MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Roseburia intestinalis XB6B4 draft genome

Total Repeats: 20928

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_021012	GT	3	6	1837426	1837431	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9002	NC_021012	AAAG	2	8	1837467	1837474	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9003	NC_021012	ATT	2	6	1837557	1837562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9004	NC_021012	TGG	2	6	1837610	1837615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9005	NC_021012	GGC	2	6	1837659	1837664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9006	NC_021012	TACAG	2	10	1837693	1837702	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
9007	NC_021012	TGA	2	6	1838125	1838130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9008	NC_021012	TGG	2	6	1838158	1838163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9009	NC_021012	TATCA	2	10	1838250	1838259	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
9010	NC_021012	GGA	2	6	1838324	1838329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9011	NC_021012	ATA	2	6	1838371	1838376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9012	NC_021012	ATT	2	6	1838514	1838519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9013	NC_021012	GAT	2	6	1838526	1838531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9014	NC_021012	GCA	2	6	1838546	1838551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9015	NC_021012	GAGT	2	8	1838570	1838577	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9016	NC_021012	AGGG	2	8	1838580	1838587	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
9017	NC_021012	CTG	2	6	1838670	1838675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9018	NC_021012	GCAGG	2	10	1838884	1838893	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
9019	NC_021012	A	7	7	1838949	1838955	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9020	NC_021012	GGA	2	6	1838984	1838989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9021	NC_021012	ATA	2	6	1839040	1839045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9022	NC_021012	CAG	2	6	1839052	1839057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9023	NC_021012	A	6	6	1839096	1839101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9024	NC_021012	T	6	6	1839157	1839162	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9025	NC_021012	TGA	2	6	1839171	1839176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9026	NC_021012	T	7	7	1839497	1839503	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9027	NC_021012	AGG	2	6	1839512	1839517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9028	NC_021012	AT	3	6	1845210	1845215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9029	NC_021012	CATT	2	8	1845250	1845257	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9030	NC_021012	GT	3	6	1846632	1846637	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9031	NC_021012	TGA	2	6	1846665	1846670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9032	NC_021012	CTT	2	6	1846675	1846680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9033	NC_021012	CCT	2	6	1847352	1847357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9034	NC_021012	GTAT	2	8	1847364	1847371	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9035	NC_021012	CAA	2	6	1847477	1847482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9036	NC_021012	AGG	2	6	1847505	1847510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9037	NC_021012	GGC	2	6	1847752	1847757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9038	NC_021012	TGT	2	6	1847858	1847863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9039	NC_021012	AG	3	6	1847875	1847880	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9040	NC_021012	CAA	2	6	1847903	1847908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9041	NC_021012	GAA	2	6	1847917	1847922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9043	NC_021012	GGAA	2	8	1847990	1847997	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9044	NC_021012	AGAA	2	8	1848007	1848014	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9045	NC_021012	GAA	2	6	1848019	1848024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9047	NC_021012	GGA	2	6	1848058	1848063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9048	NC_021012	GAG	2	6	1848094	1848099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9049	NC_021012	AAAC	2	8	1848140	1848147	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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9051	NC_021012	GGA	2	6	1848195	1848200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9052	NC_021012	GGAG	2	8	1848212	1848219	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
9053	NC_021012	TGAA	2	8	1848247	1848254	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9054	NC_021012	GTC	2	6	1848279	1848284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9057	NC_021012	TAAA	2	8	1850929	1850936	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9058	NC_021012	AAT	2	6	1850940	1850945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9059	NC_021012	AGT	2	6	1850956	1850961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9061	NC_021012	CTT	2	6	1850980	1850985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9062	NC_021012	T	6	6	1850984	1850989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9063	NC_021012	GATA	2	8	1850990	1850997	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9064	NC_021012	AG	3	6	1851009	1851014	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9065	NC_021012	AGTAA	2	10	1851025	1851034	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
