MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Roseburia intestinalis XB6B4 draft genome

Total Repeats: 20928

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_021012	GCC	2	6	2833474	2833479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13502	NC_021012	ATT	2	6	2833484	2833489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13503	NC_021012	ATA	2	6	2833510	2833515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13504	NC_021012	GTTT	2	8	2833546	2833553	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13505	NC_021012	AGG	2	6	2833579	2833584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13506	NC_021012	TGG	2	6	2834094	2834099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13507	NC_021012	T	6	6	2834109	2834114	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13508	NC_021012	ATT	2	6	2834117	2834122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13509	NC_021012	CAA	2	6	2834184	2834189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13510	NC_021012	AGT	2	6	2834228	2834233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13511	NC_021012	TCA	2	6	2834249	2834254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13512	NC_021012	CAA	2	6	2834268	2834273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13513	NC_021012	GCA	2	6	2834274	2834279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13514	NC_021012	TTC	2	6	2834281	2834286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13515	NC_021012	AGT	2	6	2834288	2834293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13516	NC_021012	CAG	2	6	2834310	2834315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13517	NC_021012	CAT	2	6	2834325	2834330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13518	NC_021012	ATG	3	9	2834403	2834411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13519	NC_021012	ATG	2	6	2834415	2834420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13520	NC_021012	AT	3	6	2834421	2834426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13521	NC_021012	ATGG	2	8	2834429	2834436	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13522	NC_021012	GATTAT	2	12	2834438	2834449	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13523	NC_021012	CAA	2	6	2835119	2835124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13524	NC_021012	ATA	2	6	2835130	2835135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13525	NC_021012	N	1369	1369	2835178	2836546	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13526	NC_021012	TTGT	2	8	2836562	2836569	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13527	NC_021012	AAAG	2	8	2836642	2836649	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13528	NC_021012	AAG	2	6	2836698	2836703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13529	NC_021012	GTCA	2	8	2836732	2836739	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13530	NC_021012	TGA	2	6	2836837	2836842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13531	NC_021012	AGA	2	6	2836852	2836857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13532	NC_021012	AGGT	2	8	2836889	2836896	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13533	NC_021012	TTTC	2	8	2838042	2838049	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13534	NC_021012	AAT	2	6	2838078	2838083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13535	NC_021012	ATT	2	6	2838105	2838110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13536	NC_021012	AGA	2	6	2838191	2838196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13537	NC_021012	TTG	2	6	2838427	2838432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13538	NC_021012	GAT	2	6	2839064	2839069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13539	NC_021012	AGA	2	6	2839084	2839089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13540	NC_021012	AG	3	6	2839112	2839117	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13541	NC_021012	TA	3	6	2839148	2839153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13542	NC_021012	AAGAG	2	10	2839168	2839177	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
13543	NC_021012	AAC	2	6	2839220	2839225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13544	NC_021012	AGG	2	6	2839287	2839292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13545	NC_021012	T	6	6	2839337	2839342	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13546	NC_021012	N	1335	1335	2839375	2840709	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13547	NC_021012	AAG	2	6	2840720	2840725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13548	NC_021012	TACT	2	8	2840799	2840806	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13549	NC_021012	TCTG	2	8	2840839	2840846	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13550	NC_021012	CTT	2	6	2840932	2840937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13551	NC_021012	ACC	2	6	2840964	2840969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13552	NC_021012	TAC	2	6	2841094	2841099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13553	NC_021012	TGA	2	6	2841118	2841123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13554	NC_021012	GAA	2	6	2841152	2841157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13555	NC_021012	AGA	2	6	2841192	2841197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13556	NC_021012	GAG	2	6	2841227	2841232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13557	NC_021012	AAT	2	6	2841242	2841247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13558	NC_021012	CAA	2	6	2841253	2841258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13559	NC_021012	ATC	2	6	2841281	2841286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13560	NC_021012	AGA	2	6	2841327	2841332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13561	NC_021012	CAG	2	6	2841343	2841348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13562	NC_021012	TTC	2	6	2841389	2841394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13563	NC_021012	TTA	2	6	2841429	2841434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13564	NC_021012	TGA	2	6	2841532	2841537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13565	NC_021012	AT	3	6	2841557	2841562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13566	NC_021012	TAA	2	6	2841571	2841576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13567	NC_021012	GAA	2	6	2841643	2841648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13568	NC_021012	AGAATC	2	12	2841653	2841664	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13569	NC_021012	A	6	6	2841682	2841687	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13570	NC_021012	CAA	2	6	2841741	2841746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13571	NC_021012	AAC	2	6	2841775	2841780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13572	NC_021012	GCTT	2	8	2841901	2841908	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13573	NC_021012	AAT	2	6	2841938	2841943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13574	NC_021012	GCA	2	6	2841992	2841997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13575	NC_021012	TTG	2	6	2842032	2842037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13576	NC_021012	AT	3	6	2842126	2842131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13577	NC_021012	AAG	2	6	2842209	2842214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13578	NC_021012	TGA	4	12	2842249	2842260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13579	NC_021012	AGC	2	6	2842271	2842276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13580	NC_021012	AGAGC	2	10	2842281	2842290	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
