MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Roseburia intestinalis XB6B4 draft genome

Total Repeats: 20928

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_021012	ATG	2	6	3097586	3097591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15502	NC_021012	ATG	2	6	3097597	3097602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15503	NC_021012	GAAAG	2	10	3097683	3097692	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
15504	NC_021012	CTG	2	6	3097729	3097734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15505	NC_021012	CAGATG	2	12	3097763	3097774	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15506	NC_021012	T	6	6	3097898	3097903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15507	NC_021012	ATT	2	6	3097941	3097946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15508	NC_021012	AGA	2	6	3097979	3097984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15509	NC_021012	ATA	2	6	3097985	3097990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15510	NC_021012	GCT	2	6	3098001	3098006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15511	NC_021012	A	7	7	3098882	3098888	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15512	NC_021012	ATT	2	6	3098912	3098917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15513	NC_021012	AGC	2	6	3098979	3098984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15514	NC_021012	T	6	6	3098999	3099004	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15515	NC_021012	CAG	2	6	3099027	3099032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15516	NC_021012	AAAG	2	8	3099037	3099044	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15517	NC_021012	ATT	2	6	3099051	3099056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15518	NC_021012	TTG	2	6	3099821	3099826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15519	NC_021012	A	6	6	3100510	3100515	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15520	NC_021012	GGA	2	6	3100520	3100525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15521	NC_021012	AT	3	6	3104991	3104996	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15522	NC_021012	GCA	2	6	3105019	3105024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15523	NC_021012	CGG	2	6	3105248	3105253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15524	NC_021012	GAT	2	6	3105271	3105276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15525	NC_021012	AGG	2	6	3105425	3105430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15526	NC_021012	CGG	2	6	3105446	3105451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15527	NC_021012	A	6	6	3105502	3105507	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15528	NC_021012	AG	3	6	3105555	3105560	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15529	NC_021012	TACCG	2	10	3105600	3105609	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
15530	NC_021012	CAG	2	6	3105703	3105708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15531	NC_021012	A	6	6	3105711	3105716	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15532	NC_021012	TG	3	6	3105773	3105778	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15533	NC_021012	TAA	2	6	3105849	3105854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15534	NC_021012	ATAA	2	8	3105877	3105884	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15535	NC_021012	GTT	2	6	3105893	3105898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15536	NC_021012	AAGAGG	2	12	3106627	3106638	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15537	NC_021012	AAGGT	2	10	3108512	3108521	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
15538	NC_021012	TAA	2	6	3109414	3109419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15539	NC_021012	ATA	2	6	3109428	3109433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15540	NC_021012	TGA	2	6	3110378	3110383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15541	NC_021012	ATA	2	6	3110461	3110466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15542	NC_021012	TGATA	2	10	3110488	3110497	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15543	NC_021012	TATCG	2	10	3110557	3110566	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
15544	NC_021012	CAT	2	6	3110580	3110585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15545	NC_021012	TCC	2	6	3110660	3110665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15546	NC_021012	CAT	2	6	3110689	3110694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15547	NC_021012	TGG	2	6	3110838	3110843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15548	NC_021012	ATC	2	6	3110887	3110892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15549	NC_021012	ATA	2	6	3110908	3110913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15550	NC_021012	CTGC	2	8	3110991	3110998	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15551	NC_021012	AG	4	8	3111072	3111079	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15552	NC_021012	GGC	2	6	3111097	3111102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15553	NC_021012	TAA	2	6	3111200	3111205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15554	NC_021012	T	6	6	3111242	3111247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15555	NC_021012	CTT	2	6	3111306	3111311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15556	NC_021012	T	6	6	3111331	3111336	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15557	NC_021012	TCT	2	6	3111345	3111350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15558	NC_021012	T	6	6	3111382	3111387	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15559	NC_021012	CGG	2	6	3111486	3111491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15560	NC_021012	GCA	2	6	3111546	3111551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15561	NC_021012	GGA	2	6	3111580	3111585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15562	NC_021012	GGA	2	6	3111631	3111636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15563	NC_021012	TTC	2	6	3111649	3111654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15564	NC_021012	GGC	2	6	3111763	3111768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15565	NC_021012	GAG	2	6	3111866	3111871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15566	NC_021012	GGA	2	6	3111952	3111957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15567	NC_021012	ATTGTC	2	12	3111973	3111984	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15568	NC_021012	AGA	2	6	3111994	3111999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15569	NC_021012	TCTG	2	8	3112007	3112014	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15570	NC_021012	AT	4	8	3112220	3112227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15573	NC_021012	AT	3	6	3112278	3112283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15574	NC_021012	AT	3	6	3112288	3112293	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15575	NC_021012	AAATA	2	10	3112296	3112305	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15576	NC_021012	AAT	2	6	3112952	3112957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15577	NC_021012	TAA	2	6	3112986	3112991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15578	NC_021012	ATA	2	6	3114724	3114729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15579	NC_021012	CAG	2	6	3114736	3114741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15581	NC_021012	TAA	2	6	3115325	3115330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15582	NC_021012	AAAC	2	8	3115339	3115346	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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15585	NC_021012	AGT	2	6	3115454	3115459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15590	NC_021012	AGTA	2	8	3118044	3118051	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15591	NC_021012	A	7	7	3118570	3118576	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15592	NC_021012	GGA	2	6	3118577	3118582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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15594	NC_021012	AT	3	6	3118845	3118850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15595	NC_021012	CTCA	2	8	3118865	3118872	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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15597	NC_021012	GTTT	2	8	3119223	3119230	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15598	NC_021012	AGA	2	6	3119234	3119239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15599	NC_021012	AAC	2	6	3119736	3119741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15600	NC_021012	AGG	2	6	3119742	3119747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15601	NC_021012	TGA	2	6	3120072	3120077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15603	NC_021012	GCG	2	6	3120132	3120137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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15607	NC_021012	AG	3	6	3120937	3120942	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15608	NC_021012	TAT	2	6	3120950	3120955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15609	NC_021012	T	7	7	3120964	3120970	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15610	NC_021012	AT	3	6	3121033	3121038	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15611	NC_021012	AGG	2	6	3121042	3121047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15612	NC_021012	AAAT	2	8	3125182	3125189	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15613	NC_021012	TG	3	6	3125215	3125220	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15614	NC_021012	TTTGC	2	10	3125266	3125275	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
15615	NC_021012	GT	4	8	3125283	3125290	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15616	NC_021012	A	7	7	3125403	3125409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15617	NC_021012	A	6	6	3125427	3125432	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15618	NC_021012	ATT	2	6	3125440	3125445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15619	NC_021012	GGGAAC	2	12	3125559	3125570	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
15620	NC_021012	GGA	2	6	3125599	3125604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15621	NC_021012	GCA	2	6	3127026	3127031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15624	NC_021012	A	6	6	3127310	3127315	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15625	NC_021012	TCG	2	6	3127318	3127323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15627	NC_021012	GGT	2	6	3127512	3127517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15628	NC_021012	ATT	2	6	3127592	3127597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15630	NC_021012	CAGC	2	8	3127732	3127739	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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