MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Roseburia intestinalis XB6B4 draft genome

Total Repeats: 20928

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_021012	AGA	2	6	3002120	3002125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15002	NC_021012	AATA	2	8	3002138	3002145	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15003	NC_021012	A	6	6	3002151	3002156	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15004	NC_021012	TAA	2	6	3002199	3002204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15005	NC_021012	TGG	2	6	3002243	3002248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15006	NC_021012	TGTA	2	8	3002422	3002429	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15007	NC_021012	N	1523	1523	3002532	3004054	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15008	NC_021012	T	7	7	3004057	3004063	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15009	NC_021012	TCA	2	6	3004134	3004139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15010	NC_021012	ATTT	2	8	3004142	3004149	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15011	NC_021012	GA	3	6	3004166	3004171	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15012	NC_021012	ATT	2	6	3004223	3004228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15013	NC_021012	ATA	2	6	3004274	3004279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15014	NC_021012	T	6	6	3004300	3004305	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15015	NC_021012	GAA	2	6	3004333	3004338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15016	NC_021012	AAG	2	6	3004339	3004344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15017	NC_021012	A	6	6	3004404	3004409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15018	NC_021012	GC	3	6	3004509	3004514	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15019	NC_021012	TTC	2	6	3004529	3004534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15020	NC_021012	A	7	7	3004694	3004700	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15021	NC_021012	CCT	2	6	3006348	3006353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15022	NC_021012	G	6	6	3006387	3006392	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15023	NC_021012	AGA	2	6	3006408	3006413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15024	NC_021012	AGCA	2	8	3006434	3006441	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15025	NC_021012	CTGC	2	8	3006451	3006458	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15026	NC_021012	CT	3	6	3006468	3006473	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15027	NC_021012	TCATC	2	10	3006487	3006496	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
15028	NC_021012	TGT	2	6	3006550	3006555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15029	NC_021012	AGT	2	6	3006772	3006777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15030	NC_021012	ATAAGT	2	12	3006790	3006801	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15031	NC_021012	AGT	2	6	3006813	3006818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15032	NC_021012	A	7	7	3006875	3006881	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15033	NC_021012	AT	3	6	3006911	3006916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15034	NC_021012	TAA	2	6	3006923	3006928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15035	NC_021012	AT	4	8	3006976	3006983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15036	NC_021012	TA	3	6	3007147	3007152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15037	NC_021012	T	7	7	3007219	3007225	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15038	NC_021012	GCA	2	6	3007226	3007231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15039	NC_021012	TTG	2	6	3007249	3007254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15040	NC_021012	T	6	6	3007257	3007262	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15041	NC_021012	CA	3	6	3007326	3007331	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15042	NC_021012	AATG	2	8	3007371	3007378	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15043	NC_021012	GTA	2	6	3007633	3007638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15044	NC_021012	AGG	2	6	3007666	3007671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15045	NC_021012	A	6	6	3007679	3007684	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15046	NC_021012	ATT	2	6	3007687	3007692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15047	NC_021012	TAA	2	6	3010182	3010187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15048	NC_021012	A	7	7	3010186	3010192	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15049	NC_021012	GAT	2	6	3011701	3011706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15050	NC_021012	TTA	2	6	3011714	3011719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15051	NC_021012	A	7	7	3011890	3011896	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15052	NC_021012	A	6	6	3011913	3011918	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15053	NC_021012	ACG	2	6	3011936	3011941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15054	NC_021012	CAGA	2	8	3011983	3011990	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15055	NC_021012	ATA	2	6	3013737	3013742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15056	NC_021012	GA	3	6	3013762	3013767	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15057	NC_021012	GAG	2	6	3013782	3013787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15058	NC_021012	AGG	2	6	3013793	3013798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15059	NC_021012	A	6	6	3015671	3015676	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15060	NC_021012	AC	3	6	3015690	3015695	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15061	NC_021012	AGG	2	6	3015723	3015728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15062	NC_021012	TAT	2	6	3015734	3015739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15063	NC_021012	GCA	2	6	3015771	3015776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15064	