MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Roseburia intestinalis XB6B4 draft genome

Total Repeats: 20928

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17501	NC_021012	T	6	6	3518190	3518195	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17502	NC_021012	TGT	2	6	3518203	3518208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17503	NC_021012	ATT	2	6	3518215	3518220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17504	NC_021012	ATG	2	6	3518244	3518249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17505	NC_021012	ATC	2	6	3518292	3518297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17506	NC_021012	T	7	7	3518302	3518308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17507	NC_021012	T	6	6	3518318	3518323	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17508	NC_021012	TTATGA	2	12	3518328	3518339	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17509	NC_021012	TA	3	6	3518400	3518405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17510	NC_021012	AT	3	6	3518417	3518422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17511	NC_021012	GAA	2	6	3518433	3518438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17512	NC_021012	T	7	7	3518462	3518468	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17513	NC_021012	TATTT	2	10	3518483	3518492	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17514	NC_021012	GTAT	3	12	3518507	3518518	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17515	NC_021012	TTA	2	6	3518534	3518539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17516	NC_021012	TAA	2	6	3518563	3518568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17517	NC_021012	TTG	2	6	3518622	3518627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17518	NC_021012	TAA	2	6	3518655	3518660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17519	NC_021012	AT	3	6	3518688	3518693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17520	NC_021012	A	7	7	3518696	3518702	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17521	NC_021012	GAT	2	6	3518728	3518733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17522	NC_021012	A	9	9	3518810	3518818	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17523	NC_021012	TTA	2	6	3519674	3519679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17524	NC_021012	N	320	320	3519714	3520033	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17525	NC_021012	TTAG	2	8	3520050	3520057	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17526	NC_021012	GAA	2	6	3520072	3520077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17527	NC_021012	TTA	2	6	3520399	3520404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17528	NC_021012	TTA	2	6	3520443	3520448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17529	NC_021012	TGC	2	6	3520455	3520460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17530	NC_021012	CCA	2	6	3520470	3520475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17531	NC_021012	CTGG	2	8	3520491	3520498	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17532	NC_021012	GAT	2	6	3520587	3520592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17533	NC_021012	ATTT	3	12	3520603	3520614	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17534	NC_021012	ATT	2	6	3520629	3520634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17535	NC_021012	ATG	2	6	3520664	3520669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17536	NC_021012	GAA	2	6	3520684	3520689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17537	NC_021012	ATTTGA	2	12	3520694	3520705	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17538	NC_021012	GGATGA	2	12	3520716	3520727	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
17539	NC_021012	ACG	2	6	3520728	3520733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17540	NC_021012	GCG	2	6	3520764	3520769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17541	NC_021012	TA	3	6	3520774	3520779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17542	NC_021012	N	1287	1287	3520788	3522074	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17543	NC_021012	TA	3	6	3522077	3522082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17544	NC_021012	GACA	2	8	3522099	3522106	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17545	NC_021012	CAA	2	6	3522110	3522115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17546	NC_021012	TGA	2	6	3522117	3522122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17547	NC_021012	AT	3	6	3522123	3522128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17548	NC_021012	TAAA	2	8	3522140	3522147	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17549	NC_021012	ATG	2	6	3522197	3522202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17550	NC_021012	ATC	2	6	3522205	3522210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17551	NC_021012	TAT	2	6	3522241	3522246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17552	NC_021012	GAA	2	6	3522262	3522267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17553	NC_021012	ATT	2	6	3522334	3522339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17554	NC_021012	GAT	2	6	3522364	3522369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17555	NC_021012	TTC	2	6	3522408	3522413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17556	NC_021012	TGG	2	6	3522450	3522455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17557	NC_021012	CAA	2	6	3522473	3522478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17558	NC_021012	A	7	7	3522494	3522500	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17559	NC_021012	TA	3	6	3522545	3522550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17560	NC_021012	TATT	2	8	3522603	3522610	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17561	NC_021012	GAAAA	2	10	3523741	3523750	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