9066	NC_021012	A	7	7	1851108	1851114	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9069	NC_021012	TTA	2	6	1851403	1851408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9072	NC_021012	AT	3	6	1851450	1851455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9073	NC_021012	CTG	2	6	1851577	1851582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9077	NC_021012	A	7	7	1851693	1851699	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9078	NC_021012	GT	3	6	1851737	1851742	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9079	NC_021012	A	7	7	1851749	1851755	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9082	NC_021012	ATG	2	6	1851785	1851790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9087	NC_021012	CATAT	2	10	1853310	1853319	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
9088	NC_021012	GA	3	6	1853327	1853332	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9089	NC_021012	ATA	2	6	1853357	1853362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9097	NC_021012	TCTG	2	8	1854937	1854944	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9098	NC_021012	CAA	2	6	1854969	1854974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9099	NC_021012	GTCCG	2	10	1855012	1855021	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
9100	NC_021012	TTC	2	6	1855096	1855101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9101	NC_021012	TCT	2	6	1855176	1855181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9102	NC_021012	CCA	2	6	1855326	1855331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9103	NC_021012	CCA	2	6	1855412	1855417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9104	NC_021012	ATCA	2	8	1855471	1855478	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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9106	NC_021012	TGA	2	6	1855539	1855544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9110	NC_021012	CTTG	2	8	1855744	1855751	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9111	NC_021012	CTGA	2	8	1855759	1855766	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9112	NC_021012	GCT	2	6	1855773	1855778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9113	NC_021012	GTTT	2	8	1855814	1855821	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
9114	NC_021012	GAA	2	6	1855898	1855903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9115	NC_021012	CAA	2	6	1855935	1855940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9116	NC_021012	GT	3	6	1855942	1855947	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9117	NC_021012	T	6	6	1855996	1856001	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9118	NC_021012	TCC	2	6	1856075	1856080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9119	NC_021012	A	6	6	1856166	1856171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9120	NC_021012	TCCG	2	8	1856251	1856258	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9121	NC_021012	GTT	2	6	1856260	1856265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9126	NC_021012	TTC	2	6	1856392	1856397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9127	NC_021012	GAT	2	6	1856437	1856442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9129	NC_021012	GTT	2	6	1856606	1856611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9130	NC_021012	GCC	2	6	1856627	1856632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9131	NC_021012	ATG	2	6	1856644	1856649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9132	NC_021012	ACAT	2	8	1856696	1856703	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9133	NC_021012	CA	3	6	1856706	1856711	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9134	NC_021012	CAT	2	6	1856757	1856762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9135	NC_021012	ACT	2	6	1856818	1856823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9136	NC_021012	ATT	2	6	1856839	1856844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9137	NC_021012	TG	3	6	1856877	1856882	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9138	NC_021012	ATA	2	6	1856894	1856899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9139	NC_021012	CTC	2	6	1856914	1856919	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9140	NC_021012	TCC	2	6	1856972	1856977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9141	NC_021012	TCT	2	6	1856985	1856990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9142	NC_021012	ATC	2	6	1857040	1857045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9143	NC_021012	TC	3	6	1857094	1857099	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9144	NC_021012	T	6	6	1857114	1857119	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9145	NC_021012	ATG	2	6	1857140	1857145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9146	NC_021012	TTC	2	6	1857186	1857191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9147	NC_021012	CAT	2	6	1857346	1857351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9148	NC_021012	TCC	2	6	1857397	1857402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9149	NC_021012	ATT	2	6	1857508	1857513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9150	NC_021012	GTC	2	6	1857546	1857551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9151	NC_021012	TCA	2	6	1857665	1857670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9152	NC_021012	TTGCCC	2	12	1857864	1857875	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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9154	NC_021012	GGC	2	6	1858009	1858014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9155	NC_021012	CTGC	2	8	1858023	1858030	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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9160	NC_021012	CTT	2	6	1858365	1858370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9161	NC_021012	AAG	2	6	1858381	1858386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9162	NC_021012	GCT	2	6	1858482	1858487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9163	NC_021012	CTC	2	6	1858501	1858506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9164	NC_021012	ATCA	2	8	1858531	1858538	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9165	NC_021012	CT	3	6	1858540	1858545	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9166	NC_021012	TCTG	2	8	1858551	1858558	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9167	