037	NC_021012	CCAT	2	8	3631226	3631233	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
18038	NC_021012	TGT	2	6	3631276	3631281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18039	NC_021012	AGA	2	6	3631324	3631329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18040	NC_021012	AGC	2	6	3631352	3631357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18041	NC_021012	T	6	6	3631421	3631426	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18042	NC_021012	AGG	2	6	3631509	3631514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18043	NC_021012	GAG	2	6	3631748	3631753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18044	NC_021012	GAT	2	6	3631810	3631815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18045	NC_021012	GT	3	6	3631860	3631865	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18046	NC_021012	AT	3	6	3631925	3631930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18047	NC_021012	TCA	2	6	3632004	3632009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18048	NC_021012	A	6	6	3632022	3632027	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18049	NC_021012	CCGT	2	8	3632195	3632202	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18050	NC_021012	A	7	7	3632217	3632223	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18051	NC_021012	GGGA	2	8	3632334	3632341	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
18052	NC_021012	AAATA	2	10	3632347	3632356	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18053	NC_021012	AGC	2	6	3632369	3632374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18054	NC_021012	CTG	2	6	3632444	3632449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18055	NC_021012	GA	3	6	3632455	3632460	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18056	NC_021012	GGT	2	6	3632504	3632509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18057	NC_021012	TTATGT	2	12	3632521	3632532	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18058	NC_021012	GTA	2	6	3632606	3632611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18059	NC_021012	CT	3	6	3632666	3632671	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18060	NC_021012	CTT	2	6	3632697	3632702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18061	NC_021012	GCA	2	6	3632706	3632711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18062	NC_021012	CAATG	2	10	3632725	3632734	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
18063	NC_021012	AAG	2	6	3632742	3632747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18064	NC_021012	TCAGTG	2	12	3632757	3632768	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18065	NC_021012	ATTG	2	8	3632770	3632777	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18066	NC_021012	GAA	2	6	3632794	3632799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18067	NC_021012	GAA	2	6	3632858	3632863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18068	NC_021012	TGG	2	6	3632928	3632933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18069	NC_021012	ATG	2	6	3632940	3632945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18070	NC_021012	AAT	2	6	3632948	3632953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18071	NC_021012	ATT	2	6	3632957	3632962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18072	NC_021012	AGA	2	6	3633010	3633015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18073	NC_021012	GAG	2	6	3633523	3633528	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18074	NC_021012	AAG	2	6	3634121	3634126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18075	NC_021012	ATG	2	6	3634147	3634152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18076	NC_021012	T	7	7	3634158	3634164	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18077	NC_021012	T	6	6	3634231	3634236	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18078	NC_021012	TCC	2	6	3635440	3635445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18079	NC_021012	ACT	2	6	3636558	3636563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18080	NC_021012	TCA	2	6	3637623	3637628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18081	NC_021012	AGA	2	6	3637655	3637660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18082	NC_021012	CACTGT	2	12	3637663	3637674	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18083	NC_021012	ATA	2	6	3637712	3637717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18084	NC_021012	AGTATA	2	12	3637725	3637736	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18085	NC_021012	TGC	2	6	3637743	3637748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18086	NC_021012	GAAAA	2	10	3637768	3637777	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
18087	NC_021012	A	6	6	3637774	3637779	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18088	NC_021012	GAA	2	6	3637782	3637787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18089	NC_021012	CCTG	2	8	3639406	3639413	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18090	NC_021012	ATT	2	6	3639422	3639427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18091	NC_021012	TGTT	2	8	3639429	3639436	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
18092	NC_021012	AATT	2	8	3639454	3639461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18093	NC_021012	A	6	6	3639496	3639501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18094	NC_021012	A	6	6	3639561	3639566	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18095	NC_021012	ATG	2	6	3639578	3639583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18096	NC_021012	AAC	2	6	3642078	3642083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18097	NC_021012	GCA	2	6	3642380	3642385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18098	NC_021012	TTG	2	6	3642401	3642406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18099	NC_021012	TTG	2	6	3642447	3642452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18100	NC_021012	GT	4	8	3642469	3642476	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18101	NC_021012	ATG	2	6	3642496	3642501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18102	NC_021012	TTG	2	6	3642504	3642509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18103	NC_021012	GT	3	6	3642535	3642540	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18104	NC_021012	GT	3	6	3642618	3642623	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18105	NC_021012	GTGAC	2	10	3642644	3642653	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
18106	NC_021012	CAA	2	6	3642657	3642662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18107	NC_021012	TGC	2	6	3642682	3642687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18108	NC_021012	AC	3	6	3642731	3642736	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18109	NC_021012	TGGG	2	8	3642821	3642828	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
18110	NC_021012	TGAA	2	8	3642878	3642885	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18111	NC_021012	ATT	2	6	3642974	3642979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18112	NC_021012	AAT	2	6	3643008	3643013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18113	NC_021012	T	6	6	3643013	3643018	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18114	NC_021012	TAT	2	6	3643074	3643079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18115	NC_021012	AAT	3	9	3643086	3643094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18116	NC_021012	T	8	8	3643121	3643128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18117	NC_021012	GGT	2	6	3643196	3643201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18118	NC_021012	TGGC	2	8	3643213	3643220	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18119	NC_021012	TGC	2	6	3643304	3643309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18120	NC_021012	ACGG	2	8	3643311	3643318	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18121	NC_021012	ACC	2	6	3643473	3643478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18122	NC_021012	CAT	2	6	3643510	3643515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18123	NC_021012	GGC	2	6	3643518	3643523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18124	NC_021012	TTA	2	6	3643527	3643532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18125	NC_021012	TAAAA	2	10	3643576	3643585	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18126	NC_021012	AG	3	6	3646478	3646483	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18127	NC_021012	AGA	2	6	3646504	3646509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18128	NC_021012	CAC	2	6	3646518	3646523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18129	NC_021012	A	6	6	3646624	3646629	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18130	NC_021012	GGT	2	6	3646677	3646682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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18253	NC_021012	CTT	2	6	3680477	3680482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18254	NC_021012	GAAA	2	8	3680488	3680495	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18255	NC_021012	A	6	6	3680493	3680498	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18256	NC_021012	ATA	2	6	3680567	3680572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18258	NC_021012	TAT	2	6	3680651	3680656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18260	NC_021012	TA	4	8	3680684	3680691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18261	NC_021012	T	8	8	3680756	3680763	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18262	NC_021012	T	6	6	3680768	3680773	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18500	NC_021012	GAA	3	9	3712201	3712209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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