17562	NC_021012	AAC	2	6	3523834	3523839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17563	NC_021012	AC	3	6	3523838	3523843	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17564	NC_021012	AAC	2	6	3523861	3523866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17565	NC_021012	GGC	2	6	3523966	3523971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17566	NC_021012	CGAA	2	8	3523991	3523998	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17567	NC_021012	TTC	2	6	3524013	3524018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17568	NC_021012	GGT	2	6	3524159	3524164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17569	NC_021012	TGG	2	6	3524195	3524200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17570	NC_021012	CGA	2	6	3524219	3524224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17571	NC_021012	GCA	2	6	3524293	3524298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17572	NC_021012	CGC	2	6	3524340	3524345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17573	NC_021012	GAA	2	6	3524352	3524357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17574	NC_021012	CAG	2	6	3524382	3524387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17575	NC_021012	GAA	3	9	3524389	3524397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17576	NC_021012	AAG	2	6	3524414	3524419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17577	NC_021012	CAG	2	6	3524438	3524443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17578	NC_021012	AGG	2	6	3524628	3524633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17579	NC_021012	GGC	2	6	3524649	3524654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17580	NC_021012	GCA	2	6	3524777	3524782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17581	NC_021012	GAA	2	6	3524892	3524897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17582	NC_021012	GGT	2	6	3524966	3524971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17583	NC_021012	GTC	2	6	3524980	3524985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17584	NC_021012	TCGTG	2	10	3524989	3524998	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
17585	NC_021012	TAG	2	6	3525041	3525046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17586	NC_021012	GGA	2	6	3525093	3525098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17587	NC_021012	ATC	2	6	3525117	3525122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17588	NC_021012	AC	3	6	3525144	3525149	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17589	NC_021012	AC	3	6	3525313	3525318	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17590	NC_021012	AGG	2	6	3525372	3525377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17591	NC_021012	CCT	2	6	3525454	3525459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17592	NC_021012	ATT	2	6	3525481	3525486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17593	NC_021012	TTA	2	6	3525498	3525503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17594	NC_021012	N	1157	1157	3525505	3526661	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17595	NC_021012	AGAA	2	8	3526662	3526669	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17596	NC_021012	GCG	2	6	3526688	3526693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17597	NC_021012	GTGC	2	8	3526721	3526728	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17598	NC_021012	AG	3	6	3526795	3526800	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17599	NC_021012	GAAAG	2	10	3526819	3526828	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
17600	NC_021012	ACC	2	6	3526889	3526894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17601	NC_021012	GGGAG	2	10	3526964	3526973	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
17602	NC_021012	ATG	2	6	3527023	3527028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17603	NC_021012	TCAG	2	8	3527131	3527138	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17604	NC_021012	GGA	2	6	3527203	3527208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17605	NC_021012	GAT	2	6	3527404	3527409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17606	NC_021012	GGT	2	6	3527441	3527446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17607	NC_021012	AGC	2	6	3527546	3527551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17608	NC_021012	CGA	2	6	3527678	3527683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17609	NC_021012	AAG	2	6	3527713	3527718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17610	NC_021012	AG	3	6	3527717	3527722	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17611	NC_021012	ACA	2	6	3527851	3527856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17612	NC_021012	CCGTA	2	10	3528063	3528072	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
17613	NC_021012	GAG	2	6	3528090	3528095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17614	NC_021012	GAA	2	6	3528114	3528119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17615	NC_021012	AGAGG	2	10	3528291	3528300	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
17616	NC_021012	CGG	2	6	3528341	3528346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17617	NC_021012	ACC	2	6	3528612	3528617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17618	NC_021012	CGT	2	6	3529030	3529035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17619	NC_021012	GCGG	2	8	3529060	3529067	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
17620	NC_021012	GAG	2	6	3529079	3529084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17621	NC_021012	GGAC	2	8	3529112	3529119	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17622	NC_021012	CTG	2	6	3529131	3529136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17623	NC_021012	C	6	6	3529205	3529210	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
17624	NC_021012	ATCG	2	8	3529316	3529323	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17625	NC_021012	T	7	7	3529380	3529386	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17626	NC_021012	A	7	7	3529442	3529448	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17627	NC_021012	GGA	2	6	3529458	3529463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17628	NC_021012	GT	3	6	3529986	3529991	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17629	NC_021012	GCCA	2	8	3530082	3530089	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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17633	NC_021012	GCCA	2	8	3530179	3530186	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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