NC_021012	GCG	2	6	3018765	3018770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15065	NC_021012	A	6	6	3018773	3018778	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15066	NC_021012	AT	3	6	3018786	3018791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15067	NC_021012	TAT	2	6	3018798	3018803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15068	NC_021012	AG	3	6	3018834	3018839	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15069	NC_021012	AGG	2	6	3018844	3018849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15070	NC_021012	AGG	2	6	3022837	3022842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15071	NC_021012	AGC	2	6	3024429	3024434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15072	NC_021012	TAC	2	6	3024486	3024491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15073	NC_021012	GT	3	6	3025953	3025958	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15074	NC_021012	AATAT	2	10	3025986	3025995	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15075	NC_021012	GAG	2	6	3026033	3026038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15076	NC_021012	GAA	2	6	3028022	3028027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15077	NC_021012	A	6	6	3028026	3028031	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15078	NC_021012	TCAT	2	8	3031936	3031943	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15079	NC_021012	GAA	2	6	3031953	3031958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15080	NC_021012	A	7	7	3031990	3031996	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15081	NC_021012	GGGAGA	2	12	3032027	3032038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15082	NC_021012	A	6	6	3032060	3032065	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15083	NC_021012	GGA	2	6	3032098	3032103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15084	NC_021012	TGG	2	6	3032168	3032173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15085	NC_021012	GAAG	2	8	3032294	3032301	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15086	NC_021012	GGA	2	6	3032425	3032430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15087	NC_021012	TCCGGA	2	12	3032482	3032493	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15088	NC_021012	GCA	2	6	3032504	3032509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15089	NC_021012	TTAT	2	8	3032602	3032609	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15090	NC_021012	GCA	2	6	3032694	3032699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15091	NC_021012	TGA	2	6	3032739	3032744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15092	NC_021012	GCT	2	6	3032749	3032754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15093	NC_021012	AGG	2	6	3032850	3032855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15094	NC_021012	GCC	2	6	3032879	3032884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15095	NC_021012	ATT	2	6	3033029	3033034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15096	NC_021012	C	6	6	3033053	3033058	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15097	NC_021012	CAA	2	6	3033077	3033082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15098	NC_021012	GTT	2	6	3033084	3033089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15099	NC_021012	A	6	6	3033094	3033099	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15100	NC_021012	GTT	2	6	3033121	3033126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15101	NC_021012	GCT	2	6	3033130	3033135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15102	NC_021012	N	493	493	3033140	3033632	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15103	NC_021012	T	6	6	3033775	3033780	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15104	NC_021012	GAA	2	6	3033861	3033866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15105	NC_021012	T	6	6	3033872	3033877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15106	NC_021012	TG	3	6	3033902	3033907	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15107	NC_021012	GGAA	2	8	3033935	3033942	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15108	NC_021012	GAA	3	9	3033994	3034002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15109	NC_021012	GA	3	6	3034052	3034057	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15110	NC_021012	AAT	2	6	3034078	3034083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15111	NC_021012	CGC	2	6	3034133	3034138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15112	NC_021012	TTG	2	6	3034153	3034158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15113	NC_021012	TAT	2	6	3034197	3034202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15114	NC_021012	AG	3	6	3034296	3034301	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15115	NC_021012	ATA	2	6	3034328	3034333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15116	NC_021012	ATA	2	6	3034369	3034374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15117	NC_021012	TGT	2	6	3034774	3034779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15118	NC_021012	AGTGT	2	10	3034829	3034838	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
15119	NC_021012	CCA	2	6	3034878	3034883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15120	NC_021012	AGGGCA	2	12	3034887	3034898	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
15121	NC_021012	GCGTG	2	10	3034930	3034939	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