NC_021012	TCA	2	6	1858562	1858567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9168	NC_021012	CTC	2	6	1858582	1858587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9169	NC_021012	TAA	2	6	1858634	1858639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9170	NC_021012	CTGT	2	8	1858704	1858711	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9171	NC_021012	TC	3	6	1858729	1858734	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9172	NC_021012	TCA	2	6	1858802	1858807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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9174	NC_021012	CTG	2	6	1858829	1858834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9176	NC_021012	CT	3	6	1858972	1858977	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9177	NC_021012	A	7	7	1858985	1858991	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9185	NC_021012	CTCCA	2	10	1859371	1859380	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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9191	NC_021012	ATT	2	6	1859614	1859619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9192	NC_021012	TCA	2	6	1859621	1859626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9193	NC_021012	CTC	2	6	1859677	1859682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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9195	NC_021012	CCT	2	6	1859889	1859894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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9199	NC_021012	CT	3	6	1860206	1860211	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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9202	NC_021012	CAC	2	6	1860376	1860381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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9211	NC_021012	TCA	2	6	1860659	1860664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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9215	NC_021012	TCTG	2	8	1860902	1860909	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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9218	NC_021012	CTTT	2	8	1860999	1861006	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9219	NC_021012	TCC	2	6	1861049	1861054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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9222	NC_021012	A	8	8	1861133	1861140	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9223	NC_021012	TCA	2	6	1861190	1861195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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9225	NC_021012	TTC	2	6	1861210	1861215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9226	NC_021012	CTA	2	6	1861622	1861627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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9228	NC_021012	A	6	6	1862974	1862979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9229	NC_021012	CCT	2	6	1863750	1863755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9230	NC_021012	CCT	2	6	1865266	1865271	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9231	NC_021012	AG	3	6	1865277	1865282	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9232	NC_021012	CT	3	6	1865293	1865298	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9233	NC_021012	T	6	6	1867216	1867221	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9234	NC_021012	T	7	7	1867255	1867261	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9235	NC_021012	CTT	2	6	1867279	1867284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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9237	NC_021012	A	6	6	1867305	1867310	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9238	NC_021012	CCG	2	6	1869767	1869772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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9243	NC_021012	T	6	6	1872372	1872377	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9244	NC_021012	A	7	7	1872784	1872790	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9245	NC_021012	CAG	2	6	1872795	1872800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9246	NC_021012	TGT	2	6	1872853	1872858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9247	NC_021012	ACC	2	6	1872898	1872903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9248	NC_021012	A	6	6	1872918	1872923	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9249	NC_021012	TTA	2	6	1872965	1872970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9250	NC_021012	TAA	2	6	1873026	1873031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9251	NC_021012	TTA	2	6	1873045	1873050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9252	NC_021012	T	6	6	1873526	1873531	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9253	NC_021012	AT	4	8	1873593	1873600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9254	NC_021012	TAT	2	6	1873617	1873622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9255	NC_021012	AAAT	2	8	1873679	1873686	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9256	NC_021012	CAA	2	6	1873716	1873721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9257	NC_021012	AAT	2	6	1873729	1873734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9258	NC_021012	TAT	2	6	1873738	1873743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9259	NC_021012	TGATA	2	10	1873753	1873762	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
9260	NC_021012	ATT	2	6	1873813	1873818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9261	NC_021012	CTG	2	6	1873979	1873984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9262	NC_021012	CATA	2	8	1873985	1873992	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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9264	NC_021012	CCT	2	6	1874481	1874486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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9399	NC_021012	TTA	2	6	1899890	1899895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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