MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Roseburia intestinalis XB6B4 draft genome

Total Repeats: 20928

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_021012	GGA	2	6	1059907	1059912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_021012	GATC	2	8	1059941	1059948	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5503	NC_021012	ATT	2	6	1060021	1060026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_021012	TTTA	2	8	1060042	1060049	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_021012	ATG	2	6	1060128	1060133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_021012	CCTG	2	8	1060156	1060163	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5507	NC_021012	TGA	2	6	1060197	1060202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_021012	A	6	6	1060244	1060249	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_021012	TAA	2	6	1060275	1060280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_021012	A	8	8	1060290	1060297	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_021012	ATC	2	6	1060301	1060306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5512	NC_021012	A	6	6	1060327	1060332	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_021012	TTGG	2	8	1060448	1060455	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_021012	T	6	6	1060465	1060470	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_021012	T	7	7	1062650	1062656	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_021012	TTG	2	6	1063297	1063302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_021012	T	6	6	1063311	1063316	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_021012	GC	3	6	1063322	1063327	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5519	NC_021012	AGA	2	6	1063417	1063422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_021012	AAAT	2	8	1063514	1063521	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_021012	T	6	6	1064217	1064222	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_021012	C	6	6	1064246	1064251	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5523	NC_021012	GCA	2	6	1064254	1064259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5524	NC_021012	TCCCGT	2	12	1064273	1064284	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5525	NC_021012	TCT	2	6	1064302	1064307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5526	NC_021012	GTATT	2	10	1064338	1064347	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_021012	A	6	6	1064369	1064374	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_021012	GAA	2	6	1064563	1064568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_021012	A	6	6	1064587	1064592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5530	NC_021012	TCC	2	6	1066138	1066143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5531	NC_021012	T	6	6	1066162	1066167	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_021012	TTG	2	6	1067006	1067011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_021012	CGA	2	6	1067020	1067025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5534	NC_021012	T	6	6	1067051	1067056	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_021012	TAT	2	6	1067168	1067173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_021012	AAAAT	2	10	1067197	1067206	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_021012	GAA	2	6	1067229	1067234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_021012	A	6	6	1067241	1067246	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_021012	GAT	2	6	1067293	1067298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_021012	TAA	2	6	1067338	1067343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_021012	AGA	2	6	1067344	1067349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5542	NC_021012	TAA	2	6	1070424	1070429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_021012	AAGG	2	8	1070439	1070446	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_021012	A	7	7	1071934	1071940	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_021012	GGA	2	6	1071985	1071990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_021012	AGG	2	6	1072036	1072041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_021012	A	6	6	1076770	1076775	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_021012	AG	3	6	1076802	1076807	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_021012	AG	3	6	1076828	1076833	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_021012	TGG	2	6	1076842	1076847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_021012	ATGGT	2	10	1076908	1076917	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_021012	AAAG	2	8	1076968	1076975	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_021012	TG	3	6	1076985	1076990	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_021012	TGAA	2	8	1080169	1080176	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_021012	A	6	6	1080211	1080216	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_021012	A	6	6	1080278	1080283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_021012	GGCG	2	8	1080409	1080416	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5558	NC_021012	AT	3	6	1080436	1080441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_021012	A	6	6	1080484	1080489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_021012	GGATG	2	10	1080540	1080549	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_021012	GA	4	8	1080555	1080562	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_021012	AGG	2	6	1080632	1080637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_021012	GATA	2	8	1080665	1080672	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_021012	T	6	6	1080673	1080678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_021012	A	6	6	1080748	1080753	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_021012	CGG	2	6	1080793	1080798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5567	NC_021012	ATAA	2	8	1080837	1080844	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_021012	A	6	6	1082113	1082118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5569	NC_021012	ATA	2	6	1082128	1082133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_021012	TAA	2	6	1082145	1082150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5571	NC_021012	AAG	2	6	1082156	1082161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5572	NC_021012	TAAA	2	8	1082966	1082973	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_021012	GGA	2	6	1082979	1082984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5574	NC_021012	A	7	7	1086171	1086177	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5575	NC_021012	T	7	7	1088673	1088679	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5576	NC_021012	A	6	6	1088713	1088718	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5577	NC_021012	AGG	2	6	1088874	1088879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_021012	A	6	6	1088882	1088887	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_021012	ATA	2	6	1090354	1090359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_021012	AT	3	6	1090418	1090423	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5581	NC_021012	A	7	7	