15122	NC_021012	CAG	2	6	3034967	3034972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15123	NC_021012	TC	3	6	3035074	3035079	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15124	NC_021012	TTGA	2	8	3035122	3035129	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15125	NC_021012	CGG	2	6	3035159	3035164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15126	NC_021012	TCC	2	6	3035648	3035653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15127	NC_021012	CTT	2	6	3035712	3035717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15128	NC_021012	TTC	2	6	3035718	3035723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15129	NC_021012	GCT	2	6	3035776	3035781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15130	NC_021012	CGG	2	6	3035816	3035821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15131	NC_021012	A	6	6	3035863	3035868	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15132	NC_021012	CTG	2	6	3035916	3035921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15133	NC_021012	TCA	3	9	3035944	3035952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15134	NC_021012	GCG	2	6	3035959	3035964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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15136	NC_021012	TATC	2	8	3036152	3036159	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15137	NC_021012	ATCAT	2	10	3036181	3036190	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
15138	NC_021012	CGG	2	6	3036260	3036265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15139	NC_021012	ATA	2	6	3036292	3036297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15140	NC_021012	GA	3	6	3036355	3036360	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15141	NC_021012	CTC	2	6	3036369	3036374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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15144	NC_021012	TCT	2	6	3037026	3037031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15145	NC_021012	TCT	2	6	3037063	3037068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15146	NC_021012	GCGG	2	8	3037105	3037112	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15147	NC_021012	ATGA	2	8	3037164	3037171	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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15149	NC_021012	AATC	2	8	3038252	3038259	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15150	NC_021012	TA	3	6	3038285	3038290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15151	NC_021012	TTTA	2	8	3038313	3038320	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15152	NC_021012	TTCA	2	8	3038585	3038592	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15153	NC_021012	GGCT	2	8	3038608	3038615	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15154	NC_021012	AAG	3	9	3038681	3038689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15157	NC_021012	GAAA	2	8	3038752	3038759	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15158	NC_021012	CGG	2	6	3038769	3038774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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15167	NC_021012	TGAT	2	8	3039353	3039360	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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15176	NC_021012	CAGC	2	8	3040140	3040147	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15177	NC_021012	TGGG	2	8	3040160	3040167	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
15178	NC_021012	A	6	6	3040221	3040226	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15179	NC_021012	TGG	2	6	3040229	3040234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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15243	NC_021012	CT	3	6	3049536	3049541	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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15246	NC_021012	AAC	2	6	3049669	3049674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15255	NC_021012	GGA	2	6	3050215	3050220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15256	NC_021012	ATG	2	6	3050229	3050234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15258	NC_021012	AG	3	6	3050267	3050272	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15259	NC_021012	AGGA	2	8	3050494	3050501	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15260	NC_021012	GGAG	2	8	3050560	3050567	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
15261	NC_021012	TA	3	6	3050568	3050573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15262	NC_021012	CAT	2	6	3050635	3050640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15263	NC_021012	TA	3	6	3050686	3050691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15264	NC_021012	TGAC	2	8	3050748	3050755	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15265	NC_021012	AGG	2	6	3050765	3050770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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15268	NC_021012	A	6	6	3051710	3051715	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15269	NC_021012	TAA	2	6	3051765	3051770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15277	NC_021012	A	6	6	3053918	3053923	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15295	NC_021012	AAGG	2	8	3055550	3055557	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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15297	NC_021012	TC	3	6	3055645	3055650	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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15374	NC_021012	GGAG	2	8	3068469	3068476	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
15375	NC_021012	A	6	6	3068905	3068910	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15376	NC_021012	A	6	6	3069013	3069018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15377	NC_021012	A	6	6	3069022	3069027	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15378	NC_021012	ATTAT	2	10	3070351	3070360	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15380	NC_021012	GGA	2	6	3070371	3070376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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15386	NC_021012	CAGAG	2	10	3073697	3073706	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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15392	NC_021012	TATT	2	8	3073918	3073925	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15393	NC_021012	TG	3	6	3073926	3073931	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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15425	NC_021012	A	7	7	3078427	3078433	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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