MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Roseburia intestinalis XB6B4 draft genome

Total Repeats: 20928

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_021012	ATG	2	6	1304848	1304853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6502	NC_021012	GCG	2	6	1304856	1304861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6503	NC_021012	GTG	2	6	1304973	1304978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6504	NC_021012	GGA	2	6	1304979	1304984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6505	NC_021012	GGA	2	6	1305008	1305013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6506	NC_021012	AGAA	2	8	1305177	1305184	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6507	NC_021012	TTA	2	6	1305192	1305197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6508	NC_021012	A	6	6	1305288	1305293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6509	NC_021012	GAC	2	6	1305296	1305301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6510	NC_021012	GAA	2	6	1305356	1305361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6511	NC_021012	CGA	2	6	1305388	1305393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6512	NC_021012	ATT	2	6	1305489	1305494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6513	NC_021012	AGA	2	6	1305540	1305545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6514	NC_021012	CTT	2	6	1305569	1305574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6515	NC_021012	CGG	2	6	1305589	1305594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6516	NC_021012	TGG	2	6	1305616	1305621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6517	NC_021012	A	6	6	1305665	1305670	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6518	NC_021012	ATG	2	6	1305706	1305711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6519	NC_021012	GAA	3	9	1305720	1305728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6520	NC_021012	GGCAG	2	10	1305749	1305758	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
6521	NC_021012	ACCGC	2	10	1305813	1305822	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
6522	NC_021012	GAG	2	6	1305882	1305887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6523	NC_021012	GAA	2	6	1305888	1305893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6524	NC_021012	CGA	2	6	1305934	1305939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6525	NC_021012	ATC	2	6	1305948	1305953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6526	NC_021012	ATCTGA	2	12	1305976	1305987	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6527	NC_021012	GA	3	6	1306024	1306029	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6528	NC_021012	GGT	2	6	1306040	1306045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6529	NC_021012	TCA	2	6	1306129	1306134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6530	NC_021012	TGACC	2	10	1306199	1306208	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6531	NC_021012	CGA	2	6	1306219	1306224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6532	NC_021012	A	7	7	1306272	1306278	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6533	NC_021012	GCG	2	6	1306300	1306305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6534	NC_021012	GAC	2	6	1306316	1306321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6535	NC_021012	GCA	2	6	1306339	1306344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6536	NC_021012	AGGA	2	8	1306519	1306526	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6537	NC_021012	CTT	2	6	1306618	1306623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6538	NC_021012	TG	3	6	1306635	1306640	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6539	NC_021012	CTGA	2	8	1306716	1306723	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6540	NC_021012	CTG	2	6	1306725	1306730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6541	NC_021012	GA	3	6	1306738	1306743	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6542	NC_021012	A	6	6	1306769	1306774	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6543	NC_021012	AAG	2	6	1306779	1306784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6544	NC_021012	CGG	2	6	1306789	1306794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6545	NC_021012	AGA	2	6	1306871	1306876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6546	NC_021012	GCG	2	6	1306894	1306899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6547	NC_021012	CAT	2	6	1306915	1306920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6548	NC_021012	A	6	6	1307079	1307084	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6549	NC_021012	A	6	6	1307162	1307167	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6550	NC_021012	GCG	2	6	1307194	1307199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6551	NC_021012	A	6	6	1307244	1307249	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6552	NC_021012	GAT	2	6	1307250	1307255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6553	NC_021012	A	6	6	1307293	1307298	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6554	NC_021012	CGA	2	6	1307347	1307352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6555	NC_021012	TAAA	2	8	1307404	1307411	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6556	NC_021012	GCG	2	6	1307497	1307502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6557	NC_021012	A	6	6	1307547	1307552	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6558	NC_021012	AAG	2	6	1307608	1307613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6559	NC_021012	ACA	2	6	1307763	1307768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6560	NC_021012	TTTTGA	2	12	1307993	1308004	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6561	NC_021012	CAG	2	6	1308093	1308098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6562	NC_021012	CAG	2	6	1308102	1308107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6563	NC_021012	GAT	2	6	1308132	1308137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6564	NC_021012	GCA	2	6	1308165	1308170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6565	NC_021012	CAGGAA	2	12	1308174	1308185	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6566	NC_021012	T	7	7	1312284	1312290	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6567	NC_021012	CAA	2	6	1312311	1312316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6568	NC_021012	AGGTA	2	10	1312330	1312339	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
