MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Roseburia intestinalis XB6B4 draft genome

Total Repeats: 20928

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_021012	GAA	2	6	3390459	3390464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17002	NC_021012	AAT	2	6	3391612	3391617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17003	NC_021012	T	9	9	3391652	3391660	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17004	NC_021012	TCATA	2	10	3391666	3391675	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
17005	NC_021012	TCT	2	6	3392590	3392595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17006	NC_021012	TCAT	2	8	3392616	3392623	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17007	NC_021012	TGG	2	6	3392689	3392694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17008	NC_021012	CAG	2	6	3392697	3392702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17009	NC_021012	A	7	7	3392799	3392805	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17010	NC_021012	CAT	2	6	3392956	3392961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17011	NC_021012	AGA	2	6	3392988	3392993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17012	NC_021012	ATG	2	6	3393065	3393070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17013	NC_021012	ATTT	2	8	3393203	3393210	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17014	NC_021012	TTA	2	6	3393240	3393245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17015	NC_021012	ATG	2	6	3393263	3393268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17016	NC_021012	GAAA	2	8	3393273	3393280	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17017	NC_021012	AAT	2	6	3393298	3393303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17018	NC_021012	AAG	2	6	3393389	3393394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17019	NC_021012	GAT	2	6	3393478	3393483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17020	NC_021012	TCT	2	6	3393513	3393518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17021	NC_021012	GCATT	2	10	3393653	3393662	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
17022	NC_021012	TCCG	2	8	3393794	3393801	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17023	NC_021012	GTCC	2	8	3393841	3393848	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17024	NC_021012	TAT	2	6	3393879	3393884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17025	NC_021012	A	7	7	3396666	3396672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17026	NC_021012	TTCATC	2	12	3396679	3396690	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17027	NC_021012	CAG	2	6	3396699	3396704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17028	NC_021012	TGC	2	6	3396748	3396753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17029	NC_021012	GCA	2	6	3396831	3396836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17030	NC_021012	GAG	2	6	3396840	3396845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17031	NC_021012	AAG	2	6	3396873	3396878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17032	NC_021012	A	6	6	3396905	3396910	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17033	NC_021012	CAGA	2	8	3396912	3396919	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17034	NC_021012	AG	3	6	3396947	3396952	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17035	NC_021012	AGA	2	6	3397031	3397036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17036	NC_021012	GCT	2	6	3397115	3397120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17037	NC_021012	GGA	2	6	3397121	3397126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17038	NC_021012	CGG	2	6	3397253	3397258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17039	NC_021012	GAA	2	6	3397344	3397349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17040	NC_021012	GGCT	2	8	3397354	3397361	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17041	NC_021012	CTGG	2	8	3397439	3397446	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17042	NC_021012	A	6	6	3397489	3397494	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17043	NC_021012	ATT	2	6	3397517	3397522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17044	NC_021012	A	6	6	3397534	3397539	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17045	NC_021012	AGG	2	6	3397577	3397582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17046	NC_021012	A	6	6	3399358	3399363	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17047	NC_021012	AAC	2	6	3399395	3399400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17048	NC_021012	TAA	2	6	3399438	3399443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17049	NC_021012	A	6	6	3399451	3399456	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17050	NC_021012	A	7	7	3401156	3401162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17051	NC_021012	ATA	2	6	3402938	3402943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17052	NC_021012	ATA	2	6	3403018	3403023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17053	NC_021012	TA	3	6	3403022	3403027	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17054	NC_021012	AAGT	2	8	3403068	3403075	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17055	NC_021012	AGA	2	6	3403084	3403089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17056	NC_021012	GGC	2	6	3403113	3403118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17057	NC_021012	CT	3	6	3403121	3403126	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17058	NC_021012	AG	3	6	3403178	3403183	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17059	NC_021012	TGG	2	6	3403267	3403272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17060	NC_021012	AGA	2	6	3403361	3403366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17061	NC_021012	ATC	2	6	3403449	3403454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17062	NC_021012	TGC	2	6	3403487	3403492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17063	NC_021012	GC	3	6	3403577	3403582	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17064	NC_021012	ATC	2	6	3403743	3403748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17065	NC_021012	AG	3	6	3403791	3403796	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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17074	NC_021012	GAT	2	6	3404300	3404305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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17077	NC_021012	GCG	2	6	3404424	3404429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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17082	NC_021012	TGAA	2	8	3404740	3404747	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17083	NC_021012	A	6	6	3404746	3404751	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17088	NC_021012	TGG	2	6	3404878	3404883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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17093	NC_021012	A	8	8	3405015	3405022	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17099	NC_021012	AGGC	2	8	3406727	3406734	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17100	NC_021012	T	6	6	3406753	3406758	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17101	NC_021012	TCC	2	6	3407032	3407037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17102	NC_021012	TGT	2	6	3407040	3407045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17103	NC_021012	TG	3	6	3407057	3407062	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17104	NC_021012	GCA	2	6	3407107	3407112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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17109	NC_021012	T	7	7	3409912	3409918	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17110	NC_021012	GTC	2	6	3409919	3409924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17111	NC_021012	A	7	7	3409936	3409942	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17112	NC_021012	A	6	6	3409951	3409956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17113	NC_021012	ATT	2	6	3409960	3409965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17115	NC_021012	TAA	2	6	3409983	3409988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17116	NC_021012	TAT	2	6	3409993	3409998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17118	NC_021012	AGCAT	2	10	3411376	3411385	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
17119	NC_021012	ATTGT	2	10	3413568	3413577	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
17120	NC_021012	GTC	2	6	3413594	3413599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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17122	NC_021012	GAAAA	2	10	3413618	3413627	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
17123	NC_021012	TA	3	6	3416497	3416502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17124	NC_021012	AAG	2	6	3416515	3416520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17125	NC_021012	CTT	2	6	3416542	3416547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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17127	NC_021012	ATT	2	6	3416577	3416582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17128	NC_021012	T	7	7	3416581	3416587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17129	NC_021012	CAA	2	6	3416601	3416606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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17131	NC_021012	GT	3	6	3416657	3416662	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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17255	NC_021012	GTT	2	6	3476160	3476165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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17258	NC_021012	TG	3	6	3478079	3478084	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17259	NC_021012	ATA	2	6	3478139	3478144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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