MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Roseburia intestinalis XB6B4 draft genome

Total Repeats: 20928

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_021012	TGT	2	6	2945156	2945161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14502	NC_021012	TCC	2	6	2945248	2945253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14503	NC_021012	A	7	7	2945267	2945273	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14504	NC_021012	TCTT	2	8	2945299	2945306	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14505	NC_021012	CT	3	6	2946266	2946271	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14506	NC_021012	TCT	2	6	2946296	2946301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14507	NC_021012	CCT	2	6	2946348	2946353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14508	NC_021012	GAAA	2	8	2946380	2946387	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14509	NC_021012	CCA	2	6	2946396	2946401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14510	NC_021012	AGA	3	9	2946410	2946418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14511	NC_021012	ATT	2	6	2946419	2946424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14512	NC_021012	N	919	919	2946484	2947402	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14513	NC_021012	GTT	2	6	2947491	2947496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14514	NC_021012	GA	3	6	2947528	2947533	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14515	NC_021012	TCA	2	6	2947540	2947545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14516	NC_021012	ACCA	2	8	2947549	2947556	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14517	NC_021012	ACT	2	6	2948077	2948082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14518	NC_021012	T	6	6	2948121	2948126	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14519	NC_021012	CA	3	6	2948139	2948144	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14520	NC_021012	ACG	2	6	2948176	2948181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14521	NC_021012	TTAAA	2	10	2948189	2948198	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14522	NC_021012	CT	3	6	2948209	2948214	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14523	NC_021012	TAT	2	6	2948263	2948268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14524	NC_021012	GCT	2	6	2948412	2948417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14525	NC_021012	AAG	2	6	2948473	2948478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14526	NC_021012	TAT	2	6	2948537	2948542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14527	NC_021012	AT	3	6	2948566	2948571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14528	NC_021012	AAT	2	6	2948578	2948583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14529	NC_021012	TTTG	2	8	2948625	2948632	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
14530	NC_021012	ATT	2	6	2948638	2948643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14531	NC_021012	N	1697	1697	2949151	2950847	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14532	NC_021012	TTCC	2	8	2950853	2950860	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14533	NC_021012	TTTC	2	8	2950990	2950997	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14534	NC_021012	T	6	6	2951032	2951037	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14535	NC_021012	ATG	2	6	2951067	2951072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14536	NC_021012	AAT	2	6	2951101	2951106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14537	NC_021012	AGA	2	6	2951253	2951258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14538	NC_021012	CCT	2	6	2951280	2951285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14539	NC_021012	T	6	6	2951313	2951318	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14540	NC_021012	TA	3	6	2951383	2951388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14541	NC_021012	A	6	6	2951388	2951393	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14542	NC_021012	TA	3	6	2951466	2951471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14543	NC_021012	ATA	2	6	2951549	2951554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14544	NC_021012	A	6	6	2951635	2951640	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14545	NC_021012	T	7	7	2951656	2951662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14546	NC_021012	TTATT	2	10	2951684	2951693	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14547	NC_021012	TA	3	6	2951714	2951719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14548	NC_021012	TTA	2	6	2951725	2951730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14549	NC_021012	TA	3	6	2951764	2951769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14550	NC_021012	GAA	2	6	2951828	2951833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14551	NC_021012	N	1082	1082	2952148	2953229	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14552	NC_021012	ACC	3	9	2953271	2953279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14553	NC_021012	TCA	2	6	2953289	2953294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14554	NC_021012	TTC	2	6	2953321	2953326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14555	NC_021012	TGAT	2	8	2953382	2953389	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14556	NC_021012	TTC	2	6	2953396	2953401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14557	NC_021012	CAC	2	6	2953440	2953445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14558	NC_021012	CTC	2	6	2953446	2953451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14559	NC_021012	TA	3	6	2953472	2953477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14560	NC_021012	AGG	2	6	2955216	2955221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14561	NC_021012	AG	3	6	2955680	2955685	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14562	NC_021012	TCT	2	6	2955713	2955718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14563	NC_021012	ACA	2	6	2956410	2956415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14564	NC_021012	A	6	6	2956488	2956493	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14565	NC_021012	TGG	2	6	2956592	2956597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14566	NC_021012	T	6	6	2956610	2956615	