13581	NC_021012	AATC	2	8	2842336	2842343	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13582	NC_021012	AAGA	2	8	2842378	2842385	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13583	NC_021012	TTC	2	6	2842424	2842429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13584	NC_021012	AAG	2	6	2842442	2842447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13585	NC_021012	AG	3	6	2842446	2842451	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13586	NC_021012	TGA	2	6	2842462	2842467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13587	NC_021012	AGA	2	6	2842471	2842476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13588	NC_021012	N	1228	1228	2842644	2843871	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13589	NC_021012	AG	3	6	2843885	2843890	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13590	NC_021012	GCA	2	6	2843893	2843898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13591	NC_021012	TAT	2	6	2843904	2843909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13592	NC_021012	ATA	2	6	2843915	2843920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13593	NC_021012	TA	3	6	2843919	2843924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13594	NC_021012	AGC	2	6	2843946	2843951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13595	NC_021012	AGTTA	2	10	2843954	2843963	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13596	NC_021012	TGA	2	6	2843975	2843980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13597	NC_021012	AGA	2	6	2843998	2844003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13598	NC_021012	AGA	2	6	2844107	2844112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13599	NC_021012	GCA	2	6	2844115	2844120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13600	NC_021012	AGA	2	6	2844132	2844137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13601	NC_021012	CTT	2	6	2844139	2844144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13602	NC_021012	ATACAG	2	12	2844230	2844241	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13603	NC_021012	CAG	2	6	2844281	2844286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13604	NC_021012	GATT	2	8	2844299	2844306	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13605	NC_021012	CCA	2	6	2844355	2844360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13606	NC_021012	AAT	2	6	2844394	2844399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13607	NC_021012	GAA	2	6	2844405	2844410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13608	NC_021012	TTTG	2	8	2844435	2844442	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13609	NC_021012	GAT	2	6	2844495	2844500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13610	NC_021012	GCAT	2	8	2844507	2844514	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13611	NC_021012	AACG	2	8	2844560	2844567	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13612	NC_021012	GAA	2	6	2844604	2844609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13613	NC_021012	AGT	2	6	2844621	2844626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13614	NC_021012	AAC	2	6	2844630	2844635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13615	NC_021012	A	7	7	2844650	2844656	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13616	NC_021012	TA	3	6	2844658	2844663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13617	NC_021012	GAAA	2	8	2844717	2844724	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13618	NC_021012	TA	3	6	2844751	2844756	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13619	NC_021012	ACA	2	6	2844880	2844885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13620	NC_021012	ATTT	2	8	2844896	2844903	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13621	NC_021012	ATA	2	6	2844932	2844937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13622	NC_021012	A	6	6	2844937	2844942	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13623	NC_021012	TAA	2	6	2844954	2844959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13624	NC_021012	GGA	2	6	2844964	2844969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13625	NC_021012	ATTG	2	8	2845003	2845010	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13626	NC_021012	ATG	2	6	2845016	2845021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13627	NC_021012	GAA	2	6	2845032	2845037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13628	NC_021012	TTA	2	6	2845163	2845168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13629	NC_021012	ATA	2	6	2845184	2845189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13633	NC_021012	TA	3	6	2845262	2845267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13634	NC_021012	CTA	2	6	2845271	2845276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13640	NC_021012	GAAT	2	8	2845509	2845516	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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13751	NC_021012	CTT	2	6	2853118	2853123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13753	NC_021012	TTC	2	6	2853195	2853200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13755	NC_021012	TA	3	6	2853215	2853220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13758	NC_021012	AGG	2	6	2856988	2856993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13759	NC_021012	GGA	2	6	2857832	2857837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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13886	NC_021012	GGAAT	2	10	2868471	2868480	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
13887	NC_021012	TCA	2	6	2868557	2868562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13890	NC_021012	TC	3	6	2868679	2868684	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13891	NC_021012	CCTT	2	8	2868719	2868726	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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13894	NC_021012	T	6	6	2868767	2868772	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13895	NC_021012	ATG	2	6	2868777	2868782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13900	NC_021012	ATT	2	6	2868883	2868888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13903	NC_021012	N	1103	1103	2869497	2870599	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13999	NC_021012	GGC	2	6	2879548	2879553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14000	NC_021012	TGACGG	2	12	2879555	2879566	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding

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