MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Roseburia intestinalis XB6B4 draft genome

Total Repeats: 20928

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_021012	AGA	2	6	1649195	1649200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8002	NC_021012	TATGA	2	10	1649420	1649429	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
8003	NC_021012	TAA	2	6	1649467	1649472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8004	NC_021012	TCAG	2	8	1649481	1649488	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8005	NC_021012	CTA	2	6	1649624	1649629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8006	NC_021012	TCA	2	6	1649636	1649641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8007	NC_021012	AGG	2	6	1650657	1650662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8008	NC_021012	ATT	2	6	1653941	1653946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8009	NC_021012	T	6	6	1653990	1653995	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8010	NC_021012	A	6	6	1654012	1654017	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_021012	AGG	2	6	1654033	1654038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8012	NC_021012	TTTTGC	2	12	1654047	1654058	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8013	NC_021012	ACA	2	6	1654077	1654082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8014	NC_021012	A	6	6	1654088	1654093	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8015	NC_021012	CG	3	6	1654096	1654101	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8016	NC_021012	TCC	2	6	1655407	1655412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8017	NC_021012	TGA	2	6	1655418	1655423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8018	NC_021012	AAT	2	6	1655478	1655483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8019	NC_021012	A	6	6	1655492	1655497	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8020	NC_021012	AGA	2	6	1655542	1655547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8021	NC_021012	ACA	2	6	1655567	1655572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8022	NC_021012	GCA	2	6	1655573	1655578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8023	NC_021012	A	6	6	1656794	1656799	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8024	NC_021012	A	6	6	1656827	1656832	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8025	NC_021012	AAAG	2	8	1656854	1656861	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8026	NC_021012	AATT	2	8	1656869	1656876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8027	NC_021012	AAAG	2	8	1657115	1657122	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8028	NC_021012	TGCC	2	8	1657136	1657143	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8029	NC_021012	CAG	3	9	1657186	1657194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8030	NC_021012	AAG	2	6	1657226	1657231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8031	NC_021012	GCA	2	6	1657317	1657322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8032	NC_021012	CAATCA	2	12	1657354	1657365	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8035	NC_021012	GTT	2	6	1657440	1657445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8036	NC_021012	GGT	2	6	1657449	1657454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8037	NC_021012	ATC	2	6	1657527	1657532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8038	NC_021012	ATG	2	6	1657546	1657551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8039	NC_021012	ATG	2	6	1657581	1657586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8040	NC_021012	AGA	2	6	1657628	1657633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8041	NC_021012	CAGC	2	8	1657655	1657662	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8042	NC_021012	TGA	3	9	1657697	1657705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8043	NC_021012	A	6	6	1657731	1657736	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8044	NC_021012	CTG	2	6	1657783	1657788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8045	NC_021012	TGC	2	6	1657809	1657814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8047	NC_021012	GCA	3	9	1657872	1657880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8048	NC_021012	GTT	2	6	1657884	1657889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8049	NC_021012	GAA	2	6	1657896	1657901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8050	NC_021012	TGG	2	6	1657955	1657960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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8052	NC_021012	GTAAAC	2	12	1658124	1658135	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8053	NC_021012	GGT	2	6	1658136	1658141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8054	NC_021012	AGA	2	6	1658212	1658217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8055	NC_021012	GA	3	6	1658216	1658221	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8056	NC_021012	AG	3	6	1658227	1658232	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8057	NC_021012	CGG	2	6	1658252	1658257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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8059	NC_021012	T	6	6	1658295	1658300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8061	NC_021012	AGG	2	6	1658371	1658376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8062	NC_021012	GGA	2	6	1659271	1659276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8063	NC_021012	AATC	2	8	1660447	1660454	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8064	NC_021012	A	7	7	1661282	1661288	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8065	NC_021012	GTG	2	6	1661295	1661300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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8069	NC_021012	A	6	6	1663399	1663404	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8070	NC_021012	T	8	8	1663446	1663453	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8071	NC_021012	AAG	2	6	1663506	1663511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8073	NC_021012	GGT	2	6	1663643	1663648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8074	NC_021012	T	6	6	1663711	1663716	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8079	NC_021012	AAT	2	6	1663942	1663947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8085	NC_021012	T	6	6	1664041	1664046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8092	NC_021012	T	6	6	1665970	1665975	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8096	NC_021012	TGT	2	6	1666318	1666323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8099	NC_021012	A	7	7	1667163	1667169	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8100	NC_021012	TA	3	6	1667187	1667192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8103	NC_021012	TCTGAA	2	12	1667677	1667688	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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8109	NC_021012	GGA	2	6	1667808	1667813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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8112	NC_021012	AT	3	6	1669275	1669280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8113	NC_021012	ATA	3	9	1669286	1669294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8114	NC_021012	GGT	2	6	1669350	1669355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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8116	NC_021012	ATAGA	2	10	1669407	1669416	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8117	NC_021012	AGA	2	6	1669455	1669460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8118	NC_021012	TTA	2	6	1669513	1669518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8120	NC_021012	ATTA	2	8	1669614	1669621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8121	NC_021012	A	6	6	1669633	1669638	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8122	NC_021012	A	7	7	1669821	1669827	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8123	NC_021012	N	890	890	1669837	1670726	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8124	NC_021012	A	6	6	1670763	1670768	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8125	NC_021012	TCA	2	6	1670807	1670812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8126	NC_021012	TGG	2	6	1670820	1670825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8127	NC_021012	TA	3	6	1671034	1671039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8128	NC_021012	CCT	2	6	1671041	1671046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8129	NC_021012	TAT	2	6	1671056	1671061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8130	NC_021012	AT	3	6	1671065	1671070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8131	NC_021012	CAAA	2	8	1671071	1671078	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8132	NC_021012	TA	3	6	1671087	1671092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8133	NC_021012	A	6	6	1671097	1671102	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8134	NC_021012	TAA	2	6	1671103	1671108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8244	NC_021012	TGG	2	6	1688086	1688091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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8246	NC_021012	CATAT	2	10	1688106	1688115	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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8252	NC_021012	AATT	2	8	1688453	1688460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8253	NC_021012	AGG	2	6	1688466	1688471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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8255	NC_021012	ATA	2	6	1688537	1688542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8256	NC_021012	GAT	2	6	1688620	1688625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8257	NC_021012	TA	3	6	1690533	1690538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8258	NC_021012	TGA	2	6	1690581	1690586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8259	NC_021012	GGT	2	6	1691239	1691244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8260	NC_021012	CA	4	8	1691316	1691323	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8261	NC_021012	T	6	6	1691343	1691348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8262	NC_021012	A	6	6	1691367	1691372	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8399	NC_021012	A	7	7	1714691	1714697	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8400	NC_021012	A	7	7	1714757	1714763	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8401	NC_021012	TCG	2	6	1714788	1714793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8403	NC_021012	GCA	2	6	1715348	1715353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8412	NC_021012	A	6	6	1719814	1719819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8488	NC_021012	TCC	2	6	1725747	1725752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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8492	NC_021012	GGC	2	6	1725951	1725956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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8497	NC_021012	CAG	2	6	1726449	1726454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8498	NC_021012	TCG	2	6	1726554	1726559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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