MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Roseburia intestinalis XB6B4 draft genome

Total Repeats: 20928

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_021012	CAA	2	6	840319	840324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4502	NC_021012	TAA	2	6	840336	840341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_021012	AT	5	10	840409	840418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_021012	TAAAA	2	10	840490	840499	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_021012	A	6	6	840553	840558	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_021012	GAAA	2	8	840573	840580	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_021012	AAAT	2	8	840606	840613	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_021012	AATGT	2	10	840627	840636	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_021012	AAG	2	6	840662	840667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_021012	TA	3	6	840695	840700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_021012	TGT	2	6	840754	840759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_021012	A	6	6	840766	840771	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_021012	GAAA	2	8	840786	840793	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_021012	AAG	2	6	840866	840871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_021012	GAT	2	6	840881	840886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_021012	AGA	2	6	840907	840912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_021012	ATA	2	6	840924	840929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_021012	GAT	2	6	840998	841003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_021012	AAT	2	6	841022	841027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_021012	TGA	2	6	841036	841041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_021012	A	6	6	841065	841070	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_021012	TA	3	6	841078	841083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_021012	AT	3	6	841106	841111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_021012	AAT	2	6	841112	841117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4525	NC_021012	GTA	2	6	841178	841183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_021012	GAA	2	6	841217	841222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_021012	ATG	2	6	841239	841244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_021012	TTGGA	2	10	841301	841310	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4529	NC_021012	AC	3	6	841362	841367	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4530	NC_021012	GGA	2	6	841378	841383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_021012	AAC	2	6	841390	841395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4532	NC_021012	ATG	2	6	841485	841490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_021012	TTG	2	6	841517	841522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_021012	CAG	2	6	841605	841610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4535	NC_021012	GA	3	6	841626	841631	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_021012	AT	3	6	841717	841722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_021012	G	6	6	841723	841728	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_021012	AAG	2	6	841773	841778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_021012	GAA	2	6	841784	841789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_021012	ATAA	2	8	841790	841797	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_021012	ATT	3	9	841828	841836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_021012	ATAAAG	2	12	841848	841859	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_021012	A	6	6	841860	841865	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_021012	ATA	2	6	841915	841920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_021012	TTAT	2	8	842097	842104	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_021012	A	6	6	842193	842198	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_021012	AT	3	6	842242	842247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_021012	CA	3	6	842270	842275	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4549	NC_021012	AG	3	6	842330	842335	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_021012	GCA	2	6	851553	851558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4551	NC_021012	ATAA	2	8	851561	851568	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_021012	A	6	6	851584	851589	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_021012	A	6	6	851656	851661	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_021012	A	8	8	851827	851834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_021012	A	7	7	851912	851918	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_021012	TTA	2	6	851919	851924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_021012	T	6	6	851945	851950	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4560	NC_021012	AGA	2	6	852098	852103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_021012	CAG	2	6	852142	852147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4562	NC_021012	GAA	2	6	852182	852187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_021012	TGC	2	6	852208	852213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4564	NC_021012	ATG	2	6	852267	852272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_021012	A	6	6	852277	852282	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_021012	GAT	2	6	852306	852311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_021012	ATG	2	6	852423	852428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_021012	CTGTT	2	10	852440	852449	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4569	NC_021012	GA	4	8	852464	852471	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_021012	AT	3	6	852493	852498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_021012	TCA	2	6	852516	852521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4573	NC_021012	A	6	6	852586	852591	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_021012	AGA	2	6	852619	852624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_021012	A	6	6	852646	852651	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4578	NC_021012	AGA	2	6	852823	852828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4583	NC_021012	A	6	6	853050	853055	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_021012	A	7	7	853124	853130	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4591	NC_021012	A	6	6	853382	853387	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_021012	A	6	6	853394	853399	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_021012	T	7	7	853406	853412	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4596	NC_021012	A	6	6	853490	853495	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_021012	T	8	8	853515	853522	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_021012	A	6	6	853538	853543	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_021012	AT	3	6	853612	853617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_021012	GAACG	2	10	854413	854422	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4601	NC_021012	T	8	8	854453	854460	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_021012	TGA	2	6	854554	854559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_021012	GT	3	6	854562	854567	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_021012	TAT	2	6	854585	854590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_021012	A	7	7	854607	854613	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_021012	TAA	2	6	855406	855411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4607	NC_021012	A	6	6	855410	855415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4611	NC_021012	GGA	2	6	857360	857365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_021012	T	6	6	857745	857750	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_021012	TA	3	6	857764	857769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_021012	AGTT	2	8	857792	857799	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_021012	AGAA	2	8	857809	857816	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_021012	CAGA	2	8	858045	858052	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4617	NC_021012	TGAC	2	8	858109	858116	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4618	NC_021012	GCA	2	6	858147	858152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4620	NC_021012	CA	3	6	858276	858281	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4621	NC_021012	GT	3	6	858298	858303	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_021012	TGG	2	6	858328	858333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4623	NC_021012	GT	3	6	858357	858362	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4624	NC_021012	AT	3	6	858370	858375	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4625	NC_021012	AGC	2	6	858431	858436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4626	NC_021012	A	7	7	858486	858492	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4627	NC_021012	GGAG	2	8	858620	858627	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4628	NC_021012	GCA	3	9	858679	858687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4629	NC_021012	CA	3	6	858698	858703	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4630	NC_021012	GAA	2	6	858771	858776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4631	NC_021012	GTT	2	6	858777	858782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4632	NC_021012	A	7	7	858791	858797	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4633	NC_021012	CGG	2	6	858875	858880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4634	NC_021012	AAG	2	6	858989	858994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4635	NC_021012	TTC	2	6	859024	859029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4636	NC_021012	CAGG	2	8	859143	859150	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4637	NC_021012	CTGAA	2	10	859157	859166	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4638	NC_021012	GTG	2	6	859183	859188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4932	NC_021012	CAG	2	6	934825	934830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4949	NC_021012	TA	3	6	936834	936839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4955	NC_021012	A	6	6	937055	937060	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4956	NC_021012	AGA	3	9	937072	937080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4957	NC_021012	GGA	2	6	937084	937089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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