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14567	NC_021012	AGA	2	6	2956616	2956621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14568	NC_021012	A	6	6	2956626	2956631	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14569	NC_021012	TAA	2	6	2956640	2956645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14570	NC_021012	TAT	2	6	2956661	2956666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14571	NC_021012	ATA	2	6	2956722	2956727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14572	NC_021012	T	6	6	2956769	2956774	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14573	NC_021012	AT	3	6	2956850	2956855	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14574	NC_021012	A	7	7	2956898	2956904	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14575	NC_021012	GA	4	8	2956964	2956971	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14576	NC_021012	ATA	2	6	2956974	2956979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14577	NC_021012	TAA	2	6	2956997	2957002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14578	NC_021012	GATG	2	8	2957030	2957037	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14579	NC_021012	N	1623	1623	2957073	2958695	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14580	NC_021012	T	7	7	2958717	2958723	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14581	NC_021012	AGA	2	6	2958735	2958740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14582	NC_021012	T	7	7	2958793	2958799	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14583	NC_021012	ATA	2	6	2958947	2958952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14584	NC_021012	GAT	2	6	2958967	2958972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14586	NC_021012	GAA	2	6	2958991	2958996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14587	NC_021012	ATT	2	6	2958997	2959002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14588	NC_021012	AAG	2	6	2959088	2959093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14589	NC_021012	T	6	6	2959261	2959266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14590	NC_021012	A	6	6	2959272	2959277	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14591	NC_021012	ATTATA	2	12	2959912	2959923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14592	NC_021012	TGG	2	6	2959943	2959948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14593	NC_021012	A	6	6	2959975	2959980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14594	NC_021012	A	6	6	2960026	2960031	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14595	NC_021012	TG	3	6	2960094	2960099	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14596	NC_021012	CTG	2	6	2960102	2960107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14597	NC_021012	ATA	2	6	2960110	2960115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14598	NC_021012	A	7	7	2960122	2960128	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14599	NC_021012	CAG	2	6	2960136	2960141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14600	NC_021012	TGA	2	6	2960174	2960179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14601	NC_021012	A	7	7	2960256	2960262	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14602	NC_021012	TAT	2	6	2960271	2960276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14603	NC_021012	ATG	2	6	2960347	2960352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14604	NC_021012	TA	3	6	2960359	2960364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14605	NC_021012	N	1393	1393	2960451	2961843	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14606	NC_021012	TTGAAA	2	12	2961957	2961968	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14607	NC_021012	ATT	3	9	2962016	2962024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14608	NC_021012	TA	3	6	2962110	2962115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14609	NC_021012	ATT	2	6	2962163	2962168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14610	NC_021012	AGC	2	6	2962171	2962176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14611	NC_021012	T	6	6	2962282	2962287	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14612	NC_021012	ACAG	2	8	2962323	2962330	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14613	NC_021012	A	6	6	2962382	2962387	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14614	NC_021012	TA	3	6	2962397	2962402	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14615	NC_021012	TAAA	2	8	2962439	2962446	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14616	NC_021012	GGAA	2	8	2962469	2962476	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14617	NC_021012	GAG	2	6	2962490	2962495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14618	NC_021012	AT	3	6	2962599	2962604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14619	NC_021012	ATT	2	6	2962645	2962650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14620	NC_021012	TAT	2	6	2962654	2962659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14621	NC_021012	ACA	2	6	2962686	2962691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14622	NC_021012	AT	3	6	2962698	2962703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14623	NC_021012	T	6	6	2962706	2962711	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14624	NC_021012	ATG	2	6	2962817	2962822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14625	NC_021012	T	6	6	2962830	2962835	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14626	NC_021012	ATT	2	6	2962836	2962841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14627	NC_021012	AACAAT	2	12	2962842	2962853	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14628	NC_021012	A	6	6	2962868	2962873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14629	NC_021012	TTA	2	6	2962874	2962879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14630	NC_021012	TAA	2	6	2962935	2962940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14631	NC_021012	AGC	2	6	2962956	2962961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14632	NC_021012	TAT	2	6	2962976	2962981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14633	NC_021012	TA	3	6	2963069	2963074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14634	NC_021012	ATC	3	9	2963075	2963083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14635	