MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Roseburia intestinalis XB6B4 draft genome

Total Repeats: 20928

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021012	TGC	2	6	939436	939441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5002	NC_021012	A	7	7	939458	939464	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_021012	AGA	2	6	939523	939528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_021012	TGTA	2	8	939579	939586	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_021012	AAT	2	6	939611	939616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_021012	CGC	2	6	939641	939646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5007	NC_021012	AGA	2	6	939675	939680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_021012	TGC	2	6	939694	939699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5009	NC_021012	GGCAT	2	10	939722	939731	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5010	NC_021012	CAG	2	6	939832	939837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5011	NC_021012	AT	3	6	939839	939844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_021012	A	7	7	939858	939864	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_021012	TTA	2	6	939996	940001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_021012	GTAT	2	8	940053	940060	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_021012	TGAG	2	8	940068	940075	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_021012	AAG	2	6	940403	940408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_021012	TTG	2	6	940416	940421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_021012	GATG	2	8	940480	940487	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_021012	A	8	8	940539	940546	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_021012	A	6	6	940555	940560	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_021012	GTA	2	6	940568	940573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_021012	GA	3	6	940591	940596	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_021012	AT	3	6	940648	940653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_021012	A	7	7	940702	940708	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_021012	CAG	2	6	940895	940900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5026	NC_021012	AGA	2	6	940904	940909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_021012	GAA	2	6	941051	941056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_021012	GA	4	8	941091	941098	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_021012	GCAG	2	8	941161	941168	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5030	NC_021012	CAT	2	6	941173	941178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5031	NC_021012	A	7	7	941218	941224	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_021012	GCA	2	6	941272	941277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5033	NC_021012	CAG	2	6	941330	941335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5034	NC_021012	ACTT	2	8	941384	941391	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5035	NC_021012	AT	3	6	941443	941448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_021012	A	6	6	941484	941489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_021012	CGA	2	6	941490	941495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5038	NC_021012	AACG	2	8	941665	941672	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5039	NC_021012	TGA	2	6	941755	941760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_021012	AAT	2	6	941777	941782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_021012	TGA	2	6	941800	941805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_021012	TGA	2	6	941833	941838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_021012	GCC	2	6	941857	941862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5044	NC_021012	GGA	2	6	941899	941904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_021012	GCT	2	6	942085	942090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5046	NC_021012	GTG	2	6	942128	942133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_021012	TGA	2	6	942154	942159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_021012	AGA	2	6	942202	942207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_021012	GTA	2	6	942251	942256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_021012	A	6	6	942330	942335	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_021012	AGG	2	6	942363	942368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_021012	A	6	6	942386	942391	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_021012	AAT	2	6	942573	942578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_021012	AAT	2	6	942581	942586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_021012	AT	3	6	942597	942602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_021012	AT	3	6	942658	942663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_021012	AGG	2	6	942670	942675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_021012	TGTTA	2	10	943484	943493	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_021012	CTG	2	6	943578	943583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5060	NC_021012	GATAA	2	10	943614	943623	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_021012	CTT	2	6	943629	943634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5062	NC_021012	ATTTTC	2	12	943640	943651	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5063	NC_021012	GAA	2	6	943687	943692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_021012	GC	3	6	943696	943701	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5065	NC_021012	AG	3	6	943725	943730	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_021012	GTA	2	6	943755	943760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_021012	ATA	2	6	943775	943780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_021012	A	6	6	943792	943797	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_021012	A	8	8	943803	943810	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_021012	A	6	6	943812	943817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_021012	T	8	8	943826	943833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_021012	TAA	2	6	943845	943850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_021012	AAT	2	6	943856	943861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_021012	ATAC	2	8	944293	944300	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5075	NC_021012	AG	3	6	947795	947800	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_021012	ACA	2	6	947852	947857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5077	NC_021012	GGAT	2	8	947888	947895	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_021012	ATT	2	6	947907	947912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_021012	AGA	2	6	947942	947947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_021012	TGAA	2	8	947971	947978	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_021012	TGAT	2	8	948025	948032	