6569	NC_021012	ATAC	2	8	1312363	1312370	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6570	NC_021012	GACG	2	8	1313099	1313106	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6571	NC_021012	AGAA	2	8	1314137	1314144	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6572	NC_021012	T	7	7	1314178	1314184	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6573	NC_021012	ATTT	2	8	1314191	1314198	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6574	NC_021012	GGA	2	6	1314222	1314227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6575	NC_021012	AT	3	6	1314250	1314255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6576	NC_021012	AGA	2	6	1314260	1314265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6577	NC_021012	GAA	2	6	1314288	1314293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6578	NC_021012	ATTTTT	2	12	1314297	1314308	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6579	NC_021012	TAA	2	6	1314345	1314350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6580	NC_021012	CAT	2	6	1314380	1314385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6582	NC_021012	ATA	2	6	1316426	1316431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6583	NC_021012	T	8	8	1318727	1318734	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6584	NC_021012	ATAG	2	8	1318735	1318742	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6585	NC_021012	GA	4	8	1318751	1318758	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6586	NC_021012	TG	3	6	1321612	1321617	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6587	NC_021012	T	6	6	1322206	1322211	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6588	NC_021012	GGA	2	6	1322229	1322234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6589	NC_021012	AATT	2	8	1322235	1322242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6590	NC_021012	TTG	2	6	1323318	1323323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6591	NC_021012	AGAA	2	8	1323334	1323341	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6592	NC_021012	TCA	2	6	1323342	1323347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6593	NC_021012	ATG	2	6	1323363	1323368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6594	NC_021012	T	7	7	1323373	1323379	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6595	NC_021012	GGA	2	6	1323427	1323432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6596	NC_021012	ATAAA	2	10	1323480	1323489	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6597	NC_021012	TGT	2	6	1323493	1323498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6598	NC_021012	T	6	6	1323538	1323543	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6599	NC_021012	AG	3	6	1323551	1323556	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6600	NC_021012	TGC	2	6	1323565	1323570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6601	NC_021012	GT	3	6	1323639	1323644	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6602	NC_021012	GAAAT	2	10	1323754	1323763	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6603	NC_021012	T	8	8	1323858	1323865	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6604	NC_021012	AGG	2	6	1323876	1323881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6605	NC_021012	TCCTC	2	10	1323886	1323895	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
6606	NC_021012	AGG	2	6	1323928	1323933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6607	NC_021012	TTC	2	6	1323968	1323973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6608	NC_021012	AGG	2	6	1323982	1323987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6609	NC_021012	TCCTC	2	10	1323992	1324001	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
6610	NC_021012	AGG	2	6	1324034	1324039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6611	NC_021012	TA	3	6	1327842	1327847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6612	NC_021012	ATA	2	6	1327912	1327917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6613	NC_021012	TAT	2	6	1327941	1327946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6614	NC_021012	AT	3	6	1328920	1328925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6615	NC_021012	TAT	2	6	1328940	1328945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6616	NC_021012	GTT	2	6	1328989	1328994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6617	NC_021012	AC	4	8	1328997	1329004	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6618	NC_021012	CA	3	6	1329007	1329012	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6619	NC_021012	A	6	6	1329012	1329017	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6620	NC_021012	CA	3	6	1329026	1329031	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6621	NC_021012	T	6	6	1329054	1329059	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6622	NC_021012	AGG	2	6	1329060	1329065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6623	NC_021012	T	7	7	1330921	1330927	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6624	NC_021012	TAA	2	6	1330937	1330942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6625	NC_021012	TAT	2	6	1331885	1331890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6626	NC_021012	TGT	2	6	1331896	1331901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6627	NC_021012	TGT	2	6	1331950	1331955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6628	NC_021012	TGA	2	6	1331961	1331966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6629	NC_021012	AT	3	6	1332053	1332058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6630	NC_021012	CAGA	2	8	1332096	1332103	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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6632	NC_021012	TAAAA	2	10	1334355	1334364	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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