NC_021012	T	6	6	2963087	2963092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14636	NC_021012	GAT	2	6	2963178	2963183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14637	NC_021012	TA	3	6	2963185	2963190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14638	NC_021012	T	6	6	2963269	2963274	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14639	NC_021012	T	7	7	2963286	2963292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14640	NC_021012	TCA	2	6	2963332	2963337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14641	NC_021012	ATA	2	6	2963402	2963407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14642	NC_021012	TAT	2	6	2963444	2963449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14643	NC_021012	AAT	2	6	2963461	2963466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14644	NC_021012	A	8	8	2963529	2963536	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14645	NC_021012	TAA	2	6	2963537	2963542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14646	NC_021012	A	6	6	2963551	2963556	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14647	NC_021012	AG	3	6	2963646	2963651	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14648	NC_021012	GTT	2	6	2963683	2963688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14650	NC_021012	TTA	2	6	2963737	2963742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14651	NC_021012	GTA	2	6	2963779	2963784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14652	NC_021012	AT	3	6	2963856	2963861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14653	NC_021012	CATATA	2	12	2963882	2963893	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14654	NC_021012	TAA	2	6	2963961	2963966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14655	NC_021012	TA	4	8	2963967	2963974	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14656	NC_021012	TTA	2	6	2964031	2964036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14657	NC_021012	TAT	2	6	2964128	2964133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14658	NC_021012	A	6	6	2964141	2964146	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14659	NC_021012	TTG	2	6	2964206	2964211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14661	NC_021012	TA	3	6	2964271	2964276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14662	NC_021012	AAT	2	6	2964555	2964560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14663	NC_021012	TTC	2	6	2964577	2964582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14664	NC_021012	ATT	2	6	2964596	2964601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14665	NC_021012	AGCG	2	8	2964610	2964617	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14666	NC_021012	TAA	2	6	2964626	2964631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14667	NC_021012	TATC	2	8	2964642	2964649	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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14670	NC_021012	T	6	6	2964811	2964816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14671	NC_021012	TCT	2	6	2964830	2964835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14672	NC_021012	GTT	2	6	2964879	2964884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14673	NC_021012	ATT	2	6	2965035	2965040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14674	NC_021012	ATT	2	6	2965054	2965059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14675	NC_021012	TAA	2	6	2968424	2968429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14676	NC_021012	N	591	591	2968441	2969031	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14677	NC_021012	N	697	697	2969976	2970672	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14678	NC_021012	ATCT	2	8	2970691	2970698	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14679	NC_021012	TGA	2	6	2970736	2970741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14683	NC_021012	CTT	2	6	2970913	2970918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14685	NC_021012	TAA	2	6	2970942	2970947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14686	NC_021012	T	6	6	2970986	2970991	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14690	NC_021012	CAA	2	6	2971134	2971139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14691	NC_021012	T	6	6	2971232	2971237	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14692	NC_021012	GAG	2	6	2971242	2971247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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14743	NC_021012	TA	3	6	2975271	2975276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14744	NC_021012	CTTT	2	8	2975322	2975329	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14745	NC_021012	ATT	2	6	2975352	2975357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14747	NC_021012	A	7	7	2977267	2977273	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14748	NC_021012	CACT	2	8	2977277	2977284	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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14754	NC_021012	TAT	2	6	2977447	2977452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14755	NC_021012	TGATC	2	10	2977453	2977462	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
14756	NC_021012	ATATAC	2	12	2977479	2977490	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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14758	NC_021012	TGG	2	6	2978117	2978122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14759	NC_021012	AAAAGA	2	12	2978136	2978147	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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14895	NC_021012	GCA	2	6	2990699	2990704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14896	NC_021012	TAT	2	6	2990727	2990732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14897	NC_021012	ATC	2	6	2990752	2990757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14898	NC_021012	CAA	2	6	2990820	2990825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14908	NC_021012	AGGA	2	8	2991762	2991769	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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14932	NC_021012	AGAAC	2	10	2993309	2993318	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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