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_021012	GGAAGC	2	12	948044	948055	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5083	NC_021012	TGA	2	6	948062	948067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_021012	A	7	7	948071	948077	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_021012	A	6	6	948126	948131	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_021012	CAG	2	6	948132	948137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5087	NC_021012	AAC	2	6	948148	948153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5088	NC_021012	A	7	7	948159	948165	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_021012	A	7	7	948196	948202	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_021012	TAA	2	6	948242	948247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_021012	TGA	2	6	948266	948271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_021012	AAGA	2	8	948273	948280	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_021012	AAT	2	6	948300	948305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_021012	GACAT	2	10	948409	948418	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5095	NC_021012	TGAA	2	8	948448	948455	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_021012	TGA	2	6	948523	948528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_021012	GGC	2	6	948561	948566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5098	NC_021012	AGG	2	6	950360	950365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_021012	AGA	2	6	950376	950381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_021012	AGA	2	6	950385	950390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_021012	A	6	6	950401	950406	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_021012	GAA	2	6	950410	950415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_021012	A	7	7	950424	950430	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_021012	AGA	2	6	950444	950449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_021012	GCA	2	6	950461	950466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5106	NC_021012	GAA	3	9	950482	950490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_021012	GCG	2	6	950492	950497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5108	NC_021012	GCA	2	6	950498	950503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5109	NC_021012	T	6	6	950515	950520	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_021012	ATT	2	6	950554	950559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_021012	GGA	2	6	950584	950589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_021012	GAT	2	6	950653	950658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_021012	GAAAAG	2	12	950854	950865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_021012	TGT	2	6	950883	950888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_021012	AGC	2	6	951002	951007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5116	NC_021012	TGA	2	6	951009	951014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_021012	GCA	3	9	951052	951060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5118	NC_021012	GACA	2	8	951075	951082	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5119	NC_021012	GCT	2	6	951133	951138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5120	NC_021012	GAAAGG	2	12	951230	951241	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_021012	GAA	2	6	951244	951249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_021012	GAAGG	2	10	953944	953953	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_021012	AGG	2	6	953970	953975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_021012	ATG	2	6	953988	953993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_021012	ATA	2	6	955661	955666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_021012	A	6	6	955753	955758	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_021012	TAA	2	6	955783	955788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_021012	GGA	2	6	955790	955795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_021012	TAG	2	6	956081	956086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_021012	TGA	2	6	956873	956878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_021012	TGA	2	6	956920	956925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_021012	A	6	6	956989	956994	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5133	NC_021012	TGG	2	6	956995	957000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5134	NC_021012	TTC	2	6	957025	957030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5135	NC_021012	GGA	2	6	957036	957041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5136	NC_021012	TCT	2	6	957042	957047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5137	NC_021012	ATC	2	6	957068	957073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5138	NC_021012	TTA	2	6	957104	957109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5139	NC_021012	ATG	2	6	957157	957162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5141	NC_021012	GAA	2	6	957192	957197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5142	NC_021012	A	6	6	957202	957207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5143	NC_021012	GGA	2	6	957221	957226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5145	NC_021012	TGAT	2	8	957358	957365	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5151	NC_021012	ACA	2	6	957519	957524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5165	NC_021012	T	6	6	962570	962575	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5171	NC_021012	ATT	2	6	962732	962737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5172	NC_021012	ATT	2	6	962820	962825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5173	NC_021012	CTT	3	9	962831	962839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5259	NC_021012	CAA	2	6	993708	993713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5260	NC_021012	TAAG	2	8	993715	993722	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5261	NC_021012	A	6	6	998238	998243	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5262	NC_021012	T	7	7	998271	998277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5263	NC_021012	TAT	2	6	999412	999417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5264	NC_021012	TAG	2	6	999500	999505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5266	NC_021012	TG	3	6	1000677	1000682	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5267	NC_021012	GAA	2	6	1000701	1000706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5268	NC_021012	AGG	2	6	1002031	1002036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5269	NC_021012	AAG	2	6	1005743	1005748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5270	NC_021012	T	6	6	1006581	1006586	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5404	NC_021012	GTA	2	6	1035752	1035757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5442	NC_021012	A	6	6	1054438	1054443	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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