1090501	1090507	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5582	NC_021012	TTG	2	6	1090626	1090631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_021012	ATT	2	6	1090696	1090701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5584	NC_021012	CAAT	2	8	1090722	1090729	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5585	NC_021012	T	6	6	1090799	1090804	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5586	NC_021012	AT	3	6	1090837	1090842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5587	NC_021012	TTC	2	6	1090897	1090902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5588	NC_021012	TGA	2	6	1090932	1090937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5589	NC_021012	GCA	2	6	1090942	1090947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5590	NC_021012	ATG	2	6	1090958	1090963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5591	NC_021012	GGC	2	6	1091011	1091016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5593	NC_021012	AAAG	2	8	1091050	1091057	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5594	NC_021012	CCAT	2	8	1091078	1091085	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5597	NC_021012	GAA	2	6	1091214	1091219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5598	NC_021012	ATGG	2	8	1091220	1091227	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_021012	TCT	2	6	1091256	1091261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5601	NC_021012	CAG	2	6	1091321	1091326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5602	NC_021012	TTA	2	6	1092200	1092205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5603	NC_021012	T	6	6	1092217	1092222	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_021012	A	6	6	1092254	1092259	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_021012	A	6	6	1092264	1092269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_021012	TAG	2	6	1092270	1092275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5607	NC_021012	ATAG	2	8	1093307	1093314	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5608	NC_021012	AGG	2	6	1093316	1093321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5609	NC_021012	ATG	2	6	1094890	1094895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5611	NC_021012	TCC	2	6	1094948	1094953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5612	NC_021012	TAT	2	6	1094960	1094965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5613	NC_021012	AAT	2	6	1095002	1095007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5614	NC_021012	TTC	3	9	1095997	1096005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5615	NC_021012	ACA	2	6	1096016	1096021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5616	NC_021012	GGA	2	6	1096025	1096030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5617	NC_021012	GTA	2	6	1097616	1097621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5618	NC_021012	AAAC	2	8	1097628	1097635	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5619	NC_021012	AAAAG	2	10	1097661	1097670	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5620	NC_021012	AT	3	6	1098962	1098967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5621	NC_021012	TCT	2	6	1099015	1099020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5622	NC_021012	A	6	6	1099065	1099070	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5623	NC_021012	AAG	2	6	1099105	1099110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5624	NC_021012	GAA	2	6	1099157	1099162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5625	NC_021012	TAC	2	6	1100015	1100020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5626	NC_021012	CGG	2	6	1100039	1100044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5627	NC_021012	AAAAG	2	10	1100078	1100087	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5628	NC_021012	CAGG	2	8	1102187	1102194	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5629	NC_021012	CTGAA	2	10	1102201	1102210	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5630	NC_021012	A	6	6	1102332	1102337	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5631	NC_021012	AGA	2	6	1102361	1102366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5632	NC_021012	CGT	2	6	1102542	1102547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5634	NC_021012	GAA	2	6	1102606	1102611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5635	NC_021012	T	6	6	1102652	1102657	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5636	NC_021012	CA	3	6	1102701	1102706	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5637	NC_021012	CCG	2	6	1102778	1102783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5638	NC_021012	T	6	6	1102865	1102870	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5639	NC_021012	GAT	2	6	1102997	1103002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5647	NC_021012	TGT	2	6	1103323	1103328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5668	NC_021012	TGA	2	6	1104519	1104524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5675	NC_021012	AGC	2	6	1104886	1104891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5683	NC_021012	TA	3	6	1107609	1107614	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5694	NC_021012	T	6	6	1108769	1108774	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5695	NC_021012	TG	3	6	1109479	1109484	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5696	NC_021012	CTT	2	6	1109485	1109490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5726	NC_021012	A	6	6	1118311	1118316	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5734	NC_021012	T	7	7	1120789	1120795	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5735	NC_021012	T	7	7	1120850	1120856	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5739	NC_021012	CAAT	2	8	1123563	1123570	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5740	NC_021012	AAATG	2	10	1123579	1123588	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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5744	NC_021012	GT	3	6	1127223	1127228	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5760	NC_021012	AGA	2	6	1129321	1129326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5761	NC_021012	GA	3	6	1129325	1129330	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5762	NC_021012	ATA	2	6	1129338	1129343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5763	NC_021012	A	6	6	1129368	1129373	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5764	NC_021012	AATA	2	8	1129434	1129441	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5901	NC_021012	GAA	2	6	1161912	1161917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5902	NC_021012	GCA	2	6	1161924	1161929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5903	NC_021012	CGGAAC	2	12	1161974	1161985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5904	NC_021012	GCA	2	6	1161990	1161995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5923	NC_021012	AAC	2	6	1162988	1162993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5943	NC_021012	A	6	6	1